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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s1194 | supercontig | LSalAtl2s1194:243814..252758 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000001171 >EMLSAP00000001171 ID=EMLSAP00000001171|Name=EMLSAP00000001171|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=583bp
MGELVQDLLLATSSSSTSSSVGITQGSPALAGGDRPPSPARLAYSSDKHP
RSTLGELNLIRKHQGLCDVLINVGSRRIYAHKVILAACSPXFRAMFTGEL
AESRQTEVTIRDVDENAMELLVDFCYTSFITVEESNVQTLLPAACLLQLQ
EIQDVCCEFLKRQLDPSNCLGIRAFADTHACRDLLHIAEKFTQHKFPEVV
EHEEFRLLPLNQLIDICSSDELNVRSEEQVYHAVMAWVQYNLDDRRQHLA
TALKYVRMPLLSPKFLVGTVGADLLIKSDDSCRDLLDEAKDYLLLPQERP
RMQGPRTRPRKPIRRGEILFAVGGWCSGDAINSVEKYDPQTEDWKIVSST
SKRRCGVGXAVLNDLLYAVGGHDGQSYLNSIERYDPQTNQWSADVAPTSS
CRTSVGVAVLDGYLYAVGGQDGVSCLNHVEKYDPKENKWTRVASMMTRRL
GVAVAVLNGYLYAIGGSDGQSPLNTVERYDPRTNKWTIVAPMSTRRKHLG
CAVFNNMIYAVGGRDEATELSSAERYNPVKNTWSPIVAMMSRRSGVFDQE
ANNNWKICGSMNYRRLGGGVGXVKMPQVDPHFW back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1194:243814..252758+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000001171-697018 ID=EMLSAT00000001171-697018|Name=EMLSAT00000001171|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=8945bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1194:243814..252758+ (Lepeophtheirus salmonis)
AAGGTGACAAGGTATACGACAGTATGTTCCATTATTTACAGCTGTTTACT
TGTGCCTAAAAAGTCCATTGTAAATAGCCAAAACAGCCATCAATTTAATA
GGCTGATTTTTTCCTTTTGAAATTTATAAAATATAAAAATCAGACTCAAT
GCAACAGCTCTATACAACTTTTGAAAATATGAATATTTATTCTTTTTCTA
TTATACAAAGCCAACCAGCCAAGTAAAACCCCTTGTCACCTATATACATT
TTCTTTCTCTTGGAGCTGAGCTGAACTTGAACATCAAATGAGAGGTGTGA
CGTCATTGACCTTCTTCTCTTTCTTTCGAATTGTTTTCTCTAAACTGCTT
GTAGCTCATAAGTCATAAGTAATAAATTAATATGTAAATGTTGTGTGGAC
AGAATATCACAACAACTACTTACTTTGAGCACAGCCGCAGCTTAATTTGT
ACACACTACGACGGTTATTTAATAATGAATCGAAATGGGTGAATTGGTGC
AGGATCTCTTATTGGCCACGTCCTCTTCTTCCACTTCCTCCTCCGTGGGC
ATTACTCAAGGTTCTCCAGCTCTCGCTGGCGGMGATCGACCCCCTTCCCC
RGCTCGATTAGCATATAGTTCAGACAAACATCCACGAAGTACACTCGGAG
AACTCAATCTCATTCGGAAGCATCAAGGACTCTGTGATGTACTCATCAAT
GTGGGATCTCGTCGAATATATGCTCACAAGTAAAGAACTCTTTCTCTCTC
TCGATCCACGATTCATTCATTCCATTTGGAAGTCATTGAGCATATTTTGT
