EMLSAT00000001236, EMLSAT00000001236-697083 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000001236
Unique NameEMLSAT00000001236-697083
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s1201supercontigLSalAtl2s1201:44563..70317 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000001236 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000001236EMLSAG00000001236-684002Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000005393EMLSAE00000005393-714321Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005394EMLSAE00000005394-714322Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005395EMLSAE00000005395-714323Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005396EMLSAE00000005396-714324Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005397EMLSAE00000005397-714325Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005398EMLSAE00000005398-714326Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005399EMLSAE00000005399-714327Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005400EMLSAE00000005400-714328Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005401EMLSAE00000005401-714329Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005402EMLSAE00000005402-714330Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005403EMLSAE00000005403-714331Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto770457auto770457Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000001236EMLSAP00000001236Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000001236

>EMLSAP00000001236 ID=EMLSAP00000001236|Name=EMLSAP00000001236|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1053bp
MGQISRISATSIFDLGKEMNAGETEFSDKSKMKPVRKKNSRLFRNAVRSA
RKLDASLNRWEHRDKILPNEPDGCGSPVCIVWEARIKRFPSVCALFKYMY
DNSMQKTVIKVQKGGCEDASELNIWIHRYDATWGQVSHQCQYCSKDNKYG
CNQKVCIHIENAARTFDNVCDAMTWLGPKTNVVKIAVGLGDCKTLYSQCI
YTDWFDLEDPCHKGDYEHYEAIKNMFIDTGNGIQNFCPKGFLEGSLQGVT
LDGIAYPKNVTFQIYQSDLALQCLNDVQPARASPPYYWNNEEVLSENKVE
ALSLDSPELSGKTLFDNCEWRSFISSDYAVKRGDIETRAVHVRYRKTSAC
GSSTRSYAMIIDARLRSNDTPADETGEIITKYTPWFGFYCDHINNKPYGK
RCSDYKVRYCCSKRVQEAAQWGDWTDYSKCSKSCGGGHQTRTRSCIKKRG
NKQNCFGILQNKFSNQKRDCNIIPCPKQFHWTDWTAWTQCSASCGDGTRH
RARGCYPSNNGGEDCPPKVDKRYKEVQECSTEKCPDPQWIKWQNWASCSK
TCVDGGWSTWQNWGECNRACGEGGKRPKRRXCIHPFPENGGKDCSGNGVE
YGPCEVLKPCPVHCLYSEWGVWSPCSVSCGNGPGVGTVERNRHIYQEAKY
GGIKCGGIKREIKNCIHCNYTKNIQMEDIQNCIPYCPIDCVWEEWGQITG
KCVICWGNQAGQFPKAVAKLRSRKKIRFVYIPPGNGGKECILSDGQNRQK
DQFYEEAVLPCKVSEEIERPQKNEHFDTYKCKSTMVQGKPFFESWTMWSG
CTAVCGRDGIQKRTRVCVGGSSKECESYTKFKSEETMPCPSVCDPPEWTM
