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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s118 | supercontig | LSalAtl2s118:125434..135666 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000001122 >EMLSAP00000001122 ID=EMLSAP00000001122|Name=EMLSAP00000001122|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=658bp
MYEACDKPPPNYYPPEVKLPSGDILQNLNGRNISDYLIKTRFEFEGKRFG
GFEFGILNPLAGRNFDQWADSFQKISKATNMNESRVDAFTSTFAKEALVD
MAYSSSTFDYIRVWFNNKGWASSVSYMNAVNNMVLRATIEEKSERMHELV
DSSKYGIAAINHPMNYTSDQFSNHQLNGIVEALLNSVNILLVLSILPASY
VLNYVLENNLKIKHLHFVYGVKITTYWITGYIFDTIIFCINLVFITVALI
AIDASSLISDANFYGFATLIILYSFFFKKQSSALFALLNLNLMIGIIPFL
TTLLVKYVNEDEKLYYVLETLFMIFPQFCLIHGLFQMFIENIKSITYEDL
GFTSTASTFDWNYLGQNYLFLFFEAVIFFIANIMMEVRIFESWRLKILPD
AFTKAQKETDDEVMDEDVYEEYQRVMNAYNELSKRYWRQKNSAVDKLSFG
VRRGECFGLLGINGAGKTTTFKMLTGDINPTSGDAFINGYSIFNEMGRCR
QSLGYCPQEDALHPLLTGREHLELYSRLRGVNKKSEIKIVNYFLKELDVI
RGGQSVVLTSHSMEECEVLCSRLGIMVNGKFKCLGTAQHLKSRFGSGYSL
TIRSGTTDGNLDSLKDFVLNAFPFSEIKEEHYNQLTYQIPLKTIKLSTIF
HEMERAKC back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s118:125434..135666+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000001122-696969 ID=EMLSAT00000001122-696969|Name=EMLSAT00000001122|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=10233bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s118:125434..135666+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGTCAGACGATGTATGAAGCCTGTGATAAACCTCCTCCCAATTACTATC
CTCCAGAAGTTAAGGTCAGTAATTTGTAATTAATTTATATGATTATTTAA
TTTCATGATTTTTTACGTATTGGCTATTGTTTTTTAACTTATTATCTAAT
TTGTTATAATTATTATAATAATAATTATCTTTGTTCCTTGTCATTTAGCT
GCCTTCTGGAGACATTTTACAGAATTTGAATGGAAGGAACATTTCAGACT
ATCTAATTAAAACTCGTTTTGAATTTGAAGGTAAAAGGTTTGGTGGATTT
GAGTTTGGCATATTGAATCCCCTCGCAGGTCGGAATTTTGATCAATGGGC
AGATTCTTTTCAAAAAATTTCTAAGGTAATTGATACAATGCTAACCCTAA
ATTCATTTGCTTTACATCATTTATTAAATATTTTTGAAAGTGAATAAATG
TGCCACCTTATCTGTAGACGGATTGTCAATTCCGTTAACTTTTTTCATGC
