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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s117 | supercontig | LSalAtl2s117:1267213..1276374 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000001073 >EMLSAP00000001073 ID=EMLSAP00000001073|Name=EMLSAP00000001073|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=480bp
MADLEAXLADVSYLMAMEKSKCTPAARASKKILLPDSSVRSVMIRYLEKM
GEIHFDKLFNQRLGYLLFKDYCQXVAKEQVPQFKFYEEIKKFEKSDCHEE
RRKKAREIYDTFVMRELLSNSKLYSKSSAEHVQKVLVSNKTAEIPKNIFE
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YAAEVILGLEHMHRRYIVYRDLKPANILLDEHGHVRISDLGLACDFSKKK
PHASVGTHGYMAPZVLSKGTPYDSSADWFSFGCMLYKLLKGHSPFRQHKT
KDKHEIDRMTLTMTVELPDTFSDCLRDLLESLLQRDVDKRLGCKGGGSEE
LKNHSFFDGVDWNQVYHQKYSPPLIPPRGE back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s117:1267213..1276374- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000001073-696920 ID=EMLSAT00000001073-696920|Name=EMLSAT00000001073|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=9162bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s117:1267213..1276374- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGCGGATTTGGAGGCGGMTCTCGCKGATGTGTCTTACTTGATGGCCAT
GGAGAAAAGCAAATGCACTCCAGCGGCGCGTGCAAGTAAGAAGATCCTTC
TTCCAGACTCCTCGGTGCGGAGCGTCATGATTCGTTACCTGGAGAAGATG
GGAGAGATCCATTTTGACAAGCTGTTCAATCAGCGGCTGGGSTACTTGCT
CTTCAAGGACTATTGTCAAAAKGTGGCCAAGGAGCAAGTCCCACAGTTCA
AATTCTATGAAGAAATCAAAAAGTTTGAAAAGAGTGATTGTCACGAAGAG
CGACGTAAAAAAGCTCGTGAAATCTATGATACATTTGTGATGCGTGAACT
CCTGTCCAATTCTAAACTCTACTCCAAATCCTCGGCAGAACATGTCCAAA
AAGTCCTTGTCTCCAATAAAACTGCAGAGATCCCCAAAAATATATTTGAA
CCCTACGTTGAAGAGATCTTTGCGTACCTTCGAGGAGATATCTTTCAACA
ATTTGTTGAGTCTACAAAGTTTGCCCGATTCTGTCAGTGGAAAAATTTAG
AACTCAATATTCAACTCAGTATGAATGACTTCTCAGTGCATCGCATCATC
GGTCGAGGGGGCTTTGGGGAGGTCTATGGGTGTCGAAAAGCGGATACAGG
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AAGGGGAAACACTCGCTTTAAACGAGAGAATCATGCTGAGCCTTGTGAGT
ACGGGCCAGGATTGTCCCTTCATCGTCTGCATGACTTACGCTTTTCATAC
GACCGATAAACTCTGTTTCATTCTGGATTTGATGAACGGTGGCGACCTTC
ACTATCACCTCTCTCAGCATGGAGTATTCAACGAAAGTGAAATGAAATTC
TATGCTGCGGAGGTCATCTTGGGTCTAGAGCATATGCATCGCCGTTACAT
TGTTTATAGAGATCTCAAACCTGCTAATATCCTATTGGACGAGCATGGAC
ATGTTAGGATATCAGATTTAGGCCTAGCTTGCGATTTTAGTAAAAAAAAA
CCTCACGCATCCGTTGGAACGCATGGATATATGGCTCCCSAAGTTCTCTC
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TGCTCTATAAACTTCTCAAAGGACATAGTCCTTTTCGACAACATAAAACC
AAGGACAAACATGAAATTGATCGAATGACCCTTACTATGACCGTTGAATT
