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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s1190 | supercontig | LSalAtl2s1190:32314..78143 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000001151 >EMLSAP00000001151 ID=EMLSAP00000001151|Name=EMLSAP00000001151|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=544bp
MEDIFHWIRKGDIFQVRIWLNEPENDLNQGDSHQFSPLHWAAKGGHYKIT ENLLSRGGRVNATNMGDDTPLHLAVAHGHREVVKLLLSQNMDVNFGNEHG NTALHYACFWNEVAIAEDLLDAGALVILQNKYGELPLDKCPGSTGKRLSE HASRSGQDVTRVVPFKDQSWLGLKTRSRDATLSKHKGININELYLHNKIG TSPRGETWIGKWQGNEIVAKILLLSKCTSRIARDFQDEYPKLRIFSHPNI LGIIGCCNNPPNLVVISQYLPLGSLFNVLHDTPNKVIIDSSTALSFALDI AKGMSYLHSLDRELPMYVLNSRHVLIDNNEELCAKVHMGDAQYSFQNKSK IFHPAWMSPESMSERYPTNNSISSNMWSYSILLWELFTREIPFAEYSPME IGMKISLEGLRISLSRGISEHMTKLIIGIMIYYTIAKNTSNGINYNEGFR VFKNKHIFRSGNRITKVSLFNFRSVRMTKIGSSKKQNNDNIIMENVEIII DLVDQISSPITLFLSIFSWTLIQVYTPPILLFQKRLNNLFVRLI back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1190:32314..78143- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000001151-696998 ID=EMLSAT00000001151-696998|Name=EMLSAT00000001151|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=45830bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1190:32314..78143- (Lepeophtheirus salmonis) ATGGAAGATATCTTTCATTGGATTCGCAAAGGGGATATATTTCAAGTTCG
TATTTGGTTGAATGAACCTGAAAATGATTTGAACCAAGGGGATTCTCATC
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TCATTCACNAGAAATCATGATCTTCCATTTATGCAAAAGATTGAATGTAA
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GTATGGAATCAATTATGGTAAATTTATAACAACACCAATTACCTTTAATG
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TTTATCGAGAAATTCTCGGGTTAACCCATCCCTTCCCGAGGGACCATCAT
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GGTGTAGTATTATAATTAGCATTTGTGCGTATCCTTCGTGATAATAATAT
GTTGTTATACCAGCATAAATAACGGGGGGAAATCGTTTTTGATGCCTTTA
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GAAAATATTATTTGGATCANNNCTATTATTTCATTATTCTGTATTTATAA
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AGCCTTCTTTTTAATCTTGGAACTACAAATATATTTCGAAATACTCTACT
TTGTCGTTTCATTAGTTATTATTCTGAGAATATGGTTCATAATGAATAAC
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TCTAACTCAATTATACGTAGTATATCTTCATTAAACCTTTTGCTAATAAA
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ACATCAGTATTTTAAACAATGATACCTTAAGTCTTTCTCCTCCCCCCCCC
CCCCTTCTCCTTGCACGCGTTTTTCTCCACAGAATTATCAACTTTATTAA
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AATCCTGTATTTTGTGTTGTTAAGACAAGAAATTTAAATTTGTGACCAAT
TTTGCCAAAAAGTTAATGTTTTTGCGTGGCAAAATTTTTGAAAACTCAAT
