EMLSAT00000001332, EMLSAT00000001332-697179 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000001332
Unique NameEMLSAT00000001332-697179
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s1223supercontigLSalAtl2s1223:245709..264160 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000001332 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000001332EMLSAG00000001332-684098Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000005812EMLSAE00000005812-714740Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005813EMLSAE00000005813-714741Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005814EMLSAE00000005814-714742Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005815EMLSAE00000005815-714743Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005816EMLSAE00000005816-714744Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto775209auto775209Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000001332EMLSAP00000001332Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000001332

>EMLSAP00000001332 ID=EMLSAP00000001332|Name=EMLSAP00000001332|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=873bp
MQTLKKALTAISLMTRILIEFNIPFNFLKTFFFFNYISFIQLTSKAITKS
SNMSMPAKVDYPPSPPPPKTPSFQKEDEEENPVGDPVPPTPTKTEIHEIQ
TSDVILATAGYDDTIKLWEAHTGKLLRTLNHPCNYVTALEISPDGGLLVA
GGHQCIKIYHTNNTNDVLLEYPKLKKNVMDVGFHEEGKWMYIAGEDGTIQ
IWDIRALDNVRYPLLHTIKAPATTVQLHPNQQELIIGDALGNVHIWNLRA
DKSETFTPATESVINDISVNPSGTHLAFVNNTGNCFVIPLKEAPKESKNP
IRTGICDDEKTEIQAHKKYALRCKFSPDGKILATTXADQTSKLWNTDDYS
LKKNCYQRDDAMISDNSPLFAQSEDVIDDGISPENDXSEPPSYDSLNPLG
SRSGFEPELDSDSVGGGSGVGGERDGSFDSVLDSDFCYGLVNRRPHGNEQ
LASSRNESGTGIIYTTFLIVNAGLGAALLNFPKSFDEAGGLGIAIFVQAF
LLIFILIALLVLAFSADHCGAKTLQDAMYGSAGKFGKYLSSVXVAIYTFG
TTITFLIIIGDQIDRVFESWVGPGWSEIWYYNRTFTITMSSVLFILPMCF
SKKIDFLSIPSTLGVIAILYIVCLVIYEYYFGDYKHGKIKTHPDSWMDVF
LVVPVICFGYQCHVSVIPIYSCMKQRNIKNFTISSFSAIAICCFCYTGAA
GWGYYTFGSLVQPDILLMYDASDPKILMANIAMALKTITTYPILLFCGRE
AIISVIFHSGGGTRLVSSIISLIWFVLSLLSALLIPDIDLVIKALGSLAS
IFIFVFPGICLFKYTLRVDPSFVRKKTIAILLISIIFQVIGFFIFGVVLT
QAVRNIKLTGLTGGQYIEGREYL
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mRNA from alignment at LSalAtl2s1223:245709..264160+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000001332-697179 ID=EMLSAT00000001332-697179|Name=EMLSAT00000001332|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=18452bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1223:245709..264160+ (Lepeophtheirus salmonis)