ACCGGATACTTTTTCCGACTGTTTAAGAGATCTTTTGGAAAGCCTTCTTC
AGGTCTGATCATTATTATTTATTTTTTAACCTCTTATATTTGAGTAATAT
TATTTTGATTGTTTGATTTTTTACACTGTTTTCTTCTTCGCTCTGAAAGC
TATGATATTTAAAAGTGAACATTGTTTACACACTTTGATTTTATTTATAT
TTATCACGTTCTTTCTGATTGATTTTTACAGACAGACAACTTTGTCTTAA
TTCTTTTCACTTGTTGATGTAAAAAGTAGCAAAATAAGAAAAAATATTTT
GTAAAAGCTAAAAGAAAATACATTTAATTACGCGATGCTAATTATTTTCA
AGACCAAGTTTAAACCAGATGTTAACGTTATACTCTAAAAAAATCAAGCT
TCAATAAATAGTAATTGTATAGTGGATATATTTTGATTTGTGCACTTTGA
ATATCCAACTAAATAGTATAATCAAACTGGAAGAACAATCAAATATAATT
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TCGACCATCCATGGAATAATCAATTATTGCAATATCCTTAACCGAAGTAT
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TCACCCGGGGGGCGGGGGAGTAGACTGGAGGGATGTAGCCCATCCTAAAT
GAAGGAATTTTTCACCAGAAAGATTTTTTCCCCATTAAATTGAATACTTG
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TTTTTTCAAAAAAGTTATAATTTAAAAAAAAAAAATTCCAAAACCAAGNN
NNNNNNNNNNNNNNNTATATATATATATATAGTCCTGCAGACGCCCCTCC
AGGCCTATAATATGATAAATGCTAGCGTCTGMCGTCCGTCTGAAAATCCT
AGACTGGMCCAAGACCGTTATAATTTTTTTTAAATCGGTTCAACTTCAGT
CTGGACTGGTCTCGTATTAAATTTAAATTTAAAAATTTAAAAAATCGATT
GTCCTGATGGAAATTAATTGTCGAGTTTTCCTTTTCTAAAAAAAGGTAGC
ACATATTTTTGGTCTAAAATTGGTTTTTTTGTCGTCCTCGTCCCCTTTCC
CATGTTAGCATTTCCTACATATAGGCCCATGTGTCTAAAATGCAACACTT
TTTTAACTTGTGTGCCTTTGTCCTATTCGTTATATTTTGGATGTTTCACC
CCAATAACTTATTTTACACAATTGTCTAAAGAAACTGTAAACAAAAAATA
AGCTAAGTCCGGCCAGATTTGAGAGCGTCATAACCTAAAACGGAGKGCTG
CAAATKTGGAGCTATCCGCGTGTGGAAAATCACCATCAGAGATATCTAAA
GTGCTGGGCTGTAACCCCTCGACTTTGTACCGGGTTACGGCTGAGGCACA
CCAAAAACTTCCTCAAGGTCCAAATCAAAGAGGCTATACATATTGTTAGA
GGCAGTTAAAGACACCATGTAAGGAAGAAAAGGCAAGGTGACCGTCAATG
ACCTTGCTTGGGAATTTATCAGTATCCATACCACCATGCCAACAAGAGAA
CTCCTCCTTAGGGATTGAACCCTCTGGATCGAGAGTTGCGTGTGACTTTT
TGCAAAATTATCCTCAACAACCTGGTAAAGCAAGACTCTTGTCTTCCCAA
CTGTTCCCTTGTACTTTTTGGGCAAGGGTAAGCTTTCGGGGGTCGGATGC
ACAACAAAGGACTAAATGAGAKCCACCATTATCACTGCTTGAGTCAACTT
AGAGCCGAGTTTTGTTAAGAACTACTGTGCAAAGTTCTGCAAAAGGCGGC
GTTATTGATTGATAAATAAGGTGGTGTTCCTTGATTGTATTTATTTATAT
TTTTGATATTTTCTGAAACGTAACAATTTTTGTTATTTTCAAAAAGTGTT
GCATTTTAGATGGAGGAGCCTGTATAATTGATTGTGTTCGCAATTTAAAA
GTCCCACACTCGTATCTATTCGCGTATATACTTTTTACGTAACATAGCTC
ACGGAGTTACACTGTATTTTTTTATCAGCTTATTTTCTCCTAATCCAGTA
GTGTTATTAGAATTGTCCATTGTTAAGCTGCGAACAATTCCCCACTATTA
TTCAATAATTATTATATATTTGGTAAGAATTCGCGTAGTACCATCGATTT
TTTTGCTTTTATTTTTTTGTGTGGGGGGGGGGGGGGGGAATTCGGGAAGA
GGTTGCATGAAAAAATTACTTGAGGCTGTACCAGTCTCAACGCTAATATG
TCATAAATTTCTTATGCTATGAAAGAAACAAAAAAACAGGTACTAATATA
