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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s119 | supercontig | LSalAtl2s119:125227..132607 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000001190 >EMLSAP00000001190 ID=EMLSAP00000001190|Name=EMLSAP00000001190|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=312bp
MIEMIKEWRIFILFLGSLPTIASNSGGRFEMFKSLIKKHTSENKTKEVGL
RHFLFDADPEKNEVCDSKFGAMEDMIEFKRMAIYEPQKEIISIDFNLRKK
EKWDFYYQLITESEITVVHASYIVYACPSTSKIKNHIYPGCCDINGCKCY
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IQKFDLMETKEDCVIRKKCRKKRCRRKKKCSQECDEDEECTKVCKTIKKC
RKRKCRKVKKCY back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s119:125227..132607+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000001190-697037 ID=EMLSAT00000001190-697037|Name=EMLSAT00000001190|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=7381bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s119:125227..132607+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGATTTATAACCTGACGGAATATCATGAAAGATGATAAATAGGAAAGAG
GAAAAACAATGATAGAAATGATCAAAGAATGGAGGATATTCATCCTTTTC
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TTTCAAGCAAAAGAAGTAGGATTAAGACATTTTTTATTCGATGCAGATCC
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ATTGATTTTAATCTTAGAAAGAAGGAGAAATGGGATTTTTACTATCAGCT
GATTACGGAATCCGAGATAAGTGAATAAATATAAACATGAACAATATATA
CATATTTATGATGCGTAGAAGTTGCAATTTTTAATATCCCATTATCATAA
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GTATTTGTAATTATAATATATACTATAAGCATGAGTGTACAAATATCATA
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TGGTGAAACAGAAAATAAAAAATACTCACCGGACATAAGAAGGACATTTC
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TCTTATTAAAATGAAGGTAAATAATTTGCCGTATATTCGAATGTTGTAAT
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TTGTTTATGTAATATCTCGAGGAGCTACAATTGTAAACCACTGCCTTTGA
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TTTTCTCTTTCTTTCATTTTACCCTTTCACTTTTCATATATGTATGTATT
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AAGTAATATACTATTGAACATCCAACGACTACATTTCCTAGTAAATCGAT
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TTCATTCTCAGTTATCATTGCAATAAAATTTCATGTTTTTCCATCTCTGA
GTGGCCATCCCGTTTTTTTTTATGCAAAAATTTTTATTGAAAACAAATTC
AAATTATATTAAATTATTTTTATATCATTTCTTGTATACGTTGTGTAAAA
GTTACAACCTAAAAATGATTTACATAATTTACTGTTCTTGGGATAAGTAT
AATGCAATGCTTGAGTATTTTATGAATTATCAATATATTATAGTATAATT
TTTGACAATTTCAATGCAAATTTATAAAATATATATAGTGCATGGCACAG
TATAAAGTTTTATGCTGGAATTATATTCCTCATAAATAAATTACAATCCA
TATTATTTTAATAGATTGATAAGATCAATTAAAAGTTGGTTATTAGAATG
AGCAATGTTGTGAAATAATCATTTATTTTAGGACACAAAAATTGAAACTT
GTTCAGTGTCCTTATTCAAGTTGCTTATACTCCTACAGACATCACAGCTT
GTATACAGAATATTTACATAAAATACATACATCGATATATTTCTTCTTTA
TTACACTTGCAAGAACCTTTGTGATGATTTGATACCCAAGGCCTGCCCCA
GCACAAGTAAAATCAAGAATCATATTTATCCTGGTTGTTGTGACATTAAT
GGTTGCAAATGTTATTGCTACTATGAGTGCTCAACCCTCATGGACTATCT
TACAAGACTTGAAGAACTTCTTCCAACGCCTTATTTTGATAAGTGTGTCA
CTAATGCAACAACAGCAGAGGTCAACGTTTGGCTTAAGAAGGCATGTTAT
GGTGCTAAGACTCTTTATAAAAAGGTATTGATATTTTGTTAACTTTAAAC
