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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s1190 | supercontig | LSalAtl2s1190:33089..45311 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000001152 >EMLSAP00000001152 ID=EMLSAP00000001152|Name=EMLSAP00000001152|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=148bp
MDLLTELQQAEFKEAFDEFDKDGSGTISTKELLLVMRSIGQNPTEDEILE
MVMESDLNGDGTIDFLEFVEMMKKKSSETDQTEDLREAFRIFDKNKSGYI
EAKEIISVTTTMGQVLTPEELETFMQEADLDGDGKLDYNEFVKIMMAY back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1190:33089..45311+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000001152-696999 ID=EMLSAT00000001152-696999|Name=EMLSAT00000001152|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=12223bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1190:33089..45311+ (Lepeophtheirus salmonis)
TAAGAACTTAGTCTTACAAGAATGGATCTTTTGACTGAACTTCAGCAAGC
TGAATTCAAGGAAGCTTTTGATGAATTTGATAAAGTGAGTCAGTAGGAGT
ATACTTTTATTTACACAATATTTATCTTTAATTTATCTCATTTTTATTTT
ATTTTTTAAAATAATATATATTTACTGAATTTTTTTACTGTAGCTTGTTG
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ACTTATTTTAGTGTTATTTCAAATCATTGCTCCATTTACAATCAATTAAA
ACACAAAATGGCATTGTTACAGATTGTCAACTGATTTTTTTATCTTATGC
GCACCTTTATATTTATGAAAAAATTAAACCTTTCAAATCAACTAAGCCCA
TAGACCTTGTACTTTTTTTCTATAATGAGATATTGGCTTTATCTTGTTTT
GATAAACTTTTTATAGTAAGTCGATCATTTTTGAATTAGGAAATTGCTAC
TAATTACACTGTTTGTCAGGATTAACTTCCGTGCCTTCTTTAGATAAGTA
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ATATGCGTTCCCTGACCAATACAACCAATTGGCGGCATTAAAAGGAGGCA
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TTGTCGTGAAAAATCTTGCTGTCTTTCTACGCACAATTCTTTTTTTTTTT
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ACTTTTTTGATAACTTTCTGGAAAGTCTGGTTTGAAATCCTGAGATCTCT
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ACTCCCCTAGTCCAGTTTGGCCTTTTTGACATAGCCATTCTGCCTCTCCA
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AAATCACAAATTAAGTTTTCAAAGGAGGATGGGATACGTTTCTGTCTCTG
CATTCATAATTAATCACTTTTTAATTAGAATTAATTCTTTTCTTCTACAA
TTTTTATTTGAAGGAAAAATTAGTTATTAATAACACATGCCAACAATTAA
GGGGTGGGGGATTAGCTAATCATTTAATTATCCGTTATCAATTATAATTT
CAATAGATATGATGGATTATTCTTATTAGGCAAAACTCATATTATTATTA
TACAAGAATAGTATTTTGCAAGAATAGTGATTTTCACCTCCTTATGATCC
AGGATATGATAGAGGAAGGMGCAGTTGGCTGTGGCGAGACAAAWCAAAGA
AAATTCGTGGGCCAGTTTTTGAATCACTAGAACCGGAACCGGCAAAGTCA
AACCGAGACCACAATATATTGATTATCGGTCTCGGTTATTGTGCTTTTGT
