EMLSAT00000001149, EMLSAT00000001149-696996 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000001149
Unique NameEMLSAT00000001149-696996
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s1190supercontigLSalAtl2s1190:13382..27967 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000001149 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000001149EMLSAG00000001149-683915Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000005024EMLSAE00000005024-713952Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005025EMLSAE00000005025-713953Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005026EMLSAE00000005026-713954Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto769070auto769070Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000001149EMLSAP00000001149Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000001149

>EMLSAP00000001149 ID=EMLSAP00000001149|Name=EMLSAP00000001149|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=190bp
MTVTELSGMIRSMQFSGYPFQGQGRVNQLGGVFINGRPLPNHIRLKIIEM
AXAGVRPCIISRQLRVSHGCVSKILNRYQETGSIRPGVIGGTKPKLATPE
IEKKVDMYKNENPGVFSWEVRDRLIKEGFCDKNTVPSVSAISRLLRGKED
YERKNGNSSQDPTPLSQSNLGSSSLQNHGTYPSTSSLTSQ
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mRNA from alignment at LSalAtl2s1190:13382..27967-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000001149-696996 ID=EMLSAT00000001149-696996|Name=EMLSAT00000001149|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=14586bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1190:13382..27967- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGACAGTTACTGAACTGAGTGGAATGATAAGATCTATGCAATTTTCTGG ATATCCCTTTCAAGGTATTAAGGACAAAAATTTTGTAAATGTGTTTTTTT TTTCAATTGTTTATTTTAAGATAAAAAATTATTTTAATGATAATGCAAAT ATTAATTTTCCCTCATAATTTATTAGGACAAGGTCGAGTAAATCAATTAG GTGGTGTATTCATCAATGGACGACCATTGCCTAATCATATCCGTCTTAAG ATTATCGAAATGGCTGSTGCTGGMGTTCGTCCTTGTATAATATCTCGTCA ACTTCGTGTAAGTCATGGATGTGTATCCAAAATTCTTAATCGCTATCAAG AAACAGGATCTATTAGACCAGGTGTAATTGGAGGAACTAAGCCCAAATTA GCAACACCAGAGATTGAAAAAAAAGTGGATATGTATAAAAATGAAAACCC AGGTGTTTTTAGTTGGGAGGTGCGTGATAGATTAATTAAGGAAGGATTTT GTGATAAAAATACAGTACCTAGTGTATCTGCCATTTCAAGATTACTGAGA GGAAAAGAGGATTACGAGAGAAAAAATGGCAAGTCAAATTTATATTTATA CTGAAAAACTTTTTTATTTCTGATTATTAGTTTTGAATTTTTTTTATTTA TACCGCAATGGGAACAATTGCCCATTAAACCTAGAACAAAAAATGACTAA AATATTTCATTATAAAATTGAACTTCAATTATATCATCTATTATCAAGTA TCTAGATTAGTTTTTTTTTTAATTAAGAGTATCAAATAAGTCGAATTTAT GATAAATTAACCATCAATTAAAATCAATTCAAATTCGAGTATATAGATAT TAAATTCTAATTAATTATAAAAAACTAGATTCAAAATCATCATTTTTTTA AACCTACGGCTTCAAAGAGAATAATATCATTAAAAAGTGTAAAACAATTT TTGACAGGAAATGATATCATGCTGTGATACATAATTTCTTTTGTTATTAA TATTTTGTTAAGCCGACACTATGTATGTAACCTCATTTAATTAAAGTAAA AGACGAAGAAGATTCTGATCTTGAAGCTGAACCAGGAATTCCTTTAAAAA GAAAACAAAGAAGATCAAGGACCACATTCACGGCATATCAATTAGATGAA TTAGAAAAAGCTTTTGAAAGGACACAATATCCCGATATATATACAAGAGA AGAATTAGCACAAAGAATAAAGTTAAGTGAAGCGAGAATTCAGGTTTGGT