ATGTTACATGCATACACTTGAAGTAAGGGAATACAATACAAACGTGAACA
AAAATGGCCCGTCGGCACTAAAGCAAGCTAGAATGATAATTCTCAAAACT
GTGTCTGGATTACATTTGTATTATTTGACAAATTATCTTCTTCCGATGAT
TACTCCTTTGAGAGTAAAATATCATTGTCACGATGAAAAAATTAGGAATT
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TTTAATGAAAGTACTAAGTTATAAATAAAATTATTGGCTCTCTCAGTTCA
TCCCATAAGTTTAAATACATAGCGTATAATTGACTGAAATATGGAGATAT
ACTGCTTTTGGGTTAACTCACCACAAATGTTCAGTTTTTTTTACATAATG
TATATSTACAATGTGGATAAAGTCAATATTTTATAGGCCCAAATCCGATA
TAGGGAATGACTTGATATACTCAAGAATTTTCACTACAGCTTAGAGCTTT
TATGAAATTTATGACACTTAATTTATTTCTATTTAATTATTGTGAAGAAC
AATATGTTTTGAAAACATAAAACTGAAATTCAATGATGACGTCCAACGTC
TATTAGAGCATATATCTCTTCCGCAGGGTCTGATCCTATCTTGTGATCAG
CACGCATTGAACTTGGTTCATAATCACCTCCAGACTCTTTTAGTTCCCTC
CTAACTCTCTAGACAAATGACTAGTCCATTTTTGAGAGGTTTAAAATTTC
AACATTGTCTTGTCCAATGCGGATTGCAACAAGGACATGCTGCCTTTTTC
ACAATTGGGGAATAAATATTTTTTTGTTATGCGACAAAACAACAAAAACA
TTTTATCTATAGTTGCTCAWTGTTCGCGGTTAAACAKCCGCCGCTCCTTT
TATTTGTATTTTTTTCTTTGTTTCACTGTAAATGTCAGAATTAGAATATT
TATTTATTCAACTTTCAAGAGTTAGTCGTCATTGACATTATTTTGTATAA
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ATGAAAACACGCGCATGGAAAATTGCCCTAGAAGAAAATTGCTGGTAATT
TATAAACATTTTTAGTTTCGATAATACTATTAAATACAAACAAAGATTAA
TTAAATTCAAACGTATCTTAATACTATTCTAATAACTTATCACAATGACC
GATAGGTTTGTATGATGATTTTTGCATTTTGTTAATATGTTTCATATTTA
CAACACCACTTCAATTTAAGGGTAAACCTATCAACAATATGTTTAATTTT
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TCACAATTTATTATTTTTATGCAAGTACATACATAAAATCCTCCATCTTT
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CAAAGTAACATGTCGTAATGCAGGAAAATGTGTCAAAGCTCCTGGAATAC
TTTGTAAAGCTTGTATTAAATTTGCATGCGAGGGAGAAAATGATATCCAA
AAATTTGATTTGATGGTAAAACGATAACTATTCAGAGAGTTGTAGGTTCT
AATCATTATTTCGTGTGTTAATTTTTTGTTGCTGACTATCGTAACAGTGA
TTTATTTCTTTTATTTTACAAAGCTGTAGACATTATTCACTCACAATTGA
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GATGGAGAGMAACACGGAAGATTTGTTAGAAATTTACAAGCCTTTGTTGT
ACTCAAAGTGATCATAGAATCTAGGATAGAAGACAAAGCTATTCCTGCCT
ATCTCTTTGCTTTATAAGGAGAGGGTTTTGTGTGTATTTGCTTCTTCTTA
GAAGTCCTTGCAGCTAATTTAATATTATGACAAATTTATTTACTATGTGA
CTTTTTTGGGCAAGAAATTAGTCTCTAAGCCTAGCAGTGCGTTATAACAG
CTAATTTGTCATGTACTAAAACATTTTTCAAATTATCAAGACAATTTTCG
TGTTTTTACATAGTTTGTGCTTAGAAATTACAACTCTAATTCTTTAGCAT
ATCAAAAAAGACATGTTATATTTTGTTAGATGTATGCTCATTATTAGAGA
TGGTATAAGTGTCAAAATCCTGGCGGGCCTAATTTTAAAAAAAGAAGTAT
ATGTTGGTTACGAGCAAGAGTACCCTTAATTATCGTTAGTAACAAACGTT
TTATCAAGGAAGAAAAACTATAATTTGGATAGGGATATCTGACAGCAGAC
CTTTCATNCTATTAAACTTATAATGTATAATTTTTTCACATATACATTTG
CATGGATTTTGACATTTTTCACATCTTTATTTACATATAAATAAATAAAA
TTACAAACTTTTCTCCTGAGTTAGGAAACAAAAGAAGATTGCGTGATTCG
TAAGAAATGTCGTAAAAAAAGGTGTAGAAGAAAGAAAAAGTGTAGTCAGG
AATGTGACGAGGATGAGGAATGTACAAAAGTTTGTAAAACCATCAAAAAG
TGTCGAAAAAGAAAATGTCGAAAAGTCAAGAAATGCTATTAAAAATGGAA
TGGGTAGCTACAAACTAGTTCGTCTTCATTTGCATATCTTTATATTTGTA
GATATCAACAAATAATATAAAATAATTGTAAAAAATTTAATGACTTGAAT
CCTTTTCATTTAATTGGATTCCAAAGAGAGAAAATAATTAATTAAAATTT
GACTTAGTTATACTCAAGTTTGTAACTTTTT back to top
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