GGTAAACCAAGAATCTATGGAAAAGATCAATATTCGATTAAGTCATCTTT
AAGGCCCCACATCTTGATTAAAGTGTGGAAAAAGACAATAATTAGTTATT
TAGACAATTAGGATTAAAATAAAACCTTATTCTGTATGTTACATAAAACC
ATTTTGATTGACATTTTTTAACCTATAAAAATATTAATAAAACTTTTTGC
GAAAGAAACAATATGCAGCATAAAGATGATGGTTTTTTTTTGTAATTTTC
ACTTCATAAAGTCTTGAATATTTCCTCAAAATGTTGTTTTGATATTTTCT
CTTCATTTGCACATCTTTGAGGCCTATGATACTCTAAAAATACCGGTTGG
TCAATTGAAATCTGAACACTTACTATATAAAGAAGTAATAAAGTTTTAGT
GATGGAAATTAATTCATTTTTCAATATATTAAAGCATACACAATTAGTTA
TAAAACAAAATAAATTTGAGCTCTCTAGCTTACGTACAAGTTGAGAAAAT
GGCACTTGAACGTGATTGACGAATTTCCATTAGCGCACACAAAGCAGTAT
GGGGTCRCCAGGKCCKCCGTCTKCGCCGRCAGCCATTCCAAAACGATAGA
GAGGAAGAATAAATCTGTCAAAAAGACCAAACTGGACCACGATGAGTTAC
AGAAAACTGCCAAGCCAATCCTCTCATGCCCATGATCTCGGGAGTTCACT
CCAGAGTGTAGAGAACTATAAAAAAAGTGGGTGAAAAGAGCCTTGTAAGG
ATAGAGAGGCCACGTTTGACACCAGCAATAAAAAAACCGTATATTATTCA
TTGTAAGACACTTATGAGTTATTTTGGACTCTTTTGGCCACCTATAGCAT
TGGGTGTATGTCATGGGGATGGCTTGCAGTTTCCTTTATCCACACACTGA
GGCCCTAAAAGCAATTGTCAGCCAGCACTGGGACGCAAAGACATATGAAT
GCATCCGAAGCGGGTGAAAGKCCTTCCGCTGCAGTGGTGCACAGCCTGGA
AGCAAACCATTGCCTCTAAGGGAGTCTACATTAATGACTAAGAGAGCTCA
GACACACATCTATTCATTGTATTAATTGTGTTGAAATTCTATTATTAACT
AATAAATTATTTCTTGTTGAAGTTTAAAATTCTAAGCGTTCAGATCTTAA
TAAACCACTTGGTACTTATATTCATACTCTAGAAGCAAGTACAAAATCAT
ATCAATGTTAAAGAAAAATTATTTTTGAATATGTTTATGTTTTATGTTCT
GCAGATGTTAATACGTCTGTTTATAAAATTCTATATCCATGTTTTTTTTT
TTTATTTAATAGGCAACAAATATGAATGAATCTCGTGTGGATGCATTTAC
GTCCACTTTTGCGAAAGAGGCACTTGTTGACATGGCATACTCCTCATCAA
CCTTTGATTATATTCGGGTTTGGTTCAACAACAAGGGATGGGCATCTTCG
GTGTCTTACATGAACGCTGTTAACAACATGGTTTTAAGAGCAACCATAGA
AGAAAAATCAGAAAGAATGCATGAACTTGTGGATTCATCAAAATATGGAA
TAGCAGCCATCAATCATCCCATGAATTATACTTCAGACCAGTTTTCAAAT
CACCAGTTGTAAGTTGAATTTAAAAAAATTGGCGCCTTGTTATAAGATAT
ATATTTATTTAGCTTTAGCTAGATATTTAAAAAAAATATGACCTGAAACG
AGTGTGATTTTTGCTTGTAGTAAGTATTCTAAACAGTAGTGAAGCATCTT
GGGTATATATGATGTCCCAAAACTCGGTTCCCACTCTATATGATTAGGAA
TAACCGTAAAAGGCCGAAACTGCAGTTTTGACCTGTAGTTAACAAGCCCT
GTATCGAGTCATTCGTCAGTCTGAAGATTCTAATGCGAGTCTATATAGAC
