EMLSAT00000001633, EMLSAT00000001633-697480 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000001633
Unique NameEMLSAT00000001633-697480
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s128supercontigLSalAtl2s128:1180855..1198962 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000001633 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000001633EMLSAG00000001633-684399Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000007143EMLSAE00000007143-716071Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000007144EMLSAE00000007144-716072Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000007145EMLSAE00000007145-716073Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000007146EMLSAE00000007146-716074Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000007147EMLSAE00000007147-716075Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto780501auto780501Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000001633EMLSAP00000001633Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000001633

>EMLSAP00000001633 ID=EMLSAP00000001633|Name=EMLSAP00000001633|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=587bp
MDESLDPRIKTLFHHPVQGREGEGEEESSSRKSGCGXYPADMKVLLKKWY
GIPKKDRGSIAMEDEEGREEISGGSFHPRPAPSSSCTSSSIYDIPKKRRR
FLDNSNMVDNHHLYHQQSRLSSALIPVYSSPPGADNEEELEEGEEEEPQN
LVMESHRESHARESEDIQNNNSSKNPSKQIKEEEQEGDDGIRDGICSWCL
HTLDQPRSSQFTMSILDDPTSNKNKIFCSERCFTLYRRAAFKKNKYCDLC
KKPTFSTACIQYQTSFEDKLIFCSESCLKTYKFEETSRREKLSNISASSR
RVLSDNLLAQSKAIPHQHKKSNKQSRRLQEKSHSQTPIVKIKPDIALKSN
ENSRKKQQNPRVDQIPPPSSSTNAPHTFHMIPPPSXLRQGXPPFLGMLPE
PTNSQPLXPLAALAGALAAASSSARPVIPSVSVPQPSRPSAFQHPPSHPQ
LLGSSSFPSPITLCPTPFFVPFPIPIPLLIPVPEKSFKGSSFFSGSESNL
NEQSPGTSQQMHVHATAATNTTTKVKMESPSPKSEENLPSIKTEYSTLEC
DNEERRRRKRASSSLVYISDHPNPAHSLNFAPSYERK
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mRNA from alignment at LSalAtl2s128:1180855..1198962+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000001633-697480 ID=EMLSAT00000001633-697480|Name=EMLSAT00000001633|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=18108bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s128:1180855..1198962+ (Lepeophtheirus salmonis)
