|
|
Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s126 | supercontig | LSalAtl2s126:328854..339207 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000001555 >EMLSAP00000001555 ID=EMLSAP00000001555|Name=EMLSAP00000001555|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=324bp
MSIQSTTQKTPIVDKGLEATTIKKLQETDGVLLESYLIYEPEHIATWFKD
GKELLGALDFDEKYQPFLERRGDWTYCALAIRHLSQEDAGNYTLTVRNQY
GEKSNHVRLSMKDQNEPSKGGIEPAFFRKPSSRQEGNKLHIECEIEALPK
PDIRWYRNDQEIQENEKYSFYRAVQQSNVNIHFARLTVLNPGPNDGGNYV
VRAVNEIGDKDCTIALNFGDLVGDENNVPAKIYEQPQLKQPDPNILILEA
HIHANPKPKITWLCNGDFIKESDRKYAKLEPRVGEKNKWNATLTIVKPTK
ADSGDIKCSAKNKWGNDHTTFNLS back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s126:328854..339207+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000001555-697402 ID=EMLSAT00000001555-697402|Name=EMLSAT00000001555|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=10354bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s126:328854..339207+ (Lepeophtheirus salmonis)
CAAATATCAACGCCTACAATTTCACATAAATATATTTGTAATACAAAATT
ATAAATTGTGTTCGTTTGTGTTATTTTTTTGGATGTTTCTTGTAATACTA
AAGGATTGAATTTGAATTAAGTTCGTTTGGTGTATTTAAAAGGAAGAAGA
TGTCTATTCAAAGTACAACTCAAAAAACACCCATTGTGGACAAGGGTTTG
GAAGCAACCACGATTAAGAAGTTGTAAGTTCTTAAAATCAGAGGAATTTG
TATTACATATGAGCATTTACTCTATATTTTATCTAGCAATTTCATTGAAT
ATGTAACAATCATACATTCGACAAAATAACTCAAAAATAGCTTTAAAAAT
AATTAATTTATATTTACATACACTCTAATAATTAATTATATTACTTCCAT
ATATAACTAAATTACCTTAGTATAAGCACACTCAAACAGGATCTGAGAAC
TTAGTTGAGTGACATACTTCTTTTTTTTTCAAATCAATTAAGTACTTTCA
GACTCATATAAATTTTCTAGCTTTTCTGAGAGTAAAATAAAATATTAACA
CATTAGGGTATATGAGCTTCAAGAGAATACACAACTTATTTATTAACAAT
GACAGTAGAGAGCCTCCCATAGACAGAATAACAGTAGGAGTAGGAATCTT
TAGTAAATTAAAATATAAATTGTAAAATGAATGATGAATCATTTTTTCAT
TGCTATAAAAATAGAATTGACTATTTGTCCGCGCTTTGTTTATTTGTTAG
TTAATAACTTGAGTTGGCATGTTTGAAAAAAAGAGTGCCAGMTGGGGGGG
GGGGGGACAAAGACATATGGTACAACTCAATTAAGACCCTTTTTAATATC
AGCTACCTGTTATATTATGATTAATATGGGAGGGAAATGAACGACTGCTA
TAAAGAGAAGAACCTTTTACATTTAAAATAGCATTAGTGGACTGTACTGT
