EMLSAT00000001178, EMLSAT00000001178-697025 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000001178
Unique NameEMLSAT00000001178-697025
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s1194supercontigLSalAtl2s1194:98342..118053 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000001178 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000001178EMLSAG00000001178-683944Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000005141EMLSAE00000005141-714069Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005142EMLSAE00000005142-714070Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto772072auto772072Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000001178EMLSAP00000001178Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000001178

>EMLSAP00000001178 ID=EMLSAP00000001178|Name=EMLSAP00000001178|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=273bp
MSWATMYENAIPVVVNFTRMDHHYKNIMFAKEKYEYLMSIGDPRVQDWPL
MSSPRITLIIAFLYLAICYFGPKWMSNKKPWSINSFVLLYNLLITTLNVY
IGAELFLTSTQLTYNWECEPVDYSNDPKAIRIASALWWYYASKGFELFDS
LFFILRKKESQLTFLHVYHHSTMFCLWWIGVKYVAGGSSFLGAMFNSFVH
ILMYSYYFLTACGPKVRAYLWWKKYLTSIQMVQFVFALVMGINAIRIGCA
FPLWMQYAMVLYMVSFLVKTAHT
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mRNA from alignment at LSalAtl2s1194:98342..118053-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000001178-697025 ID=EMLSAT00000001178-697025|Name=EMLSAT00000001178|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=19712bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1194:98342..118053- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGAGTTGGGCAACCATGTACGAGAATGCAATTCCCGTCGTTGTTAATTT TACTCGCATGGATCATCACTACAAAAATATCATGTTTGCCAAAGAAAAGT ACGAATACTTAATGTCTATTGGAGATCCTCGAGTCCAGGATTGGCCCCTT ATGTCTTCTCCTCGCATTACACTAATCATTGCCTTTTTGTATCTGGCTAT TTGTTACTTTGGGCCAAAATGGATGTCTAATAAGAAACCATGGAGCATTA ATTCTTTCGTTCTCTTGTATAACCTTCTTATTACAACACTTAATGTCTAC ATTGGCGCCGAGTTATTTTTAACGTCAACACAATTAACCTATAATTGGGA ATGTGAGCCTGTTGATTACTCTAATGATCCAAAAGCAATTCGAATTGCAT CTGCTCTCTGGTGGTACTATGCTTCAAAGGGTTTCGAGCTCTTTGACTCA TTGTTTTTCATTCTACGTAAAAAAGAATCGCAGCTCACATTTCTTCACGT ATATCATCATAGTACTATGTTTTGCCTCTGGTGGATTGGTGTGAAATATG TTGCGGGAGGCTCGTCATTTCTGGGTGCGATGTTTAATTCATTTGTGCAT ATTTTGATGTATTCCTATTATTTTTTAACCGCGTGTGGACCCAAAGTTCG GGCTTACTTGTGGTGGAAGAAATATTTGACTTCAATACAAATGGTTCAAT TTGTTTTTGCTTTGGTCATGGGAATTAATGCCATAAGGATTGGATGTGCT TTTCCATTATGGATGCAGTATGCAATGGTTCTCTACATGGTCTCATTTCT GGTTTTATTCTCGGATTTTTACTACAAAGCATATATGAGAAAGAAAAAAC TTAATTGATCCATGATTAAGCGCATAMAAGACACAACCAAAGAAATCATC TTTGTTCTATTTCAGATATTAACTTTAGTTCATCTTCCTTCACATAAGTA 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