EMLSAT00000001361, EMLSAT00000001361-697208 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000001361
Unique NameEMLSAT00000001361-697208
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s122supercontigLSalAtl2s122:886985..895877 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000001361 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000001361EMLSAG00000001361-684127Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000005921EMLSAE00000005921-714849Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005922EMLSAE00000005922-714850Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005923EMLSAE00000005923-714851Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005924EMLSAE00000005924-714852Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto780005auto780005Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000001361EMLSAP00000001361Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000001361

>EMLSAP00000001361 ID=EMLSAP00000001361|Name=EMLSAP00000001361|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=284bp
MVFDRKHYDTLCVSPKASLEEIKKSYRKLALRYHPDKNPNSEDKFKEINH
AYEVLSDSKKRRTYDQYGERGYQESSGARFESPMDLFDIIFGSRGSWKKE
ISFVKYVGTKQCNVIHVKDLVWKLQLQILDLDLFISHNISVENVEGVEKL
LILDTSVKKCNGKQTVKEEKVLEIEVEKGTNSSQQYLFQGEGDHLPSFEP
SDIIIRLEALEHAYFKRIGNDLSLKLEISLTESLCGFKRSIQTLDHRNIL
LQNDPGEIVKPNEIKSQSLKMELTSRIMLRKCFH
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mRNA from alignment at LSalAtl2s122:886985..895877-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000001361-697208 ID=EMLSAT00000001361-697208|Name=EMLSAT00000001361|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=8893bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s122:886985..895877- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGTTTTTGATAGAAAACATTATGATACTCTCTGCGTAAGTCCTAAAGC TTCTTTAGAAGAGATTAAAAAGTCTTATCGTAAGTTAGCCTTAAGATATC ATCCTGACAAGAATCCTAATTCAGAAGATAAGTTTAAGGAGATTAATCAT GCTTACGAAGTCTTGTCAGACTCTAAAAAGAGAAGGACTTATGATCAATA TGGTGAAAGAGGCTACCAAGAAAGTAGTGGAGCAAGATTTGAATCCCCGA TGGATTTATTTGACATAATATTTGGAAGCAGAGGATCGTGGAAAAAAGGT GATGTGTTTACTCGTCGTAAAGGTAAAACTGCAAAATATTATATCAAAGT CACATTGGAGGATCTTTTCAACGGAGTAACAAAAGAATTTACTATTAGCA