WENWSKCEVTCGIGQVARRRTCMAXNRDKKFRKEAITCIGIQREQKKCDM
GACGSKHDIDYEGEDSTGISGQWPSDYKLVEANHETVNLNSTKQDEDSLL
VQNLEQQQPYDTKQHQTNNRIVKSEPDVVIKDSTNSIPPHLNLRPKDTMK
PIESFRGLSSNGNKSIGVGERAEDFSYDAYESGETSRNTFDSKTDEYSSW
VQE
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mRNA from alignment at LSalAtl2s1201:44563..70317+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000001236-697083 ID=EMLSAT00000001236-697083|Name=EMLSAT00000001236|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=25755bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1201:44563..70317+ (Lepeophtheirus salmonis)
TTAGTATCAGACAAGTTTGATGAGACCTTTAAATCACGAATGGGTCAAAT TAGTCGGATTTCAGCGACAAGTATATTTGATCTGGGTAAAGAAATGAATG CTGGAGAAACCGAGTTCTCAGATAAATCAAAAATGAAGCCTGTACGAAAG AAAAATAGTCGACTTTTTCGAAATGCCGTTGTAAGTACTCTGTAATAATT TATTATTTTGAATAGATGAATCAATAAGAAATAGCAGAGGGCAAAAAAAT TTAACTTGTAAAAAGAAAACTAGTACCAGCGCTATTTAAATATCTGAAAC ATTAAATTAACAATTTATAGGTACATATGTAATTAAATATATAGTTGTTT TTGTCTTTTGTCTAAGGGAGTACTAACGTATGACCTAGTTGATAAATTGA CTTTAAGAACCATTTGCGTCTGAGATTGTAATTTAGAGAAATATTTTGCT ATCTATCGAAATGCAGTCTTCTTTTTCTGTAACTTATCTTCACTTTAATA TAGAAACTCAAGGTGTTCAATTATTCTCCGGTACACAAACCAGACTTATA AACTTATAAAAAAGGTAGTGTTTACACCACCTTACATGAATATTTGGGTA TGGAAAAGCTATTTTCCAAATGGGTGCCGTGTTTGCTCAAACCAGAGCAA AAGCAACAACGAGAAGATGATTCCATGAACTGTTTGGAGATGTTCACGCG AAATAAGAAGGAGTTTTTACGTCGGTACATCACAATGGATGAAACATGGA TTCACCACTTCACTCCAGAATCAAAATGGTAGTCTCCTGAGTGGTGTGTA GCGGAGAAAGCCACCCAAACACTCAAACATCGGCTAAGAAGGTCAGGGCG TCTGTATTTTGGGATTTGGATGGAATGTTGTTTTCCTGTCAAGGCCCAGG ACTTATTGACCGATGTGTTATATATGTATATATATATAAAGACCAACGCT TGGGTAGTTTGTCGAGAGCTGTTGAAGGGATAATTTATCCTTTCCTTGGC TAGAAGACTTTTAAACGTTTATTCAAATATTTCAAATATGAGTGCCTTAA TTTGATTGTAAGAGTATTTCGGGATGTATAATGCTTGAGGCTTTTTGTTG TGTTTGCAGCCTCTGGGGTTTACCTGGTTGAACCATTTTATGCTGTAACA ATATGAAAAGAAGCCACACATTCAAGTATAATTTTATATATATATATAAA CATGCATAATCAAATGCCAAAACCTAGTTCAAAGAGCCCTTGTTTGATTG CATAAGCAACAATCTTTTATCGGAAGTAAAGAAAAATTATTCAGTGAGAG TATTCAATACTGCAACTAACATGTCATCACAATATATGATGAAGAAGAGA TGAAGATTTTGGTAGGACAGAGAATACATCCATTTTAATGAGTTTCTTGC TCAGTATCCTTTTAAGGAACAGGGTAAAAATATTAATCACATTATTTTCA CAAATTTTTGCATGGAAAGAATGTGCACCTAAGAAGCTTAAACAACTTGA AACTGAAAGTCAAAGCCTGATACTCAAAGTTAAGAAAGCTGTCTGATTTA TCATTTAGAAATTTTTATGAGGAGACAACAAAGATACGAGAGCTAAAAGT TACATTTCGTGAAAAAATGAAAGAAAGGTTCAGAAACCGTGCAACTGAAA AAGAAACCTTACCATAAAAAAAGAAGACAAAAAGACTAATGCTTTTCGAA AAGTTGAAAGAGGAAGGCGGTTCTTTTACAAATGTTGTTGAAAATGTTGA TTTTGACATGTAATATAGTAAAAAAGATTGAAGAACGAAATAAGAATATA AAAAATAGACGTCTCATTTACAAGAGAATATTCAAAAGTCCTGCCCAAAA CTGACCCCCTTTTTAGAATACAAGTGACTCTACTCAGTAAATAAAGGGGG 