TTTTGTCAATTTGATCTTTAATACTAGTCAATTTGAAAAAGACCAAAGAA
TATAATTTGTAATAATAAGAAAATATAATCAAGAAAAATGTACAATGTCT
ACTATCGTAAATGTTCAAATTATGTCAATTAGCCTAATACTTTTTATAAA
GAACTAAAACTACCCAGATCTGAAATCAAGACTCTAAGTCCGTCACCACT
AAACGGTGTTTTTATTTTTTAAGGCTGCTATGATTATGAGGAAACAGGAA
ACAACCTCTAAATATTAAGTTACCACGAGTGTATATAAATATATCATTAC
GATGGATCAGCCAGGGAGTACTTTAGTTTCTATTGTGCTACCTGGTTGAG
CCATAGCTACACATGCTCTATACTACATATGAAACGCCAGCGAAATTTCA
TTAATATGACTATATTACTATTTCTTAGAACAACCTATGAATATGATATA
CATCAAGTAGCACTGTTTACAATAAATACAATATTCACGGTCGATACTAC
ATACGAAACGCCAGCCCGACTTCATTAATATGACTGTATTGTAATTTCTT
TGATCAGAAATGTGTATATCTATATGATATACATCAAATAACACTATATG
TCAGTTATTTCCAAACTTTTTAAGTTCGACCCTTAAAATATGTGGCCCGA
CAATGTGCCCAACCTCATTGAAATATGAATATAAAATTTGGAGGCATTCT
ATTTACATAAATCATTTGGTTTTTGGAAATTTTCAAATGGAATAAGCTTT
TTGTAGGAAAGAAATCCGTAAAAAAAATTTTTTACCTCACTTGTTCAATA
TGTTTTTGTGGAGCACTTTTTTTGGGGAAATACTTTGGAAAGTTATCTGG
GAGAGACTTATACAAAATATGAACTTTCAAAATTATTTAAGTTTGGTAAG
CAAAATTTAAATTGTTTTCTTTTTTGTTTGGAAATCATGTCGCTACCCCT
CTGTTGTTTCCAGCGACCCTCACTCTGGGAATCACTACTCTATGGTACAT
GCAAAACGACTGGGATATTTCAGTAAAAGGACTAAATTGAAATTTTGTAG
ATCAAAAATATTTGTATGAATATGATATACATCTGGGATCAATATACACA
GTGCACCCTATATACACGCTCGATACTACATGCAAAATGAAATTTATTTA
TATGACTGCATAGTTATTCCATGGATCAAAAATTACTTTCTTCCGAACGA
AAGATAATTTTTGCTTTATATATATATACGAGTATATTCCGCGTTATGTT
ACATTATAAAAAGGGCCTATAAGACAAATGAAATAATTTGTTCTTCATGG
ATATTAGATATTTATGTTATAATTTTTTTGTTTTTTTGTTTCACAGAAAT
GGAATTGTAGAAGCCTTACTTAATAGTGTAAATATTTTGCTGGTATTAAG
CATACTGCCTGCATCATATGTATTGAACTATGTTTTAGAGAATAATTTGA
AAATTAAGCATCTTCACTTTGTCTATGGGGTCAAAATTACAACATACTGG
ATTACAGGCTATATATTCGATACAATCATTTTCTGCATAAATTTGGTTTT
CATCACTGTTGCCTTAATTGCAATTGATGCGTCAAGTCTTATTTCGGATG
CAAACTTTTATGGATTTGCTACTCTTATTATCTTATATAGGTAATTATGA
AACAATTTGCAAATATTTATGGGCCATTCTATGCGAAAAGGACAATGGAA
TGTATGTTAACACATATCTCAGAATTAGATTTATTTTTTTAAATTTATTA
TCTCCTTGCGTAAGTACTCGACATGTCTCAGAATTGATGATGAACAGACA
AAAAAACAAAACAAGTCATATACTTTATTTATAACTTATTATGATACTAT
