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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s128 | supercontig | LSalAtl2s128:1726882..1815327 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000001651 >EMLSAP00000001651 ID=EMLSAP00000001651|Name=EMLSAP00000001651|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=831bp
MESGVAPTITFIESSTRVDFVDIPSFPSLPNTPPSPSLMDEESPLIIGNP YSMNSFVIEDKQEDMQEGKQEDKPNVKDEDEGLHFKDIESEPKYARVNKN KDQNLKDIIQPLSPTKSNSGRFPSTLSSTPLEDVAETNSGESTPPSTNSS SQQQPINPIELPQFSNGAIQTMMSSCRRNALAPIIASFDEDDETESDSSC NENSLLVHQGKELERESEGPIIPRLNSNNSALFFSDDPNSSLVSPLKQGL RHTSTTSFKRVRQKSNVSYSSNKYGQVLNPSNLDLEPEDAGKDQNKKGFA LYCKIIIIFGLAFPMSEVISSNVPPGYYQLFYIYLFLGSLAYLIIIYVDL LRTRASIAVTRTKLMMKAKKCETENSLKRTISGSGETEEDDYNLSSSAAA LSAINYKDGIPRPRVHYGSFYLRFGAIGMVFELNMANVSKCKNIFSIIRP ILQMIFVFVQMYFIFLNQKMNIYKSKLMSRFGLMHMIATNICVWFNVLIL ETSHEILGHGPHHHTNGDGTQPTPISDDHSSNDSHHSNGGQHTQIPEAHY LTDEVPNSDYSKGMEFQLSHLVSMCQRENNIMSKLLSDSGPFLFPCTIEY SLICAAVLFVMWKNIAEEHEHYKFQRRRRKISAHLSVFNPEIRSNLPTAE EERSAHQYSVDCTHANTGLFTGIFVMVITIISLIVFFVLMSSPDPHLNEI AVTVASLTELSLYVLTILAVIMGMIQVRTLWYDTSRKMELDNLLLIVAQT GVFMYAAFCIIGSFFQLRDHLIAFLASMATLVKFYGGEWAWPIITHVSMP LAIFYRFHSTVCLCEIWKKSFKYKPSNLAFV back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s128:1726882..1815327- Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000001651-697498 ID=EMLSAT00000001651-697498|Name=EMLSAT00000001651|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=88446bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s128:1726882..1815327- (Lepeophtheirus salmonis) TATGGAGAGTGGTGTGGCCCCAACAATTACATTTATCGAGTCATCCACCA
GGGTGGATTTCGTGGACATCCCTTCTTTTCCTTCGCTGGTAAGTCAAATA
CCATATTTTTCTTTATTCCACAAAGGGTTTCGTGAGGTCGGTTTTYCCGT
GAGTGGGACGTGGAACAAAAAAAAATTATCGTTTTAAATTCGATATTTTA
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TAACATTTCGATCCTTTTTTAATAAGTTGTGTCCATATTTTATTTAATGA
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AAAAATGTCGTTGGGTTATTAAGCTAWATAATGTAGTATATGAGATAATT
GTTTGGAGTGTTGCACKTATCTTGTAAAAAAGATTCCAGTTTTCATTACA
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ACGTTTAAAATATTGCAAAACTATATTTAAGCAGTTCCAGGAAAACTACC
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ATTTAGTTCAAACTTCATAATGAATAATAACACATTATAAATTCTTTTGA
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GGMCCTTATTGATCTTTTATGCTAACTATATCGACAGAAATGACGTAGTT
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ATATAGCAGGTGTGTGACTAGAACGCATTTTATACGTTCTCGCTATTATT
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AGTAGTCAGATAGCTAGGAATGAAGGACTGGCCTATCGGTCCTTAGAGAA
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ACGCAAGAGTCAACAAGAACAAGGATCAAAATCTAAAGGATATAATCCAA
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GCCATTTAAAATGACTAACATAACATTTTTTGTTATCTTTCTTTTTAATA
ATCTTTTTAACTTAATAATTAAGATGAGTATATTGTAGTGCTATGACCAA
GGGAATCCGCAGGGGGGCGTGTTGGAGAGATTGTAAAACAAAAAAAAAAA
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TATAACTTTTCCAATTTTTTTTTAAATGTAAAAACTATTCTAATTTTTTT
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TCTTTTTCTAAAATATTATGTTTTTATGAAGTTCTCATAAAATTTTTGAA
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GGGAATTTGTTAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTACTAATTT
TAGAANCAGTCTCGGCCCACTTCTATCCTGCATTTAATTCCTAAACGCTC
CTTCATGACGTCACTCAACAGCATTGATTTTTTAAAATCAATACTGACAG
CAGGAAGGCCCGACGATCTGAAGGTCCAGTCTTCAGACTATACTGTACTG
ATCAAATAAAGAGTGACCCAACTCTAATATTTGGTATTAGATACCTTGTA
GTTTAGTTAATAATTCATTGAACATAGTGGTGCAAATAGAGCCCTCATTT
TAAACTAAAGTACACACCCTTATGACGTCAACGGTTAATAAAAATACTCG
TTCATAGTGGCCACCTATTAATGTGCCAAATAAGTCATTTAGTAGTATCT
AATTCATTCGATAAAGCGGATTTCTTCTACGGTGAACAGCTTTGGTCTGT
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TCCAAGAAATACGAAAAAACGACAGTTGCATTGTTATTATGGCAGGAAAA
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GAATAGTTAAGCCTTTATGATTCAATTