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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s116 | supercontig | LSalAtl2s116:953600..1003455 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000001019 >EMLSAP00000001019 ID=EMLSAP00000001019|Name=EMLSAP00000001019|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1288bp
MMERRSRSSTRGGAGGDSSLRLLSSRLVESIGNRPGGDARTLSPERSSRA PGVEIPPRAASYNQYLHGPPPKPPPKSNNHSCKSSMTDLNCCSRASSRGG GGGGRNSFNSGTKREDLSGLQSGFIRDTMKLGEAELQGGERIVWEYHQVI LSRVPGYGFGIAVSGGRDNPHFTNGDASIAISDVLKSGPAEGKLLINDRV ISANNISLENVDYATAVQVLRDSGQTVHLVVKRRVVLPPNTSSNESPYPY PRYISFQKAGSVGIRLTGGNDVGIFVTAVQPGSPASQKGLQPGDKILKVN DMDMKGVTREEAVLFLLSLQDTIDLIAQYRKEEYDSIVSLQRGDSFYIKA HFSYEIPEKNEMSFRKSDVFHVVDTLHNGVVGAWQVFKMDPFMSGLSRSS SSDQQVIKGVIPNKGRAEEIATQQFNAAKKEQNQSEQAKGNGGGSFFRRK REKSHRRSKSLGKRIKDTLWSTRESPAAPLEVPNVYPVMRYSRGFSADRI LPRKSRKCLSDINVLSRIITVIIVFIKKTIGKIWFGLKACPSSLLMKEXS LRHPGFPRPVVIFGPVAXLARERLLRDYPSKFACPQDSSDDVSKNKSGIV RLSGIREIMDRRKHALLDVTPNAVDKLNYAQFYPIVIFVRADSKQTIKDC RTGVPKKAHLSSKKLFEQCQKLEKLWGHVFTGTLNLSNDNWYTKLTDLID KQQTAPIWMSETKPLEFCSDLFLIPLGLPPVDQLNLKTNTLHRSSYYPVP PPRPYPLKSKESYYDFITNPLEGFNNDSYVYSVLSKSQPAALKNNIGSSL PSPTPKINITLSPEYESKESERYLYNIRVVIFLFCASRIHSKGEINSKNC RPDESFSDDFLFPMTSRLSYTSSPEXDGEFCGDPETPKVNRAVPEVPHDG EDGRLTRSNSDSNLVSSSSNKESSDHHPLMGPINSANSNSSASANTNTNG GIPNYNAPINCAVDSPVKSGNGNIKQQHEMNSNTATKRDLYGGFRRSQVN ESIDDLPLPPHPNHSSSSTSSSSPQNPSNANVKHGMSNMGGPELPPKIDR LKKPSRRTTEDSSSLDRNAHSAYDHNGGTIYDTYKSLDNEMMTQKSTSSL QIPHESSRHTRAVSQDPNATYRRQYSNGXDVAPKQSTGYDDGDSNNTGXD SGHGSSLDRDYYGTTATNGNGVNTNNNHINSGGLSSSNNNNNNANANNAN NNGSMGMMNGLSRQHQYYYNIPNSSGNTNGNNSGSSPKRNGGDGLDLSNR EYRGSAFELYKKPLSSCPPPPSTSQAANYFNGHTTIGR back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s116:953600..1003455+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000001019-696866 ID=EMLSAT00000001019-696866|Name=EMLSAT00000001019|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=49856bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s116:953600..1003455+ (Lepeophtheirus salmonis) ATTCCCTTCATGCGCCCGCGCGCCCACCCCAAAAATACACTTCAATATAG
AGTCAGTCATCATCATTTCACCGGAGTGTGTAGTGGGTCGAGTATTGTGT
TCCGTCTTGTCAAATTAATATTATTGTTAGTAGTTAGTGTCCATGGATGT
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GAAAAGTGCCTTATCGGGACCATTATAAGTTTGTTAAATCAAATGATGGT
