EMLSAT00000001147, EMLSAT00000001147-696994 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000001147
Unique NameEMLSAT00000001147-696994
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s118supercontigLSalAtl2s118:91392..124552 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000001147 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000001147EMLSAG00000001147-683913Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000005007EMLSAE00000005007-713935Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005008EMLSAE00000005008-713936Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005009EMLSAE00000005009-713937Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005010EMLSAE00000005010-713938Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005011EMLSAE00000005011-713939Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005012EMLSAE00000005012-713940Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005013EMLSAE00000005013-713941Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005014EMLSAE00000005014-713942Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005015EMLSAE00000005015-713943Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005016EMLSAE00000005016-713944Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005017EMLSAE00000005017-713945Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005018EMLSAE00000005018-713946Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto771903auto771903Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000001147EMLSAP00000001147Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000001147

>EMLSAP00000001147 ID=EMLSAP00000001147|Name=EMLSAP00000001147|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=693bp
MNSEKEPLSHGFNVSRLSVLLNDEEEFIGSMNTWMKIKNISVKENVLQSL
LDASIDVSNLSGSDILSIIGNPVSVLCKPSFDELMNVHGQINPFNITDWS
LFIKTVQELQNNLLNQSSFKSVMGCFETDKFVGVSSEYELEKMGLNLIGN
NNLWAGLVFQDFPPDQKDDTLPEFITYKIRMNSVTVDNTRQIQDRFPSLG
PRKNPTVDLKYLTFGFAFLQDMTEHAIISIHSGRESSELPGISLQQMPYP
CYVKNNVIDNIGELLRTMIFLSWIMPVSGLIKSIIYEKEARLKETMKAMG
MGSAAYWMSFFLDRFSGGIIFIVTSFPLSLMKNVKVEFNTKMVACLLSNV
AFGTGLDYINAYEKTGFGIQWANFMKTPFDSDNFSLGLSIGFLWLDAFIY
LLLAWYIGNVFPGEFGIPKPFHFPFSISYWRGTKPALVETNSKENLDDSS
QNKKDIEEEPKHLPCGISVQNLHKVYPKGLFPPSAGTIKVYGRDIQKETE
SVRRYLVGGSRVIILDEPTAGVDPFSRRSIWDILIRYKTGRTIILTTHFM
DEADLLGDRIAIISEGKLITCGXSLFLRNRFGNGXYLTIXXYIPEDNHHE
VFSSIEDEEEDKELNDCSLPNGMLIDDEGISDVSKVNGVIINPSSSNPRA
RTIALTKFIQKHIPDARLFEQLGSEILYLLPTEDYENSIKKFF
