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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s116 | supercontig | LSalAtl2s116:829343..837050 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000001023 >EMLSAP00000001023 ID=EMLSAP00000001023|Name=EMLSAP00000001023|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=110bp
MSWSVSNLLERHKGALSRDPNFVMVVSELVSKGIVSYSEEGHILAELDFD
LRGEIFTRIFSRKGFNAFRELCSILEERSPHFLTSLLLDTTGWLGDPLSF
MCSCVGVVQL back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s116:829343..837050+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000001023-696870 ID=EMLSAT00000001023-696870|Name=EMLSAT00000001023|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=7708bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s116:829343..837050+ (Lepeophtheirus salmonis)
GTTTAGTCGTATGCAGTGTTATAATGTGTGTCGTTGTAGCAGTGATTCTC
CTCTCGTCTCCTCAATCCTCCTTTTAACTGTTTTTATTTGTTGTGTTCGT
ATTTTTAATAAAGAATAGAAATCATGAGTTGGAGTGTATCGAATCTGCTG
GAGCGTCATAAGGGCGCCCTCTCGCGGGATCCAAATTTCGTGATGGTTGT
GAGTGAGTTGGTCTCCAAGGGGATAGTGAGCTACAGTGAAGAAGGACATA
TCCTTGCAGAACTGGATTTCGATCTCCGTGGAGAAATATTTACACGGATT
TTTTCCCGTAAAGGATTCAATGCCTTTCGAGAACTTTGCTCCATCCTAGA
GGAAAGGAGTCCTCACTTTTTAACGTCGCTTCTTCTGGACACCACAGGTC
TGATTTTTATGTTCAATGTTAAAAAGTATTTATGATGTGGATATTCATTT
AGGTATTTCCGTTGAAGAATGTTACTTTTATAAGTTCATTAAAACCGGGG
TTGTAAACCCTAAGCATTTTTGGGGNTGCAAGTGTTTTTGTTGTTAGCAA
TCTAAATAGTGTTTTATTTTTATTTTCTAAGGTTGTTCTTTCATTCTTGA
GGAGAGAGCATCTAAGTATAAAGTGTAACCACGAGTGTATATGCTCATGA
ATGGTCCAGAGTAACACTGAGGAGTTAAGTGAAAGTCCAAGATGGACTCA
GCGCCCTTGCTACAAGTCAATGAGTCCTTTTTAAATAGATTCATGATCCC
AGTTCCGTGACCCTTTCCGTGTCCTTAAAAAAACTATTCCTTCTTTATTT
TCAATTTGTTTCCTTGTTTCTTATTTTGTTCTAGTTAATCTAAAGAGCGT
TTTAAACTGACTTTATAAATTGCATCATAATTGAAGAAGACGTAATTTTG
AGGGCTCAAAGTGGATATTTCTATCCATTTATAAAATGCACGAATTTCCA
AATAATCTTTATTATAATCCATCAAATGGTTTTATGTACAAAAAAATACT
TAGGACTGCATTGAATATTACTTTATACCGATAACAAACGCTGATATTTA
AATTAAATCAAAGTAATATGTACTAATAATCCCTAAAAATGGCTAGATTT
TTAACATCATTATTAGCTTTTTTGATTGATTAGGGACGAGAAAACTATCA
TTCTGATTACATTGTAATAATTAATTATTATCTACAATATGGAAATAAGA