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GAATAGTATGCCTATAATTGTCTCACATATGAGACATGGGGCTGTATGTA
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GATTTTTGTTCGAGATTGTTTTTATTATGACGCACCACTTATAATATACT
GTAGGAACCTCTACTGACTTCATAACTTTGACTCAAAAGGAAACATGTAA
GAAAAATAAAGAATTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTGACTTTTCTCTTTCT
CTTGTTTAAAGACGAAACGATAGTTTTCTGTTTATATACATACTACAATA
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AATGCCTAGAATAATTCCCCGTCGACAAAACAGACAAATTTTCCTTTAAT
AATATAGGAGGTAACTCCCCAAAAAATCCTCAGCTGTACTCTACATTTCT
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TCTTTTATTGACAAAATGCCAGGGAAAAAACCAATTTAGGACTAAGTTCA
TTATATACTTTTGAAAGATTGTGTATTCTTCTAAAATACTTATATATTAC
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CTTAGTTTACTATTTTGAAAATAACGGTTACTTTTTGATCTGACTTTGTA
TATTAGTCTCCTTTTTTTTTAACATTAGATACAAGATGTTTTTTTTTAGA
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TGGCCTCCACTTAGCATAGTGCAATTCCATTCTTCGTAGTGGAGTACCAC
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TGTTGCACAATATGTTCAGGGGTCCACCATCCTTCACTCGATGCGGTAAA
GTTATCCTTTCCCCTTAGCAGATAAAAAACACCAAAGCATATTGTTTACA
GCCCCATGCTAAACTGTGGTGTGAATGATGTTCTTGGTGGTTATACTCAG
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CTTACAACATCGGCAAGGGATCCAATACTTTTTTCCCCACTATATATGCC
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ATAAAGAATAGCAATAATAAGATCTGATATATCATTTAGGTATACATTTG
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AAACAAGTTGTAGTCACGTAGTAATTTAATAGACGTAGGTTCATGGTATG
CATTTTCTTCCGTTAGATGGCGTAGCCATTAAATGATAATTATCCTCTTT
GGTATAACCATACATACATTATAAGGCGTTTACGTGTGACGTCAGTCGGC
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TGGTATAATATCAGGTCCTAAATTATATTTAAGATATGTTATTACATCAG
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CTAGGGCGCTCTTTCCTGTCAAAAACTGACAGGCTCTTAAATTTTAAACA
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CAGTTTCTTGTGATATACACTTTGTTTATAGCTGGGATTTTTAACTCCTT
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GGATTATGGCAAAAGTTATAGATAGATTTTGATCAAATTCGCTACAAAGA
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CAACAAATTGAGACGCATAACTCAATTTGGTTTTATGTGGAGGTTTTGTG
CTCTACCGAGTGTCCATTCAAGCTCAAATCTCGTCATGTTTTCAGTCATA
GTTATTGTTTAAAATCTTAATGATTTTTGCCACAATACTAGTATCGTGCA
TCAGCAGACAAGTCGTGTGGGACGTTATAAAGTCCCTATTATAATGGAAA