TTTTTTCTTAATATTAGATGCTAAGCTTTAGCTACTGATGCTTGTTGTAA
AAAATCAAGATTCCACAGCAGTGGCGTTGCTAGCTCCTTCCTTAAAATAG
TTTCTGAAGCCTTCTGAAAATTTTATAATTTATATATAAAATAAACCTAT
TTATATCAATAGGTATATTATAGTGTTGATAACTTTTGGGGCTAACATCC
CCCCCCCCCCAACGATGAAAGCTAGCAACGACCCTGCTTGCATAGACACA
CAGACTTCATATGTACTAGTGGGAATCCCCAGAATTGTTTGGAGTTATTC
GGCGTTGACAAAAAGACACTTTGCTTTAATAATAATGTTTCTATATTTTA
TAATAGTTTTTTGATAGTCAGTCTTCGATTTAAAGGAATAGTTGTTTTAA
TATTTTTTATGGATAAAATTCACACCTCAAATATTTATTTTATTGAAAAT
GTAGTATATTTGTATATTTTTTGGAGATGTACTACTACCTCTAAATATTT
TTTAATCATGCTCAAATTTTTGTAGTACTTTTATTAAATAGATCAAGTAT
CTAGACTAAAAACGACTTCCTTTCAGCATAGGTACACATAGACAGACATA
AGTGCCTTTATTAATATAGACTCCAACAAGCTCAATGAACATTATTGCGT
TCAGGGAAAATTATTCTCTTGAACTCAATCTGCGTAGGTTTGCGTTTCGG
CCGTTCGAAGAGAAGTAAATATACTTTATGTATATTTCCTTCAATAAAAA
GTTACTAGGCCAGATTGAGTAAATGTAATAATTTAATGTTTACTTATACT
TAATCAGTGCACTCCACATGACCAATTTAAGGAACATTAAAAAAATATAT
AGCTATTCCCGAGGTATGTGTTGACGTTTTTTTGAAATTTTTGGATGTTC
TCCTATGATATATCTCTCATTTATAATTATTTATAAAATCTTTTTATAAT
TTCAGCTTAGCAATTATGCCACTCATGTATATTTTAAGCTTCTTTTTTAA
AAAGCAAAGCTCAGCCTTATTCGCACTTTTAAACTTAAATCTCATGATTG
GAATTATTCCTTTTCTGACTACCCTTCTCGTTAAATATGTGAATGAGGAT
GAAAAGCTCTACTACGTTTTGGAAACATTATTTATGATTTTCCCTCAATT
CTGTCTCATCCATGGTTTATTTCAAATGTTTATCGAAAACATAAAATCTA
TTACATATGAAGACCTGGGATTTACTTCCACGGCAAGCACTTTTGATTGG
AATTACCTTGGACAAAACTATCTATTTCTATTCTTTGAAGCTGTCATTTT
CTTTATTGCAAATATCATGATGGAAGTGAGGATTTTCGAATCTTGGCGCT
TAAAAATTTTGCCAGACGCATTTACGAAAGCACAAAAAGAAACAGATGAT
GAGGTGATGGATGAAGATGTTTATGAAGAATATCAAAGAGTTATGAACGC
ATATAATGTAAGTTTATAGGTTTGCAATATGGGTCATTTCACATCAAGTC
TCACACTCCTCCTTCAACAAAAATGATATTTTGACACTCCCAACTTTTCT
CAGAGTTTAACCAGTGAAATTGTCTTATAAAAACAAGTTATCGATGTAAT
TATTATTTTCTAGATGCTAACGTTGTTTATTTTATTGTATCTCTCTTCTT
ATACTCCAAAAAGATGTAGAAGTTTCATAGAAATGGCGTCATATTATCGA
AACAAATTTTTTATTGTTAGAGAAATTCAAACAGTGTGTGATCCTTACTC
CTTGTTGTTGGGTCCTATCACTCATCCGTAGAGTTGAGTAATTTGTTATA
AAAAAAGAGCGCAAGGGGAAGGTGAAAGCGAAACATAATATTGATATATT
TAAATAATATATTAATTTTAATATTAGTTGGCTATTATATGATTTTGGGG
