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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s1226 | supercontig | LSalAtl2s1226:24200..67450 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000001342 >EMLSAP00000001342 ID=EMLSAP00000001342|Name=EMLSAP00000001342|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=676bp
MNGPVNPICEDDDSSFKNMENEPRIVVALRDACKYYGKNAMENRVLNNLN LTITEGSIYGLLGASGCGKTTVLSCIVGRKKLNKGQVTVFGGSPGDKGIG IPGNRIGYMPQEIALYKEFTVRETLKYFGRLYEMETDQIDQRIDFILKFL QITRDRDMVGKLSGGQKRRVSFAAALLHDPELYILDEPTVGVDPRLRKSI WNHLTDLALNRKKTILITTHYIEEARQATSIGLMRNGKLLAESSPEKLLQ IYGEPSLEDVFLTLCVSQDELNSIESFNYSTSFSNSLKKVVEGIFGIFRK KPPESIMISSTKISNANEDGHTSKGVYPVSYNKSSESIDSYSSTKPTNID PKLLSNFSKNKFGNHRILSPKKLKALIMKNFIQMWRNIPNLLFIFLLPAI EVLLFCIAIGNDPTNLNFGIVNNEFPYASNASNYSCSTLQGCEFENLSCR FLSNLTNRKDLNFKYFEDEQLAKTEVLNGEIWGYMTISSNFSEAFLDRLW NTLNVDSESLLQSSLRVYLDMTNQQVSFSIKRIIFDSYKDFIGGLMTDCE LPSELAXSPVRYEDPIYGVENPSFTSFMAPGIIVIIIYFLAMALTGDAFL LERRDGLLDRSWVAGVSALEYILAVILTQFIVMIIQTIITLIFILIVFQI TCNGPLLWLIVLTLLQGTAGMTFGKL back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1226:24200..67450+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000001342-697189 ID=EMLSAT00000001342-697189|Name=EMLSAT00000001342|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=43251bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1226:24200..67450+ (Lepeophtheirus salmonis) CAAAAATGGAAGGATCTTGAATATAATAAGTAGGAAAGAAAAAGAATATA
ATTTGATATAATCGTCTTACTGCTCCCTTCAGTTATTGTAATATGTTCTT
CAGTCACATATGCATCTAATTTGTAGTGATCCAATTTTAGTTGATGTAGT
TATCTTTTTTCATCATTTGCACTTCATCATAGGACATAAAATAATACTAT
GAACGGGTAAGAATGTGATTTACTTATTTTTATTTGATTTAAATGATCAA
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GCAATCATATGAGCAGCAGCTACTTGATATTGACTTAATCAAGGCCCATT
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TGATCAAACCAATTTCTCATTGTTTAATAAAAGATTTGAGTGGGCTTTGG
AGATATGTGAGGTTTAATTTGTTCATATTTATATGATTATAAAATAAATT
TCACATATAACGGGTTTAGAGGGGTAATGCTTATCAAGCTATACATTGGT
TGTGAAATCGGATGTCGTGTCCAATTTGTAATTTTATACAAAATATTTAA
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TTCAAATGAACAAGATACTGTTGTACTTTTAATAAATAGTATAATGTCCT
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TTTTTTGAAATTAAAAATTGATTTAAGTATTCCGTGGCACATTTATATAG
TTCAAATGTCCTTAGTGATATTACTCTTAAATATCTAATAGCTGCGTCCT
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TAATTTAGTTGACAATAATATACTGAATATAAGCATTTTATTAGGATAAC
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TTTCGCTTTTTACTATTTTTTTTTGTGTTTTTTTGTGATTATGCAATAAA