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mRNA from alignment at LSalAtl2s118:91392..124552+

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000001147-696994 ID=EMLSAT00000001147-696994|Name=EMLSAT00000001147|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=33161bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s118:91392..124552+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGAATAGCGAGAAAGAGCCATTAAGTCACGGTATGAGATGGTATTAAAT AGTACATGACAAATAACCATTTATATATACAGACATTAACATATTATGCA TGAAACCATCTAACGCATTAGATGATGGATTTATTGTTTATATGAATGTA CAGGAATAATCATTGAGTTCAAATTTAAATCCAAGGATAGATATTTATTA GTGGTAAAACTCGCTCCAAGACTGACTATTTTTTAGTGAGCTCTTAAGTG ATCTCAGAGAGTAAAATGAAATTTAATCGTTTTCAAATCCTGGACATATT TTTTCACTCCTAAATCTATGGACCAATTTTCACACATGTATGATTTTTGG ACAGGGTTGGGGTGAAGGACAGTGTAGTTTTTTGATTTTTTAAAATGAAA ATTAACAACTATTCACAAAAAATTTAATTTTTTGACAATACCTATGGATT TTTTAAATAATTTTCCCCAAAAATAGAATATTTGAAATTTTTTGTGAATA ACCGTGAATTTTTGAATGATTTTAAAATTTTGTATTTGAAATTGTTTTGC ATAAAATTAATTTTTTTCTCAATATATATGGTTTTTTTTTAAATTTAATT TGTGTCAATAGTTATTATTTTTTGTCTAAAATTTTTTTTAAAACTTAATT TTTTGTGAAAAAAATGTTAATTTAAAAAAAAAAGAATTCAAAAAAATTAA AAATTTAAAGTCTAATTTTTGAATTTTTCCCAAAAACTAAAATTTTCCGT GACTAGCTATAGAATTGAGAAATGTTTTCGAAAAAAAAAATATTTGAAAT TTAATTCCTTCCTCAAAATATAATCTTGCGGACGCCCATGATGAGGTATA CCAATATGATATATGCAACACTTTTAACTTCATATGGCGTTATTGTAGCT CCATGTTTACCATTTTGATAAATAACTGACCCCATTAACAATTTTTTTAC AGTGTGGGTACCCGAAACTTGCCTTAGCTTGACTTAATCACAAAATATAT GACATTTATGGAATCAAGAAAAAATAATTCAATACTAATTTGTGATGTGT AGAAACACTATATTTAGCTATATTTTTTATTCAGTATGTTATTGGCAGST CTTCACGATGGAGGCCGTGAGGCAGACATTCTTCTCCAAGGCCCCAAACT ACAAAGTCCACGTGTTCGAGGTAAAGGAAGGAGGAGGGCCACACAGAAGC AGGCTGGCCAGAAGTGAACCATATTGTTGCTTGTTTTGGTTATTCTTGCC TCTGTGGGGCTGTAATGTACTTTTTGATGTTGTAGGCAGTCCAGATGGAG ATGTCCTTCTTGGCACTGACAAATGCACAGTGAAAATTTTTACAAGGGTT TGAATTTGTGTTTTTCTTCCCAGATTTTTACACTTAGAGGCATGGGATAA AAACAAAACTTGGATATTTACGTTTGCTTGCGTAGTGAAACCTCGTAGTA AAAAAATAGTGGAGATAAAATCGTTATTAAATACTTCTGCAAGTTTTGTG GGATTACTTTGTAGTGAATCGGCCTAAACCGAATTTTAGATGAGATTTAT TTTTCTTGAATTTTTTAATGACCAGATTTTAAAAAATGGGGAACTGTTTA AATATTTTTTGTATAAAAATAATTTATTTAACATTTATTTTGCAACTATA TCCCTCAGTTCTAGTGACAGATCTGAGCAAGAGCACATTTAAAAATAAAC AATTTTTAAACTCAATAATTTTGAATGTACTCAAAATTAAGAGCTTTTAG AGGAATAAAGTTTAAATTGTGCTTCAGTTGATGGCCACAGTCAATGCCTT TACTGATACGATCCCCTTATGCGAAGTTATGTATGTGTGATTAAAATCCT CTCAATTATATATTCAGTGAAATATCCACACAATGGTGTCATGACAATGA CACTTAATACTTCATTCAACAGACTATTCCAAGTAATTTTTTATAGTTTA TACAGTCTGAGAAAAAAGAGAAAAATAAATGAAGAATTAAAATACTAATC