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TTGTATTTCATTGGAAAAGTTACATTTGTAAAGTTTCAGTCTTCAAAGAG CGTTTTTTAACCTCTATAGCCATTTTAAAAGGAATTTTTGTCCACAACTT TTCGTCTTGAATAAAAATAAACTGTAGCCCAAGAAAATATTTCGGATACT MAAACGATCMAAGCCACTGGAAATTATTTTTATTTTTCAGAGTGCTAAAA AGATCCTCTTTCATTGAAAAGTTGGCTTAAAATTTAATTTGCTCCTTTTC ATGAAAATACCCTGTCTAACGGTAAAACTGGGCCTTATGATACACATATG AGTCTAAAGTATACATAATTATATTTATAGTTGAAGGAAAGAGATATGAC GCCACCTGGGGACAAGTATCTCATCAATGTCAGTATTGCTCCAAAGACAA TAAATATGGTTGTAATCAAAAAGTCTGCATTCATATCGAAAATGCAGCAA GGACCTTTGACAACGTTTGCGATGCAATGACATGGCTTGGCCCAAAGACG AATGTGGTAAAGATTGCAGTTGGATTGGGGGATTGTAAAACGCTGTATTC TCGTAAGGAATTTATTAAATTGATAATTTCATAATCTAACCCTTTTCTAT TAAAAAATTATATCTTTTTTTAAAACATTATAATGTAGACATTACATATT AATATAACTTTTTTTGGGATATCTTTATATATTACATCCGAATGTCTGTG TGAGTGTTTGTCCTTCAATCACGGCCATATCAATGCATGGATTTTTCTAA AAAAAAATTATATAGATTTTTAAGGGTCTAGATACGTTTCTGGTAATAAT TTTTAAGGCCTTAATAGCGGTCTTAAAATAGTATTTTCCTAAAAAACGAT TTTTTTGACTAACAAACGACTTTTTCCTATAGAACCAAAAATAAATACCG TAAATTTTAAGAATTTTTCTCGCTGCATGTTGTTTTTGACCACTTTTTTA AAAGAAAATTATAAGGTAAAGGAAGAAAAAAAGAAGAGAAAATAAAACGA AAGGTTTTTGACAATAATCTAAAAGATGAGCGAACGACAGTTGAACATGA ATATAACGTTAAATAATTGAAATTAATTCATATTTTGATATATTAAAGCA TAAACAATTAGTTACAAAAAAACTTGAGTTCTCTAGCTTACGTACAAGTT AAGAAACTGCCCCTTGAACGTGATTGGTGAATTTCTATAMCGCTTMCCCA GCAGTTAGGCGYCGCCRGGMCCMCCGCCTACACCGTCAGCAAGTCTGACA CTTTGGAGAGGAAGAAGGTATCTGCCAAAAAGGCGAAACTAGATAACTTA AAGAAATGAGTCCAGGTCAATTCCCTCCATTCCAAGAGGGTCCATGCAAG AGATCTCGGGGTTTCACACCATACTTTCTAGAGAGCTATCAAGAAATAGG TGGAAAGAAAACATATTTCCTCAGTTGCAAGACTCTTTTGAATGATTTTT TTATGAGTCTTTTGAGTTCTTTTTTTTTCTTTTCTTTTTTCATTATTGGC CCCTCTACAGGCCTAATGCCCCCCCCCCCCTCGACTACAACTTTTAGAAG CATGTCATGGAAAAGACCTGCAGTGKCCGTCACCCAAACACCAAGGCCTT AAATCCACTGTCACTCAGTTTGTGTTGACGAGAAACACATCAACATGCTA TCAACTTATTCCAAAACACTGATATCTCCAAAACAATTTTTAATCAAATT ATTATAAAAGAGTTCAGAACTTATAACCTTATAGAATTATCTATTTATCA GAAATTGCATTTGCAATATTTTTTTTTAGCCCACTAAATTTGATTTAGAT CAGGCTTTCAAAAAAAATGAGCGCAAATTTCTGGAAGAAATGACGTATTC TTGGATATAAACAATTATGCAAAAGACTGGTATATTTTTTGTAAGCTATC AAAATATTTTGTATTTGTTCATGGGATTTACTTTGATTCATTTTATTTTT TTCAGGAGGTTGTTTTTTTCTAAATGTATATGAAGTGGAAACTCTTTCTC ATACCTAAAGAATAGTTTTGAGGAGAAACTTCCCCAGGATGTAAGATTCT TGAATATTGGAATTGAGCATTTTCATGTATTGTCATTAATCGGAAAGTAA TTTCAGAATCTTTGAAATTAATCAGATTAAAAACTTTGAGGTTGACGTTA CTTCATAATGAATTTTTCCTAGAAACCCTTTCCGTATTGGTAAAAAACTA GGAGAACTAATTTTCACAGGGTCTTATTGAAGCCAAATTTGTACCACTGG TACTAGGTCATATATAGGATACGGTGGKAGTCATTTGGTGCCATGTCCGG ACTGTAGGGTGGATGCTTAACAACTTCCCATCCGAGCCCCCGGAACGTCA TCAAAGAGGTGTGCGGCCTGGCATTGTCTTGATGATGTCTTTTTGTCTCC