GAAATATCATTTGTGAAATATGTGATGGCATAGGTGGGCACAAAGCAGTG CAATGTGATACATGTAAAGGACTTGGTATGGAAATTGCAACTTCAAATAT TGGACTTGGATTTGTTCATCAGTCACAATATCAGTGTCGAAAATGTAGAG GGAGTGGAGAAATTATTGATTCTGGACACAAGTGTAAAAAAATGTAACGG AAAACAAACGGTGAAGGAGGAAAAAGTATTGGAGATTGAAGTTGAAAAAG GAACCAATTCAAGTCAGCAGTACCTTTTTCAAGGAGAAGGTGATCATTTA CCATCTTTTGAGCCATCTGATATCATTATACGGCTCGAAGCATTAGAACA TGCTTATTTTAAGCGCATCGGAAATGATTTATCCCTCAAACTGGAAATTA GTCTCACGGAGTCACTATGCGGTTTTAAGAGATCAATTCAGACGCTAGAT CATAGGAACATTTTATTACAGAACGATCCTGGTGAAATTGTGAAGCCAAA TGAAATCAAAGTTGTCCAAAATGAGGGTTTTCCGATCGCTTCTAATCTTT GCAANNNNNNNNNNNNNNNNGAGGGGTACACTCTTTATTTTATTCAATAT AATCTATCCAGATAGATTGTCAAGTGAGGCTGTACAATTTATTTCAGCTG GTTTACCAATAGTTCCCTTGAAAGCAGTACCACACGACGCTGTAAGAGTA GCTTGGACGCTATTTTGAAGGKCAATCCAGATATGATAAGAATAAMTTTC ATAGAAGAACACAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTCCACAA CAGTAATACTAATTTTATTTTTATTATTCTTAAATCAATTTAGTAATTTA ACAAAATATGCTAAATGTGTTTGATGAACTATAATAAATATCTAAAGTGA TTTTATTTATTTGTTCCACCTAAGAGTTGTTGTTTTTTTTTKTTTTTTTT GGTANNNNGGATGTACAAGGTGCAACCTCTGTTTAACAACCAATACTTCT TTTTTTGAATTTAAATTTTTCCTAAACTAATCATCTGATTTTAATAAAAC TAATGCCAAATGAAAGTTGAATAAAAAGATAGATATTATTATTCAATATA GTCTCCTTTGGCGTCAATAACAGTCTCTAATGACCTCGGAAACTAGATCA GGTCTTGATTACAGTCCCATTTTGCAGATTTCGAAATTCCTCACAGATCA TGGACATCGGCTCGGMTTTTGTGTAGCAGAAGAAWATGCTGGRCAACTGA ACCCCATACAACGGAGTCCATCGAGGGGAGTTCTGTTGAGCTAGTAAGCC AAACACTGGGTCCAACAAAGGCAAAAAAATTCTGACAACCAGGTCAGGGT TCTCTCTGTAATGGGCTCCCAGATGCAACTTTCTCATTTCAGAGCTTAAC TTGATTTTCCGGGACAAGTTTGCAATCTCAATATTGCCTCATCCGGTGTG GATCGCAAAAAGGACACTTTGTCTTTTAAAGATTGTATAAGAAATACTAC TTCCTTAATCGATGCAATCAATTATGGGTGGSGAACAAAAMAACAAACAA CAWCSTATCTGCAATGTGCTCAAAGTTTATTCTTAAACAACGACCACAGG CTGTATGTAATCACTTTAAAATACTTTTTTAAACTAGAAGTATTATCTTA AGAATACGATTATAAAATATATTTAATTGATTAAAAGAGCAATAACAATT CAACTTATATTTTACTTTGTAAGAAAAGTTTCTTAATACTCTTTAGAAGA AGTTTAAGGTGTAATTTATCTAAATATGTGTGTGGAAGATAAAAATATTA CCGAAGAAATGAACGCATTGTTTTTTAATTCATTAAGTAAATATGAATAT TGATAATACATACAATTTATTAATATTATAAGCTGTTTTAAAATCGAAAC AAAAGGAATAATTTTCCACAATTATATTTTATACCTGTCAATTCATAATC TAAAATAGTATTTGGAGAAAATGATATTAAATTTTATTGATGGAATATTT TCTGTAAATTTAAATATATTTATCATCAAACATGACATTTTTAATACAGA ATAAGACATTTCCGACTTTCCCTTCATTTTACTTTGTCATATTTATCCTT AAGGTGAATAAATAATTATAGAAACGTAGCAAAAACAATAATAGAACCTC