EMLSAT00000001102, EMLSAT00000001102-696949 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000001102
Unique NameEMLSAT00000001102-696949
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s1183supercontigLSalAtl2s1183:46311..63939 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000001102 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000001102EMLSAG00000001102-683868Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000004821EMLSAE00000004821-713749Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000004822EMLSAE00000004822-713750Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto770525auto770525Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000001102EMLSAP00000001102Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000001102

>EMLSAP00000001102 ID=EMLSAP00000001102|Name=EMLSAP00000001102|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=166bp
MQMSTMSSSSSSIQTRSPVSSPQPSNPNTTNNNNSTNSNNNNFLPQAPVV
NNEDSSSTLIVPQPDLTPGHNEGLSSDCSDDETQSGQMPVVYPWMKKIHI
AGVGNNFQPGMEPKRQRTAYTRHQILELEKEFHFNRYLTRRRRIEIAHAL
CLSERQIKIWFQNRRM
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mRNA from alignment at LSalAtl2s1183:46311..63939+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000001102-696949 ID=EMLSAT00000001102-696949|Name=EMLSAT00000001102|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=17629bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1183:46311..63939+ (Lepeophtheirus salmonis)
GGAGCCTATGGACAAACAAACAGCGCTCCAACTGCCCAAGCATCCTGTGG AATATCCCCAACCATGCAAATGTCAACCATGTCTTCGTCCTCATCTTCCA TTCAAACGCGATCTCCCGTATCGAGTCCGCAGCCTTCGAACCCTAATACT ACCAATAATAATAATTCAACCAATAGCAACAATAACAATTTCTTACCCCA AGCGCCAGTCGTGAACAATGAGGATTCGTCCTCGACTCTCATAGTGCCAC AACCGGATTTAACACCTGGACATAACGAAGGACTCTCTTCGGATTGTTCA GATGACGAAACGCAATCTGGGCAAATGCCGGTTGTGTATCCATGGATGAA GAAAATCCACATTGCTGGAGGTAAGAAAAATATATTCTGGTTAGGGGGGG GGGCACTCAACTCTTTTGAACATTTTATTATATGCAATAAAGTAATTATC AGGGAATATATATTTTTTTGTGTTCTTTCGTCTAAAGAGAAGCATCCTTG GGGGATTAGTGAAGGAGAACAACAGTCAGGTTACGTTCCCCCATGGGTAC ACTAAAAAAATATTCCCTTTTTTGTTTTTTAACTCTATTTCAAAAGGTAT TTTTAGTTTTTCATTTAAACATTATTAGACAATTTTTTTACATCACATTT CTCTTCAATGTAGAAGAAAACTATCCAGTTGAAGTTTATTTCAATTTAAT CTTTCAAATATCAATGGGTCTATTGGATCCATTGGTTTTTTAACATTCAA TTCCTGGTCCAGACCAACAAAACAACCAATATTTTGCTACATATTCAATG AAACACAAGTTTTACTTTTCCTCAGTCTAATATTTTATTTTATTGTTATC ACAATACCAACATTTTTCTACTGATTCCGGTACCAATATAGGTATTGGTA TTTCGATCCTTTCCAATACTTTTTTTTACTAAAAAAATGAAACAAAAATT TCCTTAATTTCTTATCTATTTATATGTCCATCACTAGGTTTTTTGTTTGG ATGGGAGCTGATTCAGAAATTTGTTATTTTTTTTATATAAAAATAAACAA TTTTGTTTGGAGATTGAGGAGGCTCATAAATTTTTAAAGGGTATGTTCTT GTTTGGTCATTGTTTTCATGCCGTTTTGGTGCTCTAAGTGCCCCAGATTA ATACAAATTTAGTAAAGTAGGATTTTAAACTGAACCTCATTGGTATATAT TTTATAAATATATAAACATAAAATCATATATTAAACGTAATACCAATGTG TCCAATGGACTCCATATAGCCTTATATACTTATTTACATAAATTAAAATC TATTAGAGAATGCGCCAAGTAATATAAGATCCAATATTTATAAAGAATAA AGATTAACTTGTTTAAATATTTGCACCAATAAGCTCCAAAAGTTAATTTC AATATTGTTTATCCAAATTTGGATTTTATAATTAAAACATTATATTTTAT GTTTACTTCTATTTACGATAATAAAAACATTAATTCACCTCCATCCCCCC CCCCCCCTCCTGACAACAAATTAAAAGGTCACCCAAAAATAAAAGAAAGA AATATTTCACCCAAAGGCGATTCTCTTTTTGTATTTTTGTTCCTTCAAAA TTATTCATTAATCATAAAACGCAATTATTATTTTTATAATATGAAGAAGT GAGATTCTCAAGGATATTATTTTACAAAAAAAATAACAACATAATATGTG TATTTTGTTATCATTTCAGAGCTGAAAAGTGAGGATATAACTAATACAAA AGTAAATATTAATATATATATAAATCCGCTAAATTTTTCCCTCCTTTTCA ATGAAAGACTAGTGAAAAATAAAGAGAGAGGGAGACAAGCAGTACCCGCG TAGCGGGATAAAAGAAAAGGAAAGATAGAAAAGAAAAGCGATGTAATTCA 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