AGAGAAAATGAACTTCTGCTATAAAGAGTTTAATTTACCATTAGTGCAGG
GGAAATATTGTCATTATATTTTAATTCATTTATATCTATTTTGTTAGGGC
ATTTTTAAAACAATTTACACCAAAGATAGCAAAGAATTCTTCTTTTAGAG
GGAGATGTTAACGGGCAACTACTTATTAAATAATGAACAAAAAAAAGAAA
AAAAAGAGCACGCGTATCAACCGTCTTTCCTAATATTCTAATCACTAAAG
TTAGTTGTTTCTTTCGACTGATCCCTTCTTTACTTATCAGTAACATAGTA
TACTATTCTATACTTCTCAAAGGGTCTTTGTAATTTATAATTAGCTACAA
GTTATTGGAGGCTATTAAAACATCAGTTTGATCCGAGTCCGAAGCTCAAT
TATCCGTGTCTAACCGATTTCCCCCAAAAATACCCAAAACACATCCCCAC
ATCATACCTATATCAATACTCTTTAGGATTAATTCAACATTATTTTCAGG
ACCCTAACAATGATGAAAATGCTTTGTTAGTAAAGGAACTCTCAAAGCGC
TACTGGAGACAGAAAAACAGTGCTGTTGACAAGCTTTCATTTGGAGTTCG
ACGCGGAGAATGTTTTGGTTTATTGGGAATCAATGGTGCTGGAAAGACAA
CAACTTTTAAGATGCTTACAGGGGACATCAATCCTACTTCAGGAGATGCT
TTTATCAACGGATATAGTATTTTTAACGAAATGGGCCGATGTCGTCAAAG
TTTGGGCTATTGTCCTCAAGAGGATGCTTTACATCCTTTACTTACAGGGC
GGGAGCATCTTGAGTTGTATTCCAGGCTCAGAGGAGTCAACAAAAAGTCT
GAAATTAAAATAGTCAATTATTTTCTCAAAGAACTTGGTCTCATCTCATA
CTGTGACCAACTCACACATACTTATTCTGGGGGAAACAAAAGAAAATTAT
GCKCAGCCATTTCCCTCATTGGCAAACCTTCCACTGTATTTTTGGTAAGT
CTTAATTTAATATATAAATATAATATCGGTAGCACCCGGCATTGTCACGT
CGACGAACGTACAAACTTTACTTTATTAAAGTAGAAGATAACTCGTGACT
CCTTTAGAATGAAATTTCGATAATAAAAGTTTGAGATTTAGAATTTAACT
AGCAGTAGTTATTGACCGAAGTTGATAGGCGTCGACGAACATACAAATTT
CACTTTTATAATATAGAAGATAACACCCCAACAAATCCTTGGTGTTACCC
TCTTTCTTTCATGAGCACACGTAGCTACTCACTCAATACTGAGGGCATCT
GCAGGCTCTGGCTCCTCCAATCTCTAAATTTTGAAACTTTTTGTAAAATT
GAATTTGTTGGAAATAAATTTCAAATATGACATATTTTGTAAATATCTGT
AGATTTTTAAAATTTTTTGGAAAAAAAATTAAATTTCTGTAAATAGCTAT
GAATTTTCGATTTTTTTTTAAAAGTGTAACATTTATAACTTTCAGTTTTG
AACTTTTTTGAGAAGTGTGGATTTTTGAAACTTCTTCAAAAAAATATACT
TTTTTTTGTATGTTTGAAATTTTTTTCCACAAAATTTAATATTTGAAATT
TTCTTTTTCAAAATATGTAATATTTTATTCTAATTTTTTTTTTTCTGTTA
ATAACTCTGGATTTTTGAAGTTTTTTTCGGAAAAAATTAATGTTTTTTCC
CAAATATTTTTAATTTAAAGCTAAAAAACCAAGCCCCCCCCCCCCCCAAT
TATGATCCTGCGGACGCCCTTGAATACTTTGACATTCTCTCCTTAAGAAG
AAAAAAAGTATAATTACTGATTGAGAACCAAAATTAAAAAGATTGTATGA