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CTGGAACATATAAAAAAATAAAAATATTACCCCTTCGCCCTAATTTTATT
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CCTTTAGATTGATGCGTTTGATTTTCTATTAACAGGTGTAATATTTCCGA
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TTGCGAGAGGCCATGACAAAATACGGAATGAGTGATATTCGTGAAAATTT
CATCGATTATGTCTAGGATATAATTCTGTATGAAAATGATGCCAAATTTG
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CCATTTTTGAGCAAAATATCTATATTTCGGAACGCTTCATAATGGGCAAT
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TTATACATTAATTCTAATATTTTGCTGCACCATTCTGTGCAAATAATATC
ATTTTGTATACGACAGATTTATAGTTTGCAGAAGACTAAGAGAACATTAT
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TTCAATTTATTTTATTTCATTCAAACAAAATATTAAATAGTGCAAACATA
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AAAAAAGATGAATGCTCGGCCGATTTCCAAAAGAATGGTATAATTCCTTT
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CTGCTACACTTGCAGAAAAGCTAAACTGCGAAATGTTCCCTGCATTGCCA
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AAAAATGCTACCTATAAATTCTTGAAACACGAAAAGAGTGAAAGCAATCG
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GAAGACTAGACACCTATGTGCAAGAAGAAAGAAAACAAAACACCCAGTAT
CTACAACAATAAGCATAACGTTGAAGTACTTGGCGAAGCAAGGACATGCC
ATCAGAAGACACAGTGATCAAAACAGTTATTTCATGTAATTACTTCAAGT
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ACATCAAATCAAATACAGTAAGAAATTAATAACACAATGTATTTAATAGT
AATGAGTCAGCTGTGGATACGTAAGGATGCATTTTTGGATGAAGTTTGGC
AACGATCATTAGACTAAACACAAAAACATGACCAAAAATAACCAAACCAA
TCAAGAGAGTTTAGGTCTCCGCAGCCCTTCCAGAAAAATGAACCAACGTT
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AAACGAGATCTTGGGTCTTTTTTTTTTTTTTTTCAACTATTCTTTATTTG
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GCGTAAAAAATTATATAAATAAACATTATAGTTTATACTTAATGCTCCAG
GGTAGAATTTCAACTAAATATCAATCTTTGAAAAAACTACAGTAAACATG
CAAATTATGATAAATATTTGTTAAAATCGTTTAAAACCCTTTTTAAAATA
CTTCCATGATTTTGTGAAGTTGATGGAAGGTACCGGATTTCTTCCCCTCC
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CATAGCAGGCKGATGCTGGCAAGATGATACCTCTCAACTCATCTTCCCAA
ATAGGCTGATAGTTAGTCAGTCGGCTGGCGATGAGGGCTTTACAAGTAAG
AATTGCAAAGTCCAGATCCGTTGTTACCTCAGAAGTTCCACCCTTCTTTT
TTGAAATTCCAAAAANAAACGCATGAAGTGTGTTATTATATTATTTCCCA
CAGTCCAGGGCCTAGTTTATTTAATACAAACTGTGGACATTTGTAACTGC
ACGGTAAACTTTTAATCATCATTTATTTTCCTCAGAGAAGACACAATTTT
TCTGTTCCAACCCATAAGGAGATCAAAACGCTGACTATNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAAGAGGACCATCTTAACGTGCCAC
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AATTTAAATTATGAACAGTTAAAATATCTTGTGTGATTGCGCGTTCTTCT
AAAAATTGAAGGGACCTTTAAATTTCTAAAAAGAACTTTTTATTTACATT
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TCTTATAAAACAAACAATTAATCCATTTGTCCTTTTCTAAAATAACTTTT
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TTAATTCTCAATATGTACAAGGATAGGGTAGACTTTATTGAAAATGAAGA
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GTTTTAGAAAACCATTTTCATTATGAGTATTATATTATAAAACTTTATTT
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GAATGCATGTCGTGTAACTACAGCTTATTCTCAGGTGAGTGCATATCGGT
TTCATCCCATACCAAATGATATTATTAGCTTTTTTTTGCTGAAAATGTAT
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GGATCTGAATTCTACATAACATTTTGCTTTAAAAAAATGTATTTTTTATA
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GCCACAATCAGCTGTGACAACGGAGGAAGAAGAAAAGTACACTGGATATA
AACAAGGGCATTTACCAGAATACTCCGAGGTCGATCCCCAATTCTAGTTT
GAGTCCAAAACGGACTAACAATTATAACTCCGCAACAAATCGTCCGGGTT
ACGCTCCGTCTTTTATGAGCACATACGAATGTTCAATCAGGTTTGGAATA
TAATTGAATCTATTTAAGAAAGGCTGTTCATTACTCAGGAATTAAATAAT
AGTGCCAACTGCTAAGGTAAAGAAAATTTATTATCAGACTACCAATTCAA
AAAAACAAAACAAAAAAAAACGGGCCATCTAAAACAATACACCTGATTTT
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GGATTTCTGGAAATGGAGGCCCAAGAATTAGGAAAATACTTACCGGACGA
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GATATTCATCTATAAAATCAAGTTAACGATGAACAGATCAAGTCATACTT
TAACTCTGATCGCACAAAGATGCTTATTGTATGTAATATACTAATTGCTA
ATCATCCTACGTTCAAAAAATTTATAGAAATATCCACATTCTAAATTGTG
AAGTTGAGAAAATTTTCAGCATGTTTAGAGTCATCCACANNNNNNNNNNN
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TTTTCTGACACAAGTTTCTTCACTTAAAGACTTCGGTATGATCATTCGGG
TTTTCAAAATTACATAGTCAATAAATATAACTTATTTATCACTTAAGGAT
TAGCTATGGTTCATAAGCTCCAAGAAATGGTGATTAGATATACTTTTTAA
GCACTACTGAATGTATGTAAAGACGGGTTTGATGTTCTCTAATTATATTT
GGTCTTACGAGTATTCAAGATATATCATTGTCCATATTTGCAGTGCAGCA
CGAATTCAAACTTATTATTGGAATTGATATTTGTGAAAGTAACTATTCAT
ACTAGTGATTCGTGCGTTATAGGCATTAAAGGCACTAAACGACTCTTAAA
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GAAGGATTTTAAGGAACGATTTTTGGGTGAATAATATATTTTTCGTACAA
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TTATTTATACGGAAATTATATATTAATAATATACAAGACGTCCCTTACGA
GGATTTCTATTCTAGGGGCTCACACATTACCTTTGCGTCAGTGCATAATA
TGATACTCAACTTCTTTCTTGCGAAGTATGCGTATTTCGACCAAATTTAA
GAGCATTTCTCCGTTAGAGTTGGATTGACGCGACAGMTTTTTCTTTGTGT
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ATATTAAGACATTTTCTTGATAATATTATTTTGATTAAATAGTAGCAAGT
AAAGCTATATTTTGGTGAAGGAAAGCTTCTATATGTAGTAAATTTTCAGA
TAAGTTGTAATGTTAAAAAATCATAATTGAGATATCTTATAAGTGATAAG
TATGTTCGAAATTACCTTTGGTCCATCAAGTATGATTTATGAAAAAAGGT
TTGTTTATGGCCTGAAGAAAACAGAGGAACCAGATAGTTGAAGTAGTATT
TGCGCACGCACTTGCGCAAAACACGATTCCCACAATCCTACTTATACTTA
AAGTTGATAAAATTGTACAGAAAAACGCGTGCAAGGAGAAGGGGAAAAAA
