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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s128 | supercontig | LSalAtl2s128:1707280..1719699 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000001650 >EMLSAP00000001650 ID=EMLSAP00000001650|Name=EMLSAP00000001650|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=467bp
MFLNKRGYLLKCLFTFKRKSNNMSNRNTTFSNISDEDLNNQTLLLNNYGE
DPFDDLLWDDATWIMCASFIVFTMQTGFGMLESGCVSLKNEVNIMMKNVV
DVVLGGVTYWAFGYGLSYGESYGTTPFFGVGKCRVYYSQFTLYLLIIYKV
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GVHLVGGTSAFVAAKMMGPRLGRWDINGDPPMGSPANAAIGLFMLWWGWL
AFNAGSTFGVSGKKWILAAKAXXTTFVASCAGXIFSVGYSFYTTNGKIDV
LMIINGILGALVSITAGCAIVTTFESIFIGIVGSFLSNITAGFLIWLKVD
DAVGATCVHGFGGFWSMLAVGIFAEKDSLDRVSNYAGLLHGGGFYLLGVQ
ILASVCLMLWAGIVTFLLIKVILILCSFYGLGHMNYLETNYGSKLLHDKL
IQIKRMQDVRSAFTKKD back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s128:1707280..1719699- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000001650-697497 ID=EMLSAT00000001650-697497|Name=EMLSAT00000001650|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=12420bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s128:1707280..1719699- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGTTTTTGAATAAAAGAGGCTATTTATTGAAGGTCTACTAATCATTATA
TTTTCATAACCCTTTTTCAGGGACTCGATACGGGAAAACACATGAATTAT
TCAGTCATATATTTTATTTTTTGCTATTATAAATCTAGTACTTAATTTCA
TCTTTAGTGCCTCTTTACTTTCAAGAGGAAGTCAAACAATATGTCAAATA
GGAACACAACATTTTCGAATATTTCTGATGAGGATCTTAATAATCAAACC
TTACTTCTCAACAACTATGGAGAGGATCCTTTTGATGATTTGCTTTGGGA
TGATGCCACCTGGATCATGTGTGCCTCCTTTATTGTTTTCACAATGCAAA
CAGGCTTTGGAATGCTGGAATCCGGCTGTGTTTCCCTCAAAAATGAAGTT
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CTGGGCGTTTGGCTATGGGCTGAGCTATGGGGAAAGTTATGGAACAACGC
CATTTTTCGGGGTTGGAAAATGGTGAATCTCTGGAGTGGTTACATTCTTT
GTTTTACTTATGTTTTTTTATATGTAGGTTTGTGAATGCAGAAGGTCTAA
AAATGGGACCCATCTATGCTACGTTTTTGTTTCAMCTCTCTTTTGCTACA
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATCCATTTCAA
AACCTTAAATAGTCATAATGATATAGGGACATGATTGGAAATTACTGTTG
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TATAAGTTCCTCTTTTTAGTACATCAAGTAATCTATGAGACTATTCTCTC