TTGTATAACGATCTAATAACATAATTTTAGTACATTTTAGGGGTACATCT
ATAATAAGACTAGGCATTAGAGGGGATAAATTTTTATTAGAGGGTAATGG
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TGATCCTTAGTTCGGAACTCATTTATATATTTGATCATCAACTTGTCAAA
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TATAAAATATGACATAAATCACGTGCCATAGTTTTTGTAGTTGCAGCCTG
AATATGATTGTTTATTTTCTAAATCTGTTATCATTATTACTTTGATGGTG
AAGAGAGAACATATATATGTAATAATTAATCACTAGTGCGTGAACGACAA
ATAGTAACACGGAGGCTTTGTTGAGGAGTTATAATTGTAAGTCTTTGTTG
GACATGGAGTAGATTTGAGGATCGACATCGAAATAGTTACGCCTTTTGCT
CTTGTTGTTATATAAAGAGTGGGGTTATGTAGATTTTTACTTCATATTAC
AGCTGCTCGCAGAGAATTTATTCAAACTTTGTGACAGTTCAGCTGCTTTC
CTCTAAAACATTCTCCAAATTGTAAAGTTTACCACGTGCTCTTACAGTTT
TTTTATATTTTTACATACCAAAAATGCTTACGATTTACAGCTCTTAATAA
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AGACTCGTAATTATCTACAAAAATAACATTTCTATCTTAGAAAAAACGTA
TTATCACAAACCAAAGTCATTACTTTATAACCAGTGAGTGCATCTTCTAT
AATTTCTCAATTGAGAGTTTGTACTGACATCATAAATGAAGGAAACGCCA
TCTTGAGAGCTCATAGTTGATATTTTTACTACATAAGATAGACAAATTTA
CAATGAATCTTGATCAAACTCCATCAAATGGTTTAAAGAAGAAAAAACTA
ACCACTTGCATTTAATACTACTTAATTGCAAGGATAAGAATTGATATTTG
AATTAAATATGTACTCTAATTGACTAGATTTGTGAAATTATTACTTTTTA
ATCAATAAGGTACGCGAAGAGTAGGTTAATTAGATAAAAATATCAGAATT
TTTTCGTTGTAAAAGTTGATTTATTGTCTACGATGCGGAAAAATTGTTGC
ATAACTATTTAATGGGCTATTTTTAACACATGTTATTAGGATCTGTTATA
TAATAAAACTAAGCATTCGAGGGATATATTTTTGATAGAGGATAAAGTTT
TAAGTTATTTTATTTGTTGCTTCTATTTGGATATCCAATAGTTAACTATT
TTCCTTAATATGAACGCAAAAATGATTTTAATTCTTTTTAAACTTGGTTG
TTTAAGCACCCAAAATGGCCACCATCAACAATACTGACGTTACATGAAAA
CGCTCTATAGCTTAAGAATGTATTTTTTGTTGTGAATGTTAAATGTTCAT
TCCATCACCTTCTGTGTAATGTAAAGGATCGTAAATACATATTTTTTTAG
CTCCCTTAAGAATATCCGGTCAAAAAAATGTAAAGAAAATAAAAATATGT
ATACCTTCTAATGAAAAAAATACATTCATTCATATAATCAGTTTTTACGA
CCATTACCTGGAAGGAAAAATAGATTTTGTTAATCCGTTTGAAGAAAAAA
AATAAAAATCATTTACTGCGTTTTTGGTTGAATGTCTTTCCTATAGTCTA
TATATACCGTATATTCCATAAAGAATCCTTAATATGATTTTCTCCCAAGC
TGTTGTGTTTAAATATATCCTGGGCTTGAAGCTAAGATGTTGTTACAAGT
CAGTAATTCCTTGCCTAAAATGAGGTGTTAGATTAATCTACAATTATAAA
ACGTTTTCGCTGACGTAATAAATTGTAACAGAATATAAGGCGACGCCATT
TTAGCGACTCATAGCTGATATTTTTACTATAGGGTGGTAATTGAAGGCGT
