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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s1190 | supercontig | LSalAtl2s1190:13382..27967 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000001149 >EMLSAP00000001149 ID=EMLSAP00000001149|Name=EMLSAP00000001149|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=190bp
MTVTELSGMIRSMQFSGYPFQGQGRVNQLGGVFINGRPLPNHIRLKIIEM AXAGVRPCIISRQLRVSHGCVSKILNRYQETGSIRPGVIGGTKPKLATPE IEKKVDMYKNENPGVFSWEVRDRLIKEGFCDKNTVPSVSAISRLLRGKED YERKNGNSSQDPTPLSQSNLGSSSLQNHGTYPSTSSLTSQ back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1190:13382..27967- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000001149-696996 ID=EMLSAT00000001149-696996|Name=EMLSAT00000001149|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=14586bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1190:13382..27967- (Lepeophtheirus salmonis) ATGACAGTTACTGAACTGAGTGGAATGATAAGATCTATGCAATTTTCTGG
ATATCCCTTTCAAGGTATTAAGGACAAAAATTTTGTAAATGTGTTTTTTT
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CAGAATAGTAATCAAAAGAACTTGATTGATGTGTTTGGACATTTTCTTCA
TTTTTCCAATTTGAAATCCTCACCTTCTGAGTCAAGTACGATTTGGACAC
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TGTTCATTCATGTCTCAACTTGCTTGAGCCTATTCAAAAGCCAGTTCATA
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GATACCCACGTCTTTAAAGATAGTGTTTACTATATCAACAAAATGATAAA
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TTATTAAGAAATATTATTATTAGGTAATTTCGATTGKCAGCCATATTTTA
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CAGTTCCTACAAAATGTGTCTAATCATACAAAAATGAAAGATCATATTTG
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ATTTTTCAGTTTAACTTTCAATTTTCTTAAGGAGTATTTTATAAGTTTGC
AATCAAAAATATTGCATGAAATTGTTCTGAAATTAAATATAAACAAGTCG
ATTAGATAAAATAAATCTATAATATATACTAATCCAATACATTTTATATG
AAACACATTTAAATAATCTCCTTTCCTCTAAAATATTAATTAATTAAGTC
AATTAGCGAAATAATTGACTTAATCATATATATTTTTGGAAACTTTTCAC
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TTTTTTGGATTTGTGAGACTTTAAACTCGATTTAGATATGCAATGTATGT
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AGATTAAATTACATATGWTTTCACATCRCCCCCCCCCCCCCATTATTACA
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AAAAATAATATAATGTAAGGAAAGAATAGAATTAAGTAAATTGTAGGGGA
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GCTAGACGTTTCGTTTTAGGAATTTATGAATATGAAAATTTCTCTTACAT
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GTTAATAGATCTGAAGTTTGTGATGGTCTGTACTCATTGAACAAAGGACA
TGAGTTCACTATATTTGAAATGGAATTTCCCCTGCTAGTAATATAAGTTT
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TGGGAGGAGGAGATCCGATKCCTCATKAATAGATAAATAARCCCACACTT
MGGAGAAGCCGTTAGAAGGATGGTCAGTAGATACTTCATTATATTTAAGT
CTATGAGAATGGTATTAATCAGTATTTGACAATTAAAATCTTTACGCGAA
GCAGTTATCAATGGTAGTAGAACCGGATCAATTGGGCGAGTGATAAGCAG
GTTCGCATATACTTCTGATTTTTTTTTGGGGGGGGGGGGGGAGTCAGAGA
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TTTTGCATTTTCCACTACATCTATATTCTTTCCCTTGAACATGTTTGTGG
TAAGATACTACCGTAAATGAAATCTCAAGAAAGTACACTTTGCAACAAGT
AACCTTCCATTGCATGGACGTAATCTCCGGGGACCAAGAGACCGAGTTGG
AATCTGAGTCTATTACATATCTTCCCATATTATCTCCTATTGGTAACTCT
GATTATATTGACCTGTTTTCCCCTCAAAATGTAAGGAGGTTCTTATTATT
ATATAACTAACTGGAAATATAGAACTCTATAGCAATAGATGTGCGTTATT
ATTGTCCAGTTTTTTTATTATAGAGTAAGAAATACAGTCCATTAATTTCA
TTATCCTTGGTTATCCTTCGAGCCTAATTTTGAACATAAGTTGGATTGTG
GTTCCTCAAATATTTAGGGGTTGATTTTCTATTCTATAATTGTTTTTGAT
ATATTTGCGCAGTACTGATTGAACATCGGGGTCTTTGAAGTCAATCGACT
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ACACCACAGCCATTCAATCATACTTCTTTGAATAAATTAGAAGAATGGAT
TATAGTGTGGTTTTGGAAGCTTAAAGGGCTCATTATAAAACTATACTCGT
GGGCTTCGAAGCTAAAAGGCTCATTGTAACATCACACCCATTCAATCAGA
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AAGACATTTTGAAAGTAATCAATATACTCAATTCAAATGCCGTCAATAAA
ATACAAAATATTTATTATAAGCTGAAATAATATGCAAATATATGCAAACT
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TTTGAAATAAGTCAATTGAATTAAATCAAATACCATCAGTAAGAGACATA
ATATTGAAGATTAAAGCTATTATATTTGATGTCTAATCATTGAGAATAAC
AATTCAATAATTAATAATTATAACATAGCATTCTTTAGTTGGATAAAGGT
TTTGACTAAAGTTAAACAAGAGCATCTATTATTAGTGGATGAGGATTATT
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TTTGAAATGGGTTAATTAAATCTAAACAATTTCTCAATGTTCTCCCCAAC
AAAAGCTCAGATGGCGACTTTCCCGTAGTAATGTGGGGAGGGATTTTTAA
TTGAAATAAAACTGATGAGAGTCGATCAACCCACCTACTCGAAGAACACG
ACAATACTAACTTATTTAATTGTTTATTAGAATTTTCCAATAATCCATTA
GACGAAGGATGATAGGGACTTGAAGTATTATGTTTTATACCATTACTAAT
TATATAGTTTCAGAATTCCTGAGAAGTAAAACAAGTAGCATTACCAGACT
CAAGACTAGTAGGCAATCCTAATGTAGAAAATACTATTTTTAAAGAATGA
TATTGTAGTATGAGACAAAATATAACTAGTAGGTATTTCTAACCATATGG
AATGAGTATCAACGATTACTAAAGTATATTTATTATAAACAGGACCAGCA
TAGTCAATAAGTAAACGAACCCATGGTTCGAAGGCCACTCTCATGGATGG
ATTGGAGCTTTTGGAGAAAAAATATCTATAAAATAGAACATGAGCAAATA
ATAAATTAATTAATTAAATATCAAATCTAGCCCTTTATTGTATTTTAGTA
GAACCTAAAATATATAAATGTAATTCTTTCAATAATGCATCTCTTCCCCC
AAACAATACAACCATCTTGTAGAGATAGCTCATCCTTGAAATTTTTATTT
TTATTTTAAGGCCAAACATATCAACAATAATTATAAAAGGCACAAAGAAT
TTTATCCAATTTTACTAGTTTACTAGTAATAAGAACATTTTCTAAAAAAT
CAAGGGACTTTATTCACTCATACAGACTAGAACAGAATCAGGTCTATTAG
GAAGAGGAAGTGGGCTTAACGTATCGGCCGMCCCTAACAGTTCACCCGAT
CGATGAAGAAGAGTAAAATTATATGCATGAAATATAATACTCCATCGCTG
AATACGACCCGATACAAAATCTGCAAGAGTTTTTGTAAGGATTAAATTTA
