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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s1175 | supercontig | LSalAtl2s1175:28010..41078 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000001057 >EMLSAP00000001057 ID=EMLSAP00000001057|Name=EMLSAP00000001057|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=601bp
VGSYIIHISTIAVFFKIQTLYTKQLHFTSSKKGIVVNGFVNVVISTLEKR FHLSSRETGIIASSYDFGSTLCIHCTGPCHHGYGILNISLPHFITGYYIE GTVDNSSNSTLASFNYHQICQFRHSENFSKPKCGSHESLGNYKYFFIFGQ ILQGIGASPLITLGNTLIDESVGPKLAPLYIGIFSTFFVIGPAVGFVAGG QLLNIYTDFYQLSYEEIAQIPSTLWVGSWWLGFTIMAVVSWICAALVSRY PSIFPGSPPHDSKSFDEFSTIKKLPKALKTLFINPTYMLLCIGGGIDGFW LSGLTTFLPKYVESQYFISSAYAATIVGIVAVPSGGLGTFMGGWFTKKLK LNRSGVIKLYLICQVIGIPLGFSFLLICQNTPFAGVTTPYINDTKGSIVL SGLNAPCNYNCSCSKSNYDPICGADGNLYYNPCYAGCGLQSNDTFFNNCQ CIPHQSTATKHIDSCKVDSTCSYLVPFILLMGVNIFITFMSSMSTIFATL RSVEPVHKSLALGLSTIILRLIGSIPGPMIFGYMIDRECTLWKSSNCEGE SGNCLIYENSTMSASLMTLYFVFKCLNLLSYGLALFFSKRSQINEDGKLK E back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1175:28010..41078+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000001057-696904 ID=EMLSAT00000001057-696904|Name=EMLSAT00000001057|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=13069bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1175:28010..41078+ (Lepeophtheirus salmonis) GTAGGCTCATACATCATTCATATATCTACCATCGCCGTCTTTTTTAAAAT
ACAGACATTGTATGTATATTTGTACCCTCGACAAAAGTGAAGGCACTATT
TATACCTGTTCAGGAAATAATGATTATTATTTTTGTGTAAAGTATATAAT
TATTAAAGGAGTTAGATATGTTTATGAAATCGACTAGTTCAGAGTGATTG
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TTACCATTGTTCTTACATAATTGTGGCCTATATAAAATATTTATTATTCT
TAAACAAATTGAATCGTAGAAACCCGAGATTGAGTGGGGATGACGTCACA
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CCTTACGGTATTCTTAACCTTTATTACTAAATAAAGGTTGTTTGTCTTTT
TCAATCACTGACAAAGATGTAATGTATAAACCGAAAGATGAGTTTGTAGA
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TTTACCGTGTCCAGTCGATACACTTTTTGTTTGTGGCTCGGAGCTGGMTT
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ATTTCAATACTTTATATTTAGTGTTTCAATCATCCAATTTAAGCCAAATA
TTCCCTGTTCTGTTTGATAACTTGTTGTGATGGAGAATCCAATTTCATAA
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ACCCAATGCGCGATGGCCATAGATAGGAACAGATGGTAGTCCCTTGTTGC
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AGAGCTTCTGGCGCGTCATCAAAGATGTGGGGGCCTGGCGTTATCTTGAT
GATGTRTTGTTGTCTCCAATTGACCAATWCTAGCCACTTTTGTTCGATCG
ACAGCTTCGAACGGCCAAGTTATCCACATTAGAGGCAGAATTGAGGGGAA
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CTGATGTGACCAATAATGAACAAAATGTACTCAGTTAAAAAAGAGGCGAA
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AAAGCGATAAGTTATATTTTTATGGGTTATTGCTTATCATACTCATGAGT
AGATTCCAATAAAATATTATTTATTTTAGTAACAAGCAGAAGTGAGAGCG
ATATAGATTTTAAGTCCAACTTAATCTAAAAAGATATATTTTCTGATCTC