AATTATTAATTGTGAAGTTTGTTTGATAATGACTAAAAAAATATTATCTT TTAAAAATTAGATACAGGAAGTTTATGATATGTTAAGAATTTACGTAGAA AGTGGAGCAAAAGAACGATACACAAAAATAGAAAATAGTTTATAAATTTG TTTTAATCTTTTATTTCAATTTAATAACAATAACAAATTATTGTCACATC ATTGTAATAACGAAATCATAAACTTAACTTTGTTAAATAAATGATAATTT AGAGTGTATTTGTAAGTGTTCCTATAGAGTCACATAATTAATATGTATAT TAACAGGGACATCCAAAGGGGGGTAGGCTAGAAGAGCTGTAGTCTCCCCT CCCCCCCCCCCCCACCCCATTAAAAAAAWTAAGGAACTTTTGCTTTTTAA ARRAAATTTAATTTTTTTTTCAAAAWTGTACTATTGAAGATTCATTTAAT TTTTCAAGTACTTTTCCAAAAAAAWTGATTKTCAGTAAATAACTTTAAAT TTTTCCCAAAAAATTTAATATTTGAATTTTTTTTTTCAAAAATTTTACAA ATGATTTTTTTTTTWAAWTTTTATTCTAAAAAAATATAATATTTNNNNNN CAACTCTAGATTATTGAATTTTTTTTCCAAAAAAAAATAATTTTTTGAGC ANNNNNNNNNNNNNNTTTTCAAAAAAATTAATTTTTTGTGGAAAGTTATG GACTAATAAAATTTTTTCGAAAAATTTAATATTTCAATTTCTTACGAAAA ATGTCATTTTCCAAAAGTTCTTGAGTTTTTGATAAAAATNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNACCAAGACCCCTCAAAATATAATACTATGGACTTCCTTGKT TKGAATCGTGATATTTTTTTACAAAGTATTATGGGACATCAGGGGCGTCT GCTGGATTACACTTTTTCTCAATAACCTTTGTTTTTAAGAAATCCTTAAT AAAATATTATATTTTTATGGTTTTTTTAATTTCTACGCCCCAGAACATAG TCCAAAAGTATTGTTTTTGATACAAAATCAAAATATACAGATTCAGCAAT ATTGATAAATACATTATTTCATGCTATAAATTTCACAGTTGTATGAAAAA ATAGAACTCTTACTACTTAAAAAAAAGTCTATGTAAGTAAAAATTAAGGA TTTCATAAAATAAAAAAACACATCTATTTTATACTAATAAATAATCTTTA AAAACTACAAACTTAGTTACGTATAAAGTTTGCTTCAAAAATGAGTATTT TGTATAATAAGGACATATAAAGTATTGCCTAAATCTGATGTTTACAAACA GGACAAAATAGAAAGAACTATAGTGATATTTTATTTGCTATTTTTAATAA AAAATAATCATTTTGAGAATATACTAAAAACACATTATACATTGCTCTAT TTTGACTTTTACAAACTCAAGTAAGTATTCTATTTTTTTAGTAAAACAGT CAAACTTTAGAACCTTACAGGCTGTATCCAACTTCTAAACATTCATCAAT AAATCTTTAACTCTAAATTTGAACTTTGTTCCCCAAACATTTAGAGATAA CTACTCTAATTTACTTGATATATTAATGAAAAAAGCTCGATAGGTTGATA CAGGGTTGTTCAGATAAATTCATACTACCACTAACTGCATCAATAAGGGA AGCAAGAAGAGGTTTAAAATTGTATTAACATTTCTAATAATACAAAAAAG ATACATGCTATGTCTCTGGCAGGTTCGCCAATCATTTACTTGATACGAGG CCTAAAGATTTGCAGGCCTTGACCACTTCCACAGTACTTGATGATGGAGT CCTTCAAAAAGTCAATCCTGTTGCGTGAATTAGCAGAGACCTTCCTCTTT AACTCCCCCAAAAGAAGTAATCCATGGGATTCATATGGGTGGTGTTAGTG GGCCTGGTCAAAGGATCCCAAAATGCATCTCTTCTTTCAACGAGTTTTAG GTCTTGTGGCCCTTTTGAGAGAGGGGTGCGTCTTTTTGAGACAGAAAATC GACGCCAATGGCATCAGCTTTCATCCAAGCTATCTCTTGGTCAGACAGGA GTTCACAGTACCTGTTGGCAACCACCCTCTTACTTGGTTCAGAAAAGATA GGAGGCACGATAATGCTGTTGCTCCTAATGGCCTCAAGGGGCATAATGCT AGTTGTAAACTTGATTTTAAAGAAGTGGGGATATTAGCTCTCTGTCTCTC AGTGGTCAACCATCTGTCATTTTAGATGTTGGGGGATATGTCAACAGTGA ATTGATTCTCATCCAATTAAAGATGATTTGGTTACCATGGGGCTCCAAAT CGTTCATCAATTTTTTTTTCTGTTGGCAACCTGGGTGGCATTCATTTTGT CTGTAAGGATATGTCTTTTGTAGATGCGGTATTACTTCATCCTCAGGTGC TGTTTAATGCGCTGGAGYCTGTTGCACAGCTTATTTTCTCTTTTTGGTAA GAACATTGATCAAAGCCCACGGAGATCCCTTCAAGACTGTTTCAGCCCTA ACAGAATCTGGGAGTGCGTTTTTGTATTGCTTTGGCGCTTTCTGTTATAT GCACCTCTTGGTACTAGCGGTTGGAGACGTCTTAGGCTGTGCTTTTTGGA TACCCGAGCATCTTCTTGATGTATGCTCGTATGTGTCCTGTGTAAGCCAA TTCAATCATGGTGCTTGTGCAGGTCTCCTTCATCGTAAATACTTGTTTGG AATTAAAAATGGCGCAACTAACTTGGCAGAGGGGAGGAGGGGGTGTAAAG CTATATAGTTTTTCTATCCATACATGCTATAGTATATGAATAAGACACTC TCATTCAACTCGGTTTTATTACCATTTAATAAATAAGCTATTGTTTGTGT AAGCAGATAGAAAATATATTATACACTGATGTGTAATATTGAAGAGTAAA GGTGATAACCATTTAAAATTGAAGGATAACCATATATGTATATTGTATAA TCTATATATATATATAATATTTATTTATTGAATGGATATAAAAAAACGAT TATTAAGAAGCTCTATTAACCAAAATTGAACTTTTCATTCAAGAGTCTTA CGATTGCAATCACTCACTTTCAAAAGCATTCCTACACCGTTACCTCTATT TTGTCTAACTATTTTTAATAAAAAAGACATAAAAAAGTAGCAAATTCAGA AGTTTTTTTAAATCACTGTATTAGAAAATACACAATCTATAAAGTATATA TCTCATGTTTGAAGACGCCACGTTGAGTAGTATTTTTTTGGTAACCATCT TTAGTGAGCATTGTCAGTGCATGATTGAAATGGAAAAAATTCGTCATTGT CAAGTGATAAAATACTTTCTTTTTTTAAAGACATCAGCCCAAAAAATACA AAAGTTGCACCGGATTCTACGTTGGTGAGTTTGTTCCTTCGTTTGCAAAA CTTTCATTTTGGATAGCAGAGTTTAAATGAGGCCGTACGAGCTGAGGTGA TGACTTTAGAACTTGTGAAGAAAATCCACAAAGCAGTGCTGGTGGATCGT CTACACAAAGTGCAGGAGTTAGTCGACATTGTAGGCAATCTAAAAAGTGC AGTAGATCTCATACGATCTAAAATTTGGACATCAGAAAGCTTTATGCGAG ATGGGTGCCGTGTTTGTCCACACTTGATCAAAACAGGTGTCGTAAAGAAG GTTTAATGGAATATTTTTCAAGTTTCACAGTATTTTTTTACGTGAAAGGA GATTATACTGAAAATAAATCTTTTTTGTCCCAATTTTTGATTTGATTTCT TTGTTGGGTCGGTTACTTCTAGGACTTCCCCTGTAGTTAGTCCATTATGG GACAAGTTCTTCCCAACTAAGGAATTCGTATTTAATAATTGTGTATAGCT TAACAAGAGCTAATAATAATTTCATTTACTCAGCGTTTAGAACACTGATA AGAAGAGAACAAAAGTATCGACAGCAAACAAAAAATTAAAAAACAAATCT TCGTGTTAGTGACGTTATGTAGTGTTGTATCACACAAGCTTATAAACGAA CAGAAATAGGCAATCAAATAATATTCGAATTCTTCTCAACTCAATAAATA ATGGTGAAGTGTTTACAGGTAAACAAGTGCTAATTTAATTGAACTAATCA ACGTTCAAAAAACTGATTAGAAGAAAAGTAACAAAAACGTAGAAAGCTGA CAACAAAATTAATTGTATATTTTTCTGTATGTTAAGTAATACTGTGTAAC ATCATATACATATGACTACATAATTAATGCACAAAACATAATCAGAGGTC