TTACATTGGCATTATCTTTGTTTTTTTTATTCCATTTCTTAGTGTTAATC
ATTTGCTCAATCTTCGTAATTGTAGCGTCAATTTCTATCCTATTTTTCCA
CTTGGAACATGCCAAAAAATATCTTCTTTTGCAGCAGCCGAATTAAGTGT
CTTTAGAATAGTAATAGTGATTGTTGTATGAGTCCTTATATATTCGGTCC
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ACTGTCAGTACTAGAACTGTTTTAAAAAAGGATAAGAAATAAAGTTGAGT
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TGCAGTTTTCAGTCCTTATTAAGGATTGACACAACACTGGTAACAGTAGA
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CAATGATTAAAAAACCCATCTCTTCCGTTGCAAGACTCTTTTGAATGAGT
CTTTTGAACTCTTTTTTCACACTTTTGGCCCACATACAGCCCTGATGCCA
ACCCACTTGACTACATCTTTTGAGTGCATGTTGAGGGGAAGGCCTGCAGT
TNNNNNNNNNNNNNNAGAAGAAGCCTTGCAGAAGCTGCACATTATTTTGC
GAGAAATATACAATACTGGACACTTTCAGAGTTCTGAAAATGACTCTTTT
TGACACCAGCAATGATTAAAAACCCATCTCTTCCGTTGCAAGACTCTTTT
GAATGAGTCTTTTGAACTCTTTTTTCACACTTTTGGCCCACATACAGCCC
TGATGCCAACCCACTTGACTACATCTTTTGAGTGCATGTTGAGGGGAAGG
CCTGCAGTTCTGTCATCCAAAGAAACTCTCCCTCAAAACCATTGCCAGCC
AACATTGGTACGTCATGACTGAGGACTACATCCGCAGCGTGCGCCAGGCC
TTCTGCCGCCACCTGGACCCCATCATTGCCACTAAGGGTGGCTACATTAA
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CGGGGTTAAATCAGACTAAATTAAAAGGTTGCGTGAGCAATACACTATAA
CTTCCACCACAACTGTTTTGAAAACAAACAATAGTCATCATGGAACAACC
AAGGAGAGACGCCATCCTCGAATTTGCTCGCGCGGGACACAAGCCCTCTG
CTATCTACAAGCTTCTTAACTACTCCAAGACCACGGTGTACCGGGTCTTC
AATGCCTGGGAGGTTGAGGGGAAGGTGTGTTGCAAGGCCCACAACATGAG
AAGTGACCGAATCCGCACTCCTTGCTTCCTTGAAGGCCTCCAGAAGTCCG
TCAAGGCTTCGCCGGGGGCTTCCTTGTCCAGGTTGGCCAAGAACCGTTGA
GTGAGCAAGCAGCTGGTATCCAAGGCTGTGATTGAGGACCTTGGGTACAC
GTCATACTGAATGGCCAAACAACACATCCTCACGGCATCTATGAAGGCCA
CCAGGCTCGCCAACGGTAAGTGTCTTCTCAATGACCTGAAGAGCCATGGA
GGAAGAATCATCTTCTTCTCCGACGAGAACAACTGGACTGTCTACAGAAG
CTACAACGTCCAGAACGACAGGKGGCTTGCCAAGGAGAGAGAAGAGGKCC
CTGCAGTCTTCGCCATAAATTTCCCGTGCTCCATTACGAGGGAGTGGAAT
GCTGTCGATTCCGCGGAAGTCATCAGGGCATACAAATCCTTTAGGGGCAG
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GTTTAATATATTGTCTAACTTTTTCATATTAGCAAATCCACTCCAAATTC
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GTTTAAAATTCAAAGCGTTCAGATTTATATGGACCACTCGATATGGGTGT
TGCAATGAGTCAATGATCATCTTGAATGAAGGGTCTTTGATTCCCCTTCT
ATTTATGAATCTTTTAAATATGACATTTTAAAAAATGATTGAAAATTATA
CCTTTTATCATTTTCTTCTTGAGATTCAAATACAGAACTTTTCTCTCCTT
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GTTTTAAAATTTTGATGATTTATATATAATTACTCTCCGATTTGAACTTG
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GAATCGTACTGCGAGTCCAACAAGGACTTACATTTATAATTCCCACAAAA
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TAAAAATACCAGCAATTTCATTTTAAGTATTTTGATTTTAATTTATTGCC
GGCGGGKACTCTTGTGTTCTGGGCCGGGGATATATCTTATATTAAGCATT
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TCTTACATCTTATTCAATATTGTTATCTAATGTCTTGTCGGTACCTATTT
AGGACTGAAGACAGTACTCAGCTCACTCTTGGTCTGGTCTAGTGCAGTCC
TGCTTATTAGTCTTATAAAGTTTGGTCCTTCACTCAACTATATTTCTTTT
TTCTTTTTTATCAGCTTTAATACTAATAATCCTATGGACCCAACCTATTA
CCAAATAAATAAGGACCGAAATAATAGCAGTTTTAGTTTTTATCGTTCAG
CTTTGAGTATCGCTATTGTTATATAAAGAATACAGTTGAAATTATATGAC
GGTATTGCCTAATTATCTTAGTAATTCTGCCTTTTTTTTCATCCATTTCA
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TGATTTTGAGTTAAATWTCAGTTTACMCTGATTTGTTTTCGAACTGAGTC
TCAACTACTTTTTTTTTTTTTTTTTGTAGTAGTTCAAATAATKTTTCGCC
TGTTCATGCGCCACCCCCCCCCCAAACTTATCTCTGTTTTACTTAACCCT
TCGTATTCTGTTTAAAATTATATATGTATTATTTATAATGTATGTGTACA
ATCAAGAGTTAAAAAAAAAACGCCCCCATGTATTTGGTGGGGGATATGTA
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ATCTACATACATACTAGTGTTGTGACTAGGTTCGAGAACTGCATAATTTT
GTCATTTCGTACTTGAGTGACTTTTTCTAGATCTTGGACCGTAGATGAAA
ATTTACTCATTTTCAAATCGTGAACCAATTTTTTGGGGGGTCTTAATCTA
TAGACCAATTTCCCACCTATTTTATATATAATTTATACAACATTTTTAAC
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CTAAGCTATTGCTTAGCTTGAATGTTATTTTCTTAGATCAAGAAGTTGTA
TAAAATTAAAACAAGAAATTGTTTTTGGTCCATAGTTTTGAAAATAACCA
AAGTTGCGTATCACTTAGAAAGAATCCCTCACAAACTAAAGAACAGATTG
TCATAATTTTTTTACGGCTATCCATTGAAGGTAGAGGTACTAACTGATGA
TGAGGTAAATAAGGAAAATGAATAGCGCCATCTATGTGTGAAGCCAGGGC
TTTTCAGCCGATTTGTTATTTCATTTATAAAATCGGTCTAGAATGAATTT
TAAATGGGTCGGATTCTTTGTAACCCCGTTCCCACGGCATTATTTCACAA
ACACAAAAATTATACACTGCATTTTATTGTTAGTTATCAATTTTTTTGGT
TTCTTTTTCCCCTAATCCATTTTCTAAACTTAAATAGTTTTAAGTTTGTA
TTCGTTCTTAGTTAACTACGAACAGTTTTCTATAATTAATGAATAATAAT
TCCATAGTTGGGAATAATTGGACAACAATTCCCAGCCACCATCTGATCTT
GGGCCTTTTTCAAATGTTATTTTCATATGAAAGGTTACGTGACCCAATCA
AGGTAAGAAGGTAATCCAGACTTATTTTTTATTTGCTACTTATCTAGAGC
GAGCTTTTTTAAAGGGCCGAATTAGTTCGGTACACCAAAAATCAGAGTGT
TCTCAGACCGGTCTAGGATTTTCAGACTCCAACCCAACACTAATAGTACA
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CTCTCTCTCTACTAATCATCATCTATTGTTGNCTCCTCCTCTCTCTCTCT
CTCTCTAAATCATCATCTATTGTTGTTTATAATATTTATGAAAACGTTTA
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TCGGCTTGTTTTCCCTGGTTCTAATGGTTTTTTCCTTCCAAAAAAAAAAA
AAAATGAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACATTTAAACATAT
TACATATAGGTAATTGAAATCTCTATTGATTCAATAGCTATACCCAGTCT
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TCTCTCTGTTGTAGTATACATACTAAGGTGTCTCATGTCCATGGAAATTA
TGTTTGAGCAGAAWCATGGCGAAATATCATTAGTNNNGTAGTATACATAC
TAAGGTGTCTCATGTCCATGGAAATTATGTTTGAGCAGAATCATGGCGAA
ATATCATTAGTAAATAATAAATACAGCTAAATATCAATATATTTATTTTT
ACACTTAAAAAAGAAATAATACCCTTTAAGCTAGTCTTTCACAAAAGCTT
TAAAACCAAGTGGTGATATGAAGAACATGTGATCAATTTCTGAACAAAGT
AGTGTTCTTAGCAACGTTATTTTTTGCCCGCTAGATAAAGTCTTGAATAT
TACTATATAATCTAACTACACAGCCTCCATGAATTCACCCTTTCAACTGA
ATGTACGATCTAAATTCTACGAAGGGAAAATAAAGTTGTATACGTCATAA
GGGAATATGACAAAAAAATGATATACTGACGTCATCTATGGGTTAATAAA
AACCCACATCTTCCGTGGGGAAAAGGAGATTTGACATATGGTACGTCGTT
ACCTTTATTGAACCTCGCAACCTTTCCACCAAAAAGATATAGAAAAAAGG
TCCGAAATTATCTAAAGGGCCAAAAAAAATTCAGGACTATCATTGGAGGG
TAGCATGACCTTTATATATATATTATTATTATTGATATATTTGCGGGCAG
CACTAAGTGAGGACGAGGACCTCCCTACAATAATATAATATTGCTTAGTA
ATATTTTATTTAAAGTGTAGATATATATATACGAATATCCATTATGTTTC
AAGTTAGACGAGGGAATCGATAGSTCACAACAAAAWACCCTATGTATTTT
GTTGTGAGGCTTGACGGATATATAAATAAAATACATACGCTAAGACATGG
AATAATCACGCATTCAGCTTAGCTTGTTTTCCTACGACCATGTATCTCCT
CTAGCTATCAGGGGCGTATTTTTTTACTTTGTTTTAAAGTTTTAGTCCTA
CCCGTACTTCTCAATTTTCATGTTCCTGTTTTTTTTTAAATTATGTAACC
CGAGCCGGACCCATAACTAAAAGTAATTAAAGTCTAAGTAATAAACAAAC
ACATTTTTGGTGGATATTATATTTTTAATGAAATGTATGTTATGATATAA
TTAAACACCGGATTTCCCGGGAAAGCGGAATACATTGAGAGAAACCCAAA
TAGTCGTATTGCTTCTTCTAACTAATTGAGTAGCAGCTCCCTTCTTTAAT
TCATCACCCACGCAAAAGCCATGGTCTCCTCATTTTCATATGATGTTAAA
TGTGTTTGTTCATCTATCATGTAGTATTCAAGGCCTTTCAGGMTGTACAA
ATGGCTAGWTAGGKAGTATCTCGGRTATTKAGKATTTTTGGAGATACTGA
GTGAGTGTGTGAGTGATTGATTCGTGGTTTCATCTTGTTAGTCATTTTTC
CAACAATACATTTAATATGTGATAATCATTTAGCTTCTTACTGCGACTAG
ATACATTGTTTAAATTAGAACATGGTCGTGAGTAGTGGAAAAGGGACATT
TTCCCTTCCAATATTTGAAAGAAGTTGTTGATTCGTAAATATCGGCTCCA
GTTTWTTTTGCCACATTCAATAATTTAGCTGCCTTTTTMCCTCCGCAATG
AAGCCTTATGTTTTTGCCTCTGTTTGTTAGTTATTCACTAAAATTACTGC
TAAAGATACAAATTATTTTTCTATCAAACTTGGTAGGAAGATTATATATG
GGTCTAGTAAGAGGCCCATTATTTGTGAATATTCCGACCGATATACCATT
TCCCCCCCTGATTTTCTTCTTTTTCGCCTTTAATATGTGATTACTTTTTT
TTGCAAAATAATATATGGTCTTTTTTTTCTTTTTTAATAATTTTTTTAAT
TACAATTTTAATAATAATTAAAAAAAAGTTAATGAGGGTTGTTTTTATCT
ATTGTTAAAAGGTCATTTCATATAAATACATTTATTTTATTTTTCAAAAG
