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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s1182 | supercontig | LSalAtl2s1182:9784..22228 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000001101 >EMLSAP00000001101 ID=EMLSAP00000001101|Name=EMLSAP00000001101|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=213bp
MATYYARSKNSSDFDNVLMSHYITFNPSQPSWNEFDVSACLRKFSRLYLK
LTLDEQIDPKILVDNSEYLSSTPGQKEGIDVWFVLLSGPPKNLINKNLLR
SNEDHVMISGDSNEAYNNLVKIIESDDVPLRLKMDQNNEMVILLRRDSLQ
VAPESVHPXSRGNHRYRFYRVSYTAGSMAGLGFSMAILGICVGIFLGFLL
WKRRLGVPYQLSP back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1182:9784..22228+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000001101-696948 ID=EMLSAT00000001101-696948|Name=EMLSAT00000001101|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=12445bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1182:9784..22228+ (Lepeophtheirus salmonis)
CTTCTGTGTCTCATTATTAAGAAACAGATACAGTAATTGAAAATATAATT
TACCATTTGGCAAAGTATTTATTTGGTTAACTGTATCTACATTCAACATA
CAACCCTATGTAATTGATTAATTATATAATTCAACCTTTCTCAATTTCAG
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NNNNNNNNNCCCCTTAGTTATGTGCTACTTGTAAAATATTCTTTCAAAAT
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TTTCTAAGCACGTATTAAGCAAAAAAAATTTCTTGTGAGTTTTAAAAAAA
TATTTGTATTTAAACAAAGTATTTTTATGAACAAAAATAGACTATCGTTG
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAAAAA
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TGAAAAACTGGTACATTAGTATTATTTTGTGATGAAGTTGTAAACGGCAT
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ACCTGGATTTGGCGAAGATTCCTGTTCTTTTTTGACATTATGAGGCCAGA
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GGAAATTTACCATAAACTTTCAATCCCTATGTAATTTTTTGTATATCACA
TACTATTGAAATAGGCCTGTGAAAATGTATTTCACAGGAACAAGCTATGA
GTCTAAAAACATTTTTCAACCCGTCGTAAAAGCTCATTTTGATTTCTAAG
ATATGGGTGAATTCACTTCCAACATTTGTTTTTTCTTCTCTTATCGCTTC
AAAAATATCGAAATCCTCAACAATACTAAGTTGGATCCCTTGTGTTTTTG
TTTTTATCGTTTTTATAAAGATTGTAGTTCCCATTTTTATTGCTCCTTTG
TGTCCTTTGTTAAAAGATAAATTAATCAAAATAATTCATTTTGATATATA
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ACAAATAGATCCTAAGATCCTGGTAGACAATTCTGAATATGTATGTGGCT
ATTCCAACGGATAAACTGTACACCGTAGGGKCTTTAATATAGKAAGTAAT
TTCTAATAATTCTATATTTTTTCATTACAAAAGAGTCTATCAATATTGAA
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TTTTTATTACTCCCAATAATCGATATCTGAAGGTATATAAGACTTTTTGA
TAGAGAAGAAAAAAATCCTATTTACAATATATTAAATGTTATTTATAACA
TTTGTTGAAATGAGTCAATATTAAAAATTAATCATTCACTTCATTCATTG
AATTCGAATATTTGTACATATGTATTTCAATCTGAAGATGTTGATATTAT
ATTTTGACGTAGGTAATATCAATTTATACAGAGATAAATCGTTAGCTTGG
TTTAATGCCTCCAGGGATTTTCATCTTTCAAAAAAAAGAAGCTATAAATG
TGATTTAATATTTATCTCTGGATACAATTTTTTGCCTTATGTAGTACTAA
GAATAATATTCTCATTTCTTGATAATGGTAACTTACGTTATGGAAAATAC
TTATATCAAGCAATTATTAGCCACAGAAGTGGCTTTATGTGTTTGAAGTA
AACATAAATTTTCTCGAAGAGGAGACATATATCATTCTAGTTTTCACTTA
AATCAATACTGATATTATAAAATGTTATTAATTCAAACACAAAAGCAATC
