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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s1223 | supercontig | LSalAtl2s1223:150550..162084 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000001320 >EMLSAP00000001320 ID=EMLSAP00000001320|Name=EMLSAP00000001320|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=77bp
MLITLLLCVIILYRKKSKKLDHSYSYTQIRDNRRGTTESQEEEYEKVEFL
GLEDEDPDQENPHSDSESDHRDSNLQC back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1223:150550..162084+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000001320-697167 ID=EMLSAT00000001320-697167|Name=EMLSAT00000001320|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=11535bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1223:150550..162084+ (Lepeophtheirus salmonis)
TTCAGGTGCAATAGCCATTGGTAGCCTCATGCTCATCACATTACTATTAT
GCGTCATCATTCTATATCGAAAAAAGAGTAAGAAACTGGATCACTCCTAT
TCCTATACTCAAATGTAAGTATTCTTATAAAATACAAAACGTTTTGTATA
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CTCAGCGGCAATGATGGCTTCCAGGCGGKTGCAGTGGAAGGCCTGGKACC
CACTGCGGATGTAGTCCTTTGTTATCGCATTTCAGTGCTGACTGAAAATG
GCTTTGAGGGCCTTGGTGTTTGGACCATCGACATGCACCTAAAAGGTGTA
GTCGAGGGGATTAGTATCAGGCCAAAAGTGTTCAAAAAGAGTTCAGAAAA
ACTCGGAAGAATCTTTCAAAAGAGTCTTGCAACGAAGGAGATAGATTTCT
TTCATTGCTGGTGTGAAAAGTGGTTTCTCCACACTCACAAGGTTCTTAAC
ATCAAATTTTTTTGATAGCTTTATGAACAGACCGGTGTGAAACCCCCAAG
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GTTTACTTCTGCGTGTCTCGTTTGGCCTATTTGATAGACCCCTTCTTTCT
TTCCAACATTTCGGACTTGCTGRCGGAGACTGAATGGTCCTGGAGACGCT
CAATTGCTTGGAGTGTGCGAATAGAAATTACGTAAGCCAGAGAGCTCAGG
TTTATTCTGTTTTCTAACTAATTGTTTAAGCTTTAATATATCTGTATACG
AACTAATTTTAATCTCCCACCCTTAAATAATTATTGAATTAGTAAGTGTT
CAGATATCAATGGACTACCCCGTACCTAGTTTGTATTGGGACTGTTAAAA
CTTCCAGCACGACTTGTCTGCAGATGCAGGGCGCTAGAATCGAGGCCAAA
CTCTATATTATTTAAACAATAATTATGGCATGTATTGTGTCAGTTCTTAT
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AGAAATAAGCTATCATGGCCATGAAAAGAATGAAGCTTTTAGACGTCGTA
ACGAGATTTGACGGTTCAGGTGGCATAACGGCCTGTAGTGATCAGGTGGA
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GAGGAAGACGTTGTCGATGAGTCTGTTTACCTCTTATGAACCCCTCAAGG
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TGTATATATAGAAATTGTATTGCTGTGCTTTTGAAAGGTGAGTCTCAGTA
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GTATTTTTATATTAGCGAGCAACGCCATCTGTAAAGAAAGGGTCTGGGTA
AAGAAAAAACTAATTATAGAAATTAAAAAAGGAAAAATGATTGTTACACG
TGCTTTTTCTTCTTTTTTGTTAATTATTTAATAAGTCATGGGCGTGCTAA