TTCTTTATTTGCATGTCCAGTCGTCTCAACAACAGCCTCCCAATAATATA TCCGGAAGATCCTCCATCCTCCTTTCTGAGTTAACAGCCAGCGATCGGAT CGTGCATGCAGACTTTAAAAAAAGCTTTAACGGCGATTTCTTTGATGACA AGGATCTTAATTGAATTTAATATCCCCTTTAATTTTTTAAAGACTTTTTT TTTTTTTAATTATATTTCCTTTATCCAATTAACTTCGAAAGCAATAACTA AATCAAGCAATATGTCAATGCCCGCCAAGGTAGACTATCCACCATCCCCT CCCCCTCCAAAAACTCCTTCTTTTCAAAAGGAAGACGAGGAAGAGAATCC TGTAGGAGACCCTGTTCCTCCAACTCCAACCAAAACAGAAATCCACGAAA TTCAGACCAGTGATGTAATACTTGCCACGGCAGGATATGACGATACAATC AAACTTTGGGAAGCACATACGGGAAAACTTCTTAGGACTTTAAATCATCC ATGCAACTACGTCACAGCTCTAGAGATTTCCCCCGATGGAGGCCTCCTTG TTGCGGGGGGTCATCAATGTATTAAGATATATCACACTAACAATACAAAT GACGTGCTACTCGAATATCCCAAGCTTAAAAAAAATGTCATGGATGTGGG ATTCCATGAGGAAGGTAAATGGATGTATATTGCTGGTGAGGATGGAACCA TTCAGATATGGGATATAAGAGCCCTAGATAATGTTCGATATCCTTTACTT CACACGATCAAAGCCCCTGCTACAACAGTACAACTGCATCCAAATCAACA AGAACTCATCATTGGTGACGCCCTTGGTAATGTTCATATCTGGAATCTTA GAGCTGACAAATCTGAGACATTCACTCCAGCAACTGAGTCTGTTATTAAT GACATTTCTGTTAATCCAAGTGGAACACATTTGGCCTTTGTGAACAATAC TGGTAACTGTTTCGTCATACCTCTCAAGGAGGCTCCCAAAGAGTCTAAGA ACCCTATAAGAACGGGGATATGTGACGACGAAAAAACTGAAATTCAGGCT CATAAGAAATATGCGCTGAGATGTAAATTTAGTCCTGATGGGAAAATCCT AGCTACTACTRCTGCCGATCAAACCTCTAAACTTTGGAATACTGATGATT ATAGTCTCAAAAAGGTAAGACACTTTCTTTAGACTAATAATTTATTTACT AAAATAAAATTTGATAGGAACTGAAAGTGGATAATCAGAGATGGGTTTGG GACCTGGCCTTTTCATTAGATTCCCAGTATTTGTTCACCGCTTCATCAGA TAATTTAGCAAGATTGTGGTCCTTGGAAAAGGGTAAAGTTGTTCGAGAGT ACACTGGTCATCAAAATGCTCTCKCCTGTTTAGCCTTTSGAGACGTTAAA GCGGAATCATAATCAGAGTGGCAGTGYCACTATACGATTAGGAGNATATT ATAATTTGATTTATATATTATATAATTAACAATAAGATGAATAAATTAAA ACATTTTTAACAAACTGATTGAATTCCTCCCATGATGTTCACCTTTCGAT TTTTATATCTCTTGGAAATGTCACTCGTGATATTGTTCTGTAGGATTTTT GTTTGTTCTGCAATGATATCTATATTCTTTTTAGCCTCACGACTCTCTTC AAGAGTATCCTCACGCTGAGAGACTGCAAGTTTAGCTTTACTTACCATTT TCTCCGATAAACTGATTTTGGATCGTAGATTATCCACAATGCGATCCACA TATTTAGGCGAGCTTCGTATGGACTGAAGGTGATGCATTTTACCGTTTGT CAGATTGCTAATCAGTGATCTTACATGAGTAATGGATTTCTCAATGGAAC TTGGATCCTCTGAGGTATCGCTTCCCACATCAAGAGATAGACCCATAGTG CCACGGCAGTTCTTCAAATCTATAAGTCGTTGCTGAAGGAAACACTCTAA TTCGGAAAGCTCATCTAGTAAAAGGATTCTTGTACGACGATTATCTAGAA GACTCAATGCCTCCTCATTCCGTGCGATTCCCCCATCAATTCCTCCTTCT TCCACAACAATATTATCCGCTGTGATTACATCATCCCAGTTAATTTCCTG GGAGGATTCACCCAATTCTTCTTCACTGTCAAAGTTTCCCCAGTCGATTT TTCCATTTTCACCCTCACCTAAGTCTATTTCTCCATATTCACCAAAGTCA ATTTCATTATCACCATCCTCTTCGTAATCAATGGATGAATTATCTTCCTT CTCATCTTTTTCCATTCCAAAATCCATGGTTGGATCCTCAACAGAGATGG GAGGCTCTCCATGAACCCACTGATAAGTCGTTACATTCCCGTACTCAATA AGATACTGAAGCAAGGAGCAAGGAACAACTTTATCATCAATTGTTTTATG AACAAATTTTTCATAATAATCACAAGCACTGCGCAGGGAAGATGAGGATT TAGCCAACTCATTGTAAGTAGCAGGAAGATCCTCCAATAATTTAATAATG GCTCTTTTAATTGAGGATTTCTTGCAATCACCTTCCTCTAGAATGAGTCC AAGACTCTTTGTGGACTTGACAAATTCATTGATGAGCTCATTGCTACGCT TGAGGGAGTCAGCCTCACTTTTCTCCAACTCCTGGGATTGAGCTAAACAT