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TTTATTATGATTTTTGAGGGTATAACGAAAGTATTTATTATCAAAATGTT
TAATGAAGATATACTACGTATAATTGACTTAGACGTTTTTGATCCGTTAT
AGTAGATTTTATAACGTCACACTCCATGAAATTGTAATTCATTATGAACC
TTATTCTCAGAATAATAGCTAATGAAACGACAAAGTAGAGTATTTTGAAA
TATATTTGAAGCTCCAAGTTTAAAATAGAAGGATTTAATTAAATATAATC
TACATACTAAAAAATATACCATCATAGATTTATGTTAAATATACAAAATT
AAAAAATTGGAATCATATAACTAATAACAATAAATTATATATACAGGTTA
TTGGAATAATAGATTGATCCAAATGATATTTTCTTATTCTGACATCGGAA
TGCAGTTAAAATATGTCATAACTTTAGGTTGCAAGACACAAGCGAGACGT
GGAGTTTAATCAAAAAGATAATCACCCCTCTTCTTCATGTGGAAGTTGCT
ATATACAATTGTGCACAGGATAGATATATCTCTACCGATGAGAGCTAACT
AATTATTAAAAAAAAAAGTAAATGTCTTAATCATAAAATTAGACAATAAA
TATACTAATGAAAAAATGTTAGAAATAAATCCATCTTAAAGATTTAGAGN
CTGATAAAAAAAWTGTTAGAAAATAAATCCATCTTAAAGATTTAGAGCAA
AAACTAATTATGTAGTAATGTCCGACGATATTACTCCTTATTAAGAGCAT
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ATCATGAAAAATATACACAATTGCTAATTATAATGCTACACCCAATGTGT
TGCAACCATTTCAGCAGTTGTTTTTGCCTTTTATGAGTTTTCTGAATACC
ATTTCTTGGAGACTATCAACCATAGCTAAGCCTTAAGTGATAAAAAAAGT
AATWTTGATTSACTATGTAATATCGGAAAATTAATTATCATACCCAAGTC
TTTAAGTGAAGAAACTAGTCTCAGACAAACTAGTTGCGAAACATCCAAAG
CTACTACCCCATTGTTGTGACCATTTAAGGAGTTGTTTTTGCTATTTAAT
GAGTTGTGTATCATAATTTTTGATATGTTTAGCTAAAATAGAATTATATT
TTAGGGTTAGATTTTAAAAAAAATTGAATACTTATTGTCAGATGGTACAA
AATTCAGAGTTCCACTTCGAAATTAGAAAATATTTTATACTTTTTACTGA
TAACGATAGGTTTACCCGGGTATTTCTCCATAATTTTTTTGAATGTAAAT
GATTAGCAATGGATAAGGTTATATTACATGCAATAAGCATCTTTGTGAGA
TCAGAGTTAAAGTCTGACTTGATGTATTTATCATTAAATTGATTTGTTAG
ATGAATATCCATGCTCTTGATATGAGATGAGGATAATGAGTGTCGTATAA
TTCTAGACAAGGGACTAAAATCACATTTATATCGACAAATCCGACAAACC
ATCTATTTCTCATCCGGTAAGTATTTTTCAAATTCCTGGGCCTCCAATTT
CAGAAATCCAGACAGAAGGCGACGTTATTTTAGGCATTTTATTCAGTTCT
CTATCGACGATAACCATTTAATATTATATTAATATTGAATAATAAAGGCG
GGYATGATAACGTTCTTGATTGATAGAAGAAGATGTATATTATTTAATCA
ATGGTGCCATAAGTATTTCTTCTCTTCTCCTCGCACGCTTTTCTATTCTC
ACCAAAATTATCACCCTTATATATATGTGAATAGAAAAAAGTAGACGATG
TATGTAGTGAAGTTACTTGAAAAGACCAGAGCGAGGCCTATTCTTGACGT
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GGCGACTTTTTATTTGGCCAATTGGCATTGGTTAGACTAAACTTGATTCA
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TTATGAATTAAGACCCATCTACTCTTTTTAAACCATACTCAGATTAACTC
TAAATTAATTAGATTACAAAAAATTTATTAATCGTAAACATTAGGAAAAT
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AGCTATTTCTAAGATATTTATCATATGTATGCTTAAGATACTTCTGTGTT
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AACCTGTGCACCGCCTCATCCTTCCAGGCTCATTATGAAATTCACTATTT
TCAGGATTATTCATTGCCAGCTCATCATTTAAGCCACTCGAGTGCTCTTT
