EMLSAT00000001514, EMLSAT00000001514-697361 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000001514
Unique NameEMLSAT00000001514-697361
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s125supercontigLSalAtl2s125:349817..362791 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000001514 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000001514EMLSAG00000001514-684280Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000006601EMLSAE00000006601-715529Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000006602EMLSAE00000006602-715530Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000006603EMLSAE00000006603-715531Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000006604EMLSAE00000006604-715532Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000006605EMLSAE00000006605-715533Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000006606EMLSAE00000006606-715534Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000006607EMLSAE00000006607-715535Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000006608EMLSAE00000006608-715536Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000006609EMLSAE00000006609-715537Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto776712auto776712Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000001514EMLSAP00000001514Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000001514

>EMLSAP00000001514 ID=EMLSAP00000001514|Name=EMLSAP00000001514|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=937bp
MSCACITRDTPDIENLLQLNPKKKPYTNLVPSIVTKTNKKHWKRNEDNSE
KLKGCGTCETTLFKDFNDIKHTSLSERAALLESSRCLKCADAPCQKSCPT
QLDVKSFIGSISTKNYYGAAKAILSDNPLGLTCGMVCPTSDLCVGGCNLA
ASEEGAINIGGLQQFAVEMFKKAKIPQVLPPYISKNRPDSYNSKIALIGC
GPASISCATFLGRLGYRDITIFEKDEFVGGLNSSELPAFRLPYDMNYEAI
FVGIGNPEPKKIPIFEKLTESNGFFTXKDFLPKVAKASKNGMVSKCSGCV
PQLPELFGDVIVLGAGDTAFDCATSAIRCGAKRVFVVFRKGFSNIRAVPE
EMEVAREEKCEFLPFMSPEDVVLDSKGRITHLVLARNELDDEGNWYVDKD
QSLKKKCNFVISAFGSGLYNSDIKAALEPLKFNRWGGLEVDNLTGKTSEE
WVFSGGDIAGVAETAVEAXNDGKVASWSIHRYLQRNAEGFEKISTEPQLP
KFYTPIDDVDISVEVCGMKFVNPFGLASAPPATTWPMIRRGFEAGWAFVV
TKTFGLDKDIVTNVSPRIVRGTTSGHNYGPGQSSFLNIELISEKTANYWC
QGVAEIKKDFPDRIIIASVMASFDKSDWQEICIKAAQSGADALELNLSCP
HGMGERGMGLACGQNVDMVRSICQWVSEVVKNYKIPFFAKLTPNVTNIVD
IAKAAKQGGADGVTAINTVSGLMGLNSKGVAWPNVMKKTTYGEELDDWDG
LAPPTERTYKGKSVDVKLSETLKKNIPNFGPYIKEKKKIMYENNKNSDPI
SNQKLPXNXPANVPTRNLPQVKEVIGKALDYIGAYKDLSQREHVIAMIDP
EMCINCGKCYMXCNDTGYXAIEFDPETHIPRVLEDKCTGCTLCYSVCPVI