TTTATGCACAAAAGTTTGCAAAGAAGATAATGTTTTTAATAATGTCATTT TGGAAAGAAAACTAAGAATTCCCAGTATTTAAATTGTAGGTTTTTTACAT CCATGTATTTTTTGTTTATAACTTTGCGTTACCTCTATGCTTTCATTTTA TTGTCATTTATTACGACTTTTTAATGCACTGTACATACTTACGGACTAGG GATTGCATTTCAGACGGGTATCTTAATATCAGGATTTAAGGAAAATTATT ATTATCATAACAAAAGTTTGTTTTTTATAATCAAGTAATTCACGATTTTC ATAGTATGTGACTCAAGGGCCCCAGAATGTGTTACAAGTCAGAAGATCAA ATTAGATAATAGTGACGTCATTAGAGGAGTCCACATGGTCTTTGGGGGAG AATTAAAGGGTTGTATGGTTTTTTTTGAAAATTTTGACATAATTTTTTTC CTAAATGCCAAATTTGAAAACCCTTTTTTTATAAGAGACAAAAAACTTTT TGTGGTTACATTTTTTGGGACGAGAATAAATTTGAACGAATAACTTTTTT ATCAAAAGAATCAATGGTAAATTAAAATGTTTTTTCTGAACATAATTGGT AATAATAGCAAAAAATGTCTAAATAAAATCTACAAAATATTTATAAATAA GGATTACACAGAATCAGGGAACCTCCAAAGTATATTAATTCATCCAGAAA TTTGGCAAAGAATAGTCGTTTATGTTTCTACAAATATTCCAATAACTCCC ATCATCGATTTATGAAATTTTCCTTATCGACCCGTTGTAATGTACATATT TTCAGCAGCAAACGTTTCAGAGATTTTACATATACATATTTTTAGACTAT GAAACAACATTCAAATCTTGAAACGCACGGCAACCCGCATATGTTATTGT TATTTAAATTGTAAAACATGAAAAATAAATTATAATTATTACAGATATAT GTTTGATAAAAACATATTTTAAAAGGAAAAACTTTGTTTGAATACAAAAT ATTTTTTAAGTTGCTTTATATCAGCTAAAATTAAATATATATTACACGTC TTGATTTTAATTAATTTTTTAAAAGTTAATTTTTAATTTATTTATGAGGT TTTTAAAGCAAATCAAGTTTGCTCGAAAAAGTTATTTAATCAAAAATAGA TAAGCCGGTTACGTGACTAAATTTGTAATGAATACTAATCAAATACATTG GATATTTAAATTGGAGCTGGTCTTCTTACCTCTAAGTTATTAATTAAATC TTGTATCAGAAAATTGACAATAAAAATGAAAAAATAATTCAAAATCGTCC TCTGTTCTTTTAAAGTTGTTAGATAAGTTTTATTTTTGATTTTTACCTAA AATCCACAGTAATTAAAGAATTATTACATTTAAATAAGTTTTTGCATTTT ACTCGCTTTTTTTATTATCAAAAACACATTTTTTAGGAATTATTATCAAG ATAACGTAATAACTCATTATTCCTGAAAATGTTGCAATGTTTTATCATTT AGTTCTTTTACGTCGACACATTTCTTTAGATCGTAACTATTATGTATAAA CGTTATAAATTTTTTACAAGGCTTCAAAGGCTAAGCATATGTAGTTAATG CTTCTTATGTTCATTTTTGTTTTTTACTAATTAAAAAAATAATAATAAAT TTGGTTTTTGCTAGTGAAAAAATATTTGCTTACTTACATTAATGTTTAAC TTATTTGCAAAAAATTGTTTATGATTGTTACATCAAATATTTTAATAATA ATTCAACGTACGCCTAGTTTTGAGCATCCAACATACAGCAGTGTAAAAAT ATTTAAAAAATAAAGTACAGATTCATATTTTTTTTAATTGATTTATAATT TTTTTTTAAAAGATCATAGCTTTCTAAACTAACGTAGCAGGATACAGGAA AGCAAAGGGATAATAAAAAAATATTATATATTTGTATTTACTATAGGTTT AGTCTACAGCGAAACATTCCAAAGGAGCAAACAGATTCAAAAACTTCACT TTTAACTTCAATTTTTAATATTTTCAATATATAAAGTCACAGAGTCTTAA AATGGAACTAACGTCGAGAATAATGTTAAGAAAATGCTTTCAC
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