TAGAATATTTTTTCTCCAGTCACTGTGCGAATTATCCTCAATTTTAAGAA
ATATTATTCTTATTAACACTTTGGGTGTGCCGCAAATTGTTTTTATGTAA
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CGAGAAGTCATATCAGGCTAATATGTATAAGCATCTGAAATCAAAATAAG
GTTCTAACATATAGCTAAAATTCTTGATTATTTTGACTCAAATCAAAAAT
TGAAATACAAAGCATATAATTGAATCAAATATTCCTATCAACATTGAGTT
GTATTTATGATCTAAAAAAATAATTTAGAGTTTCTCCATTTTTTTGATTT
TTGTTCTAGATTGTTTTTAGGTTGACATATATGTCTATTTTGCTCTTAAA
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AATTAAAACATCCCTAAGCTTTAGAGTTATAAAAGTATATTTAAAAAATT
ATTAGCACTTTGTTGCAAGAATTCCATACTTTTTTTCGATTTGAGTAAAA
TTTTAAATTTCTTTTTTAGAATAAAATTGAATTCTTTTTCTTTTTTGAGA
GATTTTTTTCTTTTCGAAGATAAAATTCGGAGTCTTCTGTCTACTTTTTT
TAAAGGACGATATAAATTTTATTTTTTTAAATGGCCTTTTTAAAACATAT
ACAGTATTTTCAAATACTGGTCGTTTTAAATTTATTCTATTCAATCTGCA
AATATAAAATTAAATATTTGGAGTAAAATGCAGCGTGATAGGGGAAAAAA
TTATTATTATTGATGATTTCATTTGTATTTCAGCAGAGCATTATAACAAA
AGGTTTTTAAAAATATTCAAACTAAATTTGGGCTTTTGGCTATGAATATG
AACTTAAGTTTAGCATATTTAGTCCTTCCCTTTAATTTTATTTTCATTTT
AGTGCGTACAATTTTATATTAATATCATTTTTTCAAAAATTATCATTGTA
TTGAGGCAGAAGAATATTTTAACGTGACGTCAGCATCGTTGATGTCGATA
ATCTTGAAGGCCTACAAGCCAAGGTCTTTATAAAAATAAAGACCATCTTT
AATTCAGATTAAAGAAAATGATAACTATTGGGGTGAAAATATTCAAATTA
TTTAAAAAGTCAAAGTTTAATTAAAATGAATGTGTAAGATTACATAATAC
TTGATGTTTGATAGTTTTTAATTATATTTTTTTGATTTAATATAAGAATA
ACGAATTATCCTCATTGAAAATTTTTCTTAAAACCAATTGAACCTTGATT
TTTTATTATTATTCATTTTTGTAAAATGAGGTAGAAAGATTGTATCAAAA
ATAAAAATAAATCAAATCATTTTTATAACCATACTTATAGGAAAATGTAT
GTGAATATAAATTTTGATGCATTGTCTTGAGAATACATTTTTTCCGTTTC
ATTCCACTCGTAAATTCATAAATATATTCCCTTAACAACAAGAACAACAG
TATACAGGGCAAGGTACAAAGAAAAGTTTTGTTTTAAAATTAAAAAACTT
TATGTTCCAGTCATGTTAAAACTGTATTAAACTTAGTATAAAAATATGTA
GTAAAAAGTTTTTAAAAATAGTTCGAAGAATTGTGTCTTAAAACTCTTTT
ACTTTTTTAGAACTATTCAAAAAAACAATGAATTTATTTCTATATTTTGA
AATATACATATTAAAAGTTAAAGTTTTTATTTCTAGGGTCCCCAGTNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTTTGCCTTTTATCTTAAAGC
GAAATGTTGTGAGATTGAGTATATTCTGAGACTAAATAGTTAATGGCAAA
ATTACCTAATGCAATTAATAGTATCATAAACTTTAAATTAAATATACCAG
TGATTCTTAACCGGGAGGGAATTTAAGACTGATTTAAAAACGTTCATTAA
GAATGATATTATATATGTTGGCTACAATTTGATATTGTGAACAAATAGTC
ACTCATATGTCTAACGTCTTAACTACCTACTTGTATGTCACATAGCCTTG
TATTGAATAATAAAAATGGTCATTGAAAATAATAAGTACCAACTGATGCG
ATCAATTCACTTTGATATATTGCAATTACATATTTTTTTCTATTTTTTCG
AGTAATATACCAGGGGCATATAAGTTTTATAACATAATATGTTCCTATCA
ATTAGTAACTTTTATCAAAATAATAAAAAATGACACCCTTAATATATTGA
GTATCCAAGAAATATTCAATTGTTGCATTACCTTCATAAGAACTACTCTA
AATTCTTCATTTATTTATGTCATTTTGATTACAACTTGTACAAAAATACG
ACTCGTACTCAACTTATAAATTAAAATAGCGAAAAAGTGTTAATATATAG
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TGATTTCCTTCATTATATTAGCTGCTAAAAGCAGCTAATATAATGAAATA
TCATAACAGCTAAGGTGCTTTCTTTCCGAACACTTTTCCAATTGTCAGAA
AAACTATGACCATTTTTGGTTTATATTTTAGCAAACTGGTAGGTCATATT
TTGTACAACTCTAAATGTCGCCAAACTGATCTGTTATATACATATATGTC
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AACATATTCAATTATTCTTATTGATTTAGAAGATGAAAAATTAGTCTTCT
