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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s1209 | supercontig | LSalAtl2s1209:12272..20953 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000001267 >EMLSAP00000001267 ID=EMLSAP00000001267|Name=EMLSAP00000001267|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=413bp
YISWVRGECQIEXQPCDFPFTYEGKKFSYCTEHNATEGKFVCVSSHGEDR
WSWGICNEGCLDEEDGSPLDFGGETMGQAVDCKNEPLSCVFPFIYNGVEH
NECTEEDADFFWCATHVDEHGILIDNMWGKCDVASCTEDPNAKVLIDVNE
IIVDLTFHQDDSESQLNIYGTISGLEPGLHGLAIHAENSDNCSNVGPHFN
PLETTHGSHSSEDRHAGDLGNVEVDENGLGEINITLPMETTLFGPDSVLG
KALVIYSEEDTFETEELLLTPLACGVIYEEDEWPLILILIIALSVAIVLL
LILITILICCCMRRKKPKKKKALDKIPEDEILPLHNGNGSYNKKTPLYDE
LSIPFIDATPAPTPKLGRSIDRLSSFFTRNPSYQLQRILHLKYQLMTHHG
REVEDSAGNKGII back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1209:12272..20953+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000001267-697114 ID=EMLSAT00000001267-697114|Name=EMLSAT00000001267|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=8682bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1209:12272..20953+ (Lepeophtheirus salmonis)
TACATATCATGGGTCAGAGGAGAATGTCAAATTGAARCCCAGCCGTGTGA
CTTCCCTTTCACATATGAAGGCAAAAAATTCAGCTACTGTACAGAGCACA
ACGCCACAGAAGGGAAATTTGTTTGCGTGTCTAGTCATGGTGAAGATCGA
TGGAGTTGGGGTATCTGTAATGAGGGTTGTTTGGATGAGGAGGATGGTGA
GAATTTGAGGATTTGACCTTTTTTATACTACTTTCCATATAATAATTTAT
ATTTATCTCTGTAGGATCTCCCTTAGATTTTGGAGGGGAAACAATGGGCC
AGGCCGTAGATTGTAAAAATGAACCTTTATCATGTGTCTTTCCTTTTATT
TATAATGGAGTTGAACATAACGAGTGTACTGAGGAAGATGCGGACTTTTT
TTGGTGTGCCACTCATGTGGATGAACATGGTATCCTCATTGATAATATGT
GGGGAAAATGTGATGTTGCATCCTGTACTGAGGATCCCAGTACGGAATCA
CCAGAGGGCGTTGATCCAGAAACAGAGGAGGAAGGCCCTAAAAGTAAGAT
TATTTAAATAAAATATATATGTGGTCTACAAGTTTAGAGTAGATTTGTGA
TTTTGATAATGCAATAATTAATTATTATTTGGATAGTCAATATTATTAAT
GGCGTCATATTAGTTTTCTGTGGGACATATTAAATGTTAAAATTATGCCC
ACAGTTATATTAATCCTAATTAAATAACTAAGTAATTTTGATATATCCAA
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AGATACAACTTGTACAAATTAAATCTTCTACACTACATATATAGATATTA