ATATAATATGTGTTCTATCAACACAAGGGCAAGTTAGAATAATTTCCTCA
AATTGAGGGTGTATTACATTTATATTCGTCAACGACAAACAAATTATTAT
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ACAAAAAAAGTATGATAAATTGATTGATTTTATTTGAAAGAGGAGAGTCT
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TTATGTTAACCTAGAATATATGTAGATAGTAATTAACTTAATTTAGGAAG
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CGTAAAAAGTTGCAGTCTCTGTGTATTTTCATTGGAACAACTACAACTTC
TTATGTAACAATTCATATTTGAATACGTGGGGGGTCCATTGAAATCGGAA
TACTTACATATTCAATAATTAATTAAATAAATTAATGTTTTGATAAATTA
AAGCATAAACAAATACTTATACAACAAAACAAACTTTAGCTCTCTAGCTT
GCGTACAAGTCGAGAAAAGGACACTCGAACGTGACTGACAAATTTGCGTT
CGTGCAATCGAAGCAGTTGGGCGTCTCCAGGACCACTGTCTTCGCCGTCA
CCAAGTCAGAAACGTTGTAGAGGTAGAAGGGCTCCCTCAAAAAGCCCAAA
CTGTACCAGGAGGAGTTAAAAACAGCGCAGGGTAATCCCCTCTAGTCCAT
GAGGGCCCATGCAATACTTATCGGGGTTTCACACCAGACTGTCGAGAGAG
CTATCAAAAAAGTGGGTAGAAAGAGCCTTGTGAGGGTGGAAATGACTCCA
GCAATGAAAGAAACCCATCTTCTCCCTTGGAAGACTATTCTTATGAACTG
TTCTTGACACTTTTGGCTCCCACAGCCCTGAAGTAAACCCTCTCGACTTT
ACCTTTTTACCTGGTGCATGTCGAGAGGAAGGCCTGCAGTGTCTGTCATT
CAAACACCAAGGCCCTCAAAGACACTGTCGCCATGACAGATAACTACATC
CGCTGCCACCTGGAAACCATCATTGCCCCTAAAGGTGGCTACATTAATGA
TTAAGAGAGCTCCGACACAGATATATTTATAGTCTTAATATTAATAAAAT
GTTATTGTCAATTAGTAAATTATGTCTTATTGAATTTTAAAATTCAATGT
TTAGATTTTAATGAACCACTCGGTACATATTTAAGAGAGTTTTAATTAAC
GAGAAGTACATAATATACTCACATATTTCTATCTTACCTTCAGTTATTTT
TTATAATGACAAAGTAACAATGATGAGCTAGGTTTATTCCGTATACCGGT
GCAACGTATAGGAGTACCTGGGCGGTACTCACGCTGCTTTTAAAACGGTG
GCACTGTTTAACATCCGGMAGGACTTGTCTCCAAATGCGGGGCTCTATTA
TTGTGACAAAACCTCATCAGATTTTAAACGATAATTATGACTGAGACATA
CTTAAATGTGAAAAATCCAAGCTTGAAGCAAGGTTTATATCTGAACAAAA
TGATACAACGGAGTTATTTGAATTTTTCAACTATAATTATACTTCCTCTT
AGGTTTTAAAATTTAAAATCCTGTCCGGTTTTAACTTGATAAAGGCCTCA
AAGCAAAGTAGAATAGAGAAGAAAAATATGCTGCGGAGTGATTTGAATCT
ATTTTGTTTTTTTCGAGAGAAATCGGACTTCCTCTCAGTGTTTAAGATTT
GAGATCCTGTCATATTTTGAATAGATAAAGTGGATCTCCAAAAATCAATA
GCATTTTAAACGATAATTATGACTGAAAAATGAGAATGATCCCGCAGAGT
AATTGACAAAAATTCGAATTTCATCATTTCTTAGCTACCATCAAAGGTTG
TTCACACGTGTTAGCAATTATTAAGAGGACATTTATTAGATTCATTTCAA
TTCCCCATCTATGACGAATTTGATTATACAGAGCGTTTTCGGTGACGCCA
TAAATTGCCTAATAATTTAAGGAGACACCATTTTAGGGGGTCGAAGTTGA
TAATTTTACTAAATAAAATGCACACATTTCTAATAAACCTTGATTAAATC
TATTAAATGACTTTAAGAATAAAAAAAAGACCCAACACCTGCATTGAATA
CTACTTGATCTCAATGATTAACATTGATATTTGAAATAGATCAAAGTAAT
ATGTACTCAGAATCCGTATTAAATCTCTAAATTGGTAAATTATCCTTTTT
AATAGATAAAGGACATTAAAAGTTGGATAATTAGATAAAAATATATTATT
CTTGACATGACTATAGTTAGTTTTTATCTACAATATGGAAATAAGATTGA
