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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s128 | supercontig | LSalAtl2s128:1180855..1198962 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000001633 >EMLSAP00000001633 ID=EMLSAP00000001633|Name=EMLSAP00000001633|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=587bp
MDESLDPRIKTLFHHPVQGREGEGEEESSSRKSGCGXYPADMKVLLKKWY GIPKKDRGSIAMEDEEGREEISGGSFHPRPAPSSSCTSSSIYDIPKKRRR FLDNSNMVDNHHLYHQQSRLSSALIPVYSSPPGADNEEELEEGEEEEPQN LVMESHRESHARESEDIQNNNSSKNPSKQIKEEEQEGDDGIRDGICSWCL HTLDQPRSSQFTMSILDDPTSNKNKIFCSERCFTLYRRAAFKKNKYCDLC KKPTFSTACIQYQTSFEDKLIFCSESCLKTYKFEETSRREKLSNISASSR RVLSDNLLAQSKAIPHQHKKSNKQSRRLQEKSHSQTPIVKIKPDIALKSN ENSRKKQQNPRVDQIPPPSSSTNAPHTFHMIPPPSXLRQGXPPFLGMLPE PTNSQPLXPLAALAGALAAASSSARPVIPSVSVPQPSRPSAFQHPPSHPQ LLGSSSFPSPITLCPTPFFVPFPIPIPLLIPVPEKSFKGSSFFSGSESNL NEQSPGTSQQMHVHATAATNTTTKVKMESPSPKSEENLPSIKTEYSTLEC DNEERRRRKRASSSLVYISDHPNPAHSLNFAPSYERK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s128:1180855..1198962+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000001633-697480 ID=EMLSAT00000001633-697480|Name=EMLSAT00000001633|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=18108bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s128:1180855..1198962+ (Lepeophtheirus salmonis) AAAAAACATATCCTCACACTCGTGAAGAAAACTCCGATGCGCAACGTTGG
AGGATTCAAGAGGAGAGCTTACATTTTGTTAGTTGTTGAAGATATCGTTT
GTTGTATTCCCTTAAACAAGTGATCATCAACGAAACGGAATATCATTTTA
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CAGGCGGCTTTAAGGAAAATCAGCTATCTTTCAATGCCTAAAAATATGCT
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TAGTATGAGGACTTTGATCCAATCATGTAACACGGACAATTTACAAGTGA
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GGACTTCAGTCCTTGATAAGTATTATCAGTCCTATTATTGATTATTTTTA
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AATAACTCTATAGTTGCGAAGCATGGGCTAACTACCATCTCATACTTGGC
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CGACGTGTTATAGCTTTGCATTYCCCATTAGATAGAAATGGTATTTTTGT
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TTGATCATAATTCAATTTGTGCTAACATTTATTTTTGAAGTAAGCATTCT
CGCCGTTCTTTGGTGTAAATTGTTTTAAAAGTGCATAARAAATTTTATTT
ATTCGTATTTATATATAAGAATAATATTCTNNNNNNNNNNCTATTTAAAA
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TACCATCCCTAGTTGTTCTTTTCCGAATCTGTTTAAACATCTGTAAAAAC
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GGATTTTTGAATTTTTTTTCCAAAAAAATTTATATATTTCTAAAAAGTAA
GGGATTTTTGATTTTTTTTTTTTCAAAAATGTATTTTTTTGTGAATTCTG
TGATTTTTTTAATAAAATATCCAGAAAATCTAATATTTAAAATTTTATTC
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TTGAAATTTTATTCCAAAAAGTATAATGTTTGAAATTTTATTCCAAAAAA