GTTTTGGGGTTCGCTCTAGAAACAAATTTGCCAGTATTTTATTTTTTTAA
AGAAAGTAGAAAGATTTGTCCTTTTTTATTTAATAAAAAACATAATTCTG
CGGTTTGATACTGTGATCTGGACTGAAATATCGATCCAGACTGTCCTTAT
AAAATTCGGAACGTGTCTCAAAACTAATAAATATGTATATTCACAGCTAT
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CTGGGTTTTTAAACTTGTCAAGGTGATTACAATCGCTACCTAATCCCTTC
TTACTACACTTTCAAGCTTGTGATAAGTTCTCAATTAGGGGAGCTAAAAA
TACATACTTACTGAGTTATTATGTCATTGTTACGAATCTCAGTGTCCAAC
TTCAATTATTTCAAAACAATGATGTAATATTTTTGTACATTTCCTGTTCG
TGACTCATTTTCAGATCAAATTGCAACAAATTGCAACTTTGCATTATTTT
TACTTCAAGAATACAAAATGTTCAACAATTTCAAATCACACAACAACAAC
AAATACTGAATGCTGGGGTTGAATGGGTCCTTACTATGGGAATTAAAATC
GATTTATATTACAGTACAGTACCTCAGTTTGTCAATTGAATTAGTTATGT
AAAACTTAAAACTATCTTTCATGCACGAATGTAGTTTTCCATTATTCTAA
ATTTTGGACTAATTGAAGTATTTATTATTATAAAGATTGATTCATTATGA
CGTCATTGAAACTGGGTCTCTATTATGTTTTTTAGTAGAATTATAAATAG
GTGCTATTCATAGTGATTAGTGTTGGATCGGTCTCAGCTGAAATGACGTA
CTTAGTAACTACGCCATTTCAGTTCTATAAGTTTCATTATGACCTGTTTC
AAAGAGACAAGATACCTGGAGTTTAAAATAGAAGGTGTGTGGCTAAAACT
TATTAATTACGTTCTAGCTATAACTAATTATTTGTTTCGTTTTTATATCC
TTCAATCCTAGGTTGGAGTGAAGAAAATAAAAGAGATAGAGTAAGACTGA
GGATCGTTGACATGGCAGTATCTCGCTAACACAAAAATATACAGCGTATT
TTTGTTGTAAGCTGTCGAGGTGTCGTGTTTTTGTTTTTGTTTATGTTTTT
TTTTTTCAAATCGGTGTTCTGAATGTTGATGGATTTAATTAATTATAATT
AGCTTCTTGTAAGCTTGAATAATTTCCAACAATTAATTATTGAACAATAT
TTCATAGGGAAGAATTGGCTAAATAACAACCAATTTTAAGACTTCTGGGG
TTCGTTTTGGATGAAAGGCTGCGTGTTGTAATAAAGGTTACGACGTGTTG
CATGTTAAAAAAGACTGAAAGGGAGGAGACAGATTAGGAAATCAGTCCTA
TGTTAAACTAATGGTGAGTTATCCATAATCACTCCTATCAACCTGACAAA
ACTGTGATTACGGAATTTTTTATCTTCAGTGTTAAAAGGAAATGTTTTCC
AATCTGGAAAATTAAGGAGTGCCTTTTTGGTTTTATAGGCACTATAAGCG
CTTTTATCATTTACTGAAACATCTTCAATGGATATTATATTCGTACATAT
GAATATTCAAGGATTAAAACTTGTTTCATTAGAATTCGGCTTGAAATAAG
TTGCATTATGATGTATATAAGTCATTTAGTAAAAGTGCATTTGTCAGCTT
TTTGCAAATAAAATAATGAAAAATTATAATTGAAATCTGAAAAAAAGAAC
TTCAGATTGACATTCACTTTGTTTTTAACATCTATATATTATATGTACAA
TATATATACTGTTAGTTTTTAATGAAAGTGCATGATGGTCACTAGTGTTG
TATCAATCCTAGGACTGCCTTCCTATTCAGTCATTTTTTCCCCTTCCCCT
TTCAGTCTTTTGTATATTCGGTCCGGTCTTTTTTACCATTTCACTCCTAG
CTAGGATCGAAGAAAAGAATGAATGATAGAATGAACGTATAATACTTAAA
