EMLSAT00000001173, EMLSAT00000001173-697020 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000001173
Unique NameEMLSAT00000001173-697020
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s1194supercontigLSalAtl2s1194:274459..293699 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000001173 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000001173EMLSAG00000001173-683939Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000005113EMLSAE00000005113-714041Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005114EMLSAE00000005114-714042Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005115EMLSAE00000005115-714043Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005116EMLSAE00000005116-714044Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005117EMLSAE00000005117-714045Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005118EMLSAE00000005118-714046Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005119EMLSAE00000005119-714047Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005120EMLSAE00000005120-714048Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005121EMLSAE00000005121-714049Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005122EMLSAE00000005122-714050Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005123EMLSAE00000005123-714051Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005124EMLSAE00000005124-714052Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005125EMLSAE00000005125-714053Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto775674auto775674Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000001173EMLSAP00000001173Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000001173

>EMLSAP00000001173 ID=EMLSAP00000001173|Name=EMLSAP00000001173|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=667bp
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GAIGNGAEGIPGLPASAMSFLGLFLIGVGTGGIKPCVASFGGEQFQMPEQ
EGHIKTFFSXFYAAINSGSLISTALTPMFRQNVSCFGQDSCFPLAFGVPA
ALMVVALLIFGSGKVLNLYKLKNPTNNIILDTTSFLWYCTKARFTKSKEE
RENKGFLDLGEDKYDPSFIDDVKSLFNVCVIFLPFPIFWAIFDQQGSRWX
FXATRMNGDVYGFQILPDQMQVINPILILIFIPLFDYVIYPIFDKFKILR
TPLQRIVVGGIIAGLSFGVSGVVELNLQKTYPKLPESGFSHVTLYNGLTD
CNIDSFKFTPILGEGGTQMEGTDIPSGNFSILFLQNGKKEDSMSILYTKD
FENSGANSKIIALPSEYRPKVDKSENGFPYVKFFWNAKSNDIQSVMLEPK
EENSNHVLKYSTSSLEHHDAAPSRLKTTGDFRICVEKAGSKKECLMDLEI
LYGANYNIFIQSETDETLGIMVHKIVQENSIHLLYLLPQFILLTAAEILF
GITSLAFSFTESPDSMKAVLMSVRFLTNAVGNIFDVIIISLLEGVFSSQV
EYFTIQRLNFNFFFEVR
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mRNA from alignment at LSalAtl2s1194:274459..293699+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000001173-697020 ID=EMLSAT00000001173-697020|Name=EMLSAT00000001173|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=19241bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1194:274459..293699+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATTCGAACAAGCATATATTTCACTTTGCATCTTATCTTCTTAATTAGTTG AAAAAAGAACGCTCTTCATCATTTTTCTATTATAGTTTGAATATTCTTGG TTTTTTTCTGAAGAAAGTACATACAATAATAGAAAATGGGTATGTTGTCG TAGTTTTATAATACAATAGAAGTTCCTGTACTACATTCGGAGATAACTTT GACCTCGTCGTGATCTTGAACAAATGTATTCTGAAGATTTTTTAAAGTTT TATTTCATAGTATACGAGGATGGTCTGAAAAGTGTCTGATTAAACGTATA GATGACAATACTCGTAAATAAAAGCTAGTCACATCTATCTAGCATCTGTT GACTGTTACTCACCAAAGTTTCAGCCATTCTGGACGTGTAGTTGCTATAC AACAGTCGTTTAAGTGAGTTGATGTAGTCTGTTTTCGTAAAAAAAAAATA TATATATTTTTGTAACTCTACACACAAACATTTTGCTGGAGTGATGCTCC CATATCTGTTATAACTTTGCTGGAAAAACAAATACAGATTTTTTATCCCT CTCAAAACACTCACTCAAACGAATGTTACATAACAACTGTCCGTCCAAAA TGGCTGAAACTTTACTGAGTAACGTTCAACAGTTGCCAAAATAGATGTGT CTCGCTTTTATTTAAGAGTATCTTCATGTTGAGGTAGGAAACTCTTCAGA CGACTCTTGTAGATGGTATTACCATGTTCATATTGAATATGACTTTAATT GACTTCATTTCTCCCACGGAATGCTAGGGAGGCTTTGATGATGTCCGCAG AGGGGAGCCTTGCTCCCACATGCTTGTTGGCAGCCTTGAAGGAATTCCCA CTATCGTGTGAGGTGGCGCAGGTGCTCCTCCCCAACTCCACCTAGACATG TAAGTCAAAGGGGCTTAGATTTGGGGAGCKGGRGGGCCCAAAGSCTGCCA 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