TCCCGTATAGAATATATAAAGAAAATACAATATATATTCCTCTTGAGTAA
TAAGTTAACTTTATTCAATAAGTCAATTTTCTGAGTTGTTTTTTAATGAT
ATTGCAGTGTTTTCCAATTTTTGTTACGTCGCCAGGACGATACAGTTGTA
TTTTGGTTCCAAATAACTAAAGAAGGATCTGAAAAAGTGGTTTTAGGGAC
CTGACAGTGTAAATAAAAGAAGGAAGGGGTGAGGTAGATTGTGGATCCAG
GTCTGCTACTAAGTTTGTCAGGCCCCTATAATATTTATTGACCCAGGGTT
TCCTAATCATAACTATGACAAGGTCCCCTTACACTGATACATTTTTAGCC
CCCTTTTATACGAAACATCTGTACCACATATGTGTAGATTGAAAGCAATC
CTCAATTCTCCATCTTCCTGGGCCKCCCTCCCTAGCCTCCACTCACGACC
CCATTTTGAAAGCCCTTCTATGAAGTAACTTTAGTTTTCATGGACCCTGC
TGGAACTTGGGGTACTACGCACTTTGGTAAACCAAACGGTATCTTATTCC
ATTTTCCCATGGTTCATTGACTTAAAACTGGTAAATAAGAATAACACAAT
TTTATAGTGTGTACACGCTTAATCATGATTATTATTATTATTGCTTCCAG
TATTTGTATAAAATATGAAATAACGTAACATGTTGAACCCGATTATGACT
GCTTTAAAAGAAATCAGGTAGTGATCAAAAAAGACCTCTTGATTTGGTCA
ATGTCAAGTCACACACCCTCTTTCATACACTACTATTCTTATTAAATAAA
ATAAGAGACTGGATGTTGCATAAATAAATATAATAATGCATAAAATTTAA
ATTAAGTCATATCTTTAATCAAATAAAAAGACCACAATTTCGATAGTATC
AGTCCATATGAAATCATGATMTCAGTTTTGTTTTAGTTATTGTCGAAGAT
MGGACYGTGGTMGYGKCGSCCAGCCACTTTTTTTTTTCTTTATTAATATC
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GATGAAATTGCTTGGAAGAATTACGTTGTATTAATATAAATAAGTATTTT
AGCTTAAAATTAGTACTCCTAGCCAAGATCTACACCTAAAAACAGTTAAA
GGTTCTGACAATCAAAAAGTCATGATAAACAATCATACACTAAAAAATAT
AAAAATCAATCCATTGGTCTCCCTCGATGAAAGTGTTCATACCTCCGAAC
AATTGTTTTTAAAGTAGTTCTATATCTTGTTGAATCTGACAATTCATATT
TGACAATGTCAATAGTACGGTTCCAGGAATCACAACCCATTCTTGGTATT
TTCAATGTAAAATCAACATATGTTGCTGTAGAGGACAAAACTATTGCTCT
CAGGTTTTCTCGACGAATTGGATTACCAATTTCACTTACCAATTTATTGC
CAATAAGGGGTTTGCACTCAAAAGGGCGTTATGCATTGGTCGATTAAGAG
TAAGCAAGCCGAACAAAATTTTTGTCTGTAGGGTWTTAATGTCTGTCCCC
CCCCCCCCCATCTTTAGATAAATAAATTCAATTAAAAAAGACACCAAAGG
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TTACAGGAATCGTAGTAAGTAAGCAATACAGACTGTGAAAATCTAGAATT
GAAACGTAATTTTTTTTGCTTCGGCAACTCCACACAAGGAAATTACCTAG
TGTTTTACCCCAAGACTCTGATAGTTTCAAGTCCCTAGGATTTTCTATAC
TCTTGAAAAAATATCTTTTGCATGCATTTTGTCCCATGTTATCCAATATT
GACGTAGAATCAAAGACAGGATTTCCGTGTCATAAAGTTATTTGTACAGC
TGCCCGTGCTTGAGAAATGGACTCCAAAAAACTATTTGATTGGTCAGATA
TGAGCACAATCCAAGAATATATACTCGAATTACATACTGTCGATCTCCGT
TCAAGATTGGGTTTATTGGGCATGTCAATTAAAATTTATACATATATATT
TTTGGAAAAACTACACTCAAGAGTAACAATTGGAGATTCAAACTTCGACG
AAAATAAATTGTTTTATATATTGAAGCCCTAAATGTAACCCAGTTTGAAT
CAGATTCCCCTTGACTTTCATACTCTATACCCAATACAGTAGTTTTTTTC
CTTGATAGTGCAACCCAGAAGCTTTGATCCTATAACTGGACTCCATTTAC
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TTCTAAATTTTTTGGAAAAAGAAAAAAATAGCCTCAATTCTTCTAATGAG