AGGATTCTTCCTTTGTTTCATATATGTAGATAGTTGGTGCGTCAACTGAG
AAAACAAGGSAGAATGATATTTCTCATAATTGATTTTACAAATCATCCTT
AAACTCTATCAACAAATTATTCTTATTAACCCTTTGGGTGTATCGCTAAT
TGCACTTAAAGATACAATTCTTAGGTATCTTATCATCTCAGAAATTTGAA
TATAAAGCCCCCTATAATTGACTAAAAATGTCTATGAAATATTGGGCTCG
ATTGAAGATAGAGAGCCAAATGGTCATAAAGCAAAAATTAGAAATATTGC
CTATATYTCATCCTAGAAGTCTAATATTTAATGTTAATACTTCAAAACCG
AGAAATTCAGACTMTTGAAATCTATTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAAAAT
AGGAAACCACATTTATTCATAATTAGAAAATGAGTTACGACAATTTGATT
GCGATTTTCTTCTTTTCTTGATCCCTATTCAAAATTGCTTCTATGTTGAC
GCCCCGTATAATTAGAAATATCAATATCATATATATGGTATCAATTAAAT
ATTCACTTTTATTAATATATCTTTTTACATTATTGATTAATATTTACATT
TAATTTTCTTTGTTCAATAAGAATGGATTGTAATACTGAGGTCCTCTTCT
ACTTTCAGAGTGATATTAGCAGCATGCTCTCCCTKCTTCCGAGCCATGTT
TACGGGAGAACTGGCAGAGAGTCGMCAAACGGAAGTGACAATAAGGGATG
TGGACGAAAATGCAATGGAACTCCTAGTGGACTTTTGCTATACATCCTTC
ATAACAGTCGAAGAGTCCAATGTTCAAACCCTTCTCCCTGCAGCATGTCT
CCTTCAATTACAAGAAATCCAAGATGTGTGTTGTGAGTTCCTAAAAAGAC
AGTTAGATCCCTCTAATTGCCTGGGTATACGAGCTTTTGCGGATACTCAT
GCCTGTCGGGATTTATTACATATCGCAGAGAAATTCACGCAGCATAAATT
TCCTGAGGTTCGAAATTATTAATATTATTATTTCAAAGTATTTGAAATCA
TCCTTTTTATTGACATGATTTATTAAACAGGTTGTAGAACACGAAGAATT
CCGACTTTTACCCTTAAATCAATTAATAGACATTTGCTCGAGTGACGAAC
TCAATGTGAGATCCGAAGAGCAAGTATATCACGCAGTTATGGCATGGGTT
CAATATAACTTAGACGATAGAAGACAACATCTTGCGACTGTAATAATGAT
TTAAGCTCCATGTGTTTCTCAATTGTACCACTATATAAGTTCATTTCCTC
AAACTTTAATAGGCTCTCAAATACGTTCGAATGCCACTTTTATCTCCCAA
GTTCCTAGTAGGGACTGTTGGTGCAGATCTGCTTATCAAATCAGATGATT
CCTGTCGTGACTTACTGGATGAAGCAAAGGACTATTTACTCCTTCCACAA
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AAGAGGTGAAATACTCTTTGCTGTTGGAGGTTGGTGCTCTGGAGATGCTA
TTAATTCCGTTGAAAAGTATGATCCTCAAACCGAAGACTGGAAAATTGTG
TCATCAACGAGTAAGCGTCGATGTGGGGTAGGTMTAGCCGTATTAAATGA
TCTCCTTTATGCTGTTGGTGGGCATGATGGGCAGTCCTACTTGAATTCTA
TAGAAAGGTTCTTATTTACATACATATTACAATTTTAAAGATAGAAATGA
AAAACTGAATATTTGACGATAGGTATGATCCTCAAACCAATCAATGGTCC
GCTGATGTAGCCCCAACATCTAGTTGTAGAACCTCTGTTGGTGTTGCCGT
GTTGGATGGGTATCTCTATGCTGTAGGTGGACAAGATGGTGTATCATGTT
TGAATCACGTTGAGAAATATGATCCCAAAGAAAATAAATGGACTAGAGTA
GCTTCAATGATGACGAGACGTTTAGGAGTTGCAGTGGCTGTTTTAAATGG