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CCACCCCCAATAAATTAATAGGCAACTGATATTAACAAGGGTATTAATTC
AGTAATACCATATGTCTTTCTCCCGTTTTCTTCCCTCACTTTATTACATA
TCCTATCTATAGTTATGGGAAAGTTATTGATTGCACTAAGACAGCAATCC
ACTTGAGCTGTTTTAACAATTGTAGCTCTTTGCCTTTTTTCATCTTTATA
CATGAGAAACCCAATTTATTCTCAAGCACACAATCTCACACTTCCAGATA
ATAAATTATTAAGACTTTATCTAGATAAAGGTTTGAATAGTCTGGACTGA
TCTAATCGAACCTGTATGTACATACTAGACCGTGACTCTTTATATCAAAT
CCCTATTGAATTTGAATCAATTTATTTATAATTGCAGCTCATATGACCAG
CTAAAATCTATACCAGATACTCTCATTTCCTGATCTCAAGAATCTAATTA
TAAAAATTTAATCTAAATAACATATTATAAAAAGTGAGTCACGTATTTTG
CCATAAGAATTTTGTATATAATGTTTTGACTGCCGTCACAGATAGCAACT
TAAGCCGAAATTACGTCATCTTGGGAGCCTATAATTAAAATATTTAATTA
AATATTAACTCTTTAAGAATTCGGCAATACACCGAACATACAAATTTTAC
GTAAAAAATAATAGGGGTCTACGAAATCCTCATTGTTACTTATCATTTTT
CATAGGCGCAATCCCACGTAGTTACACAATACTTAGATGTTCTCCCTTCA
AAATTATTAATAACAACTTAATGTTTTTATAAATATGATATGATGAGGCA
AGGAGTCCTTTTGTCTCAAGCACACTAACTGCCTGACCCTTATACTACAT
GAAACCCGCATGCAAGATTTTATTAATATGACTAAATTCGATATGAGACC
AAAAATATATATACTACATATATATCAGGGAGCACTATATACACGCTCAA
TGCTATATACAAAACGCATGCAAATTTCATAAATATTTATATAAAAATGT
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ATTAATTATAACATTATTTTTAATGTCAGCGACATTTTGTCTTCGCAATA
CATGACAGTACACGTCCTTATCTTCATTTTATCTCGCAATCACCTTTCTT
TCGATTAAAAAAAAACAGAAAATAAGACTCAAACTTAATAGAGAATGAAC
AAAATAAAAATACACATTTTTCCCGCAAGGTGGTGCGTCAGTCTGTAGCT
TATTGTTTAAAAAATGACACATGCTCGGAATTATTATTTTGACAGCGTCC
TCTATGTGAGACACAATTGTTTGTTATTTTTATTAAATAATATTGTCATT
AAGAGAGTTGTATTATTTTGCCACAAGACGAAGCCACTCTCTGTCGTTTT
GTTTACAAACGAAGATACGTAAACAACGCTCATGTCCTGTTGGTAGGGAT
TGGATGTATAGTGTATAAGTTTGTGTTAACGTCATCCTTTCTCTTTCTAT
CTTGCAATTGGACACAATGACAGCGGATAGTTGATATTCAATCATTGCAA
CCTTTTAATAATAAGAAATTCGAGAGGGGGTAGGTGGGGGATTAGAATTT
GATACGTGGACTAAGGGATCTCCTCCAGTCTCATCTCTCAGTCCAAGGAT
GAACTCATAGTCTTTTTCCTCCCTTCCGAATGCTCCATAGAAGACCAGGT
TACAACCATTCTCACATTATGAGACCTTCCATTTACTTTGATGATTCCCC
AATGAGCAAACTGTTTGAAAAAGTTGTGATCCTTCTTCACTTACTCCAAT
AATATATTATATCCATTCCAAAGCTATTTCCTAGCTATTAAAAGTTTGGG
ATAATTGAATATAATGTGTTCGAATGAGTCCATTCTTCCTCTCAAATATT
GAATTGATATTCACGCTATAAACTTAAAAACAAAGCTAATTCAAATTTAA
CCAATCAACGTTGGGAACAATGATAAGGAGAAAAGAAAGGGAATATTAAC
AGCTGATCCCAAATTCATATCCATGAGAAAAAAAGGGTTTCTTTTTATTA
TTAGAAAACTTTGTTATTTATCAATATCTCAAGATGGCCGACAGTAACGA
CAAGGCTGACGTCACATGAAAACGTTCTATAATTTATAAATGGTCACATA
CCTAGTATTTCATTGTTTGTTTATTTCATTTTTTTGCTATTAATTAATTA
TAATTCGTCTTTCTTTTTCTTCTTTAAATATTTGGCATACCTGCTTCACT
AAAGAAAAATTACATTCATTTATATGTTCAAGCAATGATTGGCAATGCTT
GTACGATAATAATAAAAAACTCTGAATCATTTATTATAAATGTTTATGTT