DCIQMIQRKDDYIPNRGVSLSADWKPRLPELQVKKCL
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mRNA from alignment at LSalAtl2s125:349817..362791+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000001514-697361 ID=EMLSAT00000001514-697361|Name=EMLSAT00000001514|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=12975bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s125:349817..362791+ (Lepeophtheirus salmonis)
GACGTCACTAAATATCCCTCTTCAAAGTGGGAATGAAATGTTTGGGGATG AATTAAACAAGGAATGAATTTACTGAGAATGAAATTACTAGGAATAAAAA AAACAGGAAATAACATTACTGGTAATAAAATATTGCCGGTCAAGATGTCC CCTACATAGAGTTGCTTTACTCAGGATACGCCATTTATTTTAAACAACAA ACTACAGACTACCACACCACCTTGCGGATAATATTTTTCTTTAATTTTGT TCATCCACTATTGGTAGCAACTGTTTTTGGTCTTTTTATTCTTTCTTTTT TAACGATAGAAATGTAACTAGATTCAGTATAGGTCTCAAAGTGCTCTCTA CTTATAGTTACGCATTTTACTTAATTTAAGTTGCACAAATCAACGTTCAT ATCACAACTTAGAAGCAAGAGAACATAAATAAATTGACAGCTGGCAATAA ATTCATGCATGGGATTCGTTTATGTTTTAGATATATCATTGCAGCTATCA ATTCCTGATCATGAGTGGAAAACAAATACTTTTATAGTTCCATCAAAGTT TGCAATAAAACGACTTATCTAAAGTTGTTTTTAAACAAGTTTCTATTTGA AAAAAAAGAAGCATACCCTTCTCACTCCAACAGATTCTCATAATATGTTT ATTCAATTGCGTGTGTGTCCTTCAGAATAAGTTAGAATTCATATGTAATA TATCTCATGTCTGTTGAATATTCAGTTTGTTCTTTTTAGTTAAGTATTTA TACAAATCTTTTACAGAATGAGTTGTGCCTGTATAACACGGGATACTCCA GACATTGAAAATCTTTTACAGCTTAATCCCAAAAAAAAGCCATACACTAA CTTAGTGCCATCAATTGTGACCAAAACCAATAAAAAACACTGGAAACGAA ATGAGGACAATTCGGAAAAATTAAAAGGATGTGGGTAAGTGGGATGTTTG AATACATGAGCTTTTGTAGAAGGGAAATTCAATTTTGTACAAATATTAAT ACCGAGAGGCCCATTAAAATCGGAAAACTTTAAATTTTAAACTTTAACAA GATATAATTTATTAATTAACAACAAAGTTAAAACTATAAATAAATGTGTG CCTGAGCTCTCTTAACCATTAATGCAGCTACCCTTAGCTCTAATGATTGC TTGAAGGAAGAGGCGGAAGGCCTGGTACCTGCTGCGGGTGTACCCTTCTT TCAGAGTGTCCCAGTGCTGGCTGRCAGTGGCTTTGAGGGCGTTGGTGTTT GGATAACAGACACGGCATGCCTTCCCTAGACATGCACGCAAAATGTAGTC GAGGGGGTGGGCATCAGGTATGTAAGGAGTCAAAAGGGTAAAAAAATAGT CAAAGAAACTTAGAAGAGTCTTGCAGTGGAGGAAATGGGATTCTTTCATT GCTGATGTCGAAAGTGGCCTCTCCAYCCTCACAAGCCTCTTTCCCCCAAG TATTTTGATAAGTCTCTAGACAGTCTGGTATGAAACCACGATATCCCTTG CAAGGGCCCTCATGGACTTGAGGGGATTGGCCTGGCTTTTTTCTTTAACT CATCCGGATCCAGTTTGGCCTTTTTGACAAAGCCCTTCTTCCTCTCCCAT GTTTCGTACTTGCTAATGGCCTAGAGGGTTGTCTTGGAGACGCCAACTTC GTATTCAAATTCGTCGATCATATTCAAATGTCATTTTCCTGATATGATCG TAAGATAGAGGACTCAAGTTTGCTTCGTTTTGTAACTAATTCTTAATGCT TAAATATATCACATATGAATTAATTTCGATCACTCAACCTTCATTAATTT CTATTACTCCACCTTCATTAATTATTGAATTCAGTGTTCAGATTTCAATG GACCAGCCAATAAATAGTGCAATGAGAAATTAGAAGCACTGAGCTGTGCA TCTGATTTATCGTGGAAGTCTTTGTTAGATATCCCAATCTTTCCTCCAAA AAGAAACATACCAAATACATACAATGCAGTAGTTCATTATTTTCCTAATT