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AAATTCACATGTTTCATACCGAGCTTTAGACAAGATTTATTAAGTGTAAA
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TATAAAATAACCCCCCTAATGAGGATAAGGTAAAATATGAAGTAAAGTTT
ATACCGTGAAAATAAAAAAAAACTTCAAGAAATTCAATTAGGTATTTGAA
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AAAAGATCTTATTACGAGTAAGTCATCACTAGGGGATGTGAATATTGGCT
TAATTGCAGTAAGCATAAATTAAAAAAATAATTATATGTTGGTTAGAGTA
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CAACAAATCTCAGATGCTAAAAATAGTTGAGATTTACAGCCAAGCTCTCC
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TTTAAGATTTCATTCATTTTTATTTAACTATATTAATATCCCTATATCCT
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AATTTAATATTGATTTATACTGAACCTTAAAACTAAAAAACCTAAGCCCT
CGATGTACAAAAAAATAATTATGGATTTAAAAGGAACTCTAAAGAAATCT
GACGACTTTATTTTTTTAAGTTTTTGAACAAGCGAACAAAGATTTGGGAT
TCGATACCAAAGACTTTGGACCTTTCTTGAAATTTCAATATATAATTTTT
CTGACACCTCTGGTTATTCCTATTATATTAGTCACGTTATATTATACAAA
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CATAATTTAATTTTTAACCATCTAATTCAGGTATTTAAGAACTTCCAACT
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TTATGATGATTTGAGGATTCAATCAACAATTTATAATAAGTACATTTTTC
TATCGATATAATTTAGAAATAACGAATTTGTATGACTGATGAGGAATATA
TCTAAAAATAAAATGTAGGGGGAAACCGGATGACTTCATGCACTCTCACA
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TTTGCTACATTTGATCAAAAGATATATTCTTTGTACCATCATTGATTTTT
CTCTGCACATAATCTTTTTTAAAGAAGTTGTCCCAATGCTCAAATTTAGT
TAAAATGTGGGGTATTATCTTTCGTTTTAACTAGTTATATCTTTCATTCA
TGTATACATATATATTTTAAATATTTAGCCCATTAATATCCAACATATAT
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TTGTAAGAAAATGGTTCTTGTTTGGACGACCCATTTCAGGTTCTAAAATA
GTTTTTATAATAAATAACCTAAGAACAATAATATTGATTTATAATATTGT
AACTCAAATAATATTCAAATATATATAACAATCTGCATATTTTTATTTTC
TATTTTACAGTGAGCTACAGCCAACTCGTTCAATTTAGTTTACGAAAAGC
CCAGGATTCAATTCGAAGTGCAATTGCTCATGTTGCGAAAATATCTCCAT
TACGTTTATCTGATCTTCATGTAAGGAATTTTCTTTGTTTTTTTAACCAA
TTTTGAGTTTGTTTTTTTCCAGTTATCGAGTACTCCAGGACAGAAAGAAG
GAATTGACGTATGGTTCGTTTTACTTTCTGGTCCTCCAAAAAATTTAATT
AATAAAAACCTTCTTCGATCCAATGAAGATCATGTTATGATCTCAGGAGA
CTCAAATGAGGCATATAACAATTTAGTGAAAATCATTGAGAGTGACGATG
TTCCTCTCAGATTAAAAATGGATCAGAATAATGAAATGGTATGACATATT
TTTAAAAAGGACGGGACTTATACAACATTCACATTCTCGCAACCTTTTTT
CTAGGTTATATTATTGCGAAGAGATTCGTTGCAAGTGGCTCCGGAATCTG
TCCATCCGYCGAGTCGTGGTAATCATCGCTATAGATTTTATCGCGTGTCC
TACACAGCAGGTTCAATGGCGGGTTTGGGATTTTCAATGGCAATTTTAGG
TATTTGTGTAGGTATTTTCCTTGGATTTCTTTTATGGAAGAGACGACTAG
GAGTTCCATATCAATTATCTCCGTGACAACGAACGTCTTTTCTCGCTGGA
ATGAGACATTCGTCCAGTAGAGGTGCTTCCATACCTATTGTTCCTTTATT
TGAAGACTTTCCTCCACAGTCTTCGCCTACCTTTTCGTATGGAAGAAGTA
TCAACGTTCAAAGACATTAAACATATTTAAGGAATTAAACTTGAAAGATG
GTTTTATATTACATTCAGAAGACAAATGTTGCCAAYTATCCACTAAAAAT
AAGAAGCAGGAATCCCCAATTTACATTAAACATTAGATAATTATTATCTA
GCAGATAATGAAATTAAAAAAAAAAATAAATAAACTTTTAATGCGCATTA
GGTTTTTTTAACAAAGCATTCATATATTTGTCATTTAAGTTTTTA back to top
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