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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s116 | supercontig | LSalAtl2s116:497121..508453 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000001006 >EMLSAP00000001006 ID=EMLSAP00000001006|Name=EMLSAP00000001006|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=263bp
FFVLTQDYEIHDINCSSSPDNEYIEAQLIKPPGFSGYPILADVGKFMDPA LCKITQTENASSYSLIIHNYDECGVRDESVEGVVTLSDQEVXILCXPPRS IITQNKAASYSSHLPSAARVSGIVEELPDNLEYEVALYKDSRGDDGSPIN EEVPIGTHLQLRASINTDSAWKYIKLMDVSISPQSINPIAEGHISLMKNG CRLKEFISIVPKHPFHPKKINETNYGEVRLEFEAIILQATQPFNRLWIHA RIKGCVHKEDCIS back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s116:497121..508453- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000001006-696853 ID=EMLSAT00000001006-696853|Name=EMLSAT00000001006|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=11333bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s116:497121..508453- (Lepeophtheirus salmonis) TTTTTCGTTCTGACACAAGACTACGAGATACACGACATCAATTGCTCCTC
CTCTCCAGACAACGAATACATTGAGGCACAACTCATAAAACCTCCTGGAT
TCTCAGGGTATCCCATTTTGGCGGATGTTGGGAAATTTATGGAYCCGGCA
CTATGTAAAATAACCCAGACGGAAAATGCATCATCCTATTCCTTGATCAT
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ATTTCACTAGTCAACAAATTATTGCCCTTGGATTGAGATCGTGTGATCCT
TGTTGCTTTTATTTCGAAAACCATCAAAATATACTCTATAGCCCAAAATT
TCCATTTTTGTGACTACAATAAGCAACTTTTATATACAGGGTGTTTAGGT
AAAGTCGGTGCCTTTTTTCAAAAATCTGTAAATTATTACTGAGGGCACAT
TTTTCAGCAAATTTACTTGAAAATTGGCTTAAATTGTACATATAAATGTT
GAAAAGGATCCTCAGAAAATTCCTCAAATTGTCAGGGTTACCATGTTGAT
TTTGTTTTTGTTTTAACATGCCCACTCTATAATAAATTTTCATCATTACT
CATTAGTATTGATGAAAATCGGTTGCATTTTTTAGCTTGTCCGTTTTTTT
TGTTTTTTTAGTTGGGAAAATAACAGTCTTCATTTTCTTCACTTGTAGAT
TTTCATATACTTGCTATAATTAAATATACACAGGAATTTCTGTAAAAATA
ATAATAATAAAAAAAAAAATAAATGACTCCGTTAACTTTTTGATAATTTA
CAATTATCAAAAAGTGGAGCAGCCAGACTTATTTAGACAGAAAACCGTGG
TCCAGYCCATTCTGMYCCCATCCACTACCATTTGTCGGTCCTTAAAGAAG
GTAAAATCTATCTCTCGTGACGTTTTTGGTCCTCCCCAATTTTTTTTCTA
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CTACAGCCCTGATGCAAAATCCCTCATCTACACCTTGTGGGTGCATGTCG
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ACTGTCAGCCAGCACTGGGACGCCATGGCAGAGAACAACAACCAAACCAG
ATACCAAAACTTCTGCCGGTACCTGAAAGCCATCATTGTTACTAAAGGTG
GCTACATTAATGACTAAATAAGCTCAGATACACATCTATTTATTGTATTC
ATTTTAATTAATAATCTTGTTGACGTTTAAAATTCAAAGTGTTCAGATTT
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CATCGGGAAAAATTCCAATGACTGACAGTCCTAAGGACTGGTCCTAAGGC
TGTAATGGAGAGAATAAATAAGTGCCGACAAAACATTAAACATACACTCC
CTGGCTTCTGATTAACAACTTTTCAATATATATATGTATAGTCAAACTTG
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TCACTCTTAAGCGAAGTTTGCTATTATTTAAACATTATAAATTTGAAAAT
GAGTGTGGGCACTTTCCCACAACTTTTCAATATATATATATAATTTATGT
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AGAAATCTGGGCGGAAGTACCAGATAAGCATAAGTGAAAACTAAAAACTT
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TCTATGGACCCTTCTCTATGGTCCGTATCGTTGATTGTGGATTTTGTGGA
CTATCAGTTCAGGGTCCTACATCCCCTCTTTGTCCGATCCTCCACCCTAA
ATCACCCAAAAGACTCAACAACAAACAATATGGGCCTTTGGGAAGGGTCC
ATAAGGTAATACTGCATAGTTCTACCTACTTTGACCGTTGCTCTACTAAA
AATTGACCTATAGAATCCGGAATTTGAGAATTTTGTAAACTAAGCTTTTC
AACGTGATCMCCTTGTAGACATATTTTTTTATTCAACCAGAGNCGTAACT
GTTATAATAGTGCTTAAACGTATAAGGGATTGTAGTTTCATAGAGGTCAA
TAATGGTACAGCTTTCCCTCTTGAGTAAGCTAGAAAAATAAAATAGATCC
TAGTATCTGGTCACAGTGTGTAATTGAATTTGGAATCCGGTAATCATACA
AAATTAACATTATCCTGATCTCAAGGGTCAACCAGAAGTATGATCTCAAG
TTATGTGGAAGAAATTTGCCAATATTCTTGGCTCAATCATATTTAGAATA
GAGAAATAAGGACTGCAATCCAAATTGTAAACTCCTACCAGATGCGAAAT
TGAAAACTAGAGATTTCGAATATGGGATTTTAACTAGTTTAATTTCGAAA
AATAGGGAGCTAATTAAACTAAACTTTAGCACAGATGTTGGCACATGTGT
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CTCGATTTGCCGCTGGAAGCTCTTAAAGGTGGTTATAGTGTAAATGGTGA
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AATGAGTAGGTTGGCATCTTTCGACTATGGAGGGCTCATTGTTTTCTGCC
GGAAAGGAATTTTGGTCTCTTAAATAGGAATGCGTAACTTTTGCGAATCA
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ATTCCAAGCTCACCACCGATGCTGGGTCCTCGATATTAATTAGTAAAGTT
CTGGATCTCAGTTGGTGTGTTTCCCGCGAAAAAAAACAAAAAACAATCTC
GATTCTTGTGTCTCTTTGTGAGGGCATTTTTCGTTTTATTGTGTTAATTT
TTTTGGAGGGGAGTGTGAAACCACACAGCTTGTCAGCTGATGGAGGAAAT
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TAGAGGGGTGATTAACTTTCACAAAAAGATGTAAAATTTAATTAGCAAGA
TATCAAATTTTATAACTATAGATGATTAGTGAACTAAGTAATTAGTAATT
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TCCAATAACCTATTCATTTTCATAATTTGAAGTTTGCAAACTTATTTGAA
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TAGATTTTCTATCTTGTAAGAATATTTTAAATTCTTACAGTTTGCTCAAG
TGAGGTTATTGGAACTGGATTTATTCTGAAAAAATGAATAAAAAAGTTCT
TAAAAGTATTAAATTTTACATCTTTTTGTGAACAATAAGTCTCCCGACTA
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CATTGACCTCGTTTTATTTCCTTTTGAAAAAGGAAGTTTTCTTGTCTCAC
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GTAATTACGTACACGMCATGTCGAGCCCTCTTCACTCCCCCCCCCCCCAC
CCTCTGCCCCACCAGATCCATGTTGTCTTTATCTTATATTAGATAATTTC
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TGCAGATTATTTATAGTATATTTTTCATTATTGATCACATCAGATCATAC
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TGTTGCGCTTGGCCGGTTCAGTCTTGAATTATCATTCGTCCAGATTGGAG
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GAAAAAGGCGTAGAAAGAGACCAAGGAAATATGCAATGTATTTGGGGTCG
ATGCTTTGTCAGTTCGTGTTGAACAACAGTGGTTCGAGCGATTTTGTTCT
GGTGTAGTAGAGGTGAATAATGCAGGACGCACTAGCAGGCCTGTCGTCGA
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GTCATTAAACTCTTTTGAACCATTTGCAGAAGGCTGCATACAAAAAGAAA
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ATGAATCCAACCTACAGCATAGAGTGGCACTAAGTAACAACCTCATGTTT
CTGTCTATGGCTGACGCGCTCGGGGGTACAAATATGTCCTAATGATTATT
TTTTCCCTATAGGGACTAAGGCTTCTACGAGATTCTCGTCGTCAACAAGT
TATCAAACAGAACAGGGATACTTGGCTACTATCCTTCACCCCCCCCCCNN
NNNNCCCCCCGACCTAATATATACCAAATATAGAGGGTAGGGAAGCAAAA
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CAATAATAAGCAAAAAACAATGTTAACAAAACATGTAGAAAAGGTTTTTG
GAAAACTTTTTCCACTCAATATGGACACTATACCTATTGAAATTTAACTT
TTTTTTTCAAACCTTACAATATTTTACTTTTTCTCGTTTTCCAAGGTCTA
TAGAAACTAAATATACTAGTCAATTGGATTTTGGACCACGGCATGGCCTT
TGAAATTTTGTTTTTAGTGGTCCTAAAAAAAGGCAAATTTTTTTTTAGAT
TTTTGTGTATTCTTTTGACTATACCTTCGCAAAATAGTTTATCATATAGC
ATTGATATGTGTATCAAATCAAAGCCAATAAACTGTGTTTTAATTTGTTT
AAATATGCTACTAACCCTTTTTGAAACTGTTTAATGCAAGTTGTGGAATA
