EMLSAT00000001067, EMLSAT00000001067-696914 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000001067
Unique NameEMLSAT00000001067-696914
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s1178supercontigLSalAtl2s1178:5502..31635 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000001067 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000001067EMLSAG00000001067-683833Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000004705EMLSAE00000004705-713633Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000004706EMLSAE00000004706-713634Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000004707EMLSAE00000004707-713635Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000004708EMLSAE00000004708-713636Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto768588auto768588Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000001067EMLSAP00000001067Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000001067

>EMLSAP00000001067 ID=EMLSAP00000001067|Name=EMLSAP00000001067|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=372bp
MNDTFFNVSERCGSMDEDYFNVWSTWQWWCEGVLFTGVGIIGLVANLVSI
VVLSTQDMRKHTFNQLLIALAIFDLLFILVSIPVYAFRLFTIFVGNQVFS
LLYIYFLYPMSPVTLCASIYMTLAITVERYLAVCKPILYRNLNVTMTSTR
RVALYVTPVCIVSICLNIPKFMENQAHSTDNSTEIQVSDMRINPTFMLYY
TISQIFHPTLTTGILPMAALXLLNTSIFLGIRKTQLHRRIRASNSLAHGN
SSSSEPRTSLSSSETNLAVILIGIVIMHVICHTLRVFLAALALHFIKDTL
DCMQHKGEYVPPLWTMCAESLSSLMIMISFSGNFLIYCSASKHFKAVLTR
FCSYCRSGXXQGGSSSFSSSHQ
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mRNA from alignment at LSalAtl2s1178:5502..31635-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000001067-696914 ID=EMLSAT00000001067-696914|Name=EMLSAT00000001067|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=26134bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1178:5502..31635- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGAATGATACATTTTTCAACGTGAGTGAGCGATGCGGCTCCATGGATGA AGATTACTTCAACGTATGGAGCACATGGCAATGGTGGTGCGAAGGGGTTC TCTTTACAGGGGTTGGGATCATTGGTCTCGTGGCAAATCTTGTTTCGATT GTGGTTCTTTCCACGCAAGATATGCGGAAACACACATTTAATCAGCTCCT TATTGCCCTTGCAATCTTTGATCTCCTCTTCATCCTTGTTTCGATCCCGG TGTATGCATTTCGTTTATTTACTATATTCGTGGGAAATCAGGTAAGGTTG TCTGATTTTTAAAACTGTTTGCCCACTTTTGTGACTACGTTCATACATAT ATTCAAGGACATGATACAAAAGAATATATATATAATGTATATATACAAAA GTTTTTATAAATAAAGCATAGAAAATAAAATATTTACTGTTGTGGAAATA TTGTAAAGATGTTGTATGAATAATTCAGTATAGAGTTGGTACATTGTATA AAAAAATTCTATTAAATAAAGAATTTCCTTATGGTCAAGATTTAAAAAAT AATTCCTTCCTATTAATTATTTAAATGTATAACCTTGTATCTATTTTAAA