TTCATGAAAAGGGGTTTCATTCTTTTTAAGATTGGTTCATACTCCGTATA ATAAATATAAAACTCCATGTCGGTTACTTTATTGTATCTTGCAACTTCTT GTTCCGTAAAGAAAAAGGGCCAAAATCAGTAGGTAAATAATTAATTCTTC TCATCTCAAATTGTGACATAAAAATTGTTGGAAATAGTTTACAGCTTAAA GGGAGGTAACTAACATTCAACTGCCTTACACACTGATAGGTAGAAAGAAG AAGAAAAATCAACAGTTGATAAGAAAATGAAGTGTAATCTTTTATATTAG TTAGATAATACAGTGGGTTACGAACTCATAACTATTTTGTACGGAGGTGA CATTTGTTGGAGGAACATTTTTGAATAACTTTTTCGTTTAAATTAAACAC TTTTTGAACAAGCTCGGGGCGTATGCAGAATTATTTCGAGGGACTTGGTT GTTGATTTTTTGTAGAATTTTTTTTTCCAAAAAGGATAATATTTTGGGAA AAAATTTGAGAAATTATTTAAAAAAAAAAATAAAATTCACACCTATTCAC ATATATTATTATTTTTTTTAAATTTCAAAAATCAACAGATATTTGCAAAA AATTAAATTTTTTGGGGAAAAAAATTCAAAAATTTAATTTAAAATAATAA ACTGTCTTGTAAAACACAAAAATTTCTAAGCTTGAGGTGGGATATACCCC TTCCAGCTCACCATAGCGGACACCCCTGAAGCTTATAGCATTTTTAAACG AATACCGAACATAAATATTTTTAAGTTCCTTTTTTTTAATGTTCCTTTCC TTTTTTTTTTTATAGAATATTTTATATATATAGAAAATCTTTTAATCAAA ATTCAATTTTTGTACCACTTTTTTAGATAATTTGTTAAATATTAAAGAAC TATTTTAGAACAGCTGTGTTTCACTAAATAAATCATCATTTTTGAGTACA AAAATTGTCTTAGAGTGTATAGTATGTCCTCTGGATATTCCTTCATAATC ACAAATATTAAAGTTTTATTATCTTCGCATTCTACAAATATGTCTCATCT CTAGTCATTTTTTAATGAATTTTGTGTGAATAAATCAATGTACCGTGTTT TTTTTTTGTCGAGAAATTTTTTAAAACAGTCAATTGAAGCTTCTTTACGA CACAATTTTTGCACGAATGTTAATAAACCCGTATCCCATATTATACACAG CTTTCCCATGTCCAAATTTGCAGATAAAATGCGATGTACTACACTTTTTC AAATGCCTACAATGTTTGCTGGCTCGCACACTTTCAGTTGACAATMCGAC AGTACCACATTCTAGATTTTTTTCCTCACAATTTCTGGACACGTCACCTC ATTTGGTCGACTACTGTGAGGCTCGTCTTGGCAGCTAACATAGGCTTGTT TAAATTCAGCTAGCCAAAATGTAACATTTGTATATGAAAAATAAACAAAA CAGACTCACATAGAGTATAATTCAATTCAACTTTTATATTAGTTGGGCTG AGGCCTTCTAATAAAGGTGCTGTATCACTTAACGATAGCCAAGTTTCACC ATTTTCACAAATTTACTGACAACTTTTACTTTTGATGGCTACCAAAAACG TACTTAACAACGTGACAACGTTAAACTTGAATCATGTGCTATATAAGTTT TATACAGTGCAGGTAAATTGGGACATTTTTAAAGCCCTATAGCTTAGAAA ATATTAATTTTATAGGTTTTTTTAAAGAAGAAACGTAAGGTTGAATGTTT AGATTATGCACAAAAAGTTTCGTTTCAATACGTAAACAAACATATGTATA 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TGTCTCCTTCGATGGATGCACAACTTTTGAATTTTAAAAAATTCTGTAAA ATTAAAATTTAGGAGTTATAGCCCATTAAAAAATGTCCCAATTTACCTGC ACATATTTGTTTTTTCAACAACTTCCGCTATCTCTTAGTCAGGCTGGGTA CTTCTGGGACCACCCTCGTGCTTGCTGAAACGATTCCTATGTAGATCTTC AAATCTACTCATAATTCCAGAAGAGCATACAATTATAACTCCCTACAAAA CTCCCACTGTTATCATCTATCAAGCAAGCTATAGAAGAAGAAAATACAAG AATACAAGATAATATTTGCACTCCACTGATCTCCCCACCCCCCTCAAATC AATCAACAAAAGATGAATTCACGTTCTATGATAATGTATTCAATCCTATT AAATAGAACTACATGTAGATTCTTTATGGAGTGTGTGTGTCATTTGAGAA TCATAATTCACAAGCACACATATATATTTGCGAATTATAATTGAAAACTG