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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s1194 | supercontig | LSalAtl2s1194:98342..118053 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000001178 >EMLSAP00000001178 ID=EMLSAP00000001178|Name=EMLSAP00000001178|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=273bp
MSWATMYENAIPVVVNFTRMDHHYKNIMFAKEKYEYLMSIGDPRVQDWPL MSSPRITLIIAFLYLAICYFGPKWMSNKKPWSINSFVLLYNLLITTLNVY IGAELFLTSTQLTYNWECEPVDYSNDPKAIRIASALWWYYASKGFELFDS LFFILRKKESQLTFLHVYHHSTMFCLWWIGVKYVAGGSSFLGAMFNSFVH ILMYSYYFLTACGPKVRAYLWWKKYLTSIQMVQFVFALVMGINAIRIGCA FPLWMQYAMVLYMVSFLVKTAHT back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1194:98342..118053- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000001178-697025 ID=EMLSAT00000001178-697025|Name=EMLSAT00000001178|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=19712bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1194:98342..118053- (Lepeophtheirus salmonis) ATGAGTTGGGCAACCATGTACGAGAATGCAATTCCCGTCGTTGTTAATTT
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TGTAATAATTTAAGATTATATAGTTAAATAAATATGTTCAGGGGGCGTAT
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AAGAATCGATTTTTCCTACATTTGGACAATTCCTCCGCCCCCACCTCCCA
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ATTATACAGCAAAACGTGTACTTTTAATTAATATTTATTTTCTCATTACT
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GGTCCAAAGGGCTTACCACACCAAATATCCGCCCCAAAAAAATCGTCTTA
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TGCTTATTATTGAAAATATGAAGTTATTGATGTATTTCTGAGTCCATCGC
TTGAGTCCACTGCCCTACCCTGTATATCAAACCCTTAACTATATTAAAAA
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TTCTCCCCTCCTACCCCCTCCCTCCTCCTCATCCTAAAAAATCTTTAAGT
CGGAACCCCCCCCCCCCCAAGAGTCTTAGATATATGTAACCTTTTCTTTG
TATATTTATATTATTCAATATTAGCTATAAGTGAAGAATAGCTATAAAGA
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GGGGGGGGGGGAAAGGATTAGGAAAGCAGTCTTAGGACTGATCCAACACT
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GTGTCCCAAAATAGCCCCTTCTCTTCTTTCAACAAGTTTTTGGTCTTGCA
GGCTTCGTGTGAGGGGAAAAGGTCTTGCTGAAACAAGAACACAACTCCAT
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TCTCATCCGAATAAAAGATGACTCGGTTACCATGATACTTCAAATCGTTT
AGCTATTTGCTTCCTTGGATAGCTCGGGTGGCCTTCATTTTCTCTGTAAG
GATATGTCTTTTGTAGAGGGGGTATGATTTCATTCTGAGCTCAGTGTTTA
TGGCCGTGGACACTGTTGTGCAGCCTACATCACAGGAGATGCCTTCACGG
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GACTTGTGAGCTTTTCTCTTATATGCCCCCTCCTCCTTCCAATAATTGTA
GACGTCGTAGACTGTGGTCTTTGGATACCCGAGCATCTTCTTGATATACG
GTGGACTGTGTCCTGCACAAGCCATTTCGAGGAAGGGTTTTTTTCGGGTC
TCCTCCATCGTAAACACTTGTTTTGAATTAAAAGTTGGGCAACTAACTTC
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TTGTTTAGGATGTAGTAAACGATGGTCCGGATTTACCTGAACGACCCTGT
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ATCTTCAACAAAAATGAAAGACTCATTGCAGTTAACGATTTTCTCAATGT
GTAATAATTTTCCTTTGAGATTGATTTGTTTTACATTGAAAATAATCTCC
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GCTTGTTTGTAGTACAAAAACTGCACATTTTTATGTCTACTGCTTGTGAT
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AGAAGAAATTGGAATCGATTTACTTCACTCTAATTATTCCAGGACTAATT
ACAAATCTTTCATTACAGACTACAGAAATACAGAAAAATAATTAAATATA