CTATGTGTTTCTTTACTGTCCTTTTAAATGACCTTATTGAAATTTGATAA
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AAATCTTTTTTTTTATAAAATATTTTAGGCATGTTGGAACAATTTTGAAA
AAATGGTTGGCTTTTTTAAAATTAATTTTTTTTCCCGAGGGTAAGGAACA
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ATATGAGTCATTTTTTTCTTTTATTATATAAAATAATATACATATATATT
AGAGTAGAATACAGCCGCCTGAATATGTAGTGTTTAACATTTTTAAAATT
GAAAAATTTTGTTCTTACTCACATATTTTCTATTGCAAATTTTAACATAG
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TATTGCTGAATATGTCTATTTTAATGAAAATTAATCTAAATATTAATTAA
GAACTAAAAAATTTAAGCGTACATTGTGATAAAATAATGTGGATATACTG
TTATATAACTTGAACTCCATACTTGAGGGATTTGATGTACTTTAGAATAG
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AAGGAATTGTTTCACAACACAAATATTTGGAGAAAATGAAATTTAGTGAA
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TATCTGAAAAATAGAAAGTATTTCAACCAAATAAATACAATTTTTGAACT
TTTCGTATCAATTAGCCTTTCTGGTCAAAATTTCAGGTAGATTATATCTC
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TTTCAACAAGATTGTTGATACGGCTGATTTTAAAAAATATAATATCTCAT
GAACCGCACAGAGTTAGAAGCTCAAATTTTTCATTAAAGCTAACTCTGCT
ACAAATTTGAAGTAAATCGAAAAGGTAGGGTGACAAAAGTGTCTTTTTCT
GGAAGATTTGATGCGGATTTACCTTTTTTTCAGCTGCAAAAAGACGATGA
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TTTTTTACATGAATTTGATACATAAAAATTGATGTTTAAATGAAATATCT
ATAGTTTTCTGAATATTGATTTATTCCGTCATACATCAACTTTCAGCTTT
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TTAATTCTGTGAAATGAGTGTTTTTAATTTCCAGAAAATTTTATTTCATT
ATTTTTGCAATATTTGCAAAAAGTTACTAGTGATTGCAGTTTATTTTTTG
ATGGCATTATTCTGCTTAACTTTTTTGGTATTTTTTGATTTTACAAGTAC
CATTTTTTTGTGTAAGTTTGTGTTCCTCTTTATAATACCAATTAATATTA
TTTCCTATTTTTTTTCTCATGCTCTTATTATTTTTTCATTATTGAGGAGA
TAACATCTAAATATTGAGTAACTACGTGTAAATCTGCTCAAGAAAAACGG
AGAGTAATATCAAAGATTTCTTGGGAGGTATATTTTATACAATAGAAGCA
AAGTTTTTCTATTTTTCGAGGCAAGGTTTTTCAGGTTGTTTCAATTAGCC
AATACACATTCCAAAATGACTCAGTCCGTAACCACACACCCGAGAGAACG
TTGGAATTGCTGCAGTCAAATGTCAGCCTCAAAAATGGCCTCCAAATAGC
CCCGAGCTAAATATTTTTTTTTTTTGTGAGAGGGTCTTGAGTCCGAGCTC
TGCTCGAACCCTAGTAACAATGTGGTCTGTCTAATGCCTAGTATTAAAAT
GATTGCAGTTAATTTGGAAAGGAATGAGGGGGCATAAACCTTCAAGAAGT
TCATAAACAAGAGAGAGGTTGAGCACATGGAATAAAAAAATATTTGTTCT
TGTTTCTGTTTTATAGTTAATCTATAATAAAAATTGTATGACTGACTCCA