GATTTATCAAAATACGAAATTACTTTTTTCCAATCCTAATATAGTAAAAA CTAAGCATTAAAGGTGCAGATTGTGATAGACAGTCTGGTTTCAGTCATTT TATTAGTTCGTCCTTTTGACATCCAAATACAAAGTAATAGTTCACTTTTT CCATAATATTAGGCCCTCAAAATGACTGACATCAACAAGGCTGACGTCAC ATAAAAGTGTTTTTTAGATATGGGGTAATTCTCAAAAACTAAAACACGAC CAAACTCCACAATCTTAGCTCTAATCCAAAACGATTAAATATTTGTACAA ACTTAATCAAGTATCATTTTAATTAGACTTGCTTTCACCTATCAGCTATA AAAATTATATAAATACTGTATTAGTTAACTAAATCAATTTAATGCTTCAT TAGTTATCATAAATTAAACTACTGTACAATTTATGTTAAAATGAAATCTC CAATACTTGAAAAGAAAGTCAATATATATTTTCTTTCTGTCCACTTTTTG ATTAATTATAGTTGAATTGATGAACGATATACATATTATGTGTACTCTTA ATTGAACGTTTACTGAACAATAACCAATGTGCATTTATGTTAAGACACAT ATTATCACCTCTAGTCTATCTCTTTTTAATTCATCTGAAGCAAAAAAAAA AATATAGGGCCCGACATCTTTAGTAGCGGACCTGGATCCATAAACTACCC CACCCCTTCCCTCTTTTATCTACACCAACTGGTGCCTAAAACCCCTTTTC CTGATCTATAAGGAGATCTTAGGTATTTAGAACTGTTGTAGTTATGGAAG ATTATTTATCTTAAGGATGAAATCGTTGTATAACTACCTGTTTACAAATA GGTTTCACTCATGGATTTGGCAACAATAGTGCTACACTTTGTTCAAATTG ATTAGAAAGTTATTTTTATATTCACTTAACCTCTCATAAAGAAAAATAAC TCTTATTCCTTCAAATAAAAATTTGTACAGAGTGACAATAATTCATTTTA ACTTTCTTCAAGTACGTAACTATATAAAATAAAGAAGTTCCTTATTAATA ATAATGAATAACAAAATAAGTTACTAAATGACGGATGCCATGTCTTGGGT TGTATTATTCCACCTGATTTACATATTTGTACAAGTTCAGGACACAAGTA AAAAGTAATAGCCATGAGCTTTTCTTTTATCATTATTGCTCAGGTGTACA AACTCAAATTAGAATTTGGCTTTCTCTTGTTGTCGCTATTGCCGTTGTAA TAAAGTTCCTTCATTTTTGGATATCATTTATTATCGATTATTTATTATTA TATGAAGTTTACAATATGAAATAATTAAATTCGTGATTTTTCCATAAAAT AAATATTTAGCAGGAATTCCCTGATGGTGTAAATCCTTTAGAAAATAGGA 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GCAGTATGGTGAAGCTCAGCACTTTGTAGTAGACCTCCTGCCCGATTTTC TCCCAAGCCTTAAAAAAGAAGGGAGGTAACTTCTTTCAGTCGGACGCCAC GAACCCCAGGACCATTGTGTTGGCCGGATGTTTTGTACAGAACACCCCGT TTACCTCCTCCGGTGATCCCCCAAGTCAGCGGTCGTTCCGACGGTTGTAG TCCTGGTCCACGGTGAACATCTTCTCGTAAGAGAAATGTTTACTGTGGAT CCATTTGCACGAACTTTCTTTCACCTTTGCAGTCTCCTTTCCTTCAGAGT GTCCGTCAATAGGTGGTGTGGGATCTTTGTATAAGAGGACAACCCCAAGT CCTCTTTCACAGCCCTCCTGATTGTCTCCTAGTCTACGTCAAACTCCTTA AGAGGCGACTCATGGATTTTGTGGCGTCCTCCTTGATCTTCTTCTACAGG TGCCCCAGAAAATCAGAATCTCTTTTCAAGTTGTGTCCCCCACTTCCTTC TATCCTTGAGAGGTTTTTTCCATCCTTTTTCATATTGGCCACCTTGAAAA TGAGGCTCCTTGAGCACTTCACAATGTTCATAATCTCTGCCACCTCAATT TTGGCTTCCTGGAGAAATGTTTGTTATTATTTACTTATGCAAAAAGGACA GGAGATTTGGAATATGCAGTAATAAATCACAAAACCTCTCTATTTTAATT ACATAATTAGCATTTATTAACAGTCCACGTTTTGCTTCCGAACCCTGTAT ATTAAACTGTTTGAAAATGCGGTAGCTGATATATTGACCACGGAACTTTA TGGCCATTTTAGTAGTAGAAGTACTTGTTTATTTACATTTTTTATAAATT AACGATTATCCAACTTGTGTTAAAGTTGTATCTTTATTTTGAATTATAAT AATCGGTCAATAAATAAAGGAAATAAGAGTGAAATGTCGTTTTCATATCT 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