ATATTTWAAAATAATTCTCAGGAAAGAWAGGCGAGAAACTTCAGNTTCTC
AGGTAAAGTATAGGCGAGAAACTTCAGAGGGGGATTCAACACCACGACAA
CCTATAAATAATGAACAAAAAAGAAGAAGGAAGAGGACACGCAAATACAG
CTTCTTTTTTCTTTTTTTCTAATTTTGAAAGATAGTACTTTCATTACAAA
CATATCAACTCTACTTTTGAAAAAATCAAACGTATTAGCAAGAAAGAAGG
ACAGTACCTTTTATATTAATCTCCAGTTATGCCAATCGTAAGGGTCATTC
CATGTCAAAACGACCAATGCATGTTACCTTACCCTCTCACATTAAAATGA
TTTTTGGCACACAAGCTCAAATTCATGAGTAGATTAAGTTTCAGCACTTA
ATTCTTAGTCGTTCATGAGATATACATACTCTTCCTAGTCCCTTTTTGGA
CCAAAATTTTCAATCTCACTTTAATGTCTTATGGCCTCAATTCTATTTAT
GTATTAATCTGAAATGATTTAGAATTTAAAAAATTCTACCTCTACTAAAT
ACAGCACTTTGTAACATGTTTTTTTTACATAGTTAGGGGTAGCACCGGAC
CAAAAGTTATATTTATTTTTCTTATCATAGCCCCTAAAATGCAATTTCAA
ACCTAGATTACTTTTCTCCGGAAATTTGGTCAATTTTACGTACGTTTTTA
TTTCTTAAACTTCACTTTATGATTGAAATATGTAGACGGACAAAAGAAAA
CTGAACTACAGTAATTCATAATATTGATTACAAGTTGACAAATTTAAAAA
AGTAAAAAAGTTAAAAAAGATTACTTGTTTATTAAGCTACAAACATTTTT
TAAATAGTTTGTTTATAATTTTTTGAGACTTGGAACTGTCACTCTTGTTG
GTCCTGTTCACACACATATACAATGGATTTTGGGAGCTCAATAAACATAG
CTTCTAGGAGGCCAAAGATAAGAGGGAGATGGAAAATAAGTATAGGAAAA
CTTGATATTTACGTATTTGTTTTTCCCACATTGAATGATAACCACAACAA
TACAGACCCTATTTTCATTTGTACAAACAGCAAATTGAGACAGTTCTGTT
GGTTTTTTTCGAAGCTAATATTATTATCATTTAATTATTAAGGAGTGAAC
TTCCTTTTCTACTAAATACAATTATATACAAAACCGGTTTTAACATTATT
GTATGCTCATAAAAGGTCCTTAGTCCTTAAAGATTTGTGCAGAGTTATAA
CATTAAGTTCTTGCTTGACTCAGCGGTGAATTGAATCTCAACATCGAAGT
AATTCTAGCTTATGTCCTTGTTAATTTATTTATTTCTACATATCGTAACA
GTTACTTATATCTGATCTAAAAAAACATTATGAATGTTAATCTGCTCTAC
TCCGAAATGTTTGTCGAATAATCAGGATTACCATGTCGATTTACGGTTTC
TCTTTTATTTAAATGCTTAAAATGATAACGATTTTCATCAATAGTAATCT
TTGTTAGTATATATGTCGTCCGTCAAACTTGCCAACATATACATTTATTT
TGGATGTGTAATGACGAAGAATTCAGCCATAGAAGTTTCTTTGTATTTGA
AGGATAAATATAACTGGCTATAACTTTTTTTAATTGTATTTATCTCTCCT
TGAGATTCGATAGAAAGATATCCCTTTTTTCATAACCTGAATAAACTGTT
TTACATTATGGGGCAATCCCACGATCTGGAGTTATCACAATAAATAAAAA
CTTAAGATTAAACCTATGGATTACTCCCTTGAATACAGTATTCAAGGTGA
GTAAGTGCTAAATTAAAAAAAAGAAGGAAATATTCTGACGACTAATGTAT
AGCGCGTAGAAAAATACTTTCTCTTGTTCCTATCCTTCTGTTGTGTTATC
CATGCTGCATATATGAACAATAATTACCTCAATCATACTAGAAAAAAGTA
TTGGAACATATCCAAACTCCACAACAATTTGATTTCAAAATTGGTATTTA
AAAAAAAGTTAGATTATATATTACTATCATATTATATAAAATCAATTTTG
TAGAAATTGCATGAAATTATCGAATTTATGAAATATTGGAAAATAATTTG
TCGAAATACTAACATATTTATGAACTTAAATATTTACAATTAATGTTTAA
GGTTACATTCAATGTTTATTCATGATTAAATAATTAGTCAAACTGTATAA
AAATAAATGTTCTAACATTTTAGCTCTTAAATAAAAGTTGTAATGACGAA
TAAATTAATATACATATTGTTGATCCAACGTATAAATATACTAACTGGCA
TAAAAAATGAATTTAATATATATATATATATGTATTTCTTTTTTTTTTGT
TACCATAGATTGAGATTTTGATTGTGCAATTTTTTTTTTTTTTGCAAACA
ATCAATATTTTCCCATATTTCAGAAGCAACAACAATATACTAACTGTAAT
GTGCCTGAGTGCGATCCCATGCTATGTGGATTTAACAATCAATCTGCAAT
GCAGTGTTACATTCATTCAGAGAAATTGCAACAATTTAACATTGACTATT
GGCAGCAGTGGGGMGCACTGTGCAATCCATATTACCACCTTTCAATTAAT
AAACTATAAGAATATTTTAATTCAATAGCTACATTTACTAGTATACGTTG
TTAGTAAACTGTACCATCTCTTATTTTAATAAAATAGTTTTATATTCTTC
AAGTGTAAGCTTTATTATACAATCCAATTCTGAATGTACTGTTTAGCGCT
GAGTTTAAAATATTTTGGCTGTAAAAATATACTATCTGGTAAATGCATTT
TATCATTTTTTTATAAATTAATTTTTTTTTTTAAACTTACAATCTAGCCA
CTAGATACTTATGATCATAGTGAAATTTGAATTCTCTAGCTTAAATATTG
GCAAAAATATAGTCACCTAAATATTGAAATTTAAATATCTCAGTTGTCGA
ATAGCATGTTGTCGCACTGGGTAAACGATATGTCTTAATTTTGAAAATTG
TGTATAAGGCCAGGTCAACCTGAATTCACTGAAGAACTTCACTTAAGACA
AGAAACTGATGGTGTTCTCCTGGAATCTTACTTGATATATGAGCCTGAAC
ACATTGCTACCTGGTTCAAAGATGGAAAAGAGCTTTTGGGAGCTCTTGAC
TTTGACGAAAAGTATCAAGTAAGTGTCCCGATGATATTGTTATTTTGATA
ATATAAACGATTTTTCCTATAGCCTTTCTTGGAACGACGAGGTGACTGGA
CCTATTGCGCCTTGGCAATCCGTCATTTATCACAAGAAGATGCTGGAAAC
TACACTCTTACTGTTAGAAATCAATATGGAGAAAAAAGTAATCACGTTCG
GCTCTCCATGAAAGACCAAAATGAACCTTCCAAGTAGGTTCCATTATAGT
TCATTATTATTTTTTTTTGTTTACAATCATTTGATTCTCAAATTGACAAT
TTTAGAGGAGGTATTGAACCTGCCTTTTTCCGAAAACCATCATCTCGTCA
AGAAGGCAATAAACTTCACATCGAATGCGAGATTGAGGCTTTGCCGAAGC
CAGATATTCGCTGGTATCGAAATGATCAAGAAATTCAAGAAAATGAGAAA
TACTCATTCTATAGAGCAGTTCAACAATCTAATGTGAATATTCACTTTGC
TCGTCTCACTGTTCTTGTAAGTACTAAATAGTTAATTAATCAGATGTTGA
AAATGTATTCATATTTCCTTTGGTCTAATTAGCTCAGTACCACAATTTAC
TTTAATTTGTGCATTACTGATAAACCCGAGAAAAAAATGATTGAAGCTAG
TAAATGGGCAAATTGAATATCCGATGTCATCAATTGAGNATGTGCAATTT
TTTTAAATCCTCGCAAGCATAAATCAAAAAATAAAGTATATGTTGATACT
TTTGAGGAACCACATATCCGCATACGGAGATCCCTATTAAATATTGTGTT
CTTTACTCCCTTGTACATTTAAAATTTCAAAATGGGATGCAATCATTAAT
AAGAGCAGGTTAACAACATATACTTTTTTATATGTATTCGTAAAAGGATT
TTCACAATTTCCACTTCTCTAGTCATCCATATATCATTGACATTGCTAAG
TTGAGTACTTTGCAACTTTTGAAGAAATTGAAATATATTCAATTTAGCTC
AGTACTCCTCAGATTTTTTGACTTACATTTATCCTTCAGATAGTTTTTGG
ACATCTACGCCCCATTTATCATTGTAACAAAAAAATTAATTTTTTAATAA
ATTATATGTGAAAATATTTTCGAATCCCCAACCATCCTCCTCACTGGAGT
TGCCCTACTAAATATGAGAGGCTATGCTTAGCTACTCTTCACTTCTCCCA
ATGATATTCTTTCCGACATCTATTTATTCCGAGTATCTAAATTGCGACTA
TCCCATTATCTTACTTTATAGTTATTTTTTTTTTTAGAATCCTGGACCAA
ATGATGGTGGAAACTATGTAGTTCGTGCCGTAAACGAAATAGGAGATAAA
GATTGTACAATTGCTCTCAATTTTGGTATAACAATATTATAATAATATAA
AACAACCCTTTCAAGGCATCATACATAATTGATCATTCATAGGTGACCTA
GTGGGTGATGAAAACAACGTACCAGCTAAAATTTATGAACAACCTCAATT
AAAGCAACCCGATCCTAATATACTTATCCTTGAGGCTCACATTCACGCTA
ATCCTAAGCCTAAGATCACTTGGTTATGCAACGGAGACTTTATCAAAGAG
AGTGATCGCAAGTATGCAAAGTTAGAACCCAGGGTCGGGGAGAAGAACAA
ATGGAATGCAACACTAACAATTGTGGTAAATAATTGTGTTCAGTTATCAT
ATCAAACGAACTCATCCATTTATTATAAAATCCCTCCTTCATTACTCGTC
CGGAGTTTGCCTCTAAAATAAAACCCTTTTCAATTGATGACAAAGGGGAA
CACTCATCTTGTACAAATAAATTCATACCAAAAAAGAGATTTATCTTTGA
GTGCCAAAACCAAAACTGATAAAAGTTTTTCTCCCGGCATCGGAATTCTG
AAATATCTGGAATAATACTCATTTGGGACTACTATCGTTCAGAGTATTTT
GTACCCTTAAAACAATCCTCCAGTTGTAAGTAGAATTAATAAAATTTATG
CAAAAGTGTTTTTATTGATTCTATATCTTGTTCTAAACTCGATATATTTC
CATTTTTAGGCAGAAAAATGATGACAAACAACACTCTCTTTTAGACACCT
ATAACTTATTCATAATACATAGTGATGAGGAATATCATAGTTTATATTAT
AGAAAAATATTCAATGTATATATTTTTTTAAATATACATCTCCAAGGATT
TTTGTTCCATTTTGTATCTTGTATGTGATCCCATTTTGAAATATTAAAAT
GCTCTACTCATCGTGAAAGGATCGCTTTATTGTTTCCTTCCATGTATCTC
ATTCCCAAGGAAAGAGTCAACTCTACTCCCTTATGAGGTCTGGTAGTTTT
TCTAATGTGGAATCTGAATTCGAGCATTTCTTCAGATGGATGACCAAGTT
ACAAGTATCTTCTTTCGATTGCCTCGATCTTCCTTTTATGAGACATGACG
TCATGAAATTGGGAAAAATATTATGATAATACTGACCATTTGCTACTACA
CTCCGGTAGAAAACACGATCACTTAAAAAATACGAAATGGAACAAAAATC
TTGGATATACATAGTTTTAAATTATAGAATGAATATTTTTCTAAAATATA
ATCTATTTTATTCATCATCACTATGRATTATGAATATGTTATGAGGGTCT
ACAGAAGAGTTTCGTTTTTCAGCATAGTAAGGGAAATATATCGAGTTCAG
AACAAGATACAGAATCAATAAAAACTCATTTTAATGATAAAAACACATTT
ACATAAGTTTTATTAATCCTACTTTTAATTAGGGAAATGTTTTAAGGGTA
TAAAATGTGTTTAACCAATTATAGTCACGAATGACTATAATCCCCGATAT
TTCAGAATTCAGATGACTGTGAGAAAAACTGAAATTTTGGAGATTCTGCT
CTCATGGGTAAGTTCGATAAGCGTCTTCAATTTATTCGTACAAAATTCCC
TCCTAATTGTTTCCCTCTGTTATGTATCGAGTATTTTGTTTGAAAAGACA
TTTTCCAAAGTTTTTCATTTCAAGTTTTAAACGAAATTTTTGTACAGAGT
TATGGAGACTTGTAGTCGCATTTAAGCTAGAATAAAATGCACCATAAGAA
TCGAATTGAGCTTTAGCCCAAAGAATTGACTCTGACTGAAGTTAAAAGAT
TAAGAATTTGAGTTTTGAAACTTAGAACATCCTATATTCCTTCATCTTAT
TTCAATTTAAATTAATTTTGATTAATTCTAAATCAAGTCTAGGGCATTTT
GTACTCAACACACGTACTTGAGTCGCTTATTAGCATGGTATACACTTACT
AGGGATTGAGCCATAGATAAATAAAAATATACAGACTACAAGTTGGAAAA
TATATTTAGCTAAATTTCAGTTGTTAACAAATGGCATGTGCTGGTGAAGA
ACCAGATGCTAGTACGGACTTCCCTTCTTAATCTTCTTTTATAGCTGCTG
AATTATTCTAGCAGTGCTTTCTATTTAAAAACGTCTGCTTCACAATGCCA
TGCTGCCTTCAAAAATAACTTCTCGTCAATGACGTTTATCCATTATTATT
GATGGGAACATAACATATTTCCTGTATGACTACATCCTTGGGCAATACAA
ATTATAATATATATTTTAAGAGCGAGGCAGTTCTTCAGAATAATATGTTA
ACATATCCATTCATAGTACATTCAAAGTAGTATTATACGTTATGTTATAT
AAAAAAAGAAGGGAATGTTATGACGACTAATGTAAAACAAACAAAAAAAA
TATTCTTTCTCTTGTTTAAACTATGCATATAAGTCACGCCGTTACCTGTG
TTGTATCTCACAAACTTTCTTCTAAAATGAAACAAGATTAAGGTCAAGTT
AATTGATAGTTGGACAATTCTTCTCAATTATAGAAATATTATTTAATAAT
TGTTGGGAATTGTTCAGACATCAACATGAACTAATTTGGATTCAACCAAT
CACACTGAAAAAGTGACAAGAAAGTAAATTGCAATGTATATGTTAGTTAG
ATAATGCCATGAAATCCCATTAACCTGTGTCTACTCGGACCGGACTCCAA
GTGAACAGAATCAGGACTCATAAATAGCTCTGATACAATATAAACATACA
TACCTTGAATATTATATCACCTTTTGTTAAACTCTTTCCACACTTTTACC
GTCTCTCAAAAGAACAACCCTATGTTTAATTTGTTACATCCCTGTCTTTT
CATGTTTTCTTGTTGAACCTTAAAATATTTGAATAATATTTCTATAAATC
TTTGAAGATGTATTTACATTTACGACGTAACAAAAATATGGCGTATTGAC
AACTCTGCGCAAATTCAAATAATAACTTTAATTTTTACTCATATCAAATA
TATTGATGTGGGAGTGACGGGAAACAGTTGCATCCTTTTTCCTTATGTCT
TAATTAATCAAAATTTGTTTAGCATAAACACAAATAAATCTATTTATTAA
TTATATATCTGATGTTTTTTCACATATCTTCTTTTAGTTCCTTTAATTGA
TCAGATGGAGTTGCACTGATTAACAGGGGGTGGACTTGAGGTGGTGTAGC
ATTAATTCTTTTTCTTTGAATAGCTATGGTTTTTTTTAAACTTTAATAAT
ATTGAAATTTTCTTTTAACAGCTGCAGATTTTTGAAAAAAAATTCCCAAA
AAATTTATTTTTTGTGAACAGTTAAAGATTTTTAAAATTTTTAGTTTTTG
GATTTTTTTTTTAAATCCAAAAAACATGCGCCCCAAACCCCCAATATATA
TATATATATATATATTTATTTATTCCTGCAGACATACCTGATTAAGTATA
AATAAACATTACATTATTACATTTATTCCATGTGACCAAGGAATTTTCTT
TGAATTCCATGCACATATTTCCTTCTCTAGGAACGACTGAGACGCGAACC
TACACTTATTGAATTCAGGAGAATAATTTCTCCCGAACACGTTGTTCATT
AAGCTTTGTTGTACCATTCAGAGAATATTATTTGAATACGACCTCTCAAA
TGTTGGCCTCTGGACGATTTCAACAGTTAAAAATGGTGTTTGAGTTATAA
ATTAATATAATTATTAGACGAAAGAATATTTTTTAAGGAATAAATTATTT
GACCTTTCAATTTACTAATTATATCAGATTAATTAATGTGTGATAATTTG
TATATTGAAAGTAAATGCTATCATACTGGCTAAGTGTTGCAACTGTCCTC
GATTATAGTTTGGAACTGAATTTGAGCAGAATTGTGAGCACATCTATTAC
TTGAGTATTTCCTTAATTTTAGTTTGAGTAACGATCAAGGTCGGCTTTAG
AGGAAACATTGGGGTCATTAGCTCCAGTTCGTACCAGATTATAAAAATAA
AGTCCCTGTAAATAGTCGATTTTTAATAGATTTATAACTATTTACAAAAA
GGATCCTTTGCAATTAAAATAAGAGTTAAAAAGAGCCCTGCACTCTATTT
TCTTAAAAACAAATTAGATTTGAAATTATTTACTGAAAAAAAAAAAAAGA
ATTCAAAATGATCCACCAAGGATTACACTTATTATAACCTTTTCTTCCAT
TTTCTTTTCTTTTTTTAGAAACCAACCAAAGCAGATAGTGGAGATATCAA
GTGCTCTGCCAAAAATAAATGGGGCAATGATCACACCACATTTAACCTTT
CATAATTTTGTGTTGCACTTTTTGTTTTATTTACTATTTAATTTTGCATG
AAGTAAGTTCATAGACGTTAAGTGTAAGTTTTTAGTTATTAAGATCCATA
TTTACTAACCTTGTATATACATATGATACCACAATGAATAATGCATGCTC
TATATTTCGTTTTTCTTTCGTGTTTACTTTTGTAGAATCCTACTAAAAAT
GATGGAGGTGACTATAAAGCATCCATCAAAAACAAATGGGGAACGGACTA
TACTACGTGGGTACTCGGATGAAATCGCTGGAAATAGAATGGCTAACATC
TTCATTATATAATTACCTTTTAATTAATAGTATTTTTAATTCAAAAAATT
TATTATCAATATATTTATTTGTCTCCATTTATATACTGTCATTTAATGTA
ATAAATATCAACATCTATATTAATAAAGAAATCTTTATCTGCATGTACAG
AGTGAGGGCTCAAAATGAGAAAATTTTAAAACCCATTTTCACTTCTACAT
ATTTTTATTTTGTGCCATTTTTATGTCAAACTTTTGAAGCAAAAGGTGGT
ATTTCAACAATTTTCTAACCTTTTCATTCAAAATGTCCTTCACCATCTGA
AATA back to top
|