ATTCCCTTTTTTATAATCTTATTGTCTCAATACATAAGTCTCAATTTATT
GCACCAACACTTTAAACATTTTTTTTAAAATTTACCATTGCCGAGAGTTT
TGTCTTTTTCATATCTTTATAGCAGGGTATATTATAGTCAATTCACTTTA
TATTTATTGATAATTTACAAAGTACCATTTTATATAATTTTCAGATGCAA
TTTTTATGCGTACTGTCTTTTTTCATTGGTTAATACGGTGGTATACTGTG
TTCCTGCAGGATGGCTTTGGGGAAATCATGGTTTTCTGAACACACTTGGG
GTTGTGGATATTGCAGGAGGTGGAGGCGTTCATTTGGTTGGAGGAACATC
AGGTACTTATGTTCCTAATTCATCACATAGTTTAAAATGTGTATACAAAG
TTCTGCATTGCTAGGTTAAGCGAAATAAGTCCATGCAATCCAAAACAAAT
GTATGTCTTGGTTAGTCTCGTAGATATTGTCTAAAAAGGTTACTGCAATG
TGTGAAATTATCTTTTTTTCTTTTGTAATGGTCATATTTGACCAGGCCCT
GTTTTAGTGTGAGCTGGGCTGGGTCAATTTTTTTTAAAATTGGATTTTAA
TAATAAACTTTTTTTTTACGAGAAACAAAATATTTTTAGAGGGAAGAGCG
TTTCATTTATTTTCTATAATTCCCTTTTATAGCGTTCTTATACACTTTTT
TAATAATTTCTGGCCATATTTTATTTTATGACTACAATTTCGTAGGTCAA
ATGGATTAATTGTATCTACATGTAGCTACTTTGTGCAACTGAATCTGACA
ATTGAGCAAAAATTGAATTCTCGGATATTGGCTGKAGATTTTTTTTGACT
CTAAATTAGAATATTAATCAAATAAAAGAAGAAATTGCATAAGGATGTCT
AAAGGAGTTATTTTTTTTTTTTGTTGGTTGATCAATTTATTTTATGTAAT
CAAAATAATAATGAAATTAAAAGGTCTTTTAATTTCTTAAGATAATCAAA
TTACGAAACTGTTTCATTGGATAACTAATTTACTAATGGTAATTTTATAT
AATACCATTAAGTTAAAAAAAAAAGGTCTGTATTTCATGTACCGTATACA
ATATTCCTTGGATACACGTTACTAGACTGTTTCATCTCAGAAAAATAGTT
ATAACATCAATTGTTTTACAATACATAATTTTTTTTGCATTGTAGAAGGT
TTATATCCCACACCTTGATAAAAAAAACCTGAATTTGAACAATTTGCTGA
TTAATAATTGAGTTTGCACCTGCTTCTGTCTAGGGCACAATCCCTTCCCA
AAAGAAAAAAAGTTTAATACTACCCTCACTTCTGTCAATCATGGAAATGA
AAACAAAGATACAATTTTCTCCTTGTCATCTCGTTATTTTCCCCAAAAAA
ATTATTAATGATTAATATTGCATACATTAAAAAAAACATGAAAATGTTCT
AGGCGAACTCTTGGGTCTCATCCTTTATTGTGTTTATAAAAAACTATAGT
GAGACTTGAATATTAGATAGATCTTATGAGTACGTTTTATAACTCTGAAT
AAATCTCTTTTGTTTTGTCAAATTAAAATAAAAGTTGTTCAGAGTTCTGA
GTTACGTATGTACCTAAGGCTTTGTTTCATTTTATGTCTAAGGGCTGTAG
TTGTCTCTGTTTTTCAAATAAATACCCTATCTTATGCATTTTATAGGTGG
ACGGRCGGAGATGTGTACATACATCTACTATAATTTTATATTATAGTAGA
TGTCTCAAAATTATAGCAGTTTTGGTCAGCCATATGCCTTCGTGCTAGGT
TCCAATTGATTTAAGAGGAAAGTTGGAAGTAAAATGAATATTTCCTGACG
GATTTGTCAAGGCAATATAGTTTAAAGTAGCGTTGGCCTTTACTTAAATA
TCCCAATATATCGTTAGTCCTTTGTTTTTCCTTTCCTACAACAGCCTTAC
AATGAACACTTTGCATTTTGTTAAGTTCAAATTTATATATTTTTTATTCA
GCGCTTATACAGGGTGTGTAATCTATCTATGTTGTCACTTTAGCTCACTA