TCTCAAATAGACGTGCTAGACTGCGAAAACAGGCTCAATCTTCAACAACA ACCACTTCTTACAATCCTATGAATGTTAGTTATACAACAAATCTACATAG GTATGGATGTATTGCACTTAATAGTTTATTATCGTTACTTTTAGCATTAA TGATCATTCTAAAAATTTTGATACATGATTTAATTTATTTTAATTGATAA TGAGAAGTACTTTATTAACCAGATGTTATCTCATTATCTCATATCAAAAT TGTAATTATAATAGTTTATGTAGCAATTTTCCTGATAGTTAATGGCACAT TAGGATTTAATGTAAAAATAAAATAAGATTTGTCCATTGGTCAAGTATAA ACAAATTATAAAGTTTAAAGAAAAATATATAAGTCCTTGTTTAATAAAAT TAAGTTACAAATACATATGTAGTGATTAAAATCTAAAATTTCTTATTGAT AAGGAGGTTACATGACCATAAATATTTTGGTAACATTATATTTTTAAATA AACTATTTTTTTCTAAATTTAAAGTAATTGTTTGCTTTAAAAGAAATGAT CAGGGAAGAAGTTTTAATAGAAAGCCAATAAAATATTAATATAAATTTGA ATAATAATATTTCTGTCATAAATATGGGTAACATATGGGGCTTCAATTTC TAATATTAATATAAAAATTCCTTTAAAATATTTACTTGATCATAACAATC TTTCAGAAGGGTATTCAAATGAGAAAATACTTTTAAGTTTTAAAATTTTT TACGGGGGTTAAATATGTATTAATCTTTTTGCCGCACACGGAATTAGCAT CCCTATGCCTTAAAGCCATGGTACGCCACAGCGGTAGCTGCAAAGTTGTT AGAGAATTATAAATAATTAACATACGTACATTTATATATTATACTTAAAT ATACCAATCCAAACATTTTTTTGTAACACTGTCTCATAGATTTGTTTCAT TTTTACAGCATTTGTTTAAACTAATAAGACTATATAAAATACTTCTTGAA TGAGAGGTAACCAGAACGGGGATATGTAATGAATTATTATTATCCTCAAT CTTCATAATATTTCCCTTTTAGAAATGAGAGACTTTGTGATGATAAAATT TATTTGCTTTTGTTAATAAATAAGCACTAGTTTTATGTTGCTCCGAAGTC CCCCCGAAAATTAGAAAAATCCCAAAAATGCAGAATATTTTTTGAATATG TGTTTATGTAAATTAAGAATTAATATATTCAAGCTAGATACAGAGAGGCT ATTTGTGTTTATTTCGTTCCTCCCATAGCTGCTTGTGGCTAATCTATTAA TACATCAGGCAGCTAAAATGCTCTTTTTCTAACACATTTATCAGGTTTAT TAGCCTTATATTGGGTAAATGGATAACAAGCTTTTGTTAGGAATAGTTGC TCATCAATGGTAATATTTTAACTTGGCCTGTATGTTGAAATACAATTTTC CAAGAATCGATCCCATAATGTTAAAAACAAGGTGAACTTTTCTTTTTTTA GTCTTTGTCATGTTTGGAACGATTATCAAACAGATATATCTTAATAATTC CTTATATTTGTTGCCAGTCATAGTATCCCAAAATTTCTTGACCAAATGAC TTCAGTAGGGTGCGATTTGGGTAAGATTCCTCTCACATATATTATAGCAA TTAGTTGGAGTATTTCTCGTTTGCTGGATGTCCATATATATTTATAGANN NTATTAACGAGGCTCAACTATTGTTAATTTTACAATGTGTACAATAGTAC AATTATCGATCAAGACTTGAAAAGCTGATAACTTTTTGATATTACGTTTT GTATATGATGATGTACCTGGGACTTACTTCATATGTTTTCTTTGCTAAAA CATTCTGAACTGTTTCCATTTCATATTTGTTTGTGGCAGYTTGTGTTATC CTTGCTGACCTATATTCTCTTTCCTAATAAGTCGGTTCATTTATGTTTCT TAGAGGGGGGAATTGAGTCAGTTGATTGTATCTTGGCATTTCTTGAAATG TTTAATATACTAATTAGTTGTTGATAAATACATTTAGTATCTAGAGAAAC TAGTAATGGTATTTAACAAAATTACTTTACGTCAGGCTGGTAAAAAACAT CAGAATAGTAATCAAAAGAACTTGATTGATGTGTTTGGACATTTTCTTCA TTTTTCCAATTTGAAATCCTCACCTTCTGAGTCAAGTACGATTTGGACAC AAGATAATGTCTCATTTCTTCAATGGATCATTTTATCTTAGACATCTTTG TACAATAAAAGTTGGAAGCAGAATGGCTAGTTCAGTAAAATCAATGCTAA TATATATATATATATATATACAAAGAAGGTAAGCGATTTCTTCGTATTGT TGTTCATTCATGTCTCAACTTGCTTGAGCCTATTCAAAAGCCAGTTCATA TTCAATTGTGGAACAAAAAAAATTATTTAAAATAACTGGATATAAAATAG GATACCCACGTCTTTAAAGATAGTGTTTACTATATCAACAAAATGATAAA CTAATTTTAATTTTGTGATTAATATCATGAATAAGAAAAATTCAAGAACT 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AATCTGAGTCTATTACATATCTTCCCATATTATCTCCTATTGGTAACTCT GATTATATTGACCTGTTTTCCCCTCAAAATGTAAGGAGGTTCTTATTATT ATATAACTAACTGGAAATATAGAACTCTATAGCAATAGATGTGCGTTATT