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ATAGTTTTTTCTAATCTATTATCATAATATAAGAAACCGCATTATGATGG
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AATCCTTTGTGTTTAAAACCGCGTTATGAGGAACCTCCTGTATTATATTT
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ATATTGTTTTTCACTATTCCTTTGAATTTGTAATTCGATCTATATACTTA
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ATTTTAAGTATATTAAGTATTAAATTTATAACCTTAAAGATGTCTCAAAG
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TTAACCAATTATAGTGTCTTATTTACGTAGATAGCTAAAACTTTGGCACG
CATTTGCAGTTGCTTTTTTTTTTACAAATATTTGACAATATTAACTGAAC
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AAATTGATAATTGACAAAAAATCTTTACTTATGAAAAATTTGACAGCGAG
ATTTTAGTAAGATAAAATGGGTGCAGAATCCCCCCCCCCCTAAAAAAAAA
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TTCGCATAAAGAAGTTAATTTTTTATTGAGGAATTCCAATTTTGAACGAA
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GCCTTTTTATGGCTTKTAATAATTAGTTGTCTACTTAATCATTTCATGAC
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CCCTCTGCCTTCTTACTAGATTAACTGGCTCCTAAGAGATTATGGATAGT
TGAAATTATTTTGTGTTGAACAAGTGAGTGTAGCTGATTTATCTTATCTC
ATATAATGTACCTATATTTTTCCACAGAGTTCAGATTGAGATAAAATTAT
TATTTTTGTATTATTCCCACTAATTTCGAATTAATATCTTCTCATTGCCC
CCCGTTTCGTTATTCAAACGCCTCCTTTATGTACAGAGCTGGCACCAAGT
CTGTACAATATAAAAATTATTAAAATATTGAGCCAGATATACTTTCAAAT
ATCTCAAATAAAGTCATGAATACATTTGTGTAATGATATCTTAGCAACTT
ATTTTAGTATTCATTAGTCTTTCATAATATATCGAAGTACTTCATGGAAA
AATTAATAATAAAAATTGGATTATAGAAGATATTGAAAAAAAATTGAATT
TGATATAATTTATTCTAAATAAATGATGAACGATTTAAAAGTGTATTTCT
TATCGTTCATCGTGTTTCTCAAACTATGGACCCCGGAGTATAGGCAAGTT
TTAGAAAACTATCAATAAAGTCCGGGGGTTTCTATCAGTTTGTTTATAGA
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AATATCCAACAAAACAAAAGATATGAATTAACAAATTGTCAAATACATTA
TTATTGAATAATACTTAATCAATTATTTTTATTTCTTATTGCCAAATTTG
ACATTTRAATAAATRAAGCCGATAAGTAACAATATTATTACTTATTAAAC
AACATAATTGTTCTATGCATGGAAGTTAGGCTTCCTATTTGATGTCATGA
AATAAAGTAATGGTTTAAAAACTAAAATATGCTTTGTTAAGTGGCCATGG
GTAAGAAGGGATTTAAACATATGCTCCGACTTGAGAGACCTCAATCTGTT
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TAAATTAATAATAAAATATCTTTTGAACGTGTTGATCATAAGTATTAAAA
ACGAAACTGTTTTTTTAAAAAATTCCTTTGTTTAATTTTGAACAAAAGTA
TGAAAATGGTCAACTATTGCTATTTTAGTAAAAATAGTCAGGAATTCTAT
GTGCACAAAACTTTATATTGCCTTGAACATTTCATGTAAATAGGCAGTAC
TTATTAATTTATGTAATGTTAAAAATTCAATGAATTGAAATATTAATTAT
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TTTAAGTTTTATTCATTTTGTTTATACTACATAAGGAATATATCCCGTGT