AGCGTCCTCAAGGTGCTGAAGTGGAAAGAGAGCATACTCAGAAGTTGCAG
TTAGTACCTCTTCGCCTGGGTCAGTGTCTATGGTTCCTCTTTCACTAGAG
TCCTAGACCGGGTACAACATTGATATTAACCAATGGCCTTCGTGTTACGT
ATCACCATCCATTATTTAGTTTTATTAATAAGACGAAGGGCTTCGTTTTA
ACCATAGTCAATGAATGTATCCTTCAGCAGAAGGTTATGATTGTACCCTC
CATCCAATTGTCAACTTTATTAGCTCTTCATCCAGCCCGTTACTTCCATA
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TATTACCCAGTCTTAGGCTTGCAGAGCTGAGATGTGAATGTTCCCGGTTG
GAACTTGGAAGAGAGGACGAGTTGAAGAGAAAGAAGAAAATGAAAATCGA
GGCGTAAGTGGAGGTTATATCGAGGGTTGTGGTTGTGATCCCAAATCCTT
CAATTTCATTGGTACTAATACATAATACTACGATATGCTGAATGGAGCCT
TGATATAATAAAGTTTGGTAAACTCTAGCTTAATAAATACAGTTAATATA
AATTAATATAGAAATCAAAATCCTATATAATACCTTTTATGAGTCAGCTG
CTTAAAATAATACAAGTGTTAAATTAATTGAAAATTAACATATTTAGGAG
AGTAGGAAGGTATCAGACGGTGGAAAAAATTTGACATGGCACACGGCGTT
ACCTCACTAACACAAAAATACCCTATGCATTTTGTTGTCAGCTGATAATT
TTAATTATCATATAGAGATACAAATGTGTAGTCACTCTATTAATAAAAAA
ATACAAACAATATTATAATACAGTATCGAATAAGATATTAAGTTGGACTT
TAATATTATAAAAAACATATATCATGTAATCCATTTTGAAATTAGAGAAT
AAATAATGTCAAAAATGATAGTTTGGGAATACGGAATATGGGCATTTTTT
TCATTTTTTTTTTTCTCTTTTAGGAAGAAAAGTTTCGTGATACAATAAAA
GTAACGACGTGGGCTATGAAACAAGAACTAAATTGAATACAATTTAGATG
AATGGCGCCATAACTCATTTTCAAGTATGTTTGTCATATTTGCAAGCTTG
TAAAAGTATTTTATCAACAGTTAAAATTAAAATTTTATTTTTTAATGAGA
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TAAAAAAAATAACCGTTTAAATGTTATTGCTTTTAATTTGTACAGTAAAG
ATTACAATGATGCCAAGGACATACAAATCTAAGCTTTAAAATAATTGATC
GAATTTAAAAAAAACCCTGGTGTAATTTTCCAGACCTTTGGAGTGATTTA
AGGCATATTGACTCATTCCAAATAAAGGTATATCTTTGGAAAAACGGGGC
ATGATATTAAAATCATACTTAAAAAAAAAAAAAACTTAAAAACTTTAAGT
AAAAAAGTTAAGTTCTTTTAAGTAAAAAGATACTTAAATATTGAAAACAT
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CAATTTAAATATCCCAATATCTACCCAATCTCTTTAATACAATTAACGCT
TTTCTGAAAACTTGTGCAAATTTACTTATTTATACCTTCATAAGTTTTGT
TCCTTCTTTGTGACTGTTATTATAATCACTTTAATTATTAAGATTGGATT
TTACAAAATAATTTGGTAATTAAATTTTTTTCCTCGAATGTTTTTAATGC
TAATTTACTTTTAGTAAAAGTCTGTATAATTCCTTCGTTAAATTAAGAGT
TTATTTATTCAAATAAACAGATAATACTTTGGATCATATTTTCTACAGAT
ACATGCTTGAAATAACCAATCTTGACAAAATTTTCAAAATATAAACAATC
AATAAGCCATCATGATTTTGACAAATTCATTGTAGTCTAATTTACCATCA
CCATCAAGATCAGCTTCTTGCATAAATGTTTCTAATTCTTCTGGTGTCAA
CACTTGTCCCATCGTTGTTGTGACAGATATTATTTCTTTTGCTTCAATAT
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CAACAAACTCTAGAAAATCTATTGTGCCATCACCATTTAAATCTGATTCC
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CATTACTAATAATAATTCTTTTGTTGATATGGTACCAGAACCATCCTTAA
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AAGTAATACCCTTTTTTTAAATCATAGGCAGCATTAATTTGGAAATAAAT
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