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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s128 | supercontig | LSalAtl2s128:1324650..1365458 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000001639 >EMLSAP00000001639 ID=EMLSAP00000001639|Name=EMLSAP00000001639|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=548bp
MNNLLGSKFLSSEVLTVSDKRCRNPNWTDHEIVRFLEILQEEDTMKDLMA QRNKQVFCYVAQRLCSEGANKTWDQCRIKLKNLKSQYRYVKDRVPNLDIL DLEDEKVVKKLILDCQGRGISSASIKHLKYLKKFICKQNLLEEGDETISY YGTTSVTPTIIEDDPISSSPSSPKDTSNGTDNADEEPKTKKRKCDSNSMS SVQGEIQNAYRFIENFNKDMMEQFMEQQRKSQSSFLRWEQERFRLEQQAM ERWRQEARDHEKQLFGMFCHVMTQFEPHHQGNRRRSIHHLEDTNDGFINW EERCFKRGGRPVLNAWLSSQEELVYCIMQNFDFEEIQKELFLSKSGKGVN SDMFQSYCGXPMARSLPCVKNFLEASSQCLEEEEQNSLNVTMSMIESAVK FICHKRARRISLFLLSNGMECLKDHASAISTCINTSIPEILHMNNQKRFD LIVFNHRNCQKIDQIRHCIEKEMFKCPNPEPLRLLENFMSTIRKKTHCHR VSKYSLLSGSERTNSPSSPLIFLFFLLHYFLGLFFSKSDNDWWRGGLL back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s128:1324650..1365458- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000001639-697486 ID=EMLSAT00000001639-697486|Name=EMLSAT00000001639|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=40809bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s128:1324650..1365458- (Lepeophtheirus salmonis) ATGAACAACTTACTAGGTTCCAAGTTCCTGAGCTCTGAAGTGCTGACCGT
GTCGGACAAGCGTTGTCGCAATCCCAATTGGACGGATCATGAGATTGTCC
GGTTCCTGGAGATCCTGCAAGAGGAGGACACGATGAAGGATCTCATGGCA
CAACGGAACAAGCAAGTGTTTTGCTATGTGGCGCAGCGGCTCTGCTCAGA
GGGCGCCAACAAAACATGGGACCAATGTCGGATCAAGCTGAAAAATCTCA
AGTCTCAGTATCGATATGTCAAGGATCGAGTTCCTAATTTAGACATTTTG
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TCATTTGCAAACAAAATCTTTTGGAGGAAGGGGACGAAACGATTTCCTAC
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CTCTAGTCCTTCTTCTCCGAAAGATACCAGTAACGGTACGGACAATGCAG
ATGAAGGTTTGTTTATTTTGTCTTCGTTCCTGCTTATTTCATGTGGGAAT
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GTGTTAGACGGATCTTTCTCAAGAATCATTTCGAAGTCCCTTAAGGCTAG
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CCATAGATTCTCTGAGATGATCAATGTATCGTAGAGACTTTGCATACTCT
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GTTCATCAATCATCAGTGAAGACTAGTGTCATCAAATCATCGCTTATATT
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AATAATAAAAGTACTTTTTTTAATTAAAAAAAACCGAGTCAATTTAGATT
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TTGGGGAGGTTATATGCCTATAGATATTTATTAAATAGTTTGTTTTCTAT
AGGCGCTCTTTATAAAATAACCTTTTCTTTTTAAAACCCTTTTTTACCCA
TGTTCCATTCTTATTAGTATGGTTACTTGGTGTGATGATGAAGAATTAGT
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CCCCCCCCCCCCTTAACCCTGACGACTCTAAACCCCTTTTTGTGAGCCAC
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AATATATGTTATGTACAACAATGTTATAACTTGTACAAACTGCAATTTGC
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CTTCTCTGCTTTAAAATGTTCAATCTTGGGTGCTTTTTTTTCGCTGTACA
