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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s1283 | supercontig | LSalAtl2s1283:27093..32689 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000001616 >EMLSAP00000001616 ID=EMLSAP00000001616|Name=EMLSAP00000001616|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=529bp
MMVTKQMLLLLVPLLIDLVSAENSDYCSFTRRHTACRAKGFGKKCGKVIN
SGLDENEIREILHAHNKLRALVANGQEKRGNPGPQPSSSDMMELEWDEEL
AFVAQKHADQCTFAHDCNNCRKVERFGVGQNLYISRQTLRSPKTDWSLGI
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QFLSNNQLSGSEEEKESCETEAHARELFSCNFVRNVSLESTPCDTKFSGK
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YKKKGANSLPLKVLAWPYKSRPGVVSIVRNSTSSRWIRAQITFRKILNFF
IITFKANGFGLTSTYLAIDDVILRDGECA back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1283:27093..32689- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000001616-697463 ID=EMLSAT00000001616-697463|Name=EMLSAT00000001616|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=5597bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1283:27093..32689- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGATGGTCACGAAACAAATGTTGCTACTCCTAGTGCCATTACTTATAGA
TTTAGTTTCTGCAGAGAACTCCGACTATTGCTCATTCACACGAAGACATA
CTGCCTGCAGAGCTAAGGTAAGATGAAATACATTAATTATAAAGCCTTGA
GGAATACATATAACGATAAATGTCTTCTTCTTTTTGTACTTTTTCAACAC
ATTACTTACTTCCATGATTAGACGATAGTGGTAATGTGAAGTAAGGAACT
GAAAATATCTTTGTTTTTAAAGAAACATTTGTGTTTATCTATCTATTTAT
ACACCTTTTTTTAAATTAACCTGGTCGTGAATGTTCTATATATATAACTT
CTCTTTGTCATTTTCCGATATATCTACATATATCAATTATTACCTACAAT
CTTTATTTGCGGTGAAATCTTTTTGTTAAAGAATAAACAAACTCTATAAT
TATTTCATTGAAAACTCTGATGAATGAAATATACGACATTGATTGGGATG
AGATGATATCTCTATTACATTTAAGTATCTTTGTGTATATAGACAACCTT
GCGCATTGATTTGTTAATTGGCTATAATTATCAAGATTAGTACAGCAAAC
AAATTACTACTCTTATTCATTTATTTTCCTTATTTAAAAAACAAAATGGT
AGACGGAGAGAAAACCGCAGGGCTTTGCAAAATTAATGTGGAATTAGTTA
TATATTTAGATTAGAGNNCTCAAAATTGGATTTGATCTTGTATATTATTT
TCTACCACTCTTATTCAAATATTGGTGGGGATGGAACATTGAAGAAGTTT
CTTTCAAATATATTTATATATACATATATTCCTAGTACATAAATTTATGT
TTAAAGCATTCTTTCTTAAAATCTGATATGGGTTTTTGTATATTTTTACT
CTAAACAATAAGTTTTCGAAACTATTATTTACCTATTTTTTTTTTAATTA
AAAAGGGATTTGGAAAAAAATGTGGCAAGGTAATCAATAGTGGCCTTGAT
GAAAATGAAATCCGTGAAATCCTTCACGCTCATAATAAGTTAAGAGCCTT
GGTTGCAAATGGACAAGAGAAGCGTGGAAACCCCGGTCCACAGCCCTCTT
CATCAGACATGATGGAGCTAGTAAGTATTTATTTATAATATAAAGTATAG
