EMLSAT00000001053, EMLSAT00000001053-696900 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000001053
Unique NameEMLSAT00000001053-696900
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s1173supercontigLSalAtl2s1173:43730..64482 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000001053 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000001053EMLSAG00000001053-683819Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000004656EMLSAE00000004656-713584Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000004657EMLSAE00000004657-713585Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000004658EMLSAE00000004658-713586Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000004659EMLSAE00000004659-713587Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000004660EMLSAE00000004660-713588Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000004661EMLSAE00000004661-713589Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto770465auto770465Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000001053EMLSAP00000001053Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000001053

>EMLSAP00000001053 ID=EMLSAP00000001053|Name=EMLSAP00000001053|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=861bp
MXGQGRYPFYLEPAVIIVISDGGKLTTQGTVQAELNLPMYSTVPGSELTR
EPFRWDQRLYALVLRMAGTPPASQDGHVATDNSPIDAMCEVTGGRSYMVT
SQRVLHQCIDSLVQKLQFGVVVHFEKIGQDPPILNEHLEEDDLIFRQDVV
QMDDEDALNTKGLTFSKENNSNSRPHTPNPILSPSNISWHNCRRLIYVPR
SAQKGFTLGFWPLPESFLPDSNSPTLVKRSAHPNVKFTCSSQEPMIIDNL
PFDKYELEPSPLTLYILARKQPKISWQVFIQGSGKGGPQDKGHPFGYLKA
STNLLTVNLFVLPYNYPILLPLLDELFRQHRLKPTNEWKSQFNNYLKTMP
SYYAGPLRKALTRMGAGNLALSLIPDSLDNCLSYTVSTYLKRLKNQAKLE
YDKTLSSTPVQRNRIENLKIVPRSPLKKELLLSSFPQDKVVHSRDQFTDF
SGYALQCKDSKTCHYNRYRNPFDVPRHDLLDQIVRMKSNFLQSTQNAKLV
DDDSKHSLPIGQMGNYQDYLKRMPTPLKEIENTPVRQHMFGNPFKINKNI
MLDEVVDEIALAGGPSVNSGGIHQATNSVLQSRKRLIDFSNSPIPKKLKK
GPLPRDFIYRSRSYSLSLSTNHNVDYSNLYIENQSFLINDASVESVCSTN
STNNSLVIQSNHVSNTTPEMIVELPEVSDPPQLSIPENTLMPSVVLINGI
CTENELSCNTIEGSKVRYEIKEENCDKSVSILFESPITNFPEKFNTSYDG
CEDQYSRYLSVTTLDPFSDVSGDCHTLFKLNNEELRSIKLRNQNIRQIIC
KEVKRPGKNHDRLYKMLKEDLHGPSQIRRDYIKEVIQEAFRFKRKSLAEY
LLLKMDELVRI
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mRNA from alignment at LSalAtl2s1173:43730..64482+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000001053-696900 ID=EMLSAT00000001053-696900|Name=EMLSAT00000001053|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=20753bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1173:43730..64482+ (Lepeophtheirus salmonis)