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TTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTATTGAGTCATTAAATTGTGAAGATGAAG
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CACAAGTTAGGTTCATCAATTATTATGTGTTACAGTATGTATTTTTTTAT
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TTGATTCATCCATTTTTTTAAATAAATAAATACACATAGTACGTACATCA
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ATGAACGGACAAATGGACTTATCCGATTATTTTAATACATATTAGCATGT
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GTACTACTTCACTGTAAAAGGCAGTCAACTATCAATTAAACCTTTAGTTT
GATTTGTGATAGAGCAAAGCTGTAGTTCCGGTGAGAGACCAATGGGCCTG
CCCTCATAATTTTTTCAGTAGTTGTCATTATTGGTCTATTAATGGCGAGT
CATCCATGGTTACTTCAACCAGCCAAATAACAAAAATTACGGCACTATAG
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ATTGTGAGTAATTTCAATGGAAGAAAATATTATCTTGTGCAATTTTTATT
ATATTCAGACGATAAAATAATTTAATGATAAAAAAAAATCCCCTGCAGCC
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CATTGCTTTCTTGGGTATGAAGAAACCCTTCTAATATCCCAAAATATAGC
TTGCCCCCCCCCGGGKAGCGCAGGKGAAGTGCTGGGCCCCAGGGGATGTT
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CACCAGTTCATCTGCATTTTTTTAAATCATTCAATAATTGGATTGTTCAA
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AAATTACGAATAATGTTTTTAAAATAAATGACAAATAACGACATCTAAAA
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GTTGTTTCAATGAAGAAGGGGTATTATTAGATAGTCTTCTCCGCTTCAAA
TAGAGTCACATGAAAAATACGAGATCCACATTTTCAAACTCGAATATTTC
TGAAATGTGGATAATTATTCGCGATTGTGAACAATCATCACATCACTAAA
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TTGCTTTTCATCGTTTTAAAAAAAAAAGTAGACAGTCATTTTTTAATCAT
GTTTAAATGAGAGGATCTTTAAATTTAATTAAGAGAGAAATAGAACTCAT
TTGCTTTAAAGCCTAATATGCATACATAATATACCTGAATTCATTTCATT
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CAACTCAGGTTTATACAGGCTGAGGACTCAAAAATTAGAAAATTTTAAAG
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AAGTTGGTAATTCAACCATTTTATACTCTTTTTATTGAATATGTCCTCCT
CCATTCTGAATGATGGCTTGAATAGGGGGCGAACAGAACAAGGTACAACC
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CTATGAGGCTACCAATATTTAGATGAGAAGTCTTGTTCGTTTTGCCCTCA
AAGATGCACCAAACATCGAAGTCCAGGGGGTTCACGTCGGGTGAGGACGA
AGTCCAGAAGTCTTCCGCGCCTTCTTGGACGTGTGTGCCGGGATGCAGTC
TTGAGTAAACACAATGCTGTCCCTGGGGAACGAGCTCTTCAACCATGGCA
ATACATGGTACCTGAGAACCTCGTTTGTATTGACTTTCTTATTTGCCTTG
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TATAACCTAAGTTGGCTGTTTGGTTGTGAAGGATTCTTGATTCAGCCTAG
AAGCTATCATTTCTCCTGTTCAGAACAGCGTCCACTGTAAAGATTTTCAT
CTCGGATATCGACTTGTGTGCCGTTTTGCTTGTTACTCAGGCGTTTTTGA
TTGCACAAAAAACAAGACAAACATCAAATTGTAGCTTTTTGTCAGTTGGT
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TAAAAGTACATATTATAGGAAATATTATATTTTGTACATAATATTATACG
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GAGGTATGTGGTGTATTCATCAATAATTATCATCATATTAAAAACTCTTA
ATCAAATTTGATTGGAGTTGCAAGTTTAACTGTGCATTTAGGATATGAAA