ACTTGACTTTTACCCTTTTTCGTCTCTAAAATTTGACATTTTTGACAAAA TGTTTTAGATTTTTTTTAAATGATAACATTGTCATTTTGACAACATCATT TCACATTTTTAATAAATCTATTAAAATGTTCGATATTACAAAATATATCT TGTGGGCCTATTGNCTAATTGTAATTTATTAGCAAATTCGAAACTGGGTT GACTTTTCACTTGATTTTGTGCATTGTTTCATCATCTGATTCATCAAGTT GTATTCGAACTTGTGAAATTCTACCCATGGGTCTAAATAAACGCATGTTT GCCAGTAGACATCGATAATATTTCCGTATCCATTTCACGAATTAGAGTAT CAGCAGTGCTGGCTCAACCATGATTGGGACTTGAGGCGAATACAAAATGC AAGGCTTTCAGGAAGATTATAATCTTTCTTTACGTTGGGGTGAATGGCTG AATAGGTCATAATTTTTTGTTGTTATAGAAAAATATGTTATCTTTTTGAC AAAAACACCACTTTCATTTTAATTTTTGATATTTATTATGCAAATATATT TCAAATTTTTGGGGAAATTTCCTGTTAAATATTAGTTACTTTGACAATAT TATTTCATTTTTGATAAATTTATTAAAATTTTGACAACAACTGCTGTCCT TTACAAACAATGTCATAAACATTACCACATTACCGTAAACATTATTATTT TGTCGGAAATCCCTATTCCTTCCCCTCCTAGGGCCGGGCTGGGACCATTT ATTTGCAATGTGCTATTTCCCCTATTTTTAAATTAAAGTGTGGAAACTAT GGCAAGTGCATTCAATGCCCTTGGCCAAAACTGACTCCAAGGATCATGGT TGTGTTGATTTTATTGAAAGTCATTTTAAGAGCAAATTCAATTTTTTATT TCTAGGTCCCCTTTGACTCTTACATACCCTTGATTCAGTTCCACCACACT TTTGGAATATCCATAAATGTAAATATATACATTATAAATGTAATATAGAA TATTGTAAACACGTTTAGTTATAATCCCATTCTAATCGGCGTCCTCCCTT CCTTAAAATTGATCCKCGCCCGCCTACAGTGGTGCACCACGCCGTACGTT AGGTATTGATTTAATTGATCGAAGATCGACCATTCTGTCTCAATATAGAT TTGTGAATAATAAAACAATGGGAAACATTTAAAAATTCATCCATAAAAAA TGATTGTAAAAGGTATGTGAAAAAATAAAGGGTAATGTTCGTATTATATT AATCTTAACACATATTTCATATATCTGAGTTGGCTGAATAAAACATAGAT ATTTTTATGAAAAATTCCAAGTACCGACAGTTAAGGACAGGTTCCCATGA TTGATAATCCTAAGGACCGTTCCTAAGACTGAACTGGACTGGACCGAATA AATAAGGACCCACACAAGAATAGTAAAAAATAAAGAGACCATAAGGGAAA GAGGGTTCATGTATATCTACCAAGAATTATTTTCCTTATCTCTAATTCTG ATTCGTCTAAAATTCTGTATATGCACTTTTTCATCTCTTGCGCAGTTCAT TGTAATATAACGTCTTTTGACTAAGACTCATCTAATGTAATTTAATATTA GTCAACTATTCTATAAGTTTTAGAATTGAAATGCGGGACTGAACTAGATC AGAGCAAATACAAATTGAATGGAACTGCAGTCTTCAGTTCTAAATAAACG ACTCACACAACACCAGTGACAAAACTCTTTTATATTTATAGAATGTTATA CATTTTTTTAATTTTTCGGATAAAGTATATGAGTACAACATCTAGAATTT TTCTTTTGAACCATTGTCCTTTCAATATAGCGTATGCTACACCAGCAGAC TGTGTAATCATTTTTGCGCCCACTGATTTTTACTTGTTCCAACATGTACT CGGACATTTTAGAAATTCATTATTTGGAAGTTGAGTAGCAAATTAATGTT TATATTGTAACTATATTTATCAGAACAAACTTAAATGTGGATTTACTGTT ATTTGTTAAAAATAAATTCAATACAAGGTTATGCCATCATGTAATTGGGC TATATAGAATTTTCAATTTGATGTKCCGTACCAACTGCCTGGCAACACAG ACATAATTTGACTTCATAGGTATAATAACAGCGGTACAGTAACAATGAAT AAAGACAATAAATAGCTTCTTTTGGTAACAGTTATACTCTTTGACGTCAC TATTAAAAAGTTGGAAGTTAAGTGGGATTTAAACATCAACCGGAAAATCC TTATGGTATAACCTTGTATTTCAATTAAGCTTAATTTAACAAAGTTTTTT AGATTTCTTACTAATTTTATTGGGAAATCTGTTAATTTGTATTGCTTCAA 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