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AATAACTTTTTATTCTTTGTTCAATGATTATAACTAATTAAACATACGTT
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CTCACTCCGTCATAGCAAGGACAAATAGGCTAGAACGACTTCAATGTCGA
CCCTCAATTATAATCCAACTCCAACAAAGACTTATTATAATAAACCCCTT
ATTGTTATTCTCCACTAGTTATTACTTAATGCTTACATGTACTTAAATGT
CACCAAATAAAAAATATTAAGGGTTAGAAATAACGAAACAATACACGTTC
ACACCTAAACAGCTTGGGATGTTATATTGACAGCACATATGTTATTGACT
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TAATCAATACTCCTTGCAAAATTTAATCTCGCTAGAAAAGGGGTCACCAA
TCCTATTCCCGTGAGTACCTGGTCCCTGTTGGCTTCAATTGAGTCGCCCG
CTGGACTTGTTCTAAAAAGTATTGTATGCTTTTGATTTCTTTATTATTTT
ATTCATATTTTTTGAGCTGTTATATCTCTAGCCTTTAGGGAATCTTGAAG
AATCCCTCAGTTTTACAAAAGTTGGTAACTCGTGATCTAGAAGCTGTCAG
TTTGGAGTCATGCATCAATGTGTAATGAACCATCTAACATTTTGTTTTAC
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TAGTAGAATGGCTCATTGCCGTTTTTAAATTAGTGTATTTCTCTAACTTT
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ATAATTAGCTCAATGCATTTTTCCATTGTTTTATGCATACTGTTGTTAAT
AATCATCGTTACGCAACTTTTATAAATCGTAATTTGTCACAAATTAATTT
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ATTTCCATACGTCTTCACATATCTAAATGTGACAAAAATGTTTTTTTAAG
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ATGCAATGCATGGCATGGATAATTTACCTCAAGGGCCTCCATAATAGTCC
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ATTCACACCTATATTTAATTTATTCAACCATAATATCTATTTCGAAGAAA
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AAGAATATATTCCTTTGAAGACACGATATAATGTTCCTTCTTTTTGTTCA
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AATATACTTAATTAATGAAAAAATTATTTTCTGGAAAAGAATATTAATTA
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TTTGGTATTATAAATGTTGTGTACAAGTTGTAACATTTCATTTTAATTTG
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TGAAAACAGTATTAACATATCCACAATCTATTGGTATGACTATAATTGCA
TTATATTGATTAAATTACTTATCATTTTCTTCATTTAAAATAGTTTATCT
AATTTTTTTATTACATGTTGTACTATAAGCCCGTTTTTTTTTCAACTTTT
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TGCCGTAGGTATTCTTATGCAAGGCACCCAAACTGAAAATTCCAGTTGAG
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TGTTGCTGCGGAAGTTTTGATATTTCTTGGCTGTAAGGTGCTGTAATTGA
TTTATTGATATTATGGACAGTCCAAATTGAGATGGCAACGACCTCTGTAG
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TTTTTTTGTTGTAGCTCGGACCTTATAGACATGGGATAAAAACAAAAAAA
ATTATTTTTGTTTCATCCTTCGTTTGATTACGTAATGGAACCTCATAATT
TAAAAAGACAGGGAAATAATTGTAATAAGCTACTGTAAGTTTTTGGTACG
CAATCAGTAGTGCGGAAAAGTTATAACGTGGCAAAAAAATAACTTATGCA
ATATTTCATTGTTCTACGAGATATAATAGCCTATGGATGAACAAATATTT