TCTTAGAGAAATGCAGGTAGATAGCCAGCTAATTTATTTTCTTAGATAAA
TTGTTCAAACCTGCACTAGTTGGAAAAATGGAATGAATTTCCGAATTCGT
TACCCCAAATATTTGGAAAAAACACGGAGCCCTCCTTAGAATCCACACTG
GGAGTAACAAATAACAATTACTCAAACTACAGTACTCATTGAGACGCTTA
TTCACAAAGGAGGGAATTTGAGGCCTTTAGGGGTGATTTTGAAGTAACAA
CAAAGCAAAAGTTAGAGTGACTGTAAATGTAAGTTTGGAATCTATTAAGC
TTTACAGAATCTTGTTWTANNNNNNATCTGATATTACTGGTTGGAGAGAA
AATTGCATTTGATAAAAAAAAGCATTTTCGTAGAATAGATACCTAGAGCA
CCCCTGTACATATTTTATTCTCGCTGCCCACCATCAAATTGTTTGCATAC
TTCATTCAATGTCAATTCATTCATATGTCAATGACACACCATCCATTTAA
ATAGATTTTGAAGGGAAAGTTCAAACCTCCCTCCTATTCCAGACCAAATT
CCTACATTAGTGTTACAACCATCACATGGGATAGCTACTATTGACTCTAA
GCTCACGGGATTTTCTTGCACAAATAGTGCTTCTCTTATCTGATCCTCCA
ATTTTCCACCTCTTGGTGAAATATGACTTGATTTATATATTCGTATAGGG
CGCTTAAATGAAAAAAAGACAAATATTAATTTGTTTGCTTATCGTTTTTC
AACTTCAAAAAAGAGTGATAAAGTTTACTACAGTTATTTTGAATTTCTTG
TTTCCAGTCATTTATGTTACAAATCCCAATTTTGTATATTTTAAGTAATA
AAAAACTAATCAAATTGAAACAAATTTATATTAGTCTACTTTTATTGATG
ACCATACACTCCTAATTTTAGTGGGAAATATATTTTTTGATCAGATGGTA
TCATTTCTTCTCTCCTTCAACACTTTTTACCATTTTGATGTGGTCAATCT
TGTCAAAAAAAAAGAAGAATTATTTCAACAATTCCCCTTTTGAGAGTTTG
GTATGAATTTTCCTGTACTTTGTTTTTTCCTTTTTAACTTTTTGAATATC
AAAGATATTTGCAGATGTAACTAATTAAATATTTTCTGTAAGAAAATTAC
ATTTAGCGAATATTGCTGCATCTGACAACTGAAATCTCTCGTAAATTATT
GCAAAACGAGGGTAACTAACCTTGTTATGGTAAGATTTCTTGAATTGCCT
TACGTATTTTTCTTCACAATCGATGCTTTTACTTGCATTTTTAGCTATAA
GGACAATTTTCATGTCTACAAAATCTAAACGGATTGAACAATATCACTTG
AAATTGACAGTTAAAATCAAAATATTATCATAAATATTCCATTAAAGAAA
AATAAACCAGTATTAAGTTGAATATTTATACGTATGTTCAATTTTTATTT
ATTTTACAACTATTAACGCCTTATTTATAAAAAACTAAAACAAAAATATT
TATAGCATTTGTAGCAGCCAAGATGATGGGACCTCGACTGGGCAGATGGG
ATATTAATGGAGACCCCCCAATGGGATCTCCAGCAAATGCAGCTATTGGA
CTATTTATGCTTTGGTGGGGATGGCTAGCTTTCAATGCGGGTAGTACATT
CGGTAATGCACACTTTCAGATATGTTTGAACAATTATTCCAATTGTTTTT
GTCTTGCTTCTTACATTAAGCAACCTTGCTTCACTCCAAATCAAAAAAAA
TATATTTACATATAATATATNGTCGTGTTCAAGTTAGGAATATGTAATCT
GTTCAAGTGGATAGCATACAAATTGCAATTTGCACTTTTCATAAAGTCTT
AAAAAAGTCAAAAATTACACGTTTAAAAAATTCTCAGTTCATTTTTGAGC
AACTTAGTGTCTAAATGGGACTGTTAATTGAAAGATTAACGCAGAAAATC
TTTGTACAGCGTTCAATTTGCCGCAAATATGTTTACAAAGGACAATTTGC