ACCTTTGAAATTTTTTTAAAACCCCTGCTATAAAGTTTCCTATTGACTTA
CCATTTTTACGGCTCCMATACTCCSTGGTACCMGCTCTGTTTGTAGGKAT
CAAACCTTCTTATTCTAGTTTGAATCTTTTCACTTGGAGTCCCAGTCGAA
TCTGAAATCTCTTTCATTTATTAAATTATGGCAAGGCCGTCGTAAGGGGT
GGGTCCACCCGCAGTAATAGAGAATTTGTTGTTATTACCATCCAAAAATG
ATTCCTTTTGTAGAGAAAATTTCAATAGCAAAACGGAGGGAAAAAACAAT
ATTTAATAGTTCTATTTTCTAAAAAAAAGAGGTCATGGGTCTTTTCTAAA
TAAATTAAACTCCCTTCAAAATAAAATCATCCTGTGGGCACCCCTCTAAG
GATAGTTAAGTACGACTTAATTCTACGAGTCAGACTAAATAAGATACAGA
ACTATTTACGTTTATTAATGTCATTCTTTTGGACTGGAAACACTACTTTT
CTAGCGTGGATGTTGTTCATAATTCAGGGTCTTACTGTATGTGCAATACA
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TGAGTGAATACGTGCCTGCGCGTTTTTTTCCACCCTCCCAACGCGCGATT
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CGTGTTGTGTCATCGTCATATCCAAGTCTTCAATGACGGACTTGAACTGT
TGTTCTCGTGCCAGTAGTCGTGGTGGTGGTGGAGGAGGAAGAAATAGTTT
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CCCCCTCTTATTAATAGTGCATAGACCTTCTTATTGATGAACGTGCATTC
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TCCTGAACCTTAGGGCGACAGTTTGATGTCCATAAATGTATTCATATACC
TACACAACGGTTATAAAAATTCTTTAATGGTGTATTCTACCTCTATGTCA
GGGAGAACGGGACAGGAGAGGATCCAAAAGCGCTCCTCTCAACTTTCTCC
TTCTCTTGGACACAATATTATTTATATCCTTTTTATCAAATATCTTATAT
GCTACATAATGAACTGACCGTATATGCTTTACTTCGTTTCATTCATCAAT
AACTAAGGAATAGTTGACTCCATGCCTCATCTATGGAAATTATTTTTGAG
CCATCATGATTATTAGGGATATATCGCCCCTTTTGGTCATGTCCTACAAT
TTAACAAAAAAGCTGACCCATGCAGTGTTATTTCAGACCTTATTTATTCG
GTCCAGTCCAATCATAGATAACGTCCTTCGTACTGTCGGATCAAGAAATG
ATTAAAAAAGAATAAATATAGTTGCGTGACGTCATCAAGGACCGAACTGG
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AAGTCCCATTCAAACATTAATTAGGCCTAAATGAAGAGTAATAGCAAAAT
ATTGACGTTTTTTAAAGATATCTAAAGTTTTAATCAAATAATTAGATGAT
AAACTGAAATACTTTGCTATAATGTTAGTGAAAATAATGCCTTGTGGAGA
GCACTTGTAAATTTGGGGCTTCTTACAAAGACTATGACGAGACGTGATGG
GACGGATTTGAAGTCCCATGTTAAGGATTGATGAGTGTAGGCATGGAATT
ATAGTCGTGTGGAGTTATGACGCATGCATCTTTTTCCCCTTTCTTTATTC
CCCTCATGTGGGACTACAAATTCTGCCTGATTATTCAAAGTCTCTAGAAA
TACATGGCCCAAGTAATTTAGGAGTGGTGATCAGCTGTACCGGATCGTAT
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CTCTAAAAAGTTTTCCTGCCACGAACATTTCCGCCGCTGGGGATTTTGCA
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GAATAAAATAAAGTACTCATAAAATAGTTAATGAATAATAATGAAAAAGC
TGACAGTTTTCTGTAGTAGCACAAGCTCCAATCACGTAGCTTTTTGTAGT
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