ATAGTTTGATGAMTAGCCACTTTTTTGATTATATAATAAATAAACTGAAA
AAGATAGAGGAAACCAAATCCTAAAGATCTATAAGATTGTTTTTGTATTA
ATAAAAGAAAAAAGGAGCCAAAATCGAAGATTTTGGGTCTTTTTTTTTCT
CACTCGTACAAAAAGATTGTTCAGACGTTTTTGAAAAAGTAAAATGGGAG
GGGTATAGACTTGAATCAAAGTCCATGAGAAGATTGATAGGAAAAGTGTA
ATTGGACTTGAGATCTATAACCCTTAAAAATATTAAAATACAATGGTAGA
TGCCTAGTAGGACACACACATAAATGAGCAAAGATACAACTAGAAGGTAA
GTGTTTTTCTTATATGGGAGGGTCCTGAGGTAAGCCTTCTCAGTTTGTCT
GACTTCCTCATAATAATTAATATTTTTTCTTTTGATATCCCTCTTGCAAC
CTGCAAAATGGTTGATAGTTAGTTTAAATATGATATATCTGAAAAGGAGG
TGAAATTTTGAGCAAAATAAAAGCTGTTGCTAAAGTTTTTGAGGAATATC
TTTTTACTAGCATTATCTGCTAAAACAAATAATACTAATCCTTCTTAAAT
TAATTGAGCTAGCTTGGAAATAGTTTGACTGAAGCTGTTTATTCTAATAA
TTGCATCTTGTTCGTTAACGTCATCATATTTAGTGTTCAAAAAGTAGGTA
ATTCGCTACATTTATTTATCTGCTTTACTACCACCAAAGTAATTATTAAA
TTCATAAAAATATTTTTGGTAGTATTTCACGTTTGAAATTTTAAGTTTCC
TTGAATTACAACACTAGATTCAATAACTGTACAATCTAAAATGAATTACA
GTAGTTATCACTGATTAATTAAATAAAAATAACTAATAATAATCTTTTCA
AAAATCAGCTACAGGTATTTTACATGTAGCCGATTCTGTTATTTACTGAT
ATTAGATTTCATTTCACATTAAATCTACACTTTTTTTTTGTAAGTACAGA
GTTGGTATCTAATTTTTCTTCGTGATTCATCAAATTTGAAATGTTATGTT
CTCTCAAAAAAAATTTCGTCATTCATTCTATTTCGTCATTTTTCCGTTTA
CGCATCKCCTCCGCCATTAATATTATATTAGTTCTCGGTTAAATTGTCGC
CTTTGTTTGAAATCCTATAAATGGTATATCATTTATTCTTAATATAAGTC
TTTTTAGTTCTCTATATGCCCATCTACTTCTCTTTCAAAAATTTTCATTT
TTAAATTAAAAAGAGTTCATAACTTTATTAGAGCCAAGGTTAATAGAAAT
ACAAGGATAATACAAATACATGTTTATACCATGATGTAATCGGGCTTGCT
AGAATTTTCAATTTGATGCGTCATACCAACTGCTGGGCTTGACAGACATA
TATTTATAAAATACAGAACCAATCATATTCTATGACGTCACCATTAAAAA
GCGTGGTGGAAGTCAAACARCAGCCGTACACGCATTATGGTATAACCTTG
TATGCCTATTAACCTTGATTAGGGTTATCCTCTGATTTATTATCTATATA
AACGATAATCATTGTATATTTCATCAGATACTATAATTTATATCAATTTT
TTTTTACCCGGCATAAAATTTGTCAGTAAATCAGATTTCCATTTATTAAA
AATTTCCTTGTTTGATGCTGGAAATGTATGCCCAGAAGTTTCTATAAAAG
ATATGGAAAAGTAATTTCGTATTTTATGCGTGATTTCAATGCTTTATAAG
AAGTCTATCCGATTTAAGTCAAATATGCCTTGTTCTGTTTGATGACTTTT
TGCCTACGGCAATTAGACTTCATAATGCTCTTCTCTTAGAAGCCTTGGTA
GTTATAGGCTAGAAAGACCAATTTTCATATGCCCAAATTTGTWCACCRAA
GCGCGTTGATCATAGACAGGAACAGGTGGTAGTCAGTTGGTGCTAGGTCC
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GAGTTTTTCACATTGGAGGGCAAAATTGAGCGTTTGTCCATAGCAGAGCA
GCACATATTATATTATTCCCTGCCAATTTTACCAAAGACACAGCATCACC
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TTTCACCCACTATRTTTATTACTTGACATMGACGWAAGATWTCTWTTTTC
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ACGGTCAATAACTCAAGGTTGAACCGGCCAAGTGCAATACTCTCCTAAAA