ATAACGTTTGAAAGAGGATAAAGGTTTGAGTCCTTTTATTTTCTGTTCCT
TTTTGACATCCAATGGTTCATTATTTCTCATTATATTAATTATAAAAGGG
TATTTATTCCTATAACACTTGGTTATTTAGGGCCACAAAATGGGCGTTCA
CTGTAGTGACGCTGGTTTTTCTCGATTTCTCTCCTAATTAGATCCATTTG
TACATTATTTTTTGATTTGTTCCTAATATCATAGAGATATTATATCCATT
TTCTGTTGTTGTTTATTCTTCTTTTGAAATGCTATCGCCTATCAACACCA
CGACTCGATTAAATGATTTGTTCAAATTGAAATAAACAAAGTTTCTTGTT
GAGTCATTTATGTTGAACAAATATTGATTTGTATATTATGAACTAATACG
TTCATACATATTCGTAAGGCAATAGAGCGTTGTCTTGTGATCACACACAA
TACATTAGAGTGGGTCGAAAATCAGAAATTGAGAAATCCATTATATCGAA
ATTTGTAATACAATAAAAGACATTTCCAAGCCAAATATGAGGACGATTGA
AGATATTTATGGAAATTCAGTTGAATTTTATATGTATATTATTTGTGGAT
TTATTAAATATTTTTGTTCATTATCAATACCATTTATGATCAGAAATTTT
ATTCCTGGAGAAACGTAAGTGTAAAAAAATTATTTCCACAAATCTAATTT
AGATATTTTCTGTCGAATATTGTGTTATTTATGTCTTAATGTAATGCATC
AATCACAAATCACTTATATTTCAACTTTTTCTATTATTATTCATCAATAC
CTTAACAACAGTTACTCCTTATTCATCTTGTCATTACGATATAGTSAATG
GTTAAGTTAATGATCCTCACAAAAGTAATTAATTAGCGGGGGGGTCCATT
GAAATCTGAATGATTCAATAATTAATTCAGGTTGAAATTAATTCATATTT
CGTTATATTAAACCATAAACAATTATTTACGGAATAAAACGAACTTGAGC
TCTCTAGCTTCCGTAAAAGTCGAGAAAATGACACTTGAACGTGATCGATG
TATTTCCAATTTGTGCACTCCAAGTAGTTGGGTGTCTTCAGGGCCACCGT
CTACGGTATGACTATATGCAAGTCAGAATCGTTGGAGAGGAGGAAGGGCT
TTGTCATAAAGGCCAAAATGGATCCGGAGGAGTTAAAGAAAACAGTCCAT
GATGCCTATGCAAGAGATCTCAGGGCTTCACAACAGATTGTCCAAAAAGC
TATCCAAAATGTGGGTGGAAAGAGCATTGTGAGGGTGGAGAGACCACTTA
TGACACCAACAATTAAGGAAAAACTCCGTTACAAGACTCTTTTGAATGAG
TCTTTTTATTTTTTTAAGACTTTTGGCCCCTTACAGCCCTGATGCCTACC
CCGTCGACATGCACATTTTGTGTGCATGTCAAGGGGAATCACTCATCCAA
ACACCGAGTCCCTCAGTCATTGTAAACCAGCACTTGTACGGCATGATAGA
GGACCCACTACGGGTGCCTTGACTTCCGCCATCATTGCTGTAAAGGGCGG
CTACATTAATTATTAAGAGAGCTCAGACAGACATCCATTTATAGTATTTA
TTTTGTTGAAATCTGCTGTTAATTATTTATATCGTGTAGAAGTTTAAAGC
TCTAAGTATTTAGATTTTAATGACCCACAAGGTAAAGATGGATTAAATTC
CATGGAATGGCTTTATGATTATTAAAGATCTGAGACCTGCATTGAATATT
ACAAAAAGTTGATATAAATCCCTCATAACGACCCACCCTAATATACCTAC
ATATAATAGGGGGTATTATCTACATAATATATATATATATATATATACAT
GTTTATTATTTAAATATCACACAGGTTGAAAACAATTAAAGGAAATACTA
ATGTAGGTACATATTGTTATTGGGGTTCGGTCTGAAAATCATGATTTTTA
