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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s125 | supercontig | LSalAtl2s125:349817..362791 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000001514 >EMLSAP00000001514 ID=EMLSAP00000001514|Name=EMLSAP00000001514|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=937bp
MSCACITRDTPDIENLLQLNPKKKPYTNLVPSIVTKTNKKHWKRNEDNSE KLKGCGTCETTLFKDFNDIKHTSLSERAALLESSRCLKCADAPCQKSCPT QLDVKSFIGSISTKNYYGAAKAILSDNPLGLTCGMVCPTSDLCVGGCNLA ASEEGAINIGGLQQFAVEMFKKAKIPQVLPPYISKNRPDSYNSKIALIGC GPASISCATFLGRLGYRDITIFEKDEFVGGLNSSELPAFRLPYDMNYEAI FVGIGNPEPKKIPIFEKLTESNGFFTXKDFLPKVAKASKNGMVSKCSGCV PQLPELFGDVIVLGAGDTAFDCATSAIRCGAKRVFVVFRKGFSNIRAVPE EMEVAREEKCEFLPFMSPEDVVLDSKGRITHLVLARNELDDEGNWYVDKD QSLKKKCNFVISAFGSGLYNSDIKAALEPLKFNRWGGLEVDNLTGKTSEE WVFSGGDIAGVAETAVEAXNDGKVASWSIHRYLQRNAEGFEKISTEPQLP KFYTPIDDVDISVEVCGMKFVNPFGLASAPPATTWPMIRRGFEAGWAFVV TKTFGLDKDIVTNVSPRIVRGTTSGHNYGPGQSSFLNIELISEKTANYWC QGVAEIKKDFPDRIIIASVMASFDKSDWQEICIKAAQSGADALELNLSCP HGMGERGMGLACGQNVDMVRSICQWVSEVVKNYKIPFFAKLTPNVTNIVD IAKAAKQGGADGVTAINTVSGLMGLNSKGVAWPNVMKKTTYGEELDDWDG LAPPTERTYKGKSVDVKLSETLKKNIPNFGPYIKEKKKIMYENNKNSDPI SNQKLPXNXPANVPTRNLPQVKEVIGKALDYIGAYKDLSQREHVIAMIDP EMCINCGKCYMXCNDTGYXAIEFDPETHIPRVLEDKCTGCTLCYSVCPVI DCIQMIQRKDDYIPNRGVSLSADWKPRLPELQVKKCL back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s125:349817..362791+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000001514-697361 ID=EMLSAT00000001514-697361|Name=EMLSAT00000001514|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=12975bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s125:349817..362791+ (Lepeophtheirus salmonis) GACGTCACTAAATATCCCTCTTCAAAGTGGGAATGAAATGTTTGGGGATG
AATTAAACAAGGAATGAATTTACTGAGAATGAAATTACTAGGAATAAAAA
AAACAGGAAATAACATTACTGGTAATAAAATATTGCCGGTCAAGATGTCC
CCTACATAGAGTTGCTTTACTCAGGATACGCCATTTATTTTAAACAACAA
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CCTGAGCTCTCTTAACCATTAATGCAGCTACCCTTAGCTCTAATGATTGC
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AATACCGAACATAAATATTTTTAAGTTCCTTTTTTTTAATGTTCCTTTCC
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TCGGACGGTGATGCCRTCGATCTTCTTTAACCAAACAGAGAGGCTCGGTG
TTGACAATTACCGCAAGGTGCTGTAGGACAAAGTCATCACGTGGAGGAAA
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TCTGGTGGCTGCAGACTTGGTCCTCTAACTCTCCCAATTCTAACCCTATG
GACTTCTTCTTGTAGGGGGAGTTAGAGAAGCAAGTCTACTCGAGGCCGCA
CAACAGTTTGGCCGACCTCAAGGAATCGATCGTGAAGTACTGGACCAAGT
GTGATCCAATTCTATCACGGATAAAATCTTTGAACAATTATGGGAGACTT
CTATATCAGTAAGCACGTATCACATATATATTCTATATTCAAAACCGGTA
AGACGTATCTTAAATAATAAAAATAAGCATATAACATATATATATATTAC
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CCGTCTTGACCAGGCCATCGCCGTCAACGGCGAGCACATGAAATAATCTT
TGTCTCCTTCGATGGATGCACAACTTTTGAATTTTAAAAAATTCTGTAAA
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ACATATTTGTTTTTTCAACAACTTCCGCTATCTCTTAGTCAGGCTGGGTA
CTTCTGGGACCACCCTCGTGCTTGCTGAAACGATTCCTATGTAGATCTTC
AAATCTACTCATAATTCCAGAAGAGCATACAATTATAACTCCCTACAAAA
CTCCCACTGTTATCATCTATCAAGCAAGCTATAGAAGAAGAAAATACAAG
AATACAAGATAATATTTGCACTCCACTGATCTCCCCACCCCCCTCAAATC
AATCAACAAAAGATGAATTCACGTTCTATGATAATGTATTCAATCCTATT
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TGTGGGCCTATTGNCTAATTGTAATTTATTAGCAAATTCGAAACTGGGTT
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AAAAACACCACTTTCATTTTAATTTTTGATATTTATTATGCAAATATATT
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TATTTCATTTTTGATAAATTTATTAAAATTTTGACAACAACTGCTGTCCT
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TGTCGGAAATCCCTATTCCTTCCCCTCCTAGGGCCGGGCTGGGACCATTT
ATTTGCAATGTGCTATTTCCCCTATTTTTAAATTAAAGTGTGGAAACTAT
GGCAAGTGCATTCAATGCCCTTGGCCAAAACTGACTCCAAGGATCATGGT