TCTACACTCAGTGATGATATACTTTTTGAATACCCTAATAAAAAGAAAGA TATATTAAAATATATCCCCATAAAATTATCAACGATTGAAAAAGACCAAA GTGCAGAGGATTTATTTTTCAAATATTGTCTTCGTAAATGCACTAGTATC CCAAATATTAACACAAAGAAATTTACAAATACTTTGGACTACAAATATAC ACTTACTAAAACATGATTTAAGTAGAATATTTTTAGGGATTACCTACTTT TTTAAGTTTTTGACAAACTAGATAGTATATAGCCAAATCATTATATAATT ATTCTATGAAGAAGAAAATAGATTTTGAACTTGATTAACAAATTCAAATC CGAGGGTATAACCGTAAAAATCAATTTTATTTTTTTCCTTATATTGAAAT AGTGCGTTTCTGATTGTTATTACGCCAAGAAAAATTAAAATGATCTTTAT GGCCATAAATTTCTGCTTGTATAGTCTTTAAACTGTATTTTTGAAGGGAA AGAAAAAGTTACAAATTCTTTATGATTTAGTGTTATTCTTTGCCTTGAAA AAAAAAAAAAAAAATAATGGAAAAAAGCATAAATTATAGTTGTAATGTAC ATATTTGCATATTTAAAAAAATATATTTTTTGATCATTTGGGTATTTTTT TCGGAATCGATGAAAATACCCAGTAAGTACAAAAAAATAGAACCTTTTCT AACATGTCTAGTATATTCCTCACTTTTGATCACAATGATAAAAATCATAG TTTGTCTTAAAATAAAAACATACTTACAACTTCATGATAATAAAAAATTA TGCCTTCTTTTTAATTTAGTTAAGATTTGTTGATTACAAAAATACTATTA TCTGTTTTCAATAAACTATCAAGGTTTATTGAAAGTACATATAAAAAGTG TCTTTATGTAGGGAACAAAAGTAAAAACTTGGGGTTATAAAGATAATTTT TATATTGATCGAGGTTAAATCAATCAAAAACACAGCATCTAGGTTTTTGG ATTTTTAAAAAGTGTTATAGACTAAAATTGATTTTTTTTCTTCCGAATTT GAATATTGAGAAGTTAAAGTTTAAGTTCAATATGTAAAAAAATATATGTC TAGATAGAGCCAAAAAATAAGGAATGTATTGAGCTGATTATTAAATACTA CACTTATAATGGCCCAATTTTTTCTGTCTAGTATCAAGACATCTTTGAGG GATCAGTAAATTCGGTTTCAGCTCAACTTTATGCTTTACAGTGTACATTT CTGTAAAAAAACAAACCAAATTCAATATAGAAATTATAGCAGTGTAGCGT TATACATTTGCTTAAACTATTAGTTCTATCACTTTATGGATATGGATTTT TGCTTTTAATATGTTATTAAATCATAGAATATCCTATCTATATTTTAAAT ATGAACCAATCAAAGTATATATTGATTAGTTTTGAAACTATTTTCTATTT TTTTGTTTTGGTCTTAAGAAATTTTTCAGACTGATTTGGACTGATATATC GAAATTCAAATCGTAGATCTGATTTATGCTACTTTGTGGGGTTCTAAGAG AATTTAAAATGATAATATGTTGAATAGGCATTACTCATAGGCTATACCTA TATATTATATTATATAAATTAATGTGCTTCCTTTAAATTTTGTTTTTTGT TTTTTATTAATCTTCTTGATTAATTATCACTATAGAAACATAACACAATA GTGTATGGCTCAAATGTAGTTCTAATCTTACCATTTTAGATCTTTGAATA ATAAACAAACTCAACAGGAATTAAAATAAAAAGTGCTAATTACTCTTACT CTAGTGGTAACAATCATGGAAGAAGTGTAATCAGTATTAAAGAAAAAGAG TTTGCAAGTTCAAAATAGATGATAAACGATTTACTTCAATTAGAAATAAA TTATATAAAGGAAGGAAGTTATAATTAGTGAAAGAAAAATGGTTAATATA ATTATAACAGTTCTCAATACTGGAGCAGATGTTGCTGTTGAAGGATTAGA ATTTGTTTGAAAGATTGGATTAAATAAGGAAATGGCGAAAAACTAGGAAG AAGAGAAGATATTATTGGAAAGTAAAGAATTACTTTACCATTAAATTTAC TTCAAAATATAAGTATAAAAATTTAATGACGATCTGTTTTTAGATTGTGG ATTATTTGACATTACTTTTGCTTCAAATAAAAAAATGGATCAAAAATAAT ATCGTCTTTTAACTTTACACCTGATGAGAAAAAATACCGTTCAATCTCAG CTTTAGAAATGTAATGGGTACTCTCTTCCAGCAGACACAACAARTAAACG TTGGTTTGCTGGCTTCAAACGTTGTCTTAGAGACACGAATAATGCAAAAC