TTAGTAACTACGTCATTTCAACTGTTGCAGTTACCATATAAGACAAATAA
AGACATCAGTCCTAGGACAAGGCGTTACCGATCAAACACCATTGCTCACA
GTTAAATATTAGAGAAGAAAAATTAGAACTGTATATATGGCTCGTCCCAT
CAACACAAAAACAAGTTAGGATGATTTTTCTCGAAAATGACTAACATTTT
TATATAGGCATTGATTTTTTGTAGAGATAAACACGGTATCGCTATTAGAA
AAGGATACACGCCTGGTATCACAAATTACTCATAAAGGTTACAAAAATTA
CCAGTTACTATTGAAGAAAAATAATATGTGACCCGTGAACACAAAACCAA
ACTGGAATTATTTTTATCAAAAATCTGGATTACATTATTTTTACTAAAAG
AATTATTCAGATTAATCCTTTTAAAGACGTCTAAAATTGCACTGGAAGTA
GTAAAAATCAATTGTCACTTTGAAAGAATTAGAAATTGAAAGATGCCATA
AGGGAGCCAATTAATCTCTCATAAATCAAATGAAAGTTTTTAAACTTTAA
TTAAAATTCTTAAAATCTCCACAGATTCCAAAAATTTGAATAATAAGACC
ATAACTGATTGAAATATTGGGATGTATGTATATAGGATGCAAAGAAATAG
ATTAGACTTTTCTGATTGACGAGTGTTTAGATTTTTTTGGTTAACTCGCC
ACATAATATAGATTGTACATATCTGAAAGACATATCAGTGAAAAATTAAA
TATTTACACTATTCACAGCGTTACCCCACTGATACAAAAATATACAGTAT
ATTTTGATGTTAGCTGTCGATGTTTCTGTTTCTTTTCCCTTAATCAGTGC
TCTGAACGTTCATTGGTTGAATTGGAATTAACTCTTATTAGGGTGTGAAT
ACTTATTAAGTGAATAATAATTCCGTAGAATTMGCRCATTWCCAAGTGNN
NNNNNNNNNNNNNATTTTATTCTCGTTGTTGTTGTTTCTTTTTTACTTTC
CTAGTACACAAATCTAGCTTGAGAAATGGTGATGTCATTCATTAGCGTTT
TTGTGATGTACTTGCTTTAATTCTCCTAATTGTAACAGCATCTCTAAGTA
ACGTAGAAGAATATCAAGGTTATTTCTCTTACCTAAGAAGAACGTAATGA
GTATTGTGTCAAATGTATGGAAATATATTTTAACTTTTTCCTTTTAAGCA
GTAGCTGCTTAATATGCATGAATAATTTATATGGAGTACACATGTATGTA
CATATTACCCTCAATAAGTTTACCTACTCAAATGCCTTGCTATAATTTAA
CATTTATATAATATTTTACATATTTTTATTTTTTTGGAATGTCAAATACT
TTAGGGTTAAAGTCCATTCATTGTCGTCCTTAAACATTGACTTACCTTGA
AGAGAACGTAGTTGATGAAATGTATGATTTAGTTTATGGCAAAATATTCT
ATATTTACTGACTTATATAGTTATATTACATATTTTCATTATGTTCTTCT
TTTCTTTTTTGTAGACGCTAAGGTCTTGATCGATGTGAATGAAATTATAG
TGGATTTAACATTTCATCAAGATGATTCCGAATCCCAATTGAATATCTAT
GGTACTATAAGTGGATTAGAGCCAGGACTGCATGGACTTGCTATCCATGC
TGAAAACAGTGATAATTGTAGCAATGTTGGACCGCATTTCAATCCATTGG
AAGTAAGTTATAACAAATCCTTCTGTTCAACAAAAAGGGTTTCTTTATGT
ATCTTTCATTCATTTTAGACTACCCATGGAAGTCACTCCTCAGAGGATCG
GCATGCTGGAGATTTGGGGAACGTTGAAGTAGATGAAAATGGATTGGGAG
AGATAAATATTACATTGCCCATGGAGACGACACTTTTTGGGCCGGATAGT
GTTTTGGGTAAAGCGTTAGTTATCTATTCAGAAGAAGATACTTTTGAAAC
