EMLSAT00000001544, EMLSAT00000001544-697391 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000001544
Unique NameEMLSAT00000001544-697391
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s1269supercontigLSalAtl2s1269:66863..93552 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000001544 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000001544EMLSAG00000001544-684310Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000006747EMLSAE00000006747-715675Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000006748EMLSAE00000006748-715676Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000006749EMLSAE00000006749-715677Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000006750EMLSAE00000006750-715678Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000006751EMLSAE00000006751-715679Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000006752EMLSAE00000006752-715680Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000006753EMLSAE00000006753-715681Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000006754EMLSAE00000006754-715682Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000006755EMLSAE00000006755-715683Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto771209auto771209Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000001544EMLSAP00000001544Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000001544

>EMLSAP00000001544 ID=EMLSAP00000001544|Name=EMLSAP00000001544|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=747bp
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YFFGPVRILDKVLEGRKLNDLSLNELILINGDIELLVRELSEELVGDLGI
RDELEFEKELKNTFISLLLNIQSKLRQINRKNSGKPSTFKYLTTVIPYQI
GSNYLSTPNMNDDMLNEIINSTSCEDMDEFNRNGPLHILCRNNETIIIKK
IARKYNVNFVVTTENINEEIETSEVGRSFDVIDLNSFNHDTYLGVSSMEK
WLESLEHKYNEFMEIKIIGKSHQNRKIFCIEISTNKNNPIVLIDAGIHAR
EWIAPATSLFVIEIIGEFHQSEEMKKFQWHIIPNANPDGYHFTRTEDRFW
SKNRRNPDKGSKCSGVNLNRNFPSGFGKGPKNPCARAYIGKYPLSEPETK
AIADYVKSIVHNNVIMALSFHCFGQTLFTPFAYDGPSSHPLLELMHTMLE
DATHHMLPNYYQYGLVRTYLRYKNEGIGGTSMDFYADQGIPFAYTWELPD
MGQHGMLMPSRKIQEIGKEVMTGLSRMTAWIYKNQREINVSIESFGPSND
QHSSSMGIYEAINNPSIEYNGERFVYKKTTNIPEKNPRFLYYLPIYEIWM
VGNKLGQSYATLFHFEDSLCPEKLTGSWFYYDNSWKNSDRSLKVSCF
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mRNA from alignment at LSalAtl2s1269:66863..93552+

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000001544-697391 ID=EMLSAT00000001544-697391|Name=EMLSAT00000001544|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=26690bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1269:66863..93552+ (Lepeophtheirus salmonis)
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AAAAACGCGTGCAAGGAGAAGGGGGGGGGATGAAAGACATATGGTACCAT TGTTTAAAATATTGATATGATTTTCACTGATAATCACATCCGTATTTATA AGTTGCCTACTTTATTATGATTTTTGAGGGTATAACGAAAGTATTTATTA GCAAAATGTTTAATAAAGATATACTACGTATAACTGACTTAGACGGCTTT TATCCGTTACAGTAGATTTGAAAACGTCCCACTCCATGAAATTGTAATTC ATTATGAACCATATTTTCAAAATAATAGCTAATAAAACGACAAAGTAAGA GTATTTCGAAATATATTTGAAGTTCCAGGTTTAAAATAGAAGGCTTAAAT TAAATATAATCTACATACTAAAAAAATAAAAAATAAACCATCATACATTT AAGTCAAATATACAAAGTTAAACAATTAGAATCATATAACTAATAATAAC AATAAATTATAAATACAGAATATTGAAATAATAGATTGATGCAAATCATA TTTTCTTGTTCGGAATTCATTTCAATATGTCATAACTTTAGGTTACAAAA CACAAGCCAGACGTGGAGTTTAATCAAAAATATAATCACCCTTTTTTTCT CATGTGTAAGTTGCATATACAATTGTGCACAGGATAGATATATCTCTACT GATAAGATTTTAATAATTATTGATAATAAAGTAAATGTCAAAATCATAAA ATAATGTTAGATTTAAACCCATATCTTCTTCCAATCTTAGTACGAACAGC TTTTAGAATCCCACTTTTATTTATTTCATGTTTATCTAAAAAAAGAAAAG TTAATTCATGCAGTCAAATTTTAAAGCTTAATTACTTATCTTAGATATAA AAATAAGACTCATTTATAACTGATAAGACAATTCAGGCAACTATTTTTGA CTTAATGCAGTTTTCTAACATGATATCGTAAAGATTTAGAGCAAAAGCTA 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