ATAGTTGACGTCCAAATGAAGTGGTAACAATAGAAAACATAAAAAAAAAT ACACATAATCGTTTTGAATTATCAAAAAGTGAAATAGCGAGAACAAAAAA CGCGGCGCTGGCGTTACTCTGCATGGAGATTATATTGATGAATAAAACCA AATTGGGACAAAAACAAAGTGTTTTTATGGTTAATCCCGGGACTTATCAG TTATGTTTTATTTTGTGATAAGAAAGAATGGAAAATTAGGGAGGGGCTAT GAATGAAGATAAGCATTACAGAAGATTACTAGTCATACGTAATGCAAGAA TTAACCATTTGTAAAGTTGTGATAAAGTAGTAGATTGGCGCCATCCACTT GTAGTTGTATCCAAACCTAATGTAAAAGTGAGAGTATGTATGGATCTAAA AAAATTGAAGGATCAAATTTAGAGGAATATACATCCCATTAGACTACCTT GGGACATAGTATCAAATACTTCAACAAACATTGAGTTTTTACAGCATTGG ATGCAAAACAAGGATATTGGCTCATGAAACAGGGGAAAAATACAAGAGAA ATGACTCGATTCATGACAGCTAGTGTGGAATATATATTTCCTTAATAAAG CCCCGATGGGATTCATTACAATGGAAGACGCAAATTATTTTCGTGGAAAT GAGGTAATGGAAGGTTTATCAATTACTTATTGTGTTGTAGACAACTTCCT CGCTTTATCACACAAACTTTCGAATAACATATTAAAAATGTCCATAGAAT TGTATTAAGATGTAGGGTAAACCAAATTACAATAAATCCATCCCAAATTG TATTTGCACAACCTAAATTAAAATATTTTATTCATATTCTATTCAAGAAT 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GTACAAATTTGAACACAATAGAGGCCTGTGTCCTAGTTACGAAATTACTT TTTAACCGACTTATTGTATGGACCAACTTGCGAATACATTTAAATACCAG TGCCAGATACTAATAAGTTTTTGGACTTTGTCTGATAATATTGTCCGAAA AAAAGTTGCAATAAATAATATGGATACCGTCTTGAGTTTTCTATCATACA AAGATAATCGTTATTTAGTTATTTCAATAAAAGAAAATTTGATTTTTAAT TCTAATTATAACAAGAAACATGATATCATTTTTGTAATAGACATATTATT TATATTTATCTACAAATAAATGAAACACAAATATAAAGATTCAGGTCTTT TATTCTAATTAAAACATATTAGAAATTGTTGATCAATTAAAGAATTATAA GTGTTTATATTTTTGGGGTACACTGTATAAGTTAGTACACATGTTTCTCT TTTTATCTCAAAATTGGAGACTTATATGTCGAAAGTAAAACTTCTATTAT TACCTTGTAATAATAAGGAAATAACTTCACTATGTGAAGTGAAGCGATGT AAAGTATATATTATTGCAGTAGGAGATGTGGGATTTTAACTTTTTCGAGA TATTTGTACAATTAGCACTTTGGAGGATAATGAAAGTAGATGGAAGGTTT CATTATGTGGAGAAAGTTGTAAACATGTCTCTTTTAGCTAGATTATTCGA GAGGGGGAAGGGACTCGGAGTCGATTTGGGGACTGAGGGATGAGGCCGGG GGAGATCACATCTCATTATATAAGGCACTACACTTTTTCTTGTATCTTGG GCTCATTCCTCTATTTATTATCTTATTACTAAAAGGCTGGGATAACTAAA TGTCAGCTGGCCTCTCATACGGTCTCCAATTTTGAGATAGAAAAAGAGAA AGTATTACATGTGGGTAAATGTATATAGTGTACTCCTCTTTATATAAATG CAGGGTGATTAAGCTAATAGAAAAAAAAACAAAAAAAAACAACACTAAAT TTTTCATATTCAAAGACGAAATTTTAAACGAATTTTTTGAAATATTAAAA TAATATAAGAAGTATGTCCTAATTTCATAGGAGAGCTTCTGAATGGTAGA CAACTTATCTATTAAAGTTTCGCTCGATTATGATTCTAAGAGCAGCTCCA TCATGGGAAAATCAACCTTTATTACTTCAGAAGGAAATACCACTTATGTA ATGTTTTGTCGGTCCTCATTTAGGACCGAGGACCACGGTAAAGYCCAGTC CTGTCCCATCCAGTCCATTCCCACTTGTCAGCCGTTGAAGAAGGTAAAAT CGATCCCTCGCCACATCAATGTGTGTGTTTTTCCTCCTTTTAATTATTCC CTTAAATAATAATAACTTATGTAACCAAGTAACGATAATATGTTCGTATT ATATTGTATTATAATGAAAAATATTATATTTTATGCAAAATATGTGTGAT AATCTTAATGCGTATTAAATATATCTTATTTGGCTTAATAAACCATCGAT ATTTTTACGAAAAATTCCAAGGACCGACAGTTAAGGATTGGGGTCCCAGA GACTGATGGTCCTAAGGACCAATAGGACTGGACTGGACCGAATAAGTAAG GACCGACACAACACTACACTTAAGCGCTAGTTTTTATGTGTCTACAGTTT GAGGAAAACAGATCTTCGAATATTACCATACACCCAACTTTTATGAAATA AGGAACAACGGTCCAATAATAAGGGATATACACTAAATGTATATGCTATG GGAAAAAAGTAGTACTGATCTATATAGAAGAATTGTACATGATAGCTGTT TTCGTAAGTCGGGTTTTATAAAATTGAGAAAATTGTATGGAGTTTTAAAT ATAAATACAGGGAGGGATATCTTCTTCTAAAAGTTTATATCTAAAGTCAC 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TACATCAAACAATGGCAGGCATTGGAATCACTTAGCCCAATCTTATCTTG ACAATTCCTTTAAATAAAAAAAAACAAACACACACACACACACAAATGGA AAGTTGTTTTATTTGGGTGTCAAAAATATAGGTCATTTTTATAAAAATGT CCCTTCTCTTTAGATTTGATTCCAGCACTACATACTTCTTTTGTGTCAGT CATAATTTAGAACTGAAGACTACAGTCCTGCATATTGGTCCCAAAATTTA TAAAGTTCAGTCCTTTATGACGTCACTCTAGTACTGAGAGTACCATTCCC AAGGACCAATTCTAAGATTGGACTGGACTGAATAAATAAAGACAAATACA ATACTACTCCTCACAACTAATCCAAGGAGAGGAGATCAATATAGTTTATT AATTGCAATAGGATTTAAGCAAAATAGTTCAAACTATATGCACATTTTTT CAACTTTCTGTTAGTTAACTGGGATATTATTCACTCCAGCAACAAAAACC GAATATTGTAGCTTTTATTTTATATAATTAAGCAAATGTTTTTAATATAA GAATAATTAATTACATATTGTTTATAGCCCGAACTCGTGTTGTTATCCCT TAGTTAATGAACTTTTTATAACGTAATTAGTGAACTGGGTAAAAAATAAA AAGTATTTAATTAGATTATAATCAATTGAACAAATATAATAATTGGTTGA ATTAAATTTTGTTTAATTTTTTAACCATACCATTCATTTTGCATTAGTAA ATATTATTTAAAACTATTCAAATACTTCATTCAATATAAAATATTGAGAA AACACAAAATACATTATTTTTAAATAATGTTATTAATATGAGTTTGGTGT TTTACAGGGATTGACTTTGTTATTCTTATAATAAAACACAAAATTGAAGA AAATAAAAAATAAAAATAAATAATAATTGAAGAAATCAAAAAGAAAAAGA AAAGAACGACTTCAAAGTAAAAATGTTCATCAAATACACTAAACCTCGTT TAGTAATAGCTAAATATACAAATAAGTCCTTCATAGAAGATTATCTACAT AAATTAAGAATGATTCATAATCTGATTTAATGTTTGGGGAGCATACTGCA ATAAAATGTAGATTTGAACAAATAAGAAGCATTTAGAGTATAAATATAGG GATATAAAATATCCCAGTTCACTAATTAAGGGTCAATATGATTTTACAAA AGGCCATTTTCTCGATGTCTTATATTTATAAAACTATTTTTAGGATTTTA ACAGAGATTTACTAGTGCNAGTATGGAAGGAACATTTTTTTCTTAAATGC TACAAAATTTAAATGATGTAGTCGTTCAACAGTTTGTAATGTAACTAGAT GATTAAGTGGTCCAATATTTGTATTACTCATTGTTTTACACTGAAATAAA AGTTTTGGGATGTCTCTATATTGTTCCCTCAACACATCTATTGGATTAAT CCTAGAAGTTTGATCTTTCTCGCAATAAACCTGAAGAAATGTTTTTATCG TTTTCTGCCATCAGTTATTATCGAATTGTTCGTTCCTTTCTCGTACAAAA TGTTTTTATTAAAAACTTCTGTCATAAAATTTACTCATTCTAATTGATGA GTTCGTCATGTAGTCAAGTCCTGCATTCCCAATCACAAGTTCTTGGCACT TCATAGTTGATCAAACTTTTTTTAAATCTCACTATTAATCCCATCGTTTT CCGACCAAAAGATACCAAGTGATTTGGAGTAACATAAATGGACCTTTGCC TCTCATTATCTCTAAGCCTTGCCGAGTCTTTTCCTCCAGTTTCATCTTCA GTAACTCTAATTTATTAATTTTTTAGTATATACAATCTCAATAAGCTGAG TAAATGGCTAAATTGTTTTAATAAACAAAACAGTATTCAACCCACATACT 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