TAACAGGTTTATATTAAATAATTAAAAAGAACTTTTGTCCTCACAAATAA
TAATGGTTTTTTTTGGGCAAAAATATGAGGAAATATTTCTTTTTCTACTG
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GGGTGTTCTACTATTTTCACTTCATGACACAAAATGACGCCAATACCATG
ATTACTTGAATCTGCAATAACAAAAATAGACAATTTAGAATCGAAATGAA
TCAAACATTTGACAGCCAACATTTTTTTAAATTTAATAAATGAATGGTCT
TCCTCTTCACTCCACCTCCATTTGATATAACTTTTTGATAAGCTATTTAG
TGGTCCTATAAAAGTTGACGTTTTGGGAATAAATTTTCTATAGAAATTTA
CAATTCCCAGAAAAGCTTTCCATTGAGTGAGATCACTCTGCTTGGGTAAT
TGAAAAACTGCTATCAATTTTTCCTCAGTTGATTCTAAACCTTAATTCGA
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GAGCACATGAGAATGTTCCATCAGGTTTCGAATGTAGTAGGGAAGGAAAT
TCACTACTKATAAGTTAAATAATAAATTGACAKCAGCCACAGAAAAGAAA
ATTTATTCTTCCTATAACCTATTCCATAAATAATGGCTGCACTAAAAAAT
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TGGATGTGGGAAACGACCAAAATGATAAGTCATCGTACGCTCAGATAACG
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AATACAGATTGATACGCCGGCGAGAGAAGGAATTGAGCAAGTGAGTAAAG
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ATTTATTCAACATGAAAGATAAGAGTCTTAGACACATGTCTATTAAATAT
GACCGCCCATGTTCTCCACTACCAACTCCAGGCTGGACCGGAACTTGTTG
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GGCAGACTTCAGCTGGACCTTGGACTTGTATTGGACTTCCGACAGCATCC
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TCACCCATTGAAAAATCTTTTATTCAAGTGGAATCTGTCACAACGAAAGA
TGTAATAGGTTCATGAGAGGAAGTTGAGGAACATTGTGAAGATTAATAAT
GAGGACAGAACGAGAGTTGGATCTCTCGTTGAGGAGGTAGGTCGGAATAA
AATGCAGGATAATAGAAAAATTTCAAACCAAGGCAAATGATTGAGAGATG
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GACTGATGGCTTGCACAAAAGAATATTGACAATTCTTGCAAGCGAAGAAC
CCAAGGGAAAGAGGAAGAAAAATAATAGAGAAGTATAAAAACATCAAAAG
ATTTTCCGGTCTGTTAATTGAAATTTAATATGACGAATACAAATAAGAAT
ATTATGAGTAACAATGCTCTGCAAAAATACAAAACCTCTATCATATCAAG
AAATTATAACCTATTGAATAAAAAAAATCCAATTTTAGAATTTTCTCTCA
AAATGTACGATCTATTAAAACCTATGAAAGAAGACACGATTATATTGACT
ACCTTGTATCTTGAAGTGAAGACATTTTTTATATTCAAGACTATAAAATC
GATGAAGAAAATCATAGTTGTAGAGAAAACTGTACAAAATGTGACCCTAA
GGAATTAATTATTTATCGGAACTATTTAGACAACAAAAGATGGATGTTGA
TCAGAAAATGGCCTGGAATGCAAACTAAAAGACTACAATGAAAACAAGAT
TGGGAAGTTATTGTAGGTAACACTTATGGACCATATGAAGATAGAGCGGA
ATTCTATGAAAAAATTTGTAAAGAATTTTCAGAACTAGACTATAAAAATC
TAGTGTTGGCTGGTGATCTAAATCTGTTCTTTGGCAAACCAATGGATTCA
TGTATTTACGAAGGGCAATATAACTTAAAATCTAGGAAAGTTTTGGAACT
GATGATAGAAGATCTAGGAATAGTTGACGCAGTTAAATTTTGGAATGGAG
ACAGTTTTATCGATACATAGTCGACTAAATCGATGAAAAGTCGCAAAGAT
TTCTTACTTATAAATTCGGAGATGACAAAGAGATTAAAACATATTGAGAC
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TGTCTCATAAGAGAAAAAAATGGATAATGCCCAAAAAGATTTAAAAAAAT