CTATTTATATGCAATCGGAGGATCCGATGGTCAAAGTCCTCTTAATACAG
TTGAAAGGTATGTTGTGTTCTTGAATGACAATAGTTTGAGAATAGGACTA
GAAGACTTTTCTATTCTCTAGGTATGATCCTCGAACAAACAAATGGACAA
TCGTAGCTCCCATGTCAACTAGAAGAAAACATTTAGGCTGTGCCGTTTTT
AATAACATGATATATGCTGGTAAGATGAAGTTAACTGGTTTGTTTAACGT
TATCATTATTTTTTGTATGTTTCCAAGTTACTTACATTGAGTCGGATTCA
TTACCTATTTTTTAAAGATTGATAGAAAAATTAATGGGAATGAGTACTCA
TTACCTTACGAATTTGTATCTCTTAGTCAGTAATTAATAATGATACTACA
TAAATACGATTTAATCTTCCTCATGACGACTTTTTCATTTAATATTATAT
TATTTTTTTTCTTTCTTTCATAGTGGGAGGAAGGGATGAAGCAACGGAGC
TATCATCTGCTGAACGATACAACCCAGTCAAAAATACGTGGAGTCCCATT
GTAGCAATGATGTCTCGACGAAGTGGGGTAAGTTGTAAAACAAATTTAAA
TTGATTTGTACAAGTGTGAGCAACAATATTTGTGGACTTTATTGCCATGG
GAGATAAATGATTCGGCAACTATTTTAGTTAGTTTTTTCTTTAAAATTGT
ATTCCATAAGTTTTTTCAAAATCAACACATTAATTGAAGGAGAAAAATGC
TCCCATTAACAGCATACACAGGAAGTTTGTTGCCATCTTTTAACATTTGG
GGGAGGGATTCGCCCCAAAAATGATTAACACCGTAATACACTTAAATAAT
TTGGTTTATTACATATATATGATACATTTTTTGGGGTTGTTTCCAGATAG
TGCTATGTCAGTCCTTATTTAGGACTGAAGACTGTAGTCCCGTCCATTTC
ACTCTTGGTCATTTAAGCGGTAATGATGAATGATTAATCTTAACAAAAAA
TTCAACATATTTATTACAATAGAACCTAGCTATTAATCAACAACAATGAA
TTTGAAAAAATTTAACTATTCTGTACACAAATGTAACTTTCTAACAATGA
AACATTAACAAGTAGGAAAAAACTGCTACTATTACATGATTCGTTAGGCT
TCAGACTCTGATTTGGGAAGTGTGGCAAGGGGMGTAAAAGAGGGCGGTGA
TGTGGAGATGGGAGTGGGTTGTGCGACATCCACACTGTCAAGCATTGGTA
TAATTAAAACTTCTTTTGCCATTAGATCATATTTAACAACATAGGTAGTG
AATCTACGACAGAGGTGTGTCTCTGCCTCAAAGGCATCAAAAAGTACTCT
ATGATGGAAGTAAGCGTGGCTAAAGATGCGATAAACCCGTCGACAGACAG
AAGCTAGTTTGGCAACAAAGCACTCTTTGATGGAAATACGAGATGGAAAA
TATTTATTGGAGTTGAGAAGACAGGCCGCACCATCCAAGGTGTGCCGGGT
GTAGTCAATGGCAGGACATTCTTTGGGAGTTTTATGTGCGGCACAAAGGA
AGATCCATTGCTCTGTGGCTGMCATTTGCGTGCACATCTTCGGATTGCAC
TCTCCTTGGAGAAGAACGGCGAGCCCATTCAACTCCATGGAAAATTGTCT
TAAATGCTCATATTTCCAAACCCCTTCATCTTGGGTCTCGGGAGACTTAA
GAATGGCTTCAACGMCAGAGACATCCCTTCTAATCGTCTGTTGTATGTAT
TGTTGGACAGCCAAAGTAGAGTCCATGTCTTCAAAGTCGAGGTTCGGCCA
TTGGTTAAAATCTGTAGTTTTAGTTCCAGGGAAATTTCCACGGAAAATTA
CCTTTGGGCTATCCGTGGGAGGTGCTGATGTCGTGGAATCCGCGACGGCT
SSTGCCKTTTTATCTTGGTTGATTGGTCTTACAATATTACAAAGGATATA
GCTAAATTATATTATTGTGAATGAATGTGTTGTGTGTTTTTGACAACCTC
CTTATTTCTACATAACCACTGGACTATTATTATATACAGAGAATTAAGAA
GAGGAGAGTTACACGACCCGGCCAGCTGCAGTAATAGATGGATGAGCAAG
AGAGGAAAAGAGAAAAGAAAGAACATTTATCCACGCAACCTAACAATTAT
GGTTCTTCCTACAAAATAGAGATGTTATACGTCTTATGGTTGTAAATAAT
ATGACCTACCAGTGGGGCTCAAAAAGAAGAAATGAAGTATTATCATTGTA
ATCCTAACAATTTGAAGAATGTTTGGGAGAAAAACAGCTCATCTGTCATG
ACGTTTTATTAGATAAGCTGAGAGTAGAGATAGGACTGGTCGCGGACCGG
GTATGCTATAAGCAATCATGTAAATCCGGTGTGTTTTTTAGCTGGCCAGT
TAATTTGTAATTGATAGTAATTGAAAGAACGAATTTTCTTTTCCTTAGTA
GTTGCCATTATTATTTAATTACTGAGTATTGAACATCCTTTGCTAAATAG
ATTCAATTATATTCAAAATCTGTTTGAACGTTCGTGTGTGCTCATAAAAG
ACGAAGCATAATCCTGAGGATTTGTTGCATAGTTATGATTGTAAGTCCCT
GTTGGACTCAGAATAYAATTGGGTATCAACATCGGAGTAATTCTAGCAGC
ATGTCCTNATAAAAGACGAAGCATAATCCTGAGGATTTGTTGCATAGTTA
TGATTGTAAGTCCCTGTTGGACTCAGAATAGAATTGGGTATCAACATCGG
AGTAATTCTAGCAGCATGTCCTTGCTTACATCATTTTCTCCTTCCTCTCT
TGTCAGAGCTGATTGTAGCTGATCTAATGAAACGCCATGGGCATTATACC
TTCTCTCCTCTAAAACACTCTTCAAATTGTTGAGACTCAATTCTACTCTT
GAGTCCATTAAGTCTGCAACAAATTTCAAGGTTACTCCCCATCTTTTATG
AGAAAAATATTTTGTCGAACATTCAATCAGATTTTGAATATAATTGAATG
TAATATGAAAAGAAGTACTATTAAGGAGTTAAATAATAATGACGACAGCT
GAGGAAAATAAATTCATTCTTCAGATTATCAATTCWAAAAAACAAACAAA
CAAAAAAACACCCGGGRTAGCCAGTATATATACCGGATTTTTATCAAGAT
AAATAAACCGTTTTTTATAATTCGATCTACATCTTCTTATAGGATTAACT
TTCTTTAATCCTTTTAACTATAATCTAATTTATGCTAATGATGTAGATAT
TAGCAATTAGTCTTTATGTATTTTCATACTATTTTAGCATAGTATGGAAA
AAAAAGAAATCTAAATTTGTACTCACTTGATTCCTCAGTTGAACCGTCCA
TTTTTTTATTTTTTTTTGCTATAGTCACGACCAAAATATTTATAGTACCT
AAGAAACAAATGTATTTGGTTATTAGTGTTGTGTTTTGGTCGGAAAATCC
TGGACCCGTCCAAGATCGTTATTATCTTTAAAGGACTTACTATTTTAGCC
CTTTAAAAAAGTTGGTTCTGATCTCATCTTTGAGAAAAATACAGTATAGG
AATCTGTTTTACAACAACAAAAATTGCTCTCATATAAAATTATGTCTATA
CCGATTCAATCGATGAATTTTTAATGCCGTCATTTGTGTTCCAAAATTTT
GTATATCTTAGATTTATGTTGTGTCGGTTCTAATTAAATTCAGTCTAGTC
AAGTCTAATTCAGTACGGGTACTTAAGTGTCTTTTCTTGCAATTTTCCGT
AAAAATGTCGATAGCTTATTAAGCCAAATAAGATATGAGGTTTGTATTAA
AAGCATTGCACATATCTTGCAAAAAAACAAACAAAAAAAACATGTTTTTA
CAGCGTTCCAAAATGGAAGCAAAAAATTGAGAAAATTTGATACATTCTTC
AGTATTGCAACAGCCAAGGTAAAAAGGSGGAACAGGCGGCAAAAAAAAAA
AAAAATGTGCTGTGTATGGACTCAATACACTATCGAATGCAACAGCAAAG
TGGTGGTTACAGCGATTCCGTTCTAATAATATGAGGCACGATCGAAAAWG
TTGATAAAATAATCAAAATCGTCTAGTTGGACCGGAATGTTAATTTTAAT