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TTTTGAACAATAGTTACTACAATCCATGTCCTAGGTCTCGTGTTTTACGC
CACCAATTGATCTTTATTTTAGATCCCACTCATAGTAAACCAGCCCTAGA
GACAGCCCTTTCTGTGAATCAATCCAAGTAAACTTATTATTGGTACCTTT
TTGCCAATATGAAGCATAGCAATAGTTGATTAGTATAAGTGACACTTTAT
TTTGAAGTTTATTTAATTTTAATAACATATTTATACTAATATTCCTTTCA
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CAAATATATAAACCAACTTTTGTCAAGTCGTTGTAATATTTTAATGATTT
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AAGGGTAATACTCCGATTCAGTGCCACATTTCGACATAAAATAACTATAT
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ATCTTTTTATTTTTTCTTCAAGTGCTTTATATCCTAACCGAAGTTGTAGA
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TCAGTTTAGTTTTTCATATTTATTAAGAAATTTAATAAAATAAGCTGGTT
AGGTCGCGTTAAATACAGATTACAATAATATTCAATGCAAAATAATTTAA
AATCTTATTGAGTTTTTAAGTAATGATATTTAATAAAATCTAAAAATAAT
TTAGTTGTTAGGGGCTTAAAACAAGTTTAAAGATGCTTCATATTCAAAAT
AATTGATTAATTGATAGATATAAACGATTTAAGTTTTTTCTTCAGAATAT
TATTGTGAAATATATTAACACAACCTAACTAGCTTATATAATTTAATTTC
ATATTATATATTATAAACTAAATTGGCCAAAAATGAATTTAAATCACACT
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ACATTTTTTATTACCTGTAATCAATAATTAATTTTTCTAATACTGAATGT
TTGAATCAATTTGTTATTTACTCTGATTTAAATCTATATAGTTATTCCAT
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ATTTTCTAGATTTTTGTTTTTCGGCACTCCCTAAGACACAAAGTTCATAC
TGTTTAAATTAAATTAAACTTTAAACCTATAACCAGTTTTCCCACAGATA
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TCGAGTTTAAGTTCAAAATTAAAAAAAAAGAAAATATACGAAATAATTTT
ATATGATTTTGAATGATTAACTTTCACTGAAAATTATTGTACATTAAGAA
ATACTACTACTTAAGTTATAACTCATTGATTATAAACTGAAGAAAGTCAA
TTCCAGAAATCTCTTGAGAGCCCTTCTCTGGCTAAAAAAACATGCTTGAT
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GTCTTAACACTTTGAATTTTAAGCTTCAACAAGATATAATTTATTAACTA
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TTGCAGGCCTTTTGGCATCAGGACTGTTAAGGGTAGAATATTTATATAAA
AAAAGTTCGAAGAACTCAAAGGGCACTCATAAAAAGTGTGTTGCAACAAA
GAAGATGTGGTTCTTTCACTGTTGATGTCAAAAGTGACCTCTCCATCCTC
ACCCTGTAAGGCCACGTGATTTTATGTTTCTCACATTTGTTCACATATTA
CATAATTGACTTAAAAAAACGTATTTGAAAATGAGGATTTTATAAGAAAA
AATATTTTGTTCTTCTAAACATCCTGAACATTTATTTAAAACTGCACTTT
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GTGTGATAATGGTAATGATTTTAAGACTTATTTGAGATTACTTTCTTCAA
GAATGTTTGATTTATTTTATAAAATTTATACTGCAGATAAGAGTAGCCAG
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TGGATTAATTAACTCTTTTTTAATACTGCCTGTATCATTAGAGGTTTCCT
AAAATTCATGAACACATTCTTCAGCGCGAACGGAATTTTTTTTAAGGATT
TCTTTTTTTTAAAAAAGGTTGTCATTCGGGGAAATTATGCAGCAAAGTAA
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TTAAAAAAGAGTGCGTTCTCCAGTTATCTCTCTAGTACTCTCTGACATAT
GTGGACCCTTCTCACTCTTAAATCATAAATAATATAATTATCAAAGTTTC
TTAATATACACCGTTTTATATTTCAACTTGAGTCACAGTCTATCATTACT
ATTGTAATAAAGTGTGTAAGTGTGTATATTATATTATAATGAGATCGAAA
CACTTATATGTCATCATTAACTTCCGTTGGGCTGCAAATAATAAATATAT
GTATACTATATACAACATACAAAAGATAATTTTCATGAATTATGTATATT