CAAAGGTTCATCGATTGGGTGGCCTCTAAACATTTGGACCAGGTTATTGA
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TTAATGGAATTAAGAGAATTGTGATAGAGGAAATTCGTGATGAAAAAAAC
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TATTCAACAGATTTAAACAGGCACAAATATTAATGCTTGAATATGAAAGA
CTTTCTTTTAAATAATACTTGAAACACCTTAGAGAGTTGAATGAGGATGC
ATACTTTGTTGAAAAATATGTGTTTGTCTTTGAGAAAAACAGAAATCAAC
AAGCTCAGAATATTCCTGGGAAAATCAAATTACTAGAAGGAAAGGAGTTC
TACACAGACATTTTATTTGGAAAACGGCATGGTTAACGAAAGAAACTGGT
TAAAGAACAAAACCATATTTTTCAGAATTTTACTTTAATTCGTAAATCAG
GAAGCATTTTAAAGAAGATAAATCACCAAGCTTTAGTGGAATTACTTCTA
CATTTAATCTGAAACGAGGAATTATTACCTTAACGCCAAAATCTGACAGW
AAAGCAGTCGATCCAAGAAGTTTCTATCCGATAACCCTATTGGAGGTCTT
GCACAAAATAATTTCATGTACCATAATGCAAAAGATGGGGCCCACTTATC
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GCAAATGGGGGATATAGTACAATAATAACAGTTGATTTACACAAGGCTTT
TGATACAATAAGTCAAAGGATAGTTTTAAGACAAATTTAAAAGAAACATT
AGCGATGACATATATAACATCATAAGAACCTTTATTTCAAATAGAGCCTC
CTTTTTCAGCATAGATGGCGTCTTCTCTAACCAATGTTACAAACATAGTG
CGTAGAAACCTACAAACTCATATAAACTGTCTTTTAAATGTGGTGAAATC
GTCATGCAACTTCATATTTATACGTCGTGTGAAATGACGAAAGACTTAAT
GCATCTTACGTCTAAGATACTTGCGAAATTAAAATTAAGGAAAAGGGCAT
TGACTTTTTTTTCGGACCTATGGAAGGAGGCAGGGAASCAGCCGTAGCAA
GAAACTTATTACATTTATTAAAAAATCTATAAAGATGAAACCAAGTGGCC
ACCTCCTAACTTAGCAAAGTATCAAGACTGTCATGAGCTTTGGAGCAAGA
AGCGGATGAAACGGTTAAACGAGCAAAGTTACATTAGTGTCGCACATGCC
CAGTTATAACAACAGCAGCAGCAATCATCATCTAACCCACCAAATTCATA
ATCCAGCCCAGCACCCAATTCAGAGATTTAATTGAATTATGTATTATGAA
AGAAATATGGTGTTTACTTTTTTTTCTGTCTTCCATCTTAGTTCTCATTC
AATACCTGAAAAGCTTTGTATGTAATAAAGTAATAATTAATAGTTATTCA
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TCTAAATCCAAAAACTCAGAAAAAAAAAAAAGATTAATAAAATGGATGGA
TGCACGAGGCCATTGGAGCAGCTGAAATGTCGCCTGGCTTTTTACCTCAT
ATCAATTGGATATTTTAATGAAGGAATAGGGCTTCTACCTGAAAACTCAA
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GAAGCTCAGAATTATCACAACGAGGAAGTGTAACACCTCTTTCATTGTTT
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AATACAATAGAAGAAAAATCCATCATTATCGCTTTTGGACCATAGTGTAA
GGGACACCCTTGTGCATTTTATTTACTATTATACATATAAATTAGTTAGT
AAAAGAACCATGTGAGTCAACATATTCGGAGTTGGTGCTAAATGTTAAGG
GAAAAAAGAACATTGTGTTTTATAAATTATCCCAAAGAATTAAATGACTG
TATTTATCAATTTTTAGTTGAATTTGGAAATATTTAGGATTATTTTCATT
CCATTAGTTACCATTTTTTTTAAACGTTTAATTAAAAAAAGATATTTTTC
TACTAACTTTTCAGAGCTAAAAATATTTCTGAAGCTCTAATAAATGATTA
TACAACGGCATATTTTTACATCAATTATATTTTAATACATATCTTTATAT
AAAAATACTATATCTATAAATAGATGTTCATATCAGTTCTAGCCAAGACC
CCACTCCCCTGTCACAGTCAAATTTAGGATCATCTTCATTGCAAAACCAT
GGAACATATCCATCAACGTCATCATTGACATCACAG back to top
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