GCCAAGAAGTACTTTATATCCTTGCTAAACCTCATCTACAATCACATTAT
TTTTTTAACTTCCAGCATCTTTTTTTATATTAGTTGAACAAAATCCCTGC
AAGATTTTAGTAATTTTATACTTTGCTTCTTGTATAATATACTCACTTAT
ATAAATCACATAAAGCATTGTATATTATTGCGGTTCGATTGTCAACTTTT
TTCGAATTTTGATTAGGGGTAGTACGGAAAAGTTATCATATGGTATGAAA
ACTATCCATGTAAAATTGCATTGTCCTACGAGGTCATTTTTAGATCTTAC
AATAGTTTTGATAGACATTTTTCTAACCTTTTCGTAAGTATTTAAAAAGT
TTTTTTCTAAAATTGTATTTCTTGAGTTGAAAAAAGAGATGAAAGTTAGG
GAAATTTGATGATCCACGTATAGAGCGCATCTTTTTTACATTTTCAATGT
GAACAAATTTTTTATTTTTTTATAGGATGAACCAACAAGTGGCATGGATC
CTGGTTCCAGACGATTTTTATGGAACTGCGTTTTAGACGTAATACGAGGA
GGTCAATCTGTTGTGCTCACATCTCACTCAATGGAAGAATGTGAGGTACT
ATGTTCACGACTAGGGATAATGGTCAATGGAAAGTTTAAATGTCTTGGAA
CTGCTCAACATCTTAAAAGTCGTTTTGGATCTGGGTATTCTCTAACCATA
CGAAGTGGAACCACAGATGGAAATCTTGACTCTTTAAAAGACTTTGTATT
AAATGCATTTCCTTTCTCTGAAATTAAAGAAGAGCACTACAATCAACTCA
CATATCAAATACCTCTTAAAACAATCAAATTGTCCACTATTTTTCACGAA
ATGGAAAGAGCAAAGTCCATGAAACATTTATTGTTAGAAGACTACTCCTT
GACTCAAACTACATTAGACGAGGTAATACGGATTATATTTATAGTTGTAA
AAATTTTTTGGTATGTTAAAAAAAAATATATATATATAAAAGCAACATGG
TAATCCTGACAATTTAAGGAATGTTTAAGAGGGAAGCAGATTAGCTGTCA
TGGTGGCTCATAGATTAGTTGCGAACAGCTATGAAAAATAAAGATATGGC
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ATATATAATCCTACATACGCCCTTGTCTGTGTATAGCTGCACTTAACTAA
ATATTTGGTTTCCTTTATTTTAGCATATCGGTTGGTTATATTTTATACAA
TTCTACTTTAAATATTATTTATAATAAATAAAAAATCCTTTTTTCTTCCA
TTAGGTATTTATTCGCTTCGCAAGCGAACAAAAGGGAATGTCTGAGGATG
CTGAATTTGTAAACGATGAAGAAGGACCCGAGACCGCAGTAGAAACCACT
GCCTTATAGTTCTCCTTAAAAAACTTTAGATATTTTTTTTTCTTCTTTCT
AGTGTGATATTTTAATATAATTGTTGAGGTTTTAAAAAAATAGTAAGCCA
TACGTGTATATAGTTAATTTGAAAACAGTTGGACGTCCTACTTACAGTGT
GTATACTATACAATTTTTAAAATTTAAATGATTGTTATTTTATTTACTAT
ATAAATTAATTAGGTATGTATTTATGTAGTCGTGGAGTGAAAGGCTGTGT
CTTAATTATTCATTCATATTTGTATATTATGATACCTTCATGTTTAAAAT
CATACATACATACATAACGGCTTTTTTTTCTATTGTTTCTATTAAAAAAC
TTATTTTGTATGAGCATTTATCTATTTTAAGTTTTAAATCAATTGCGCAA
TATATGTTTTTATATTTATTTTATAGGTGTTAG back to top
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