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TTTCCTTTTATAAGGCGAGGAATATAATTTACATTTACAATAATTTGATC
TCCTTTTTTGATCATGGAGGAGTCTAGATCATTCAATACTTTGAAAATTA
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TTTTTTCAAATCCTATGAGGTGTTGCTACGATATTGGAACGGAACGCTAA
AACCTCATTTTTTGATGCCACGGAGTAGTTTGAATATTTTCACAAAAATA
AACGCTTCATTTGATTGTTTACAATTTGAGATCTTGTCAGAGTTAGATCG
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AGATGACTTTTTATTTTGAAAGGCTGTTATAATTATTCTTTTATTCTTAA
AGAGAGAACAATTAGTAGGAAGTAATCACTAGTGCTTGAAAGAGTCACTC
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TTAATTTAACGTCATGACAGCTAAACTTATCTCCTCCGAAACATTCTTCA
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TTTTTAAAAATAATTGTAAATTGTCATTTTTTTAAAAAAAAGATTCTAAA
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TCCAGTACCTCATTGTCTCCATACTCAAAGCTGATGGAGGACAAATTGAA
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ATTGTCTTCTACTTTTTTCCAATGGCAGAAGAGACTCACAAGTAATAATG
GAATTGGAAGAGAGGATGAAGTGTCTAGAATTACGAAAATAATAAAGCCT
TATGAAAGGATTCTGTGTCATAGATATGAATTGCGGTTATGTACATCAAT
GACACGGTAATACTCAAATCAATGAAAGAGTTTTCTAAAAATATTATAAG
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ATGAACCTCTTTGTTTCTCTCTGTACATTCATAATATATATTTATATATC
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AGACATTATATTTTTGATTTTTTTCCAAAAAAAATATTTTTCTGAGAACA
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TAAGTTTACTGCAACAATAATATACCTATCAATAAAGTATAAACATAGGA
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GATCCCCAATTCTGCTCTGAGCCCAACAAGGACTTAAAATTATAACTCTG
CAACAAACCCTCACAGTTCCGCTCCGTCTTTTTTGAGCACACACGAACGT
TCTAACAGGCTTTGAATATAATTGAATCTATTTAGGGAAGGATCTTCATT
ACTCATAATTAAATAACAACTGCTAAGGAAAAGAAAATTCTTTGTTTATA
TTACAAATTAACGGGCAAGCTAAAAGTACAGAGGATTTACATCATTGGTC
CTATAAGKACAGKGGKGGRGKGGCAGGGGGGGGGGGGCACGGACCTCATT
CTCTCCGAGCAAGGAATATTTTATACAAGTTNCGTGGGCGMAAAKWAAGR
RAKAKAAWTAAAGTAAGTGCAAGAATTTTGATTCAGAAAGGTAAGTTTAG
AAGAATGGAAATTCTTCAATTCTAAAAAAGGTCATTTCCAATAAGGAAAT
ACATATTTTTTTCTATAAAAAACAATTCATTCAATGAAACATGCATACTG
GTGTTGGATCGGTCCTTGGACTGATTTCCTAATCAGTGTCCCTCCCTCAA
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ATTCGGTCCTACAGTCATATCTATTTTTTTATTTTATTCCTTCCTAGCTA
GGATTGAAAAATATAAAAACAGAGAAGATAATTAATGATAGCCAGAACGT
ATCATTGGCTTTAAAAAAACTTAGTGATAGTTTGGATCGGTCCTGGGACT
GATTTCATAATCAGTCTTCCCTTCCTTTTTAACTTTTTTATTTATCAGTT
GGATATTTTAAAAACTTCAACGGTTCTAACGACCGATTATTTGGTCCTCA
GTCCTAGCTATTTTTTTATTTTCTTCAATCTTAGCTATTTATGCATTACA
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TATTAGGACCGAACTGATATAGCTGCATTCTGTACAGTTTTTTCAAACCG
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ACAGTTTGTATGTTTTCTAAAATGATCAAAATGTAGTACTGGATTGGTCT
AATTTAATTAAAAAGACTGCAGTTCCATCAGTCCAGTTCTAACACAATTT
GTCAGTTCTAGAACCGGTCATTATTGGTATATTTTATGGTAACTACAGCA
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AAAAAATATAAATAGACTGGAGTCAAACTGTATCTGGTCCTAATACAAAT
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GCTTGAAATCAACTGGTAGTTAGCCAAATAAGTCAAGCATACCATCTGCT
ATTAATCTCTTAAGTTCTCGCAGAATATCATTGCCCTTTTATTTATTCAC
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TGGGAAATGGATCATAAGTATAAAATGAATGATGTAAATCCGGTGTGTTT
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