AAAAAACATATCCTCACACTCGTGAAGAAAACTCCGATGCGCAACGTTGG AGGATTCAAGAGGAGAGCTTACATTTTGTTAGTTGTTGAAGATATCGTTT GTTGTATTCCCTTAAACAAGTGATCATCAACGAAACGGAATATCATTTTA TTCAACTTCCTTGTAATAACATTGCAGAGAAGGATCGCATAAAAATGGAC GAGTCTCTGGATCCAAGGATCAAGGTGAGATGGATTTGCATGGCATGCAT TTTATTTATAGATACATAATCTAGTTATACCTTGACATACGAGTTTAATT CGTTTCTGGACCGAGGTCGCAAGTCAAAGCAATTTATCCTATAAGAAAGG AAAAAAACCCTCTTGTTTTAAACTCTCAACCAGCTCGTATGGCAATGCAA TTTTTTTCTCCGAGTCCATTTTTGTATCTCAAGGTATTCTGGGTTTATCA TTATGTATAGTTACTTATAACAAGTGCTCGGTTGGTCCTTATTTATGACT AACGACTTCAATCCCTATAGTTCAGTCCTAAAACTTTTAAAATTCTTCTT TTTTAATCAGTTCTTGTGCTGACAGTCCAAATGACCGGCCCTATGTTTGG ACTGGACCGAATAAATAAGAAACCGACTTAACACTACTAAAAAGTGAAAA TGCGCGGATTTTTAAGCGTGCAAAGATATAATTGACTCATCTACTTGTAC ATGTAATTTTTTTGTTTAACCAAAAGGAAAAAAAAATGACAATTATAAAA TGTCAATTTGAGGTTTTATTGAGGCTTTTTGTATTTCTTGTCTACTCACT TAACCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTTGTTCCTCTCCATTCAAAGTAGTTCC TCAATTTTTTTTTGCTATAATTGTGAAAGAGGAGAAGACGAAGGAGTTAG AGAGACCTCCTGCTACTTAATACCATGATATCGAATGAAAACGGTCGCAT TGGGTTACGGGTTCAAATAAAAAAAAATAAAAAAATGTGAAAATATATAT TATTACCATTATACTTATATGAAGTAGGCGCTCGATGAAATACGATATTT TATTATTATACAATGTTATCCACCAAGAAAAAATACTTTGGAGAAAAGAA GAGAGAAAGAGATAAACAGTAAAAAATGAGGAATAATTATAATTTTTATT CGTCAATTGATTATAAAATACAAAAACCAGAAATGGAACTAAAAACAGTT CGACATTTAACCTTTTAATTTGCAAGTATGTATAATACTTAATGTGTAAT TTGCTTATAAATACAATTTGTATTAATTCTTTTTCCAAGTTTTTTATTTT TTTTTCTTCTCTCTCTCTCTCTTTCTTATATTTTTCACTACTCGAGTAAT TCGATCTTTGTAAAGAACTGAAACTCGAAACTCACATCATATACATATGT ATATATACATATATGCGTGTAGTGTATAAAATACTTAGTACTTGAATGCA TTTGTGAGAAGCTCAAACCAAATTCTCCCCTTAGAGTACTAATATCTTAA TAAATAATTATTGTTACATATTATCCGAGTCAGTCAAATATGATGTCTAA CTATTGGGGGGTTTATTTTACTCATCTTATTCCACATTTCACATCCTCTC TTCTTTATTCGTTTAGGTACATCCTCATCGTTCATCAATGAGGGGGTGAA ATTCAATTCCAAGCTCTCATTTTACGCCATTCTTCCTCCTCCCCCCCCCT TTCCCTGTTTAGAACAAATAAGGGTCTTCTTTCTTTACTTCCTAGCTGAG ATGATCCGTACTGTTAATTTCTTTTGAAATGCACCTTGAAATAGGATTCA TTCAAAGACCATAACTACCCCCCATATGTGGTTTTATTAACCTAAAAGCA CTATTCAAATATAGTAAAGAAAAAAAAGTTTTAATAAATCTTAAATTAAA TTTGGAAGATCCGCGTATTGCGCGCACTTCTTTTAATTTTTAAAAATATA CACAGAAAAAAAATTTATCCAAATTCTTTATTCATTTTGAAAATTTTCCA AGGATACTCTCCCGTTTTTTCTCCAGGAATGACTTTCGAAAAATATGTTT TATAATTGTTATAAGTGTAAAATAATAAGTTGTGTCTTTTGTTTCAAATT TTGACTGAGATGTATGACCTATACATAACCTATTGTATAGGCCCTTTTTT TACCACTTGAGATTTTTCGCAACACCCGTAATCGAAATTTGAAAAAAAAA