TAAATTGTCAAAAGAAAGCGAAAAACGCTCAGAATTTTTAACTTGACCTA
TTAGATTATTTTTTACTTAGTTATATAATTTATTATACTATGGTGGATAG
GGGAAACATTTGGTAAAAAGATTGTGACCGAAGAAATCGGCTTAGGAAAA
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TACACTAATTCTTATAATTTAAATAATAAAGTCATAACATTGAAGTATAA
ATTGCTTTTCAACCAAAATATTATACCATAATGATGAAGTTAATGACAGC
TGCGTGCTATTTTTATAAAAATTTAACCGATTTCATTGAAACATATAAAA
ATGAAAAAAAGAGGTAAAACTGAAATATATTCTTACTCTCGGAAAAAGTA
AACGATGAGTGTGAAAAAATGTTGAAACTTCCTCCAATTAACAACAAATA
ATCCCCCCAAAAAACAGCCAAATGAAGGATTTCAATGATAAAATAAAATA
CGATATAATTAAGCTACACAATTAATCTAATCTCTCTCCCTCTCTTTTGC
GTCTCCATTATCTTAAGAGGGAAGGGACATAGGCATACATATTCGGTGTG
TCTACATAAAAACAATCTGGAACAAATTTATAGAAAATCCCAATTTATGA
TTTTACTTAATATATACAGGGTGATCCATAAGACTTAGGATAGAAACTTT
AACTACATATTTCTCATAGACTGTTATATATTTTTTAATTCTGTTTAGTG
CATAAGATTAACGCATTGTTTATCTTTGTTTGTTGTTAAACAAACTTTTT
TTTCTTCTAAAACTTGTTTTTGAGCCTCGAACGTCATCATGAACACGAAG
TGCGTATTCATTTGGAAGGCAAAATATAAAGTGACGTAAATCGTGTCGTT
TTTTTTTGTTTTTTTTTTGAGAATCTGAAGAATAACTTTTCTTTTGCAAA
GCTATTGTCATTATTATCTAATTCCTGAGCTGTGAACTTCCTTTTCGGCT
ACTTGTAAGTCTTTGATAGACTCAGAGTAGAAATGGGATCGAGATAAGAG
MAATTGACGGAAATGTCCTTGTTTATTTCCTTCTCCCTCGTCACAKCTGT
TTGTCACAGCTGCTCTCCTCCAAAATATGCTCCAAAATGTCGGGTGACGG
TGTTGTATTTTTTTTTTACATGCCCAAGACACTCAATTTTTATCACTATA
TATTAGTCACATAGTATGAGCTTTAGCTTACTACAAACGCTTGTGATTGA
ATGAGCCTTCATGTCATAATAAAACAGGCAGATACACTTTTCTTTATTAA
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CCTGATGTTTGACTTCCACCACGCTTTTTCATAGTGACGTCAAAGAGTAT
ATCTCTTACCAAGAATAGCTATATATCGCCTTTTTGACTATTAACCTTGA
TACAAAAAAAAATGAATTTTACWCTTTCTTCATTTTTTTGATTTTTGTTC
TAGATCAGAGGTCGGTAACCCCCGACCTGCGGGCCTTATTGGCCTGCCCA
CTATCTTATCATGATATTTTTGTCTTATTATTTTTCATTTCTTTATAATA
ATTCCTGTAGTAAAAAATAAAGTTATTGTTTAAATAAATTATATTGAATC
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CATAGCTTGCCGACCCCTGTTCTAGATTGTTTCTATATTCAAGCACCACA
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GTGGGTCTGGCCGTTGTGAATGGTCAACTCTATGCTGTGGGAGGATTTGA
TGGTACAACCTATCTTAAAACAGTGGAGGTATTTGATCAAGAAGCGAATA
ACAATTGGAAAATATGTGGTTCCATGAACTATCGACGTCTCGGAGGCGGT
GTTGGTGMCGTCAAAATGCCTCAAGTTGATCCGCATTTCTGGTAA back to top
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