GCGTTTGTAGTATATCATAGACTCATACCTTTACAATGTTTTATCGTATG
ACCTGTGTTGACCAATAGGGAACAAGCAAAAAACTTACTTAGCAAAAAAA
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TTCAGCTTTCTGCCAACTGATTTACGAATGTGACAGCAAGGAACCACACG
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TGATATATTTTTTTGTATTTCGTTGATAATAAATTAAGATTATTTATTTA
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TGTAAACATTTAGTCACCTACGTGTAGAATCCAATAAATAATCCTTGTCC
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TCTTAAGGTATTACTAAGATTCAATGCCATATTTCGACATGAAAAAACGA
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TTAAAAGATGATCTTGATTATGTTTAATAAAAATGTATATAACTACCAAA
AATGAAGGACCTTACTTAGATGCAAATATATTTTTTACTTTTTCTTCAAA
TGCTTTATATCATAGCTAAACTTATAAAATAAACCTTAAATTTCAATTTT
TTTTAGATTACCTTCAAAAAATGTCAATTTTGATTGATTTATGGTCAATT
AAGCTTATAATATTTATTAAAAATTTAAATATAATAAGCTGGGTAGGTTG
CGTGAATATATACTACAATAATATTCCAATAAATTTTTTTTATTACTTAT
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TAGATGCTACATATTCAAATTAATTGATTAGTATTTACTAATTGATTTTT
TTTTCTTTTTGTCGGAATAACTTTTATATCGTATCATTTGTCATCATTAA
TTTGTTTGATTTTTGTATGTGTAACTATTAACTTATTAAAATTTTTCTAA
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GTATAAAATATCATATTAGCCACTTTGAGGGGAGAAATCTAAGAGATTTC
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TATATTAACTGTTATATATAATAAATAGAATAATTTTTTAAGTCTTTTTT
TTATATTTATATCAACTTACCCAAAACTCACCTTTTCTTAACATGGAGTA
AATAAATAAAATGAAATTATTTTAATTATATTAAATAATTGACAATATTT
TTTTCATATGTACTTCTAAGGTCTACAAAAATGTAAAAGGTTAAACATAA
TTAAATTCGGAATTAAAATGAAAGTAAGATATAATAGTTTAAAAAAAGAT
ATAAATTTTTTTGTGATACCAGTCTTTTTTTCTGTAATTGAAATTTTTGG
TATTGATTTATTTCCAAATTAATGCTGCCTATGATTTAAAAAAAGGGTAT
TACTTATTATTATGAAAATAAAATTAATCTCATAAAAAAGTTTTTTTTTA
TATATTTAAGGATGGTTCTGGTACCATATCAACAAAAGAATTATTATTAG
TAATGCGATCTATTGGTCAAAATCCTACTGAAGATGAAATTCTTGAAATG
GTAATGGAATCAGATTTAAATGGTGATGGCACAATAGATTTTCTAGAGTT
TGTTGAAATGATGAAAAAAAAGAGCTCAGAAACTGATCAAACAGAAGTAG
GTTGATTTATACATGAACTTTAATAGAGGTTACTCTGTAATTGAGAGAAA
TTTCGATAGGATCTACGAGAAGCATTTAGAATTTTTGATAAAAACAAATC
GGGCTATATTGAAGCAAAAGAAATAATATCTGTCACAACAACGATGGGAC
AAGTGTTGACACCAGAAGAATTAGAAACATTTATGCAAGAAGCTGATCTT
GATGGTGATGGTAAATTAGACTACAATGAATTTGTCAAAATCATGATGGC
TTATTGATTGTTTATATTTTGAAAATTTTGTCAAGATTGGTTATTTCAAG
CATGTATCTGTAGAAAATATGATCCAAAGTATTATCTGTTTATTTGAATA
AATAAACTCTTAATTTAACGAAGGAATTATACAGACTTTTACTAAAAGTA
AATTAGCATTAAAAACATTCGAG back to top
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