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AGTATGACAAATAAGTATCGATTATGTGCTATGCATGTCATATAGGTATA
TAGGTCTATTGCATAAAAATTTATTCTTTATACATTTATTCAGCGATTTC
AGTAAAGATTCGAAATGTATTTAAATCACATAAGACTGTGTTGTTTTTGA
TTCATAATTATTAATATCTAAAACTTTAAAAAGATTTATTTTTCTGCAAA
ATCACACTAATTTTTCACTTTAAATTGAATTAAAATTCACAATAATAAAT
ATCAATATATACAAGTATAATATTATTTTTTGGTCTAATGTCCCAAATGG
AACATTGGGAAAATGGAACGTTGCAAATAGTCTGCTCACGCATTTAGTCA
ATCATTTCTTTTTTATGTTATTCTAAGACATTTTTTTTTTGTGCCGGACC
AAACTTAAACAAAGTGGCAAAAAAAAGATCAAATCATCCATATTTATTCA
TATCAGTTGTCTATGTGACAAATATTATTCACTTGATTTAGGTCAGCATA
TATACATATACTTAATTTTATAATAATAATTTAAAAAAATCAAATATTAC
ATTTTTTAGAAAAAAAAAATTCAAAAACCTATTGTTACTCATAGAGAGTT
AATTTTTTTAGTATAAAAAATCAAAATTCCATAGCTATTCACATAAAGTT
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TGTATTTTTTTTAGAAAAAAAATTTAACTTTCAATTTGCTGAAAAAAAAA
ATCAAATATCGCATTTTTCTATAAAAATTCAAAAATTAAATATCAAATGT
TAAATTTTCTATAAAAATTTGTAAATATTGCATTTTTGAAAGAAAATTTC
AAATATCCATAGCTACTCAGAGAAAGTTAAATCTCTTGAGAAAAAAATTC
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TGAATGATAGATTAACTAACTTGGAACCATCAAGAAATGACATATGTTTC
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ATACGTCATAGATACTAATGTGTGTGTCTTCACCTTTGTAGGTGTTTCTG
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GCTTGTTATCATTCATGATGATAATCGGATGCCGTTTTTTGTTACCTTCT
TCTTTTTTTTTGAGTTMGTAAACTGAATTATGAATTTTATTTTCCTCAGC
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CTCTTTCATAATCGAAACGGATCAATGTACATCCCTATTTATTCCTTTAC
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TTGGATCGTTTTTAAGCAACATCACCGCTGGTTTTCTTATCTGGTTAAAA
GTAGATGACGCTGTGGGGGCTACATGCGTGCATGGTATAGTAGATCTTAT
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GATTTGGAGGTTTTTGGAGCATGCTTGCCGTTGGGATATTTGCTGAGAAG
GACTCATTAGACAGAGTTTCTAATTATGCAGGATTACTCCATGGAGGAGG
ATTTTATCTCCTTGGAGTCCAAATCCTTGCTTCAGTTTGTCTCATGCTTT
GGGCAGGGATCGTTACTTTCTTGCTAATCAAAGTAATTTTAATTCTTTGT
TCATTTTATGGTCTGGGTTTATATATATGTAAATACATTTATTTCAGGGA
ATCAATTTAATTATCCACTTCCGAATGGATCCGTATGAGGAGCTCCTTGG
AGCGGATTACTGTGAACATAATATTTTTCATTCAGGAGTTGGAGTAACGA
GAGCTGTAAGTGTATTGAGGACTCACAAGCCGGAAGTTGATTTAAATCTG
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TTTATTTTATAGATGTATGTAACTAAGTGTGTGTCAGTCCTTATCTATTC