TGTGTTGATTTTATTGAAAGTCATTTTAAGAGCAAATTCAATTTTTTATT
TCTAGGTCCCCTTTGACTCTTACATACCCTTGATTCAGTTCCACCACACT
TTTGGAATATCCATAAATGTAAATATATACATTATAAATGTAATATAGAA
TATTGTAAACACGTTTAGTTATAATCCCATTCTAATCGGCGTCCTCCCTT
CCTTAAAATTGATCCKCGCCCGCCTACAGTGGTGCACCACGCCGTACGTT
AGGTATTGATTTAATTGATCGAAGATCGACCATTCTGTCTCAATATAGAT
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TGATTGTAAAAGGTATGTGAAAAAATAAAGGGTAATGTTCGTATTATATT
AATCTTAACACATATTTCATATATCTGAGTTGGCTGAATAAAACATAGAT
ATTTTTATGAAAAATTCCAAGTACCGACAGTTAAGGACAGGTTCCCATGA
TTGATAATCCTAAGGACCGTTCCTAAGACTGAACTGGACTGGACCGAATA
AATAAGGACCCACACAAGAATAGTAAAAAATAAAGAGACCATAAGGGAAA
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CATTTTTTTAATTTTTCGGATAAAGTATATGAGTACAACATCTAGAATTT
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TTATGGTATAACCTTGTATTTCAATTAAGCTTAATTTAACAAAGTTTTTT
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AACAAGTGGAATCATTTTGGATACAAGTAGTGCAATACCATTGTTGCTCT
AGCGTTAGAATACATAACTTAGTAACTTATAAGCTTTAAAAATGATAAAT
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GAGCCGCCCTTCTTGAATCAAGTCGATGTCTCAAATGTGCAGATGCTCCC
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CCTATGACGTAATCGATTTTGAAGTACAGCTGATGAAGGATCTAGGTGTC
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GAATCCAATGGTTTTTTTACATKAAAAGATTTCTTACCTAAAGTAGCCAA
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GATGAACTTATTATAGTATATTCATATACAACAATATTTATATGAAAGAT
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TGACCCCTTTGTTCTAAGTTTTACAATATTTCAAATTAATTATCAACTAG
GGGGTTTTGTATTTTAGGTATATATTTAAATCAACTGATAGGAAAATAAT
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TGTAATTTTGTCATATCTGCCTTTGGATCTGGACTATACAATTCAGACAT
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GATATTGCAGGTGTGGCTGAAACTGCTGTAGAGGCTGMAAATGATGGCAA
AGTAGCATCATGGAGTATTCATAGATATCTACAAAGAAATGCAGAAGGAT
TCGAAAAGATTAGCACAGAGCCTCAATTGCCTAAATTTTATACTCCAATT
GATGACGTGGACATTAGTGTTGAGGTAATTATTGATAGTACGAGTTGCTT
AAGAGAAGTGATTATTCTAATTTCTTGTCAAATTAGGTTTGTGGAATGAA
GTTTGTAAACCCATTTGGACTCGCCTCCGCTCCTCCAGCAACAACATGGC
CTATGATTCGACGTGGTTTCGAAGCTGGTTGGGCCTTTGTAGTGACTAAA
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TCGAGGAACAACATCTGGTCATAACTATGGACCTGGTCAAAGTTCATTTC
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GGTTCGCTCCATTTGCCAGTGGGTATCTGAAGTGGTTAAAAATTATAAAA
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GCAAAGGCTGCAAAACAAGGAGGTGCTGATGGTGTAACTGCAATTAATAC
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TGTACGCAGGAGGATCTGTCATGCAAGTATCAAGTGCCATTCAAAACCAA
GACTTTACAGTCATTGATGACTATGTTACAGGTCTAAAGGCTTTATTGTA
CTATCAGGTAAATATATTGACCTTAATTATAGCAATTATAGAAGGAACGT
GCACTTTATTTTTTTTTGACAAACTTTGTGCTATTTTGTAGAGTTGAGTA
GTTATAGAATGAAGGAATGAGCAGAATTAAAACCATTATTTAATGAATGT
CCTGAAGAATTTTAGGATTTTTTTAGTTGATTTATTTATGTTTTAGCGTC
AAAATAATAGTTAGTTAACAAAGTTTTTTAACTATTTGAAATATTTATTC
CACGGTTGTTTTAGTTTGATTTTCTTTTTCATTTCATAGCTATTATTGTA
ATAGAAAGATAGCCTTTAGTTGGTTAAAAAAGGGAGGGAAAATATAAAGA
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TTTTTGTTTGATTTTTTTTTTTTTTTCATAGGCCATAGAGGAACTTGATG
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GTTGATGTAAAACTAAGTGAAACTCTCAAGAAAAACATACCAAATTTTGG
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CCGATCCGATATCAAATCAGAAACTTCCAAAWAATAGSCCAGCCAATGTT
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CTACATTGGTGCTTACAAGGATCTGAGTCAAAGAGAGCATGTCATAGCTA
TGATTGATCCCGAGATGTGTATCAATTGTGGGAAATGTTATATGASGTGT
AATGATACGGGTTATKAAGCCATAGAGTTTGATCCCGAAACTCACATTCC
ACGTGTTTTAGAGGATAAGTGTACAGGTTGCACACTTTGCTATTCAGTTT
GCCCTGTGATTGACTGCATTCAAATGATACAACGTAAGGACGACTATATA
CCCAATCGTGGCGTTTCTTTGAGTGCGGATTGGAAACCTAGGCTTCCGGA
GCTTCAAGTGAAGAAATGTCTCTGA back to top
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