TAATCTTTCCTTCCTGAATATACTTGTATGTACCAATATTAAAAAATAGG
CTCGCTATAAGCGGATGATCAAAATTTCCTTAAGTTTTTCTTTTCTTTTT
AGTCATTAGGATTGGGTTTAAGGGAAACATCTATTAAATTTCTTATATTA
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TAAAACAAAATGGCTTTGTTATTGGTGGTGGTGGGGGGGGGGGGGAGCTC
TGATATACCTATGGATTACTCACCATTAATAGACCAATAAATAAACCTAT
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TCGAATAAAGAAAAAACACTTCTTGTTTACCTTGAAGGCAAACATTCCAG
ACAGTCTAGTCTAGAATTACATATACCAGTTTACATTAGATAATTTAATG
ATAATATATAACTGTATAAATAACGATTATGTCTACAATAAAGTAAGAAT
TAAACTAACTAACATCCTCTTCACAACTATTGTATCCGTATCCAACAACT
GATGGCAGCAGGGYGATCTTACAATAGCCTCTGTAGTCTACAGGGGATAT
CTCAAAATCTCTTATACTTAATGATTACAGCTATAAAAACAGAATACCAC
CTGCTAATGAAGAAATCATTAGAACATGTATAGTAGTCGAAGAATTTGCA
GTTTTGCAAAAATATGGGTATGTCACATCAGGGGCATCTGCACTGGGTGG
GTGAAGGGGATGTAGCCCCATTTTGAGAAAAAAAATAAAGGAATTTTTGC
TTATTACTTGAAATTTTTCGCAAAAATTTAATATTTTGTCAATATCTGAT
TTTTTTTTCCAAAAAAAATGTAATATTTGATACTTAATTTTCGATTTTTT
TTATGAATAGCTGTGGACTTTTTAAATTTGTTTCAAAAATTTTAATATTT
GAAATTTTTCCACTAAATTGAATTTCTCAAAAAAAAATTCTGAAATATAT
GATTTTTCATTTTTTTCCCAAAAAATTTAATTTTTTTTATGAAAAGCTAT
GGATTTTTGTATTTTTTCTCACAAATTTTTAATTTTTGGAATTTTTTTAC
AAAAAATTCCAAAAATCAAGCTCCCTCCCCCCTAAATATAAACTGGGAAC
GTCCCTGCACATAGATGGAAACTACAGTTGGTCTATCGATGAAATAAACT
GCATCACACTCCAGGATTTTTAAAAAACAATAATGAGAATACTTTTAAAC
CGGTCAAACGGCCGTATAAGGATGGATAATATATTAGTTACATTAGTTTG
AAACGCATTTACTATATAAAATTTAATGAATGAACATAATAACAATGTCA
ATTATATTTGCCAAATATTTTAAATTTCGTAATATCCGTATTTTTCACCT
TTTTTAAATCAATGTTTGTAATTATGGTTCTAACATCAGATATCTAGAAG
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ATCAAGTTTCTTATAAAGTCGTTATATTTTATCTCCGCATACATAAATAT
AGCATTGTACTTCTTCTTTGCTTAAAATACTTAGGAAAACGGAAGTTAAA
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GACAAGTATTTATTAAATTCAAAATCGTCTATGATAGATGTCTAGTGGAT
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ATGTATATTGGCATTTTTAGAAATTCTACCAATATAACCTTACTTATTTA
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TTTATATAACTGGACAAAACAGAATGATTGATTAAATAACACTAATAAAG
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ATATTGTGTTGTTAATATAATTCCGCTTCTAAATTGTCCGCAGGATTATT
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TTTTTTTTTTTTTGAAAAATAATTCATTTTTTTCGGAAAAAATTTCAAAT
ATGATTTTTTTGAGAAAAAAAACTGAAAATCCACAGCTGTTAAAAAAAAA
AATCTTTGAAAATGTTTTCAAAAATCCATAGTAATTCATAGAAAACAAAA
TTTTTTGGAAAAAAATTTTAAATACCAAATTTTCCAAAATTCTTGGAAAA
TAAATTTGAAAAAATAAATTTAATTTTCTTGGAAAAAGCTAAAATTCCTT
AATTTGTTGGGGGGGGGGGGGGCTATAGACCCYCCAGCTCSCCCCAAGCA