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CAAAAAAAATAATTTTTTGTTAACAGCTCTGGATTTTGAGAAAAAATCAA
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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TTAGGCCTACATACTTAGGTGATTGTGGCTTTTTGTTACTTTGAGGGGGA
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TCGTAACGTATCTTATTTCCTAATGCCGCTGCTGCTATTTTGAAGGGATT
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GTCCGCAGGATTATATATGTATGTATTATTTAGGGGTGGGGATCTACAGA
CCCTCCATCCACTCTCTGAGAATGTCCCTACTCACATCGTTACCCTTATT
GTACCATGCATCCTTTCCTCCAGAAAGAAACAGAAAAAAGGCCTGAAATC
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TATATAATCCCAGACTATCATTGTCATATTAATTCTTCATCTTTTTTAAA
TGAATTGCATATTATTAAAATCTACATAGTATTTGATTCGATCCTCTATT
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TTGTATATTATAGCCAAACTTTCTTCATAGAAATAATAAAATGGCCAATA
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GTTCTTTTGGAAACGGAGTATAAATATAGAATAACTTATTACTTTGTGTA
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AGGTAACGCAAGACAAGATGGTTGAAAAAAAAAGTAAACAAGAACGATGT
ATATGAATTATGTTCAGGATTTACGTAAACTCGATCAAAAAATATAGAAT
ATAAATACCGCTTCTAGATAATTAGGGTTATGTATTTTTGTTTAAAAATA
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GGTTTTAATGAATAGTTTATGTTTCTAGTTAAATCTAAAGAAAAATACAT
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TTGATAGCCATGACGCCTCTTGCCCTTATAGTCTCTTGTGCCTCTACAAC
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GGTGGTTTTACGCTCACCTCAATATGGACAATATTAACATACCTAGTTAA
CAGCCTTCCATAGTTATTGTAATACCCATGTCCTGAGCATCCTGAGCAAA
AAAAAGTTTCTAGTAAAACGTGGAAATTCCATTTTTTTGGGAGGGGGGGG
GGGCGTATAGTCCCTTCACCCAGTCTACACATCCTTACTTTTACTTAAAT
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TTTTTTTTTCTTTTTTTGAAGAAGTAAAGGTTAGGAGATTCAATAAAGAT
ATTGCTATATGAGGTCACAGTGCTACCTCACTCATATTCAAATTTACAAT
CGATCTGGTTGTCAGCTGTTTATTTTCCTTTATGATTGGTTGAATTTGAA
TTATTTATAGGGAATTTGTAACGTTGTTACCTTCAGTATAAATGACAACC
TTTGCACCAAAAAGAAACCGGACCAAAATCCGTTGGTACCTACTAATTAG
CAAATTCATCCAACTTTCCAACTATTGAATGGCTATTTTATAATTAGTCA
TGACTATCAGATGCAGTTTTTAGACCGCACGTTTTTTTGGAGTTGGCAAA
TTGAAGAGTACATTTTATTTTCCTAAGCTGTTGTCGTTATTATTTAATTC
CTGAGGAGTGAACTTCCTTTTCTACCACGTACAAGCTATCATTGATATAT
ACGTAACCTAATTGAACATTTGCGTGTGCTTATAAAGGGCACGAGAGTAA
CCCTGAAAATTTGTTGTGGAATTATAATTTCAAGTCCTTGTTGGGCACAG
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TATTTCCATATTCCCCTCGTCAACGCTGCTTGAGCTGATCCAATGAAACG
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ATGATAAATTCATAGTTGAGAAGAATCCACAATCTTCTGATTTTTGGGGA
TTTTTTTTCTATTTATTTTTGGAGATGCAATAAAGATATTGCCATGTGAG
GTACTTTTAAGAAACAAACGATGACCCCCAGATATAGAAATAATAAAAAT
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GGAGGAAGAAATATTTAGTTACTTCAGGATTTAAATATATACATAGGTAC