GATAAATTTGGATGTATCCCAAAGATTTTCCTTCTATATATATAGCTAAA
AAACCATTTAAATATAGCTATTTAAATATATATTTTCCTTATAAGTATAT
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CATTCTCGTGGTCAAATCTGGTTTTGGAGGATTTTTGATTTAAATTTATG
GAATGATTATATTAATAAAAAAACCATTTGACTAACAGAGGCTTAATATA
AAGGACTATTAGTTACATATTCGTAATTAAGTACTATTACATATAGATAT
GTGCCCAAAAAATATCTTAACTTTGACTAATTTCATATGATTTTTAAAAG
ATTAGAATTGATATTGATCAAAATAATTGAAATGTAATTTATTTGTTGAT
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TCAAATTTTGTGGATCAAAAAACAAAAATCTTTAGCTATTTACATGAAAG
TTAAATTTTTTGGAAAAAAAATTTACAAATTTCCATTTTTTGGTATTTTT
TCTTTTTTTTGTTGAAAGATTTATTTAAATTTCATCTATTAAATTTTTTG
AAAAAAAATTAACTATATAATTTTTTAGTAAAAAACAAAAAATCCTTAAC
TGGCGGAGAGCTKCAGCCCCTTCAGCCCACCCCCTGCGGACTCCCGTGTA
GATTAGCATCAAAGTTATTTAAGTTTATTTCCGACCACCCTCTATAATAC
TTTATTCATAGAGTACGATGACAATTAATTTAACTCACCTTTGACGGCTA
TTTTTATCATTTGTCACATATGGAACGTAAAATAATAATTGCTCATTTGA
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AAGAGTAAGAGGCCTTATTGGAATATTAGGCTTATAACGTCTCTCTCATC
TTTTGACTTTTAACACTTTATATACATATTATGTAGTATGACTTTAATAA
TAATTAATGGAGCCAACACTAAACCAAGTAACTTTAACGGAGTGGTTTCT
TGTTTTTATTTACTGATATACCTAGATATAATACGGTATGTGGTGAGTTA
ACAAAAAAAAACAATCTTGAACAAATATCAATAAAATAAGAAATTCTATG
TAGTGGGTTGATCTTATCTAGAGATATTACTTTCAATCAGGCCGGATTGA
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CAGAGCAAGCTGAGACACTTAGAAAGATCAAAGAAGATTCTATACTTTCT
CAAGCCCAACCAAAATTCAGGGAAATTTTTTGTTCTTTCCTGATTAGAAA
TTATTCCCCGTTGATGCAACTATGAATCAACAAAACATTTAGACAATATA
TCTCAGCTTCAGAACAAAAAATCCAGCAAGAACTATGGGCTTTGGCGTTG
TGGAGTCTGCCATTCCATTTTGTGGGCAGGAAGCAGCCGTCCTATGGAAT
GCTTACATCGAACTTCTGGATAAGAAAATGCGACCTTTGCCCAAAGAAAA
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GAGTTCTTAGGACTCGAGGATGAGGATCCAGATCAGGAAAATCCTCATTC
AGACTCTGAAAGCGACCATAGGGACTCCAATTTACAGTGCTGACTATATA
GCCAAGACTCAGAATATTTCAATTTTGAGCCTGAGATATGATCAAAAATA
GTATTGATTTAATTATACAATAGAATGGGTACATCTATTTAATTAATTAA
TTTGCATTTTATAATTATTAACTATATATATTGGGACTTGAATTCTTTCT
GAGGACCAAAAAGTGTACTTTTACTTTATATGTGCTTTCGGAGTGAGTTT
CCACYTTCAATGGAGAGGGCARATTTAAGGACTATGCATATTATAATATA
GTCTTCATACNTCAACCATTTTCTTATTCAAAATGAAGACGTTTTGCGAT
TTTAAACGATTCTTGTTTAATTGTAGGATTAATTTGGGAAAAACCCCATT
TTTTCGTGATATTTTCCCTTCTGCAAACAAGAAACATTTTAAAACACAGA
ATCTCTTCATTTTGAAAAGGAAAACTTTTGATGTTTGAAGATTATCAGGG
GCGTCTGTAGAATTATATATATACATTTATTTTTTTTTTTATTTTTAAAA
AATATTTTAAAGAAATTTAAAGATCCATAGTTATTCCCAAAAAATTTTGA
AATCCATAGTTATTCTCAAAAAGTTTCAAAAATCC back to top
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