GTGGACCGATCCAACTCGGTCATTTAAAGAAGTTCAAAGGGRCTTAAAGA
AAAATTAGATCATACAAAAAAAAAAAAAAACCCAAGTCTGGAAAGGCCTC
ATTAACTCATTGAGCGTGAGGACTCACATAAATCTTATTTGTACGACTCA
TAAATGAGGATAAGGAAGAAAATCGGTCCATAGATTGAGACCGAAAAAGT
CGATCCACGATTTAAAAACGTTTAAACTTTGTTCTACGGTCTGAGATTAC
AGTGTTTGGATAGAAATATCGCTCCAAATCTTTATAATAAAAAAAGACCG
AACCGAAAAAAAATCGATCTTGGACCAAGTCTCAACCCTAGTCCTAAATA
TGCTATAWAGTTATTTAATATATGTACATTAAGAGTCNNACCTAGTTGTA
ATAATTAGTGTAAAGCATGGTGGTTAGATGGTATATAGATACTCCCTTTC
TTTGCCTCATATGCTATTGATATTCATTACTTATTATGTATAACATATTC
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TTTGAAAGGCTTGCAAAATCCCAGATCCATGTATATAATTGTACTAATGA
TGACACATCTTAAATTGATTATTTTCTGATTTTATGTTTATTACTTTATA
GGAGATAATAATTTATTATTCCATCTAAGCATACACAAGCTGTATACACC
CACATCATGTTGTTGCGTATATTCATAAATTAGATTTCAGGCCCGCACAA
CTTTTTGAGAATTGACCATATTTTGATTTCAATAAAAGGACATGTGGCCC
AATTAGTGTTTGTTTTAGGGTAGGGGAGGATCAAAATATATATCTAAATC
AGTGGTTCCTAACCTTTTTGGAAATATGAAAACTTACTAATTGAATAATT
ATTTGAATAAATCAAATATGAATAAACAATTCTTCAAATTGTCAGGGTTA
CTGTTATTGTCATGTTGATCTTCGTTTCTTGTTGTTGTTTTTTTTCAACA
TGCCCAAAACACACACGATTTTCATCACTAACCTTTTAATATAATGAGCA
TTATTGCCTCTTGAAATATTTTAATGGACCACAGAACCTATTAAATTAGC
CCTCATYAAAWATGTATTCATAAAACAAKACCATTAAATACACATTTACT
TCAAATTAAGGCAAAATTTAATTTTTCAAGGCCAATCTGGCAGTCCTGTA
TGATACAGACATTTTAGAAATGTTTTTAGAATTTTTTTTNNNAATCAGCT
TTGAAATATATGAACATAATTTATCCTTATCTTCAACGCCGAGGGAAAAT
AGACAAAAATAACAAAAAATGTTTGACCTTTTTCTGAAGGCCACGAGGCT
ATGAGAGAAAAAATAAGGTTATATTTGGAATTAAGGGATCAAATTCTATA
AAAAAATTTTTTACTGTTTTTGTACCATTTTTGCTGTTGGACAGTGTAAT
TTTACAAGAAATCCTTTCTTTGGGAAATATTTTTCAATTTAACAAGTAGT
GGTTTGCAATGCTGGCCACAGGTTGCACATCCCTGGTTTAGAGAATTTTC
GGATCTCTAGAGATTACTATAAACTACTACTCCTTGCTCGACAATACGTT
ATAATTTTCAATATCAGGGAGCAAGTATGAATGAACAAAAGTATTCATAT
TACCAACATATATAGTCATATTTCTATTGATGCTCACAGCAATTTAGCCA
ATATTCACAATATTTGTGAGATCAAATTTAATGTTTTTTTTTATTAGGAC
ACATCACTCAATTTGCATGTTCTTTTTCACATAAGCCATTCTTGTATATT
TTCAATCAAATACAATAAGCGGAAGGGATGCCGCCTTTTTTGCATTTAAC
TGTTCATTAAATCGAGTTTATAACTTAATAAAAATATGTTGTATTCTCCT
AGGTTGGTTGGGAGATCCCCTCAGTTTTATGTGTTCCTGCGTGGGCGTTG
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