GCAAATCTATAAACCTATACCTCTTCTTCTTCTAATAACTAAATATGTAT
CTCATATGTTCCTTTCCTTCCATTTAAATACCTAATATCGAACCACCATC
GCAGATAACCAATGTATACATTTACTATACAGTATGTAATAAGATATTTT
TTATTGCTCCATGGTCTAGCATTTCTATTTTTTAAGGTTTTAGTATATAG
TTAGACATATATATGTATACATCTACAAGCTGTAACTTGTATACACAAAT
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ATCAGTCATTTTAATAATTACAAAAAACGATTAGTGTTTGGTCGGTCTAC
AAACACTAAAAAGAGTCCTGTCATATCAGTCCAACCCTAATACAATTTGT
CAGTCAATGACGTAGTTACTAACTACGTCATTTCAGTTGGAAAAGTTTCA
TCATAACGTCTTTCAAAGAGACAAGATGCTACAATTAATTTTTTCTACCT
TTTTGTGTTCTTTAATTCTAGCTAGGTGTGAAGGAAATAAAAAGATAGTT
TGTCCGTAGGACAGAAGGACCGACTAATCGGTCTGTAGGACCGTAGGGCG
GTAAAAGAGATCGGGCCGATGAAAAAAAGAAGACTAAACGGGAAGACTGA
TTAGTAAATCAGTCCTAGGATATCAAGAACTATACAATTGATTTTGATTT
GTGATGTTCCGCGAACTGAATTTTGCTGATTGAGTATTACGGTGTTTAAA
AAAAAAATAATACTCGAGCTAAATGGTTGAGTTTCAAATTGCTGTAACTC
AAAAATTACAAATAAATATATCATTCTAGCAGTCTAATATAAAAAACAGA
GACATTTAGACTGTTGAAATGAATTTGGCAGGTCCTTTTTATTGTAAACA
AATGGAAAACAGTATGATTTATAATGGAAAAGCTGGGGCGTCCGCAGGGA
GGGTATGGAGGAGCTGTATCCCCTCTCCCCAATTGAAGGTTTTTTTATCC
ATGACTAGGGAAAATTAATCATAAAACAGATGTAAATAATATTTTGAAGT
AGTTATTTTCTAAGAAAAAGGTTATTCGAACAATTTATTTAATGAGGTTT
AAATTTTAATTAAAATTTAAAAAAAAACCTACTCACAATAAATAAAAATA
TATATAATTCTGCATACACCTTTGAAAAGCTTAGCTCAGTAAATGCCAAA
TATTTGAGATGTTTGGCATTCACCCCACGAGTTACTGGGTGCGACCAAAA
AATCTTTACACATAGTTTTTGCTACATAAATCAAAGTTTTTGTGAATTGT
AAAATTGTTCCGGTCAAATACACAAAATAAACAAAAAAACTATATCTTCC
TAAGTGTCTTCAAAGCAGAGAAAATGTCATCTGAACGTGATCAAAGAATT
TTGGTTTCTTACCAACGGAAGAGAAGTTGTTACCATGGTCCAGACCAACT
ACTTGAACATGAATGTGGTGTTCTAGCATGATGGTGCGCCAGCAAAATCG
TCCAAAAAAGGCCCAGAAGTGGCTGGAGAACAACTTGTCTTTCCTGTCAA
AGAAAATGAGACCCCTTCTCACTTTTTGGTTGCATTTGAGTCCAAGGCCT
GCATCGATTCTCACCTAAATATTAACAATCTCAAAGAGACCCTCAACCAG
CACTGGGATGCCATGTCTGAGGACTACATCTTTAATGGGTGCAAGGCCTT
CCATGACCMCCTGGAAGTCATCATTGCTACCAAGGAGGGCTATATCGATG
ATTAGGGTAGCCAAGACACTATATTAGTTATTTTTATTTTATTGACATGC
CCTATTACAATGGTTGCCGAAATACATCTTGATAAACTTCTAAATTGAAA
GTGGAAAGATTTTTTCACCGCACCCGGTATAGTTGTTACTCGCCCTAACA
ACAATTATTTTTTTATAAATTCAATCTTAAAGAGAAGAAATACATTAAAA
AAAACTTTCTTCTATTGATTAATAATAAGACCCTCTTTACCGTTAAACGT
TATTAATCTTAACCTACTCGGATTAAGCAGATTTTTTAATCGTGAAATTG
TGACACTTTTTGAACCCGAATAAAAAAAGTACTGCACTGTTTTGAAAACG
TTGCCGTGTGGACAGGGTCTGAGAGTATATATTGCACAGCAATCAACATA
CTTGTTCAATGTGTTGGATAAGTTACAAGTAAATACTCGTCTTTTACATA
AATGAGCCGAGTTTTTGGTCTTCTTTTTTGTTTATTTTATAAAACTCGAC
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CGAGGTTATTCTGCTTTGACAAACAGACAGACAAATTTTGCTTTTTGAAT
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TAATTAGATTGTTATTTCTTAGATTAAGTAGTGACGTCGTTCTGTGATAT
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