ATTGTCCAGTTTTTTTATTATAGAGTAAGAAATACAGTCCATTAATTTCA TTATCCTTGGTTATCCTTCGAGCCTAATTTTGAACATAAGTTGGATTGTG GTTCCTCAAATATTTAGGGGTTGATTTTCTATTCTATAATTGTTTTTGAT ATATTTGCGCAGTACTGATTGAACATCGGGGTCTTTGAAGTCAATCGACT CAATTGTAAAACCATATTCGGGGATTTCGAAGCTTAAATGGATCATTGTA ACACCACAGCCATTCAATCATACTTCTTTGAATAAATTAGAAGAATGGAT TATAGTGTGGTTTTGGAAGCTTAAAGGGCTCATTATAAAACTATACTCGT GGGCTTCGAAGCTAAAAGGCTCATTGTAACATCACACCCATTCAATCAGA CCTCTTTCAGTACATTAGAAAAAGGGATTGTATTGTGATCTTTGAAGCTG AAGTAAGTAATTGTAATACGGATTTTTTTTCTTTTTTAAGATCCAAGAGT TGTGTAAAAACATAGACATAGTGTTAGTTGAAATGAAAATAGTTTATTCG AAGACATTTTGAAAGTAATCAATATACTCAATTCAAATGCCGTCAATAAA ATACAAAATATTTATTATAAGCTGAAATAATATGCAAATATATGCAAACT CGAAGAATAAACAGTAAAATCTGAAATGAAAATAGCTTATTTGATTGTGT TTTGAAATAAGTCAATTGAATTAAATCAAATACCATCAGTAAGAGACATA ATATTGAAGATTAAAGCTATTATATTTGATGTCTAATCATTGAGAATAAC AATTCAATAATTAATAATTATAACATAGCATTCTTTAGTTGGATAAAGGT TTTGACTAAAGTTAAACAAGAGCATCTATTATTAGTGGATGAGGATTATT CAGAATATATTTTCTGCTTTTCTAGGGATGATTGAACTTTATCTGAAATA TTTGAAATGGGTTAATTAAATCTAAACAATTTCTCAATGTTCTCCCCAAC AAAAGCTCAGATGGCGACTTTCCCGTAGTAATGTGGGGAGGGATTTTTAA TTGAAATAAAACTGATGAGAGTCGATCAACCCACCTACTCGAAGAACACG ACAATACTAACTTATTTAATTGTTTATTAGAATTTTCCAATAATCCATTA GACGAAGGATGATAGGGACTTGAAGTATTATGTTTTATACCATTACTAAT TATATAGTTTCAGAATTCCTGAGAAGTAAAACAAGTAGCATTACCAGACT CAAGACTAGTAGGCAATCCTAATGTAGAAAATACTATTTTTAAAGAATGA TATTGTAGTATGAGACAAAATATAACTAGTAGGTATTTCTAACCATATGG AATGAGTATCAACGATTACTAAAGTATATTTATTATAAACAGGACCAGCA TAGTCAATAAGTAAACGAACCCATGGTTCGAAGGCCACTCTCATGGATGG ATTGGAGCTTTTGGAGAAAAAATATCTATAAAATAGAACATGAGCAAATA ATAAATTAATTAATTAAATATCAAATCTAGCCCTTTATTGTATTTTAGTA GAACCTAAAATATATAAATGTAATTCTTTCAATAATGCATCTCTTCCCCC AAACAATACAACCATCTTGTAGAGATAGCTCATCCTTGAAATTTTTATTT TTATTTTAAGGCCAAACATATCAACAATAATTATAAAAGGCACAAAGAAT TTTATCCAATTTTACTAGTTTACTAGTAATAAGAACATTTTCTAAAAAAT 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TATTCATGCAAAAAAATTGCAAAAAAAATTTCCATCTAGCGATAATTTCA TTCAAAAAACAAAAAACTTTGATTTTGCTTTAAAAAACCTCTCGTTTCTA AAAAACAAAACAAAGACGATATATGTTGAATTCATCCCATATCCTTGTAT TGGTTGCCTTTTATTCAAGAAGTCTTATGTTTGAAAAGGTTGAAGGTCAC CGATTTCGAATATTTGGTTTCATTTAGTTTCTACCTAAAAATAATAAAAC AATATAAAATTATAAAATTTAGAAAAATCAATAAAAGAAAACGTATACTT AAGTTGCAATCGGAAAACCTAGTAATTTAACATTATTGTAGTAATTTCCT GATATAAATTTTTATAAACAAGAAAAAAGAACAACAATAAAATTGTAGAT TTTAAGGAAGGCTTTAAGTTTTTGCCTGTCATACGCATTAAGTAATTTAT GTTTGGATCAAAAGTGCTCTTTTAACATTTTGTATTTCCAACCCTTAACT TATGTTAATTAACCTTAATCAGCAGTGAGTAAAATTCACTTTTAACCAAT TAAATATGTTATGGAACGATTTCTGGTATAATTCACGATATGAGCTTAAA GGAAACAGCAAAGGGGGCATTCCCGAACCACGTGCAACTTAGGTGGGAGG AGATTGTAAACCTTAAAAACTTATATATCTTCGTGGGGAAGAGAAGGGGC CAAATTAAAACAACATTGACCTTAATAATATACCTAGATGTTATAAAAGA CGTAATAGAGAAAATTTTAAAAAAAATAGAAGGGCGTCAACAATATTGTA TACAGTGCTCGGAATATCTATTGTCGAAATGGTGTCCCCTAAATCGGCTT TGGATGTGGGAAACGACCAAAATGATAAGTCATCGTACGCTCAGATAACG AAGAAGGATCCAAATACTTTTAAGAGAAATAATAATTTGGAATGGAGAAG 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