TTATTTAGTCGTTTTTTTAGAGCGGGTATGTCATAGACAAGGGTTTGAAT TAGAAATTGACTCGCCTCAGCTAAATAAACGTTTTCTTTTGTGTAAACAC TAGAAATGTCCTTCCAATCCTTCATACGCTTAGAGCCATACATCCCAAGG AAATTCTTACTGTCCTTCTCAGTCTCTGAAATGATATTAATTATCAGTTA AAATATTAGGGTACTTCAAAACCACAAACACCTTTTAATATATCAATGAT TTCAAGGACAATAAAGTAATTAATCCTTGCTCCAGAGAGAAGGTTCTTGA CAGTGGGATGTTCTGGCATATCCAAAATTGCAGAGCTTATTTTTCCTCGA ATCTAATGTATGATTATCAAATTTTGTATGCATAATTATAATAATATTAA TGAACTGAGTATACCTCTAATACGTCATCATGCCAACTTTTGGAACAAAT CCGTCGACTAATTAGCCAATCAAGCAGTTTTTTTATTTGAATATCAATCG GTAAATCCTCCTCGTTCATAGTGACCATATTCTTAAATGCAATTTATGAT TATTCCAATGATTAAGTGGGGTATCTTATTTAGGGTTGGAGTTTTAAATT TATTATTGTGAAACTGATTATTTTTATGTTATTATTTGTACTTTCAATCT AAAGAGACACGTCTACAACACAAAGTATTAGAGCAGCGACATCTTTGAAA ATCAAATTGAACTAAACAGCATTATTATTAATGTGATACCACGGAATGGC AAGTTAATTAATAGAAGATTAAATCAATATTATGCTAAAAATTCATTAAT CATTTAATCTAAATTAGAGGTTCTCAACCTTTTGGGGATAAATTATATAG TTGTGACGTCATTTTTTAGGGGGTTGACAGAATGTTTATCTTCTGTGTAT GTATAAAATACATTTTGCGTGTGTGTCTTTTATGGGTGCCCACACCGTTG GAACTAGTAGGATGCTGAAACTTTTCATGGGTGCCTCTTTTGAACCTGGT CAGGCTAAGACGGGGTGTCAATTTTTGGGGGACATATAATAAGGCCTTAT TCTATACCTAAAACAGAAAAATTATTTCTTACAACTGTATGAATAACTCC GTTTTCGGTGAAAATTACAATTACAATGTTTATTTGGAGGTTCCAAAAAA ATGAACTTACAATGGAATATGGGATTAGTAAATCGAATAAAGTTTGTAGA AATTTGTCTGGAGATTTGTTTGCATACAAACTTGACACATAAAAATTGGT TTTAACTTAAATATCTGTCATTTTCTGAATAATTTTTTTCTCATTTTTTT ATCAAATGTCAATTTTCAATCTTTAAGAAGAAATGTCATAAAACGATGCA TTTTGTATATAAAATTGTAGACTCTAACATTCACACAATATTTTATTTTC AATTTCTGGAACATTTTAATACATAATTTTTGCAATATTTGCAAAATGAA GGAGTTATCGAGGGTTATTTTTTTTATACAACGTTATTCATCATAACNAA ATGTCAATTTTCAATCTTTAAGAAGAAATGTCATAAAACGATGCATTTTG TATATAAAATTGTAGACTCTAACATTCACACAATATTTTATTTTCAATTT CTGGAACATTTTAATACATAATTTTTGCAATATTTGCAAAATGAAGGAGT TATCGAGGGTTATYTTTTTATACAACGTTATTCATCATAACTTTTTTTTT GCAAACAGAAGATTGGTAGGTTTGTGCTTCTTTTACAATTCCAATAAATG CTTTGAGCTATATTTTTGCAAAATTAGAATTACCATGATCTTTTTCGACA ACAACGAAATATTCATATTATAATTATTAGTATTATGTAGTATATAGAAG TATTTTCTGAATATTTTTTTAATTTTCTTAATTAATTTGACCATTTTCAA TGTGATTCCCCTCTCCCTCCTTAGCCAGAGMAACGCCAAGTAATCCTTGG GTATTTTTTTATAAGAGACAAAAACTTTATTGATTTTTTGAATAATTTTT TTTTTATAAGGAATACAATTTGACTCATTGGAATTTGGGTCTTGAACCCC TGGACTAAGCGAAATAATGTACATATAGGCTAAAGAATCTATATTATTCA 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TTTATACTACCAATTACAAATTAACGGGTCAGCTAAAAAACACACTGGAT TTACATAGTTAACTNAAAGAAAAATCCTTCTTTATACTACCAATTACAAA TTAACGGGTCAGCTAAAAACACACTGGATTTACATAGTTAACTATTGATA TTTCTCATCCGTGATCATTCATCACTATGTAATATGAATAAGTATTAACT ATTAAGGATCTAAAGAAGAGTGTCGTTTCTCATCATTTTTTAACCTAAAA ATGGAAATATATGGAGTTGAGAACAAGATAGATAATCCACAAATAAAATT TATAATCATTAAAAAAAAAACAATTACATAAGTTTTATTAATCTTACTTT TAATTTGGGGAATGTTTTAAGTTTAAAAAATAAATCTCTGCGATAATAGT