GATTGAATGTTTTTTTATAAATATACTATAAATGTATGATTACAATAATC AAATAAATAACCTGTGTAATGTTTATGTTAATCTGACCATAACCTTCAAA TGTTAAAAGATTCGATTCTAATTTAAACATTACTTAAGACATTACATGGT TACTTTATAAGGTTTCTCATTTTATTAATTTTTATTCCGTATATATGACA TTTTTTATTTTTTTTAATATTCTGAGTGTCAAGTTAAATACAAAACTGAC AAAATCTTCTGTTTAACACAATTTTTTTTTCTCCATAGGATTTAATGTTT CAAGGCTAAGCGTTCTTTTGAATGACGAAGAAGAATTCATTGGAAGTATG AATACGTGGATGAAGATTAAAAATATATCAGTGAAAGAAAATGTTCTTCA ATCTTTACTTGATGCCTCAATTGATGTTAGCAATCTTAGTGGATCTGATA TATTGTCTATCATTGGTAATCCTGTTTCAGTTCTGTGTAAACCATCCGTG ACGTCAAAGCTCTTTCATTTTCGTCAAAAATTAAACAATCCAATTCAGGT TGGTTCATTTTACTACAAGGAATACTCTTTACATGGAACATTAAGGTGGC CCTTAAAAAAGGAATTATATATTTTATTTGTCTTACCCTTCATAAAGTAA ATTTGCTCTGCAACTTTTTTGTTTTTTTTATTTTACTTAATACTAAACGG GGCCCTCACTTTTGAATGTTTTGTCATATATTGCTAATTTAGGTGTCAAA AAGTTTGATATTTACAACTTTTTCTAATGTCGTTAGGTTTCAAGACCAAC TTTATATGTCGTCTGTAGAGATAAATAAATCTTATGCCAATAGAGCATAT TCACGTGGCATCTCAATTGTTGATGCCGGTCATTTTGGTGGCCTATACAA CCATATTTTATAACAATACAAATCTGCTTTGATTATTATTAAGGCAAATA GTTAATTATTCGATGTTCAAATGAGATCAACAAATAAAAGGATTTAAACC TTACTGTCTATGAAAAATCTATCCCTCTTTTGGCCAGTTTTATCATGTAT CTCTCCTAAAAATATGCTATTACTTCGTTAAACAATCTTATTTTATTACA ATGGAAGCATCAGATATTTTTTTCGAATTATCCTACTTCTATTTTCCCAA TCCAACAAAAAAAAAAGCCATTTTAAGGGATTTGTAGTACATATCAGTTT AATTTAATTAAAATATCAATTTTTATCATTTGTATCAAGTAGGATTCAAT GGAGATGTTTAGTCTTTTTCGTTTCTTAAGGGCATTTCATAAAGTTCCTT CAAGATATATTGAAACTTTGTCCATTTTTGTAGTTAAAATATCCCCTTTG AGTCCCCAAAATGGTATCTCCTTCTATTACATATAATGCAATTTATGACG TGACAGAAAACACTCTATACCAATACTTTTACTGTTTTAGTAGTTTTTGC TCTTTGAATATTTAATCCTTTTTAACATTAATTAAATAACTTAATATTTA TTGTATTACAAAGTGCTTAATCTACAAGACGAACCATTATTTGGTACACT CTTCTCTTCTCGATAGTGGGGAAATTTTAACTATTTCTACGCTTGATATT TTTTTCAAAAATAAAAACGTCAGCAAATGTTGAGAAATTAACAATTTTAA TCAAATGTTAAAGAGCCAAGTGCCAACTTCGATTACTGTTTAAATGTTAC TATTTTCGGGAGACTATTATATATTTTAGAACTAATACATATTGGATTGG TTTTTAGCATAATAGACAACGCAATCGGGAGAAATTAATCTCTTCAAATC AATGTGCGTAAGTTCTCGCTCTGGCCTTTCCTATAGAAGAAAATATACAT TATGTAAAAATGGACTTCAAATGTAAATATGTAAATGTAATACTATAATG TTTACTTAAACTTAATCAGTGTAATTTCCACGTGCTAGGGTGTCATAAAT TTATGGTCTCTGGAAAAAAGTAAAACAAAATTATGTTTTTTCCAAAACTT GATACTCTCATCCGATTGGACGTCCTAAATTTTTATATCTCCCTCCCTCA ATGTATTTTTAGATCAAATATATTGATTACCTTGAAGGCTACTGATTAGG GGCGTCCCCGAGATTATATTGGGGGAGGCCGGCTCTTCTTCTTTTTGTAC AAAAATTCCTTCGTTTGGGAGGTGCTACAGCACCTCCAGCCTGCAGATAC CCCTGCTAATATACTACATATTGAAAAGGGTTTGTTAATCAGTGAAGCAT GGAAATTTTTTCAATAAAGTAGTCTCCGAAATATCCCATATCCCCTCCCT TACTCTCATCCTAAAAAAATACTTTCTGGTCAACGTTTAGTCATAAACGT ATGATCCCTAGCCAAACATCTCCTACGTAAAACTTCAAATATCTAACCCC