GCCGTGTCAATGAGTTCTATAGCATTTGGAGTGGTACCAGATCTACTGCG TAGACTCATTCGTGGATTTAACTACATTTTAAGGTAAAAATGAAGTGACA GGTTCTTATTCAATTTATTTTATTCATCAATCCATAAATTCTTATATCAA TAACAATACATCATTGCTTCGCCTTTATTTATAAGTTACGTAGCGTAATG CCCATCTCCACCTAGAACATTTTTTGATTAAAATAGATGCTTAGATTGAT TGTTTCTGACATACATACAATCTTTAATAAATATTTATTTCGAATCCCAT GTCAAAAAAATGGTTGAACAATGAGTTTTAGCAGGTTATTTTATACGATA AATTGAAGGATCGACTTTAAAGGAGTATGAGCATGACGTTGGAATAAATA TCTTGGGAAGTGATTTTCGGATAACTTCTAAAATACCGCGAAATAGAGTA ATGAAAAAAAATGGAATATTTAAGTAGGTGAATCATATTTAACTATTAAT ATATTTATTATATCAACATTGAACAACAAACAGAAACATATACGAAGTAA AAACTACGTATATACTTGGTTAAAGAAGCCAGTCAGAACTCGTGAGTGTA TACGTCTGAAATTCTCTATTTTATTTGTTTTTCTTTTCATTTCTTTTCTT TTCTTTTCTTTTCTTTTGTGTTAGAATTGAGTTGTTTTGATATTTAAAGC ACTTGAGGTGATCTGGACTGAATCGTAAAGAGGATTGAATTGGCAATTGG TCTTGGCTTCTGCTTGGAATTTTGGGGTGAAGTATCTGGATAGAGGATAC TAGTGGGGATGACAATAATAGTGTTTTTAGTGGACACTTCAGCCTCAATG GAGCAGAAGGCGKATGTGTCTGGRCGTTGTTCCTTGCTGGATGTAGCTAA AGGAGCTGTAGAGTTCTTCGTGAAGATGCGGCAAAAATCTTGCGAGTCTC GTGGGGATCGCTATATGCTGCTTACGTTTGAAGATTACCCTAGGAATATC AAAGCAGGTTGGAAAGAGAATCTTCAAACATTTATGAGTGAATTAAAGAA TTTGGTGGCCTCTGGCATGACAACAATGGGCTCCGCTTTGAAGCAAGTTT TCGACATTCTCAACATGAACCGAATGCAAACCGGGATAGGTAATGACGTA ATACTTGATGCGGCATCTTTGGAAATCATTCCCCATTTCTCTTGTTGTCC CTAGATATGTAKGGACAAGGGCGCTACCCTTTTTATTTAGAGCCTGCCGT AATTATTGTCATCTCGGACGGGGGGAAACTCACAACTCAAGGCACTGTTC AGGCAGAGCTGAATTTGCCTATGTATTCTACTGTACCTGGATCAGAGCTC ACTCGTGAGCCTTTTCGTTGGGATCAAAGGCTTTATGCGCTTGTTCTTCG TATGGCTGGKACACCGCCAGCTTCCCAGGATGGACACGTTGCCACTGATA ACAGTCCAATAGATGCTATGTGTGAAGTTACAGGTGGCCGTTCCTACATG GTAACTTCACAGAGAGTTCTTCATCAATGCATTGATAGCTTAGTTCAAAA ACTACAGTTTGGAGTGGTTGTCCATTTCGAAAAAATTGGTCAAGATCCGC CTATTCTCAATGAACACCTTGAGGAAGATGATCTCATCTTTAGGTAACAA ATTTAATATATTTCTACTTACTTTTAAATCTTATAGAGCGCTTTCTCTGA CGTCAAAGATTTCATAATAAACGATGTGTTAAAACTTTAGACGAATATTT ATAAATGGAGATAATTTACTTCTACTTGAATTATTTAAGCAGTACTGTTT TCGGTACAGTTTTTTCAAAATGATTCTTTTTCTCATGGTTCTTCTCTGCA GGATCAAAATTTTCCTTATTTTCATAAATTAATCAATACAATATTGATAT GTATTTTAACTAGCCTAACCTAACTTAGCTTCCACGCACCGTATATGTTA CCTATTTAACACATTATAATTTTACTGTTTTGAACAGTGTCTACCTTAAC TATTGCAAGGTACTTGTCAAACCTGTTTGCACGGGTCCCAAATATCTATC TGTGTAGGGATGAGGATAATAACTTAGGCCAGAGGCGGTTTTAGCGTGAG CGCCCGGTAAATTTTTTTATTTGATAATGGAATAAAATTCGTTTTGGCCA TATATATCTTTTTCAATCATTCAATCGATTTATTGACTAACTTATATTCT AAATCTATATTTATTAAGCAAAGTTTGTCTGTGGAGGAATAGTTTTTACG AACAACTTAGTTTAACTAAAGCTCAGTGAGTCATATTAAATAATAGAGTT TGTGTGTGTCCCTAAAGGATGTCCACAACGTTGGACCTTGGAACTTGGTA AAGCTAATACGGGAGTGCCTTATTCTATACCCAAAGCACACCAAAAAAAA AAAAAGCTGAAGGAGACAATATTGAGTGTTGAGTTATAAATCAATGGCTC CTCAAAAAGAACTATACGAATAATTGTAATCAAATTGGTGAATATTGTAT GGCATGGATAAAACAAAGTTTGTAGAAATTTGTCTGGAGATTCGTTTGCA TATAAATTTGACACATACAAATTGATGTATAACTGAAAAAGCTGTATTTT CAGAGTAATTTTTTTAAAATCAAACGTTAATTTTTACCAGGTTTCTTTTT TTTCTTTTTTAAACCATCCAGCGCAGGGCCAAATGGAAGTGCGGTCACAC AGGTTTTGAAAATATCAATTCGAGCTTAAAGTGAGTCTTAAAAAATGTTT CAGGTATGTCAAAGCATTGCTGTCATAACTGTCTTCCTATTTTGAAGCTG GTCCATGCATATCTGTTTTATTCCAGAGTGAGCTTTTTTCATTTAAGGAT 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