CCCAAATTACTATAATATTTCAGAATTCAGACGACTGAAATAAAAAATGA GATCAGTTTTTAATTCTGCACTCAAATATAAATTCGATTATTGGCTTCAA TTAATTTGACGCGAATTTACTTCTATCCCTGTGTTATTATTCATTTCCAT CAACAAATTATTCTGATTGATCCTTTGATCCTTTAAAGGAGCCGAAAATT GCACTTAATGTTGAAAAAAAAAAACCATTCTCATATTGAAATGATTATAA AACATTATGATTATTAAACCTTACCACATATTTTGTTAACAATATTTTTT GCCTATTATTGAAAATATTAGGTTATGGATGTATTTCTAAATCCATCCCT CGAGTCCACGTTTTGCTGTCCTACCCTGTACATATATAGTGATGAGAAAG TCGGAATAAACTATAAATAAAAAAAAGATTTATTTTTATTTACTTCATAT ATGTGTTAACGAATGCTATGAATCAATTCATGCATTCATTGAATAAAAAC TGTTAAAAAGATATTGTATAACGCTTGATTAATATTTTATTCAGAGTCCT TACGTCATGAAATTTATATAATTAAAAATAGGAGTATTTATGCTTTGAAC TAGCAATTATATGGGATTTTCAGAAAGCAGTCTGTTCTTTTTATAATAAA GAGATTCTTCTAAGTTTGTTCATTTATTTAAAAAAAAAATCCGTAAATAA ATACAAAAAATTCTATTTAACAATGTAAATTACCATTTCTTTGCTAACGA ATGATTAAATTCCCAAATTATAATGAGAGATGTATAAAGTCTGTTTATAA AGGACTTGGAAATTGAATGGAAAAGGAGTATTTTAAAGGGCCGAGCGGGA AAAAATTGAACGACAAACGAAAAAAAAAAATTCAACGCCATTCCTTTCAA TTTTTATTATTTTTAGGCTTTTTAAAGAACATTAGGTCGATTTTTGGTAG AGCAATGGAGGCATAGTTCTATTTTCCCTGTTGCTCCCCCAAAAATGGAC CTATTATCTTTTTGAAGTGATTTTTTTTAGAATAAATGTATGGAGGCACA AATCCCTACCGCAAAAGTTAGATAGTTATATCGTTCAGTGGTTTTCAAAA CTGTGGTAAACATATCGATCATACATCATAAACTCATGATTAGTGATGGA TAAAATATATCCTCCTGCCGATATGTAAAAATAAAAGAGATGGAAAATGA ACATGGTACTCCTGAATAATCTATGGAAGGAGAACAGCTTGGCTGTCATT ACGTTTTATTACATCAGCTGCAAGCAGCCGTAAGATGAAGCAAATTGCAT CAAATAATGCAACTGAGCAAAAAAAAAAAATTCTAAATCTGCAGACAACC TTGATAGTGTTCCTTGATTTATATCCAATACCAATACACTATAAATGAAT AAGGTCATTCCAAGCCAAATCAATCACTCAAAAACAGGACCATCTATATT TTTTTTTTATTCAAATTTGACACATATTTTAATATTAGTTAAAAACTTAT GAATCCAAAATTTTATCGTTTTTCATCCTCCCGTTCAGGATTGAGAGGCT TRTAAAGTTTCGCCCTCAATTCCACCTACCCTATTTTGAATGTTTTTAAA GATATCGATCAACTTTAAAACCCATTTAATTGTTTGAGTCTTTTGTTGTA TTTTATTGGCAAGGCAAAAAAATGAGTTTTTACCCATAAAGTCACGAGAT CTATATTTTGACCTTTAAAAAAAATAAAAAATAAAACATGTCCATTTTCA ATTTCACTCAAATTTTTAAACGTTTTTAATTTGTAGTATATCATAAACAT ATACAATAAGTTTTTAGAGATGCATTCGATTCCATATACAACGGGTGAAA ATATGTACGTAGGTAGAGCAAATTTCTGAATATTTACATATACTAAATAT TATACTCTAGTTTTTGAAGTATATATGCATGGTTTTTAGATTGTAGTAAC TAGGTAGAATCGAATGGATTTCTAAAAACTTAATGTTTATGTTTTACAAA TTAACATTTAAAAATTTGAGTGAAATTGAAAATGGAGTTGTTATTTTTTT ACAGTCCATTAGTCTATGTCAATTTAACTATTGTGCAATATTGTACAATG TAAATGACATTATGTCATTCGGCATAATATGTAATCGCTTTCGAGTTATG GAACAGTATTACAAGACCCTAATGACAGCTATTCCATGGTGTTTTGAATA TAATTATATAATTACAATTATAATAATTAAAATCGTTAATTATTTAAAAA AAAATATTAAATATGTACTTTGACTCCTTCAACAGAGCGTTTTCACGTGA CCCAAGTACGTCATTTTGGGACCTTAACAACAAAGTGTTATAATAATGAA GAGCCTTTCTTTATCTGTATATATAAAATTGAGTTTTGTGTTTGTCTGTC TATTTGTCCTTTATACGTCACAACACCGTTGGACCGAGGAGGCTGAAATT 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