TGAGGAGTTACTACTTACCCCTTTGGCGTGTGGGGTTATTTACGAAGAAG
ACGAATGGCCCTTAATACTCATACTTATTATCGCATTATCCGTAGCCATT
GTTTTATTACTCATTCTTATCACAATTCTCATTTGTTGTTGTATGCGGAG
GTAAGGATCGACATTTGCAATATTCTTGTTCATAATAATGACATCGTATA
TGCTCTTATTTAGGAAAAAGCCCAAGAAGAAGAAGGCACTCGATAAAATC
CCTGAAGACGAAATATTACCCCTTCACAACGGTAACGGATCGTATAATAA
GAAAACGCCATTGTACGATGAACTCTCCATACCTTTTATCGACGCAACTC
CTGCTCCAACTCCAAAACTTGGAAGGAGTATCGATCGTCTATCCTCCTTT
TTTACTCGCAATCCCAGTGTTGGAAGATCGCGTGGATCTTTAGCTAGCAG
TAAGATCTTTTCATAGGCACCTTATTATCAGATCAGGGCTCTAAAATCAG
TCTCACATAATTCCACCCAATGTCACAATCTCACACCACACATGGTATTT
CTCACACATTTATATAATCGATCATGAAACTATAAATGTCTAATTTAGTA
TCACAATATTTCGAACGGGAGTTCCCTAAGCCCATTGTCTTAAAGGGGTC
AAAATATCTCAGAATTCCGTCAATTAATAATTTTAATTATATGTATTATC
CTTTATTTGTCGGAACTTAAGATCTTAAGATTTAAAAACTTGAGATCCCG
GTTGAACACCCAATTAATTTCTAACTTGAGAGCCCTGATATGCTATTTAT
ATTGCATATAGGATTTTTTTTTTTTTTTTTTGCATGTTGAATCATTTCGT
AGGAGCATGTGTAACCTTTTTCAGTTGAATTTGATTTTTACGAATTAAAT
ATTATTAAACTTATTTATTTCAGAATTGATTTTGATTTATATTATACGTC
CTATTCTCTTTTTTTATTTTCAGACGATGAGTTCGATAGTTCAGTTGTTT
ATTAAATGTGTTCATTATTTTCATTATAATGTGGATGTACATTTTGTCTA
TTTAAAAACAAACAAATATCCCGTCCATCACTCTTTAGTTTTTTTTTTCT
CTCTCTCACTCTTGCTGTTAAAACAATTGTTTTAGAAATATGAATATATA
GATCTATTTAATATATATATAATCATTATTTATAAAATTACCCTATCTAT
GAATAAAAAGAATCAAATGTGATTTAGGCACCTTTCATCTTCCAAAATCC
ATACGTAATTATTACTTTTACTCAATATATAACTAATAGCTTGGGAATTG
GCTTTATTTTTCAATTTATATACTGGTGATGGCGCTTTTTCTGAGTTGTT
CTTTAGGCTTTATTTACATATATACGTACATCAAAGTATAGAGGTAAGAA
GCTTCTAATTAAGCTATATGCGTGCATATTTTTTTAAAAGCTTATAATAA
CAAAATGGGGCATGGGCAAGACAAAACTGCAGAAGCGAAACATGGACCAC
GGGACCAATATTTTTCCAATATAGTTGGCTACGCGGTAACTTTTTCCCCG
TTAGGGGCATAGAGTATACTTAATATATTACTCTATAACTAAATTTGCAA
CATTCAGGAATTGAACCCTTTTTGCAACAATTAACAAGTTAATTAATGCA
AAGGGAAGATATATCCGTGGTATCATAAAAAGGACATCTTACAGTGGAAA
AGTACAAAGATGACAAAGAATATCCTCAAACTAATAAGCGCGTATCGCTA
CTTTATTTTATAGCTTTGGAGCGTGCCAAAGTGGCGAAACGTGCCTGTTA
GCTCTAGGAAATTTCCTTGGAATTGTGACAACTTTTCCTCCCGGAAGGTT
TGGCTTTTGAAATACCACAGATGTCGCTACTTAATCATTTTTCCTTGTGA
AGTATACAATTTTTTCTTTCCTATGCAGAATTTATCTTGTTAAATTAAAT