CGTTTGTATTTTGAAGGAGAGAGGGAGAGAGAAGTCAAAGAAATAGTATC
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ATATACTTCATTATTTTGCCAGTTTGTGTTGCCTTGACGTCAAAAATGCA
GTCATTTATATACTTTTTATTATTACTTATTTTTGACTCACGTCATATCT
AGACGTGCCATAGAGATGTACGCTGAGCAAAAGCAATGAAAATTTTTTGA
AGCCGAAAGTTAATTGACCAAAACAATGGAAAATAGTTATTTATACATCA
ATCACTTCAGATCTTATAGGGAATCATCTTATATTTCTATGAATACTGAA
GAAAATACACTAAATTAAATTTTTTAGAAAGAAAAATATTCTACTGCACA
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GAGCAAGTAATCGTTCGTTATCAAAATTTTGGATGATGTAATTGAATAAG
TCGTTATGAGACCTACTACAAATTGTAACTAACTTGTATAATCTGCTTAT
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AAAGTTTTTTCGAACCCCTGTCTCCTTAAAGGTACGAACAATGACGTTTT
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AAGTAAAATTGAGGATCGACACATCGGAAACATTTTTGCTAATGTGCTTC
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GACTAAAACAATGTTTTCATATGACATGTGCAAAATAATGAATGTATCTA
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GTATATAGTTTATTGAGAAAACAATATTTATGAAATATGTATTAAGAGCG
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GAGTATTCCGGGGGGCCTTACAATCATAAATTGTTTTATGATCATGAATA
ATTTAGGAACTTACTATGTAAATAAATACGAATTTGACCTACCTAGAAAA
AATTTGATATTATATATATATATTAAACTATATTTCAACCTGAGACAACG
TCTATTGAAACTGATAGAGGTTGCACGCATATCTCATATTAAACAAACCC
AGCTTCGGAGAATTATATATTTTATATAATATTAAAAAATATGCCATCAC
AACACATTCGTTGTAAAAAGTATGAAAATAAAATCATTCATGTCATTCAA
TACTATTGCGTAATGTTTAATTAAAAAGTTGGGAGTTTCTTTTGATTTGA
GAAGTTTCATAATTAATTTCCTAGCTAAAAATATATTTACAATTTTTGTT
GTTTGGGATATATTCCACAGCCAGCATTATCTGACTGGAAAGTGCGTTGA
TTAAATCTGCGTCTACATAAGTTGATCACTCCAAGTTATCTACGATCACG
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ACTTTTATTCTGGATCGATATTTTAATTGACTACAATTGTAAATAATAAT
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GCAACGCGCTTGGGGGAAATTATTTTCTTAAACTGAATGTGAGTTCGATA
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GGCAATTCTGAGGTTAGATGAAGTAATACACAAATGTTGACTTATTCTTA
GTCAGACCAACTCCATGCGCCCAATTAAAGGAACATTAATAGGCCGAAAA
AGACTTTTATAGCCCTCCTCCTGATTACAGCCTGGTTAACCAATAAAGTT
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AATATTAAGCAATTCACTACAACTTTGCTCTGAACCAGTAAAATACAGGA
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TATGACCGAACCCCAGGGGAAATTTGGTTTCGTACCAAGTCTCCTTATGT
AATATGAAAGATAATGCAATCACAGCACAACAGCTTACAGAGAATGAAAA
TAAAGTCATTAGACTCATTCAATACTATTATGCATCAGCAGTTTAGTTCT
CAAAGTATGACATAATATGTTATCTATACATTCATAGGCAAATAAAGGCC
TTAAAAATGGTGTATCAACATTAAAAGGAAAAACTTTTTCTTTTTTGAGG
TCGTAAACATTTTCCTCTTTCCTATTCTAACTTTCCCCTTCGCCGTTTTT
CTATTTTACATTTCCCTAAGCAATTTCTTGTTTCAACATCACTCTAACTA
TAGTATTAACATTAAAATACAAATGTGTTGAGTTAGAGAACTGAGCTGAC
AAAATGGTTCTCTTTCTTCCATTTATGTACAAAATATACATACATTATGT
GTATCTCATTTCCCGTAAAAATAAATCTTTAAATGACATGATCCCGGGAA
ATACCGTCATTCTGTTAGTAAATAATTAATAAATACTATGAAATTTTTGA
CTATTTCTTTTTAGATTTCAAAAAGAAATAATAAACTGTAAGCTGATTTT