ATAAATGAAAAATAAATCGCCGTATCATCAATAGTGACGTCATCAGGGGC GTCTGCATGATTATTTGAGGTTGAATGAGTTGGGAGGCTGGACTTTTTTA ACAAATTGAATTGAAAAGTTTTTGTCCTATTTTATCATTGCCAAATTTGA CAAATATACATTTTTTTTTTTGGAAGAGACTCGATTCTTTTTTTATTTCA ATTTGAGAGTTTGAATTTTTTAGAAGAGACTAAATTTGAACAAATAACAA CTTTTAAAATAAAAAAAGGGGGAAATGATTTTTTATTTCTCGAAAATTAC TTCTTTTAAAATATTTTAGACAAGAGGAATTTTAACTTCCTAGTGATAAC TATATAAATTCTGCAAAAATGTAGAGCTATGACCCTTTGGCCCTAATAGT TCCGGTTCCACTTTCTTGTATTCAAATTTCTTGGAGGAGTTGAAATATTC AAGAATGCAATCATTCTATAGTTTAGAGTCTTCACTTGAATTACGAAACT AAATTCGTTCCCAGTATGACCATTCAAATATATCAAATCAATTTCTAATG GTGAAGCTATTTTTATTTCTTCATGTGTAATTTGTAACGTCTCCATTGGA TTCATTAGAAAATCATTTGTCATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNAATCATTTGTTCATAGAAATTAAGGAATGATTAATC TTATAAAGATGTTACAAATTGCACTTGAAGAACCAAAATTTCATCACCAT TAGAAATTGATTTGATGTATTTGAATGGTCATACTGGGAACGAATTTAGT TTCGTAATTCAAGTGAAGAGTATTTTAAATTGTGCACCATTGCTTTATGG GATATGTTTTGAACTCTATATCGGTTCCTTTGTTGCGGCAACCTTCTTGG AAAGCTGTGGACCAAAATCAGCATAATCGACTGATTAACAAGACTATGAA ATTAAAAAAACAAAAAACAGAGATCCCTAGAGCAACGATCCTTGATCTAG TTGCACGGAAAAAAATACTAAGAATATTTGTAGATTAGAATAGGCACATA AACTGATTGTGTAATAATTTTCTACAATATTTTTTTGTGTTGTCGCATAA CAAAAAATTGGCAAAAGAATTAGTTATATTTTGATAAAAAATGAAGGAAA ATACAATTAAGCCAAATTTGATTAATGTTTAGAGGTAAATTTCAAATTTG TATAAGAAAATAGTATTTTAAATTTAAATACAAACTTTATAGGGTTATTA TTTTTATAAACACCCGGTAGGCCAGGCAATTGGCCCCCTAAAAACGTGAC ATTAATTATGACATAAGCTAAAATCTTATGTAAATCTGTGTCCGTGTTCA TCATTTTATTATAATTTCAACCCTGACTGTTATATGTGTGTTCAGATTGT GCAAGGGTAAGCTATCTGTGTCCTATACACAAGGCTGGGACTTGTAATCA AGGCTGAATGCGGCCATATTGAGTAAGAGAGTCGAGGAAGGATTATTTTT TGGTTATTCAACTTTGATAATATTTTTAGAATTTTCAAAAAGTGTTGCGT TTTAGACGGAGATACTTGTATACAAGGGTCGTTTGAAAAGTTTGTGCATA GTCCGAGAGATGGCACTAATGGCCGCGTATCGAGGTTATGTTTAGTTAGC TGTTCAACAGTCCTGTGGATTCTTTTGGATCTGCTGCAAACCGTCCTTGC AACACTTCACACGATTTCGTCTTTATTCTAGCGTGAGCACCCATTTTGCA GATAGATTTCTCATGTCCAAATGTTGATGCAAAATATTATGTACCCATTC ATTCGAGATGCTCACAGAACTATTAGCAATTTCACACAACTCACTCCTCT GATATCCATCACCAAATCATGCATTTTATCAATGATTTCTGGAGTAGTAA CCTCAACAGGACGTCCAGAACGTTCATCGTCACTTGTGCCTATGGGACCA CTCCCAAAATTTAGAAAATAGTCATAAAGGGTTTTAATCAAAGGTGTTGA AGCCTCCATAATGTTTATCAAGCTTATTCTCCTAAGACGTTTTGCTTTTC ATAAAGTAATGTTTAATCTACGTACGAAATTCTTTTTCATACTTTCTTTG AAAATCAATTCATTTCCTCTGTTCAAACGAAGACCAAACAGAAAGAAATT