TTTGAAAAGGGGTTAATATAAAACTTTAACGGCTGAAAAGACATCGTTTC TAACTACGTTATTTCAGCTATTGAAGTTCTCATAAAACTCAAAATACTGA TTTATTTTATTATAGCCGGACTGATAGAACTATAGTCTATTTTGTTTTAT TTTTATACCGATCCAACACTTATTAGAACCAATTGAGAGGGAGGGATGAT GAAAATAAAAACTATGATTTTTTTATGTACACAATAAGAGCCACCATAAT CGACGATGCACTCTTTCTTTTTCTTCTGTTTTAACCCTTTGTAGGTTAAT AATTTTATAGGTAGAATTGTTATTTAATGTAAGAGGGAGTTGAATAAAAA 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CACTGCTTTTTAATGGGGGGGGGGGGGCACCGTTCAAGCTTAGCAATGGT TTGGAAAGTGTTATAGGGACTCTGTTTCATAATTAAACGTCATTATGCTT ACTTCAAACGTAGTTGTAAAGATACCAATATATATATTTCATTAACGTTT GTCCATGAGAAAGCTCTGTTCAATGTGAGTGCCTCATTTACTCACTTTTG ACAAAAAAACACAAAAAAAATGTGCTGATGTTTTTACCATGTTTTAACGT AACAAACTGTAATTCTTGTGTCGGTATGTGACAATGGATGAAACATGGAT CCATCACTTCTCTCATCATCTGAGTGGACAGCAACTGGTGAACCTCGTTC TAAGCATCCAAAAGCACAACAATCAGCTGGAAAGGAGATTGTCTTGTATT TTGGGACTTGTATGGCATAATATTTATAAACTAACTTGATCTATCTAAGT CATGGCCTCGAAGGTCGGACGAAATGGTTGCTGCCGGGAAAAAGTCTGTC AAGGGGTTCTCTTGTAGACCTTAAGGCCAAGATATTTCTTAAGTGGCCGG TCCATGGTCCTTCTGTTGACGTTGAGCTCCCTGGAGAGGCCGCTGACTGT GACCTTGCCTCTCTTGTCCTCGACAAGACTTTTTTCACGGCATCAACTAT TTCGTCCGACCTACGTGGTCTTGACTTAGATCCTGGGGTGGCCTCAGGAG TCCCTTTGGCTACCACGCTGTAAACAGTGGTGCGGCTGCATTTCAGAACC TTGGCAATTTCAGTGGGAGTTTTTCCCCGCCCGGAAAATTTTCAAAAGGG CAACTCGACGTCTCTCCATATTATCGACTGTTGGTTCATTGTTGCTATTA AGATTTTGCTGGAGTTTTGTTCATAACTAGTCAATACCCTTGCCTCGGAG TATAAACCCGTTTCAACTCAATAAAATCCCAAATATGTGTATGGCGTAAA 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AGACGGTGAGTAAAACACATGATTTGCAAGGTAGTTAATTGTATATGTAA GCCCTCTTTGGACTCCGACTAGAATTAAAGATCGACATCTGAGTAATTGT TGCCCACAATTATTCTGTAACATGCGAAGTGTGATTTGCAATGGTTAAGA AATAATATAATCTACCAGTATGCTAAAATAATCCCCAAAATGAACGTGGT TACCCTGACAATTTGAAGCATTTTTGCGAGAAAAACAGCTTAGTTTTCAT GACGATATTCAAATTAGCTGCTATTAGCTATGATATGAAGGAAATACGCA CACACTCTACTCCTTATCTACGAGTGATATAAGCCTGAATTACTCCAATA TCGATCCTTAATTCTACCCTGGGTCCAACAAGGACTTTCACTTATAGCTT GCTAACAAATCTTCAGTGTAACTAGTCATCTTTTACTCGCATGTGATTAA AGATAAAGCCAAGTCTTCTTATGGTTTTTTTTAATTAATTGTGCCTATAT TTCATTTAATTACATTTAAAAAACATGTATATTTCTTTCTATTTTTTAAA GGGCCCTTCTCATAAAATAAGTTCAATCCTTTTTCTAAATTATGGTGATT TTAATATTATTTCTTCTTAGTTTATATCAATACAAATTACAAAATTTTAC CCAGTCTTAGAGCAGGGCCTTTGTCAAGGGTCCCGAGTGCCCATTTTAAA ACCAGTTCTCCTCCCAATGCTACTTGTAGCTTATCTAATATAACATCTTG ACAGRTAACCTGCTCTTTTTACAAACATTTTTCAAAATGTCAGGATTACC ATGGGAATTTTTGGTTTCTTTCTTTATTTTTAGATATCGAAAATGCTTAG AATTGACATGTTATTATTGCTAGTGCAAATGTTATAAGATCTAAATATAC AATTCTGTATTTTATATAAATTAGGGATGTATCAAATATACTCAGAGAAT 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