AAAAGAATGAAGTAATGGAGGCTCCGTTGTTCAGTATAAAGTAATATTCA
TGGAACTCAAAAAAGTATTATTATAACCAACATAATTTGGAGGGAAATTG
ATCGAGTGGTCAACGTTAATAGTCTTGGATCAAGCTAACCAAACAGCCGC
AAGATAATGACGCAGAGATCCTGAGTGTAATAAAAAAAAGCTTAACTGTA
CAACGCTCATACCCTATTAAAATTCTTTTCAATAATAACAACTCAGATAT
TTATATTAATACGCTATTAACTAACAACTCATACTAATCCACATATAATG
ATTTAATTACATGTCAGGCTTTTCGCATGCATTCATCATATTCTTTTTGT
CTTCTTCTTATTTGATGTGTTCCTTTGTGCTTTAATTAATCATTCTTATT
TAAGTGTGTACTCATATCCCCTTATTCTTATTTTTGCAGTACCAGCTCCA
ACGTATCCTCCACCTGAAGTACCAGCTAATGACACACCATGGAAGGGAAG
TCGAAGACTCCGCCGGAAATAAAGGAATTATATGAAATATACCTTAACAA
ATAAATATTTAGATGTATTGGACATAGATAATTATGGAACAGAGATTACT
TATAATTAACGCGTATATAAAATAAAAGTTGTAGTTGTGACAGCATTTCG
GTTCCCGTATCCGAACAATTAATACATGAACCCTACTACTACTATTACGT
GCAAGGAAAAAGGATTTGAATCAAAAGAAGACGCAGAGGGATAATCCGTA
CAGACATTCAATTAGTTAGATTGTGCCATAATAACTCCTCTATTATTTTC
CAAAGAAAATGTCTCGTCTTAATTTTGATTGTATTATTCTACTTACATAG
TAGTTTACCACCTCCTTTGTTCTTGGGTTATAATATTATTTATCAGTTCT
CATAATTATTTTTTAAGATGTTCTAAGCTGATACTGCTGCTGATTCCCTC
ACCCTCAAAAATATTGTGTAGATGTAGCTTTTCTATTATTATTTTTTTTG
TTTTTTAGCAAATCCCATAATGTGTATTTTCCTTGTGTCCTAACAAAGAA
ACAAGCGTTTTATGTTATTAATTCATTGAGATATGTCCAGTATTCTCTTA
AAGGGCGGTTATGAGAAACTTTGCATATGCTAATGACACTCTTATTGATT
TTGTAAAGCAGATTAAATACACAAAATCTAGCCCCCTCCTCCCCATTCTC
CTCTGCTTAAATGTACACACTTTAGAAATGAAGAATAGTTTTTCTCATAT
GGTTTTATTCGTTATGATTACCTCTTTAAGTATCCAAGGAGAAAGAGGTT
TAAACCTGTGAATACGATGAGGCCTTAACCACTCTGTAAGCAAAAAACAA
AAAAGTTATCCTAATCATTATTTTTGTATATGTTTTTATGCTAAGCTTGG
ATTATCATGAGGTGGGTAGTTGGTTAAGTGTCTTTGTATGATCATAGCTT
TAATTTGTTGGTTGTTTTTTTTTTTTGTGAGGGRGTTGTAATAGACATAT
TAATTGAGCTTGTTTTACTTACTAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGCTAGGT
ATTCTTTTGCAAAGGAAATACGTATTTTTGTAAATTTCTTACTTGTAATT
GGGGAAGGGATGATTTTTGGTGCTCCTTTGCTCTATTTTATTTTTTGCAG
GAGACCATCATCACCTCATGTGTGTCCTTGCTTATCCAAAATAATACTGC
TACTTGTAACCATCTCTTCTAGTCAAAGAGATTTATGTGTATATTTAAAT
AAAACAAAATATCTATATCTAATGTAATGATAAACCCTCAATTAGATATG
TTAATCTAATTTAGATGATAATATGTCAAAAATATTTTTGGATTATATTG
TGTTATTTCTTTTATTTTTCACGTCGTTATTG back to top
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