TTCACGATGTAATAACATATTTTTAATACATTTTAGGGTTATATATATAT
ATATATATAGTGAAACTAGGCATTAGAGATTTATATATTTTTGAACGACA
GTGAGGTATAAGTTCTTTTATTTCATGGTCCGATTTTGACATCCAATATC
TCACAATTTTCCTTAATAATAATGAAAAAAGGGCCTTCATTGATATAAAC
AGTGATGTAAATCCGGTAGATTTTGTTAGCTGGTCCATAATTTCGGAGAG
GGTAATCTGAAGAATGAATTTTCTTTTCCTTAGCAGGTGTCATTATGGTT
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GCAGCCCAGTCCCACTTGTCGGTCCTTAAAGAAGGTAAAATTGATCCCTC
GTGACGTCAATGAGGGTGTTTTTACTTTTTTTAATATTCGTTATATAATA
AAATAAAATATATAACTAATTAACAATATAATAGGTTCGTATTTTTCATT
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AAAATTAAGACCGTCGGTCTTAAGCACCGATAGGACGGGTCCTAAGACTG
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CTAAATACATTCTATTAGATAAAAAAAACAGCTGTATATTTTGAATTTCT
TTCCAAAAAACTTAATTTTTTCGGAATATTCATGATTTTTTGAAATTTTT
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TTGTTGAATAACTATGAATTTTTCGAAAAAAAAATACGAAAAAATAGTTA
AATTAAGATTTAATNATTCTTGGTATTTTTTTTTTGTGAATAACTATGAA
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TGAAGCTAAAAATGTTTTGTGCTGGTAAGGTCTATTTGTGTGAAATAAAT
ATTTTACAAGTGGTACATCACTATAAAAAAAAAGAAGGGTGAGAATCCCT
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TCAATGGCAACTATTCAATACTGATATGACGTGCTCTGTCTGAAAGAATA
CAAGAATAATAATAAGAATTTGTGGGGGGAAAAGAAGAAGTTGGGATGAC
GTAATGAGTACTTTAGTCTTTAGAGCGCTCACTAACAAAAACAAAAATTC
ACTTTCACATACCAGCGATTATATTTAATTCAAATCTTAACATATACTAA
AAATGCAATTGAATTATGATACATATATCTAAAGAAGGGATGTGTGTAAA
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TTCAATATTTAATCAGTTGTGCTGTGTTAACTTCTTCCTCTTACAGAATA
ATTTTCCCTTATCTTTCCTTTAAATTGATTTAAAAATCCATAATAAAATA
AATATATTTGAATTTAAATTATAATATTTTCCGTACATTAATGCTATTTG
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ACAAATCCTATTTCTACTCATTATGTAAAGCACTAAGCCTTTTTCTTGTA
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ATCAAGACGGCTTTCTTGAAGTTGTTACTAATAGGATGGGATAATTGAAT
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ATGACGCGCGGGGAAACTTATACAGTGTATCCTATATATATATATATATT
AATTTTATTTTATTTTAAATGCTCCTTCGATGGGTCAGATGGAGGAGTTG
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CCTACGAATATTTCCTTATCTAGGAACGACAGGAGTTCAAGAGAATAATT
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AGAGGCAGTACAATGAACAAAGTAGTTGTGATATCCCAATTTTTGACATT
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CAAGGGTGGAGGCTCTGAAGAACTCAAGAATCATTCCTTTTTTGATGGAG
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CCTAGAGGAGAG back to top
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