AATCATTGGTGKGGATTWTTAGTCAGTCAATAAAAAGTTAAGCAGTTTCC
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AAGCATTTCAACTCAGGAAATTGATTGTTACCGTGAAATAAGCAAAAATG
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AATTGTATAATTTGTACTGTATACTCGTTTTAAGAAATAATAAAAATGAT
TTGTTAAAATTGGTTTGCTTAATTAACTATTTATTTTTCTTTAAACACAA
TTAATATTATATATTCTTATAAAAGGTGTACGACCGCTTCCTCTTTTTAC
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AGTGTTTCATTTATTCTGCTTGCCGTTTTTCTGAATAACATAGCGGATAC
GCCTACTCACTAACTTGCAGCGTGTACACACAAAATCTTCCGGAGTATTT
TTGCCTACTCGGCCTCAGTGAGTAGCATCAAAGAGTCTTTGCTGACACTG
ACAACTGCATTGGCTTCCGTCTCGTCTATAACCTAAATTGTAAAGTTCGA
TATTCCATAATAATTCTATAGTTGTGAAGAATTGGTTTTTTTCTATTGAT
TTTTTTTTGTAAAGTTCAAAACAATGAACAACTTTTGTCTCCATTAGTCA
TTTATCTGTACTATTAATTTTTAAGTTATCTGTTTTGTGTCCCAACTTGC
CTGGCGTTGAAGTAAGTTGAGACAGGAGGGATTATAGATAAATAATAGTG
TTTATCGGTTCAATTGAAACCTAGTTTAATTTTAATGAAATTGTATTTGA
TTCGTTATCATTTAATGAATTCAACCATTGCAACAAGTAATCTTCAGGCG
CTGTTCTCCACTCACAAGAAATTAAAAAAGAAATATTTATTTATATATAT
ATGCCCCAAGTAGTTACATTTATAGTATCACTCAAAAAAATTTCCGAAAA
GAAACAGACATCATGTGATCCTTAGCAAAACAAGTAAATTATACCAATTA
CTATTTGTCTCATTAAGTACTTCCAGACTATTATTGTCATATTATTTCAC
TACAATTTTTCAAATGAATTTCAAGATTTTAAAGCTCTACTTAGTATTTT
ATTAGGTACTGTATTATAGTACTGCTTTGTATTATTTCATTAAAAGCTTT
TGGAGCGGGACTCCTTGAAACTTACAAAAAAATTGAGCCTACTTAGCTCT
GCAATAACTAGCCCTATTTTTGTACATATTCATAAAACGATGGGTAATCA
TTTTATTATTTGTTAAATTGATTTATTATTATTCCGTAATACTAATAAAT
TGTACGATATTTTATTTCAGACTCTCATAAAATATTTCACAATGCCATGT
ATATTTGTACGTATCTCATTGGCCCTTAAGTTGCCATACTTTAATTTTAC
TGGTGTAATGTCTATACAATGGAATATTCTATCCGATGTATAGTTGACGG
TGAAACATTACTCGCTTTTTGGAATAAGCAAAAATACTTTATGTATTTTC
TCTTCCGCTTTTTTCGTCAATTGACTCTGCGTATTTATGAAATCGAAAGA
GTATTATAATTCAGAGATAAAAGAAAAACATTGATCAGATTCTCTCAAAT
TTATACCGACATAGGCCGAGCTCCCCACTAGTCGTTATTCATTATGTTTA
GTGATGTGTGTTACTGGCTTGAAAATTGGTCATAATACAGCTGTTAAAAG
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AATCCTGACATTTCTATAAGAAAATGTGTAGTTTAGTTTTTATCTAATTG
TAAATATAATCGTTTTAGTTCATATTTTGCCATAATAATAGTGCAGCTGT
TTTTTCTCACTTATTTCGTGCCTGAGTTTCGTCTTTTTATATTGTGTTGC
CTCGTGTGCTATTACATCTTTGCTTCCCAAAGTTAACTTAGTATAGTAAA
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GAAAGTCGAGGTATTGACTTTCGAGTGGACTAAAAAGGTTGACGTGAATC
TTAAATCCGAAGTATTGAAGATATATTATGTACATTTATACATCTCTATT
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TACTGATAGTTTTTCAAATTACATGTAACGGTCCGTTATTATGGTTAATT
GTTCTTACTCTGTTGCAAGGAACGGCTGGGATGACATTTGGTAAGCTTTG
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