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TTTTCTGCATTGTTTTTTCTTTTCTTCATATATTGTCTTTATTGATGAAT
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AACAATAATGTGTTGAGCCTTGAATTTCCCTTTCTAAAAATCATTAAATT
GTATCACATTTTGTGCGTGTCTTCTCCTTTAATCAGGGGGGAAAAAACTT
AAGCAAACCTCCTGAGACGTTTTTTGTTATTGATATTTTTTTCAATTCCC
AATTCTATTTCGGATTGGAGTCACTATATATATAATTAAATATCAAATAC
GCAATTGATTTCCTATTCCATGACGATGTATTGCTATTTATGTCAGACCT
GGGAGGAATTAGTTGTTATATTTATCAATCCTTTTATATTCCTTATGATG
AGGAAATTTCCCTGGTTATATGTTATTTCCTATATAATAAATTAATACAT
CAACCCAAATATTTTTTTAGTTGGTCAAGTATGCCCTGATACCCTTTGAC
ATTTGCAAGCCTTATATTTTACTAAAAAAATCTTGTTTCTTCTTTCAATA
TCAAATATATTAACCTTTGTGTCTCAGCTTTCTCTCTGATTTTTTCTTGG
TTTTAATATTAGGTACAATTTACGAGCATCGATAGAGTAATTCTTGGATT
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TCATGTCTAATTACTTTTCAATCTATGCTTTCCATGTATTGTACAGATTA
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TTCCAATTCATTGAGTAAAATTTACATCTTAACTGTCGGTTTTGCTTTTA
AAGTGTTTATGTATGTTAAGGCCTCTAGTAAAAAAGGTACATTCACTATA
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GTTCAGAAAATTTTATAACTTAGGGGATTATTTTGGTTCATAAAAATAAG
AGTGTGACAATTTATATTGTGAAAAAGTAATATTGGTTTTTCTACAAATT
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AGAACAATTTACCCGTCCTGACCGGTCGGAAATCGATTAATGTAAATCCC
TGATCACTAGAAAAAAACACTTTGTAGGTTAAAAGTAGATTTTTGAGAAT
AATTATTTTTGTAGTAATATGTGTAGTTCTTCATTGTTGTTCCTCTAAGA
TGCATCGTTTGAATTATTGATTGTTTTGCCATTAGTCGATGTAGTTTTTT
TAAGAGCTGTGTTTTTTTTTTTTAATTCTAAATAATTTAATTTTAGAAAT
TTTTTTCCAAAACATTTAATTTTTCAAATTTGTTTTCAAAGAAGTTTCAA
AAACTAAGCCCCCCCCACTTCCAAAAAAAAAAACATATATATATATATAT
AAATAATTTTGCGGACACCCCTGATAATATGTATCATTGTTATCAGCTAT
AATACATTGAAATTCTATATTTGCACACTTGTTAAGGTTTAGTTATTTGT
TCATCAAAAAATATCCTTTTGTCTAATTCTGAATTTCTTATTCAAATTTT
ATATTTTTTAAACTTTTGCAACCGTTCCTGACTGTGAAGACAGTTGTAAC
ACTGGGGAAAAAAATATTCACTGGTATAAACTTCATATGTATTCAATCAA
TAGCAAACATACGTATGTAGGTATTTGTGTTCAAATTGGGCTAGTCTAAG
CTTCGGGCTAATTGAGCCAAAGACAAAAAGTGTTGCTATTATCMCTGCCC
CCCCCCCCCCTTATTGATTTGCTTAAGTCGTCAAACTCTTAATGTTACTC
ACAACTTGTCCTCTATGTGAGAGAAGAAAAAAAAGTTTATGACCCAATAA
AGTCTTTTTATTTATTGATAGGATCTTTACACAATATTTGCAGATGTGGT
TAGTATTTGTATTTTTGCTTTTATTATTATCGTTCTACTGATAATTGAAT
TCTCAAATAGTAAGGCTATTACTTCATGGACTCTTTTTTGCGATATTTTA
TGACCTTTACTCTCTCTCTCGCTTAATTTAATTAATCTGCTACCCTCTCA
TATCNNNNNNTTTCTCTCTCTCTCGCTAATTTAATTAATCTGCTACCCTC
TCATATCATCATAAACATATGGGTATTTCTCATTGAAAAATCTTTTGATA
CATCTTTGGAGGTCACATACTAACCAATTGCAGCAGGTTTTTTTAAAGCT
CTTGTTTGAATCCCTTCATTCTTTCTATCTTGTGAGTCATTATCTCCATT
CATAGTAAATAGAAAACATGACTCCTCCATTAAAGAACTTAATAATTTAC
CCTTTTTTTTTGTTCATAAAATGACTCCGGCCATTCAAATGATCGTGTTA
GTAATGATACTAAGTGTTTTGTAAATATGATTATTTACAGCTTTTCAGAA
TAATACATAATACATGTTTGTTTAACTTTACTTTCACACCATAGGAATGG
GATGAGGAGTTGGCCTTTGTGGCACAGAAACACGCAGATCAGTGTACCTT
TGCACACGATTGCAACAATTGTCGAAAAGTTGGTGCGTTCTCTATTATAG
GGTTTATCATATTTCATGATAATATTTTATTAATAACATTATGATTTATC
TAGAGAGATTTGGTGTTGGACAGAATCTATACATCAGTCGACAAACTTTG
AGGAGTCCTAAAACAGATTGGAGTTTAGGAATACAGAAGTGGTTTGATGA
AGTTACACTTTTCTCAAGGAATGATGTTAAGCCCTTTCGGTAATAACTTT
AATGTACACGTATTTTCTTTTATAAATAAATACAAAATGGGCGTGTCCTT
AGAGACAGCTAGTTCTGTCCAGGATGAATGCAGAACTGAATCCTTTATTT
ATACATACATACATAACATTTTTTTGTCTTGGGGCAAAATGTGGGTGCGT
AGATTGATTAATTTTATTAGGTGAGGATGCACGTTTATGTTTTTGAAATT
AATCATTTTTTTAAACGTATGTATGTAGTGCCATACCCTTACTCTTTCTT
GATCTCCTCCTTGATTACATATCTACCTATGTGTTAACTTATAAAAAATT
TCTATAATAAGATTTTCAGCTGAAATTGGTCACTACTCTGCCATGATTTG
GTCCTCTACGAATAAAATTGGGTGTGGAAAGAGTGAGTACCTCTCTGGTA
AATGGTATACAAAACTCTACACCTGTAATTATGGTCCTTCTGGTAATCTT
ATTGGAGGATCTGCCTATACGATTGGTTCWCCTTGTTCCGAGTGTAAGGA
CAGCGTCTGCTCAACAAAGTATCCTGGACTATGTCGTAAGTATTCTACAT
ATGTACATTGTACACTTACAAATGAACATACTGGAGGTTGGTTAAATTCA
TGTTGTCGGTCATTGCAGAATCTAATAGTGCAAGGAACTCCACATTGCTT
ACAAATAGTATTGATACAACCACAAAGAAGTTTAAACTMCCTACGACAAC
GACAACTACCACAACAACTACAACTMCCACATCGACAACAACTACCACAA
CAACGATAACTACTACAACGACTACAAGAAGACCCACTACTACGACTTMA
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AAAGAGAAGAAGMCCATCAACAACYCCAYCCACCACAACAACCAAGAAAG
CAGAGAGCTCCACTGTCAAACGTGAGACAACTCCTCAGCAGTTCCTATCA
AATAATCAATTGTCTGGAAGTGAAGAAGAAAAGGAATCCTGTGAAACAGA
GGCCCATGCTCGAGAATTATTCTCTTGCAACTTTGTTCGCAATGTATCTC
TGGAATCAACTCCTTGTGATACCAAATTCTCCGGAAAGGAATGGCTCTTG
ACAACCCTAGCAAACGCTCAAGGGGAGCCCACAGATTCCTTCTACGAAGT
CAAACTCTCAGAAGGGGAAAAAACAGAGCTCTACTTTGATAGAATCATTC
AGCCACCTCGAGGAGGTGTAGCCTGTTTATCATTTAGATACAAGAAAAAA
GGTGAGGCGAGACAAACGGTAATATCTAATGCATATAAGTAACTAATCCG
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ACATCTAGTCGATGGATCCGTGCTCAAATAACCTTTAGAAAAATCTTAAA
TTTCTTCATTATCACGTTTAAGGCCAATGGATTTGGCCTAACCTCTACTT
ATTTAGCCATCGACGACGTAATTCTTCGTGATGGAGAATGTGCCTAA back to top
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