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GAAGACTGTCGGTCCTTCTGACAGTCTTCAGTACCAGAATTGATTAAAAG
CAGATGAAATAAAGTTGTGTGACGTCATGAAGGATGAAACTTTATACATT
TTTGGTTTGATCTGCAGGAATGAACAGAACTGGACTGAGATTGAACTGAA
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GCATTTCCTCAAGATTTTCTCCATTACAAAAGTTCCATGGCTCTAATTTT
TGACTTGTTTAATGACGTTACAATAAATACATGAAAGCAATAAAAGACAG
AATTGTATAGTTTATGACTTAGAACACGTGATGGATTCTTTTATATTTTC
CAAAGCAGTTATCCTTATTTTTTTATTCTTGAAGAGAGACCATTTAATTA
GTCTAAAATAATCACTATTGTGTATGTTCTTGAATTTGGAGTGTAATACT
GAACATAGAACTGAACTGCAGACGCCTCTGTACAGTGTGGGATATGTATT
TATTTCCTTTCTCCTACCCCTGCTAGAAGCTGATCTAATAAAAAGTCATG
ACAATTAAGCTGCTTTCTTTCAATACATTCTTTCAATTGAAGGTTACCAT
GTCCTTTTTCTATTTCTTTTTTGTTTTACCATACCTATAAGTCATATTTT
ATACAAATTTAAATATATCTCCCCACCTTCTTCCCTATAATTTTTGTAAA
AATCATTATCAAAATATTCCAATGTGTAAAAAAAAGTAATTTTGAAAGTA
TGATAATTTTTTTTTCTCTTTTATTTAAAAAAGGCTGCCGATACATTTAA
AAAAAAAAATAGAGCAACGAGGGTATCATATTGGATGCCCATTTGGTAGT
CAATGAAATAGTATGAGAAAATTATTTATTGTATTTGTTTATAAGTTCTT
GAATTTTCATACTTTCTTTATTAACCACAAAATACATAATAATAAATTTA
AATTGGTAATCGTTTGGTTGATATATTGAACACTACCTAGACAACGTGGG
TATCATATTTGATATCCAGGCATTTTAAATAATAATTTTCTTCTACAATT
GTGTAAGAAAAAGGTCAAACAAGTGTAATTTGCTTGTATAAATATATACA
TAGATTTGGCTATAATATCCATTCTGATTCCACCTGTTATTATGTAAGGA
TGTCAATTTTTCTGATTCGAATGACTATTCTGACGTTTTTGACAAGGCAT
GCGGTATGTCATTTTTTTGAATACCTTTATTACATTTTGCTTGATTGATA
TATATATATATTTATATCAAAAAATGCAAGGATGGAATCAAGTGACTCAA
TTCCTCTCCTTCTAAGAAACACTAATCAACCCCTTTATATGAAGAGTAAA
TGTATAAAGGCAAAGATAACTCAATCTTGTACAAACAAATAGAAAAAAGA
GAGAGTTCAATCCGTTTTAGTCAAGAACACTTTCTGAAGGAAGTCCCAGG
TTCATCATCATTTGCAAAACGTTACATCATTAAAGAGACCAATATTACAA
AATAAATTAATATATTTTTTTTAAATCCACCGTTGTTTAAGGGGGTCGTT
ACCATCCGTCGTTCTAGTGCTTGATCATATGTCAAAATATTGTAAAAATG
TAAATTAACAAAAAACAAAAACATCAACTGTAAAAAAAATATAAAATGTC
TGACCTAGTTCTCTCAAGAAAAATATGTACAAATCATGATGGCTCTTTGT
CACTCATACATCTTTAGTAACAACCTACTCAATCAGTCAAAAAATAATTA
TTTTATTTTTTAAATTAGGAATTTTCCAATTTGTCATATTTATTATATTT
TCTTTTTCAGGCCACATGAACTACTTGGAAACCAATTATGGTTCCAAGTT
ACTTCATGATAAGTTGATTCAAATCAAACGAATGCAGGATGTAAGAAGCG
CTTTTACAAAGAAGGATTAA back to top
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