GAATGCCTCTAAATGATTTAGTTCTGTACACATACAAAGTTTATGAATAC
AGTATCCCTGTGTTCTTTGATTTGAATGAAGATTACTCTAATCTCATGGA
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AATTGGGTATTTTGACAACTCATACTTAGCATATCAAGTAAAATTACCAT
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AGGGGTTTTGTAACGGAAGGTTAATTAAAAAAAATAGACTTAATAAATTA
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TTTACTATCATGGCAGTTGTGTCTTGGATATGTGCAGCACTCGTGAGTCG
GTATCCATCCATTTTYCCTGGCTCTCCGCCACATGATTCAAAAAGCTTTG
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ATTAATCCTACATATATGCTGTTATGTATTGGAGGAGGAATTGACGGATT
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TTCGCATATTTCTGAAAATCAAAGTATCTTACTTATGTGCATATACTTTA
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TCTAATTTGTCAAAATACCCCGTTTGCTGGAGTAACAACCCCCTATATCA
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TGGAAATCTATATTACAATCCTTGTTATGCAGGCTGCGGTCTTCAGTCTA
ATGACACTTTTTTCAATAACTGCCAGTGTATACCTCATCAAAGTACTGCT
ACAAAACATATCGATTCCTGCAAAGTTGATTCCACTTGTAGCTATCTAGT
TCCTTTTATCTTACTCATGGGTGTCAACATTTTTATTACTTTTATGTCAT
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CCTTTGGAAATCCAGCAATTGTGAAGGAGAGAGTGGAAATTGCTTAATCT
ATGAAAACTCAACTATGAGTGCAAGTTTAATGACTTTGTATTTTGTATTT
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GTAGTTTGAATTTTAGAATGTAATAATACTTCTAAGCAAAATTAACCGGT
AACAATGATGAAATGCCCATGGACTCCAATAATTATTTTACAACACAAAA
ATAAGAGTATGGCATGTTGAAATATAGGAATCCCAACGATACAACCATCC
TTTATAAAATCCAGGCTCGTTTCCCCCTGATCTATTTTGCTCCTTGAAGT
AAACAGAGATCAACTGACCACTATAGGTCAATGATTCCCAGATGCCCAGA
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TATTTATATTTTATGCCCATATCTAAATTAATAAATTGGTTATCGATTCA
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GCAGCAGATCATACAGTCTTTAAAAAAGCAAAACCTAATATTAATAAATG
TACCTGAAAAAGATAGTTTTATATTCTATAAGAATATATTCTAATTAATG
TATCCTATATGAAGAAAATAGATGAATTTTAAATTATTTGTATATATAAA
TAAATAATTCTATATTTTTGTATTCAACACAATTAATAAAAATCCTAAAA
CTATTTAAGTACGTGAATCAAATTATTATCAACAAGAATTATTGCAGGGA
GCAATGAACCTAAAGAGTCTTTCCTGTTCCTCCATAGATAACCAAGTCCG
TATACTTCCATCGTATTCATCTGACCCATCACAGCAATCACAAATACCAT
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ACGCCCATTGAGCAGGCATTTGTGGAAGGTTCATCAAACCCAGTGCTCTC
ACAATCACAGTAATCATCATTGAGTTTCGCGACTGTAAAATATGTTCCAT
CACCACAAGGTATGAGACCGAATCTAGACTCAAATAAAAGAGGATTATAT
TATTTGAAGGAAGTAAAATTTTGAATATATGAATGAATTACTTGTTGGGG
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GGATTTTTGTGGTGTTTTTTTAATACTTGGAGCTGATACGGGGATTTTAT
GCTCATCTACGGGAAATTGGAAGAAGATCTCGAAGAATACTAGAAATGAG
ATTAGAAGGGATCCTGTACAAACCACGAAAAATAACTGTTGACGACTAAG
ATTTCTAAAACGGAGAAATTGCGACAAGTAACAACAAGATAAATAGCAAT
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ATGAGGTAACCTAGCCTTAAAACACACTTTAAAAAGGAGAAATTGAATCA
TATTTGCAGCTTACCTACGTACACAATAAGGCACTTGACTATACAACTTT
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