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GAGCAGTTTTATAGTGTACTGTCGGTAATATTTGTATATAATTTTATGTG
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TGCAATTTGCTAACAGTGTATATATATTATATTAATATCCCATACGGTAA
TCTAACCATCTATCTATATCAGTGGTCGTGTAACTGTTTTTAGCGTTACC
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TGTAATTTACCCCTGTTCCAGAACCACTGATCTGTATGGTTAATTGAAGC
TTACAGCGTACATACTATGAGGAGGAATTGCACGAATAATTTTACAATAC
TTCCATTTTCAAACAAGGCTGCTACACCAATAAGTAGGGATTGGATGATA
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GCACAAATACTGCAAATATTAGTATAATTTCTGTATACTATCCTAGAAGT
CTAATATTTAAAAACTGAGAAATTCAGACCGTTGAAATGAACTTCTCTGA
TACATTTTATTGTAAAAAAAAAATTGGGAATTACAATTATTTATAATGAA
AGAATAGTTTCAATGTATAATTAATATTCTGTTGAAACGTAGCTCAATCG
ACAATGCACTCAGGACAAGTTATTATCTTGAACTTCATGTGCGTAGATTT
GCGCCCTGGTCGTTCCTAGAGAAGGAAATGTACTTTATGTATATGAACTT
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CTTATACTTAAAGAAGGGATCTATGTAAAGAAAAAACTAAATATGGCGAT
ATGAAAAGGAAAAACGGTTGACGCGTTTGCTCTTTATTGAATAAGTTGTG
GGCGTGTCCGCCTCTAAAAGAAGAATTATCGATTATCTTCGGTGTAAATT
GATTTCAAAATGCATATATTCAATAAATATTAATGAATTTAAATATAATA
ATAATATTTTTCCATCACTTAATGTTATTTTAAATAGTTCTCCACTTTAT
AGCTGTAATTCAATTTCTTTCCCCACAATCATGTAACCTGCAGCTGATAT
TAAAAATTATCTTAATTATGTAATACCATAAGTATCGTTCCCGCTTTCTC
CTTGTGCTCTCCAAAAAATACCATCCCTTCCAACAGGGCATGAACAAACT
AATAAAAAACTGTCAGGTAGGCTAGAGATACTGAGTCAATAAACAANTTT
TATATTATATTATAGATCGTTTTCCTGCGACATTATCTTTGGGGAGTATT
TTGAAGGAGACTAATATAACCAAATTTATAAGGATAAAAATCCCTCTCTC
ATTTCTTTTTGACTAACATGGAAAATAGGGAATGTATGTCATGTTTTTGA
TGTCCTAATCAGACTGACAGAAAGGGAAGAACCTTCATCATTTATCAAAA
ACATACTTTTATTTATTCTATCTAATATCCTAGTATGTAATTACATCATT
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TTTCATTATAAAAATCTTGCAATTTCTAAGAGACTTTCACTAACTATCCT
TTACTTTATTCATATATCCCTTTTTCCTTTGGCATCAAATTGTATTCTAT
ATAGACTATACATAATCTCTCTGTTGTGACATAAAAATCTCTACATTTAA
AAAAAAAATCAGTTGACACCATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCACCTTCA
AATTTATATTTTAGCTGATTAAATCTAAGATATGCCAGATATTCTGGATA
TTATAACATTGATAGAAACCATAATATTAAGAGTATAAAATGAAAAAAAA
TATTTATATATGGTTGAAAATAAGCTCAACATGAACACAGTCAGTAGTAA
CAACTCCATTTTGAAAATCGAATCAGATATAATTGCATTGCCATTCTAAA
GTAGAGATTGTGTTATTGTTATTGTTTTTAAAAAAATTTAGATCAATAAG
ATTTTTTTTTTTTTTGAAAAATGTATTATTTTCTTAATCTTAATCGGGTA
TTTACTTTTTTTTTAGTACAGTCGTTTTTATACTGTAAAATTTAAATAAT
CGTAAATAAATCAATAATTATTCAGCTACCTTTTTCATTGCAAGTTTTTA
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TACAGGACACTCCCCTATGCAAAATTTTACACTTTTATTTATATGAATAT
ACTGGTAAAGGGTTATCCAGTGTTGCTTGTGCCAACGAGGAAGCGGGAAA
TCACATTGACAATGGTTAATGTTATTTCTTCTTAATGTAAAAACCCCTTA
GTTGCGGACGAGCTTTATAATATCGCGGCTGTATATTTAATATATTTTTT
ATTAATTTAAGGAGAAAAAAAATGTTATTAACTTCAAATAACATACCAAC
ATATATGAATTAAAAAATTTGTGTAGATTAGGACTCACTCTTTTGTTTTA
GTCAAATCGAAATTCGTGAAGAAAATTGCAAAAAAAAACTACTATGCACT
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