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TAGGTATTCTCCTAAGCTATTATTAACTTGACGTGTATGTATACAAAAAT
AGAAAACAATAGAGTAAAATACATTTTTTCCTTGAACAAAGCTAATAACT
CTTTAACTAAAAAAATAAAATACAATATTACATACATTGATTCTTAATGG
TTTAAATTAGATTTCTTGAAACTAATATATTTATTTGATGTCCATATCAA
TGCTATACTATAAGATATTCCAAAGCTATATTGAAAGGAATACAAACAAT
CACTGTTTTTTTACCTTTTTTTTAGAGCCATCAACAATAAATTTTCAAGT
CCTATGCGGCAGGCATAGCCCCGTCCAAAAGACTGGTATATTTATTTTCT
AAAGACATTCGAGAACAGGGAAAAGTCAAATTTTAAAAGGTTTGAAAAGA
AAAAAACAAAAATTGAACAGGTGTAATGGCCACCTTCATTATCAATCATA
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GTTGTCCAATAGAGCCACTATGGCTAGTGAGTCCACATTGGGGGKGTGRG
GTCCTGTTCGTTTTGCTCTCCAAAGTGCCCCATCTGGAAAAGTCCACTGT
GTTTTCATATTTGCTGAAGAAGGGTGCCATATCTTTTAGGACGAGAATCA
AGACGTGTTAGGCACGCAGAACTATTGGTACATAGCAGACGTGTGAGAGG
AGACACCATGCTGAGTCCACACGTAGTTACCCTCCGGGTAGTTGGTCTTC
AGCCATGGCAAGATGGTGTACCTAAGTACCTTAGAGTAGGCTTCCTACCC
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CCAAAGACCATTGTTTGGCCCCGATATTGGTGTGGAAAACGCCTTGGAAC
TCTTCGTTTGTTTCTGAAAGCCTACGGTCGTTCTGGCGGTTGTGGAAGTG
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GACGCCGGATACAGAATATCAAAAAATAATCACTAAAGCTGTTCGTAGTA
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TACATAAAACATATTGAAATAATCAAAAAATTAAGAAGGAACACAAAAAT
AAATATCATACCTATATAAACTTTCTTTTTAAAGACATCCTCCTTATTTA
TAGCCCACCATTCCATTTGTATTCCTTTGAAACTAAAATATTATTAAAAA
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TATTTTCTAAAATAGAAAAAAGTTTATTCGTCTAATTTAAGTATAAATCT
TTTTGTCTCCTTTAAAAAAAAAAGTTCTTAAGCACATGGATCGCAGCAGT
TGTTGGGTGTGCGCTTTCTTATTTTTGGTTTATTATTAATTTACCCCTCA
GAAGTAAGCATTCTCGCCTACTTTGGTATTAATTGTTTTAAAAATACATC
ATAAAATAAACATATATGAATTTAAATATGATTAAATATTTTCCCTGCAC
GAATATATATATATATATAGGTTTACTTCTTTATAGCATTAATTAATTTA
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TTCTTTTGTTCCCTTACAAACATGTCAACTTTAGTTACTACATACCAATC
CTACCCTCTCTAACTATTTGTTCCTCTTTCTAATATTAGGGCTTTGTAAG
TGTTCGAGTCTGGTTTCCAAAGGTTGAAGGTGTAGTCACACTCTCAGATC
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTTCTAACGGCACTGTTTTAAAATAAT
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GACTGGATCGATATATTTGTAAACTGTCAATCGGCGAAATACTAACCATA
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GGTACATAATTCAGGGGCGTCCGTAGGATGTGGGCTAAAGGGGCTGTAAC
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AATGGTACAATTTATCATACAATCTTTTTATTAATTGAATTAAAATGTAC
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GTATCGAAACACCGTAACCAATGTTCGTAGCGGAATCGATACGATTTCTT
TTTGTTGTATCCAGATAAAATTTGATCATAGTTTTCAAGATTTTTTGAAG
ATTAATTGTTCATTTATTGTCAAAAAACTTCATTAAAACCTCAGAGATAC
CTATATTGGCCATCAACTTGTGTGTTCTTTGCAACACAAATCAAGATTTT
AAGAGTTATCAGGGGGGATTCATTTTTATAATGTCTCAAATATTTACAGT
TGAGTTACTTTTGGGTAGCCATTCTGGGTCTTTCGTGTGATCACTTCTAT
GAAGGTGTACAATGGTTAATTTTCAGAAAAAATTCAACCTATGAACTGTA
ATTTTTTTCTTAACATATAATCGGTCTCAGTATATCGGCCATGTCCTATC
TTAATTATACTCTTCACTGTATACTTATCAAAATGCTTTTCAGATGTCGT
TTGAAGGAATTTATAAGCATAGTTCCAAAGCATCCATTTCATCCTAAAAA
GATAAATGAAACAAACTACGGAGAGGTTAGGTTGGAGTTTGAGGCCATTA
TACTCCAAGCCACACAGCCTTTTAATCGTTTATGGATACATGCACGTATC
AAGGGCTGTGTACACAAAGAGGATTGCATTTCA back to top
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