GACCGATCAGGCAGAAAGTTGTTGTGTATTTTTCCAAGAGATGCTTCTAC CTAAACAGTACTTTAACACGGACCAGTAGTGCCATCTCTTGGACTTTGCA CGAACTTTTCAAACAACCCTCATATATATTGTGTGCACAATATACCTACA TACAATATTTAAAAGTAATGATAGTTCTAATTGAGAAATAGAAAATACAA TATAGATGGATCATCTATCATTGTTCGTATTGTTTCGTTGTTACTTTAAT GGAAGAAAGGAAGGAATGAAGACCCTTGTAAATTGAGATGAAATGAGTTT TATCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCAAGAACATAAAATAAAAATCACAGAGC 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AGAATTAGCTATTTTGAAACAGTGAACCCTTCCCAAATAAAATATTAGAT AATAACTCTATAGTTGCGAAGCATGGGCTAACTACCATCTCATACTTGGC TTTCTTATGTTTATATCGGGAGGAAATTTTTTTTGYTACTACAAAGGTAT CGACGTGTTATAGCTTTGCATTYCCCATTAGATAGAAATGGTATTTTTGT AAAGAACAAACAAAGTTTAACGATTAAAAAAGGAATTTTTTTTTCCTTTT TTGATCATAATTCAATTTGTGCTAACATTTATTTTTGAAGTAAGCATTCT CGCCGTTCTTTGGTGTAAATTGTTTTAAAAGTGCATAARAAATTTTATTT ATTCGTATTTATATATAAGAATAATATTCTNNNNNNNNNNCTATTTAAAA TGTGAAAGGTTCTATGCTTTTTAAGAGTAATTCCTTTCTCTCCATAAATT CAGTAGTACCATAACTCTTACTTTCGCCCTCTCCTTGTGCTCTGGAAATA TACCATCCCTAGTTGTTCTTTTCCGAATCTGTTTAAACATCTGTAAAAAC ACTTTTGACTGCATATGAGCAGAGGCGTGAGCAGGGGGTTGGCTGGAGCC CTCCCAAATTAAGGAATTTTTCATTTTAACTAAAAAATTTAATATTCGAA TTATTTTTCAAAAAATTTGATATTCTAAATTTAATTTATAAAACAGCAAG GGATTTTTGAATTTTTTTTCCAAAAAAATTTATATATTTCTAAAAAGTAA GGGATTTTTGATTTTTTTTTTTTCAAAAATGTATTTTTTTGTGAATTCTG TGATTTTTTTAATAAAATATCCAGAAAATCTAATATTTAAAATTTTATTC CAAAAAATATAATATTTGATACAAAAATTTTGAAAAAAAAAATCGTTATT TTTTGTGAATAGCAGTGAATTTTTGATTTTTTTTCCAAAAACTATAATGT TTGAAATTTTATTCCAAAAAGTATAATGTTTGAAATTTTATTCCAAAAAA TATAATATTTGAATTTTTTTTTCATAAAAAAATAATTTCTTGGGAATAGC TATAGATTTTTGATTTTTTTCACAAAATGTTATTTTTTTGTGAATTCAGT GAATTTTATAAATAAATTCCCAAAAAAATCTAATATTTAAAATTTTGTTT CAAAAAAAATAATTTTTTGTTAACAGCTCTGGATTTTGAGAAAAAATCAA AGTTAATATTCGATATTTTTTCCAAAATCGTAATTTTCTGTGAATAGCAG TGAATTTTTGAATTTTTCTCCCCAAAAACTATAATGTTTGAATTGNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NTTTCTTGAGAATAGCTAAAGATKTTTGATTKTTTTSCAAAAATRTAATK TTTTTGTGAATTCATTGAATTTTATAAATAAATTCCCAAAAATTTAATAT TTAAAATTTTGTTCCAAAAAATATAATATTTCATATTTTTTTCCAAAAAA AATAATTTTTTGCTAAAAGCTCTGGATTTTGAGAAAAAAACCAAAATTAA TATTTGATATTTTTTTCCAAAATCGTAATTTTTTGTGAATAGCAGTGAAT TTTTGATTTTTTTCCCCAAAAACTAGAATGTTTGAATTGTTTTCCAAAAA ACTATAATGTTTGAAATAGTTTTCCAAAAAATATAATATTTGAATTTTTT TTTCATAAAAAAATAAATTTTTGTTAACAGCTGTGGATTTTGAAAATTAA AAAGAAATTAATATTTGAAATTAATTTTTAGAAATTTTTTTTCCAAAAAA TTAATTTCTCGAGAATAGCTATAGATTTTTGCAATTTTTTGTGATTACCA ATGGATTTTTTGAAAAAATTTCAATTTTGTAATTTTTTTCAAGAAATTCC AAAAACCAAGCCCCACTTTCAAAAAAAAAAAATATATGATCCTAGGGACA CCCCTGATGAGGCATGTTTTGCATTTGTAGAATTGATGCAAAAAGCCAAA TAATGAAGACAATAGAACCAGAAATACTATTATGTATAAATAGACAGTAC ACTGACTTGACTAACAAGAGGAATAGGAGAAGATCTGAAGCTTCATAGAA GGGTTCTACAATTACTTAATTATATATAATATAATATGTGTATTTATTAG GAAATATCAAATTTTCCCCCTTGTTTAGTTGAATTAGTTGTAGGGAGGTG GATATTTGATATTTTTTTCCATTTGTTTGTCAAAAGTTATTTATGCAGGG TTAGGCCTACATACTTAGGTGATTGTGGCTTTTTGTTACTTTGAGGGGGA CTCACTCTTCAGTGTTCATTAGAGATGAGTTGAAAGTTCGAATCGTACTC ACTCTGGATACATATATATGAGTTGTACTCATATCATGTACATAACATTA TATACCTACACACGTATGATGCCATTTTATATATTTATATTACATTATTG TCGTAACGTATCTTATTTCCTAATGCCGCTGCTGCTATTTTGAAGGGATT GAATTTCACAAAAAAAAATAAAAAAAATAGGTTCTTAGGTATCGTTTTCT CTCTTCTCTTTCCTTCTCTTCCCTTCTCTTCCCTTCTCTCTCTCTCTCTT TAGTAGTAATAAGGTATTTATTTATTCCCCTACGCGTTATTCCAGAAAAT AAATATATTTAATTTGTTTACCCCAAAATCATTCAATTCCTCTATAAAAA TGAACTACGATAGCTAAATAGCTATTATGAAACATATTCAGAGGATCTAG CTACTACGTACCTACTAATAATGGGATACAACTAATTGTAGAGTAAGCTG ACACCCAGAGATTTGATGATGAAAAATAAACGGAATCCACTAACTAGCAA 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TCGTCAAATGACGAAGATACATGAATCTTATTTCGATATTTGATACTTGG ATTTTTTAAGACAAGTATAAAATAGACTTTGTGTAACAATAATAAGTGAA CGTATGAGTACATATGTACCTATTATTTTTTGTATCCGACTCCTTGTAGA ATGGATTAGTCCCTGTTTGGTTATTATAATACATTCATATATATATTTGA TATTCTATTTTGGTTAGGTTTTTATTTTTAATTGCAACAATAAAATTGAA TAAAAGTCTCGTATTACTCAATATTTAAGTAATAAGTATGTTTCGTGAAA GAAAGAAAAAAATTGTGCTTGTATATACCTTCATTTGTATATATGTATGT ATGTACTAGATATAAAAAAAATATCGAATAACAGAAAAATTCGCAATAGA AAATTCTAAAGGTTGCAGTTTTATGCAATTTACAAGAAATAACTCTACTC CAAACAAATATGCTATTCATTAGATAAAGTAAATGGGTATCTCCTGTTCT GAAATGAAAAATAACTTGTTATCCCATAAGTGCAGATGGGATGTATAGCG ACCACAAAAGGAAAAACTATCTCGTGGCGTGTTAACGTCTCCCTCTAAAA AAAGAGTTCTCCACAATCTTTGGTGTAAATTGATTTAAAAATTCATTGAT TGCATAAATACAGATGTATTTGAATATAATTATAATATTTTCCCTTCACT TGTGGTATTTTAAATGTGGAAGGACCTCCTCCTTAAAGCAGTCATTCATT TCTCTCCCCAAAATCAGATAATAGGCAGCATACATTAACAATGGTCTTAA TTCAGGTGTAGCATATGTCTTCCTCGCACCTTTACACATCTCTMCCCATA GGTAGYCCCGTAATMAAGCCTATATCAAAGGATATCCGGGCACTCCAAAG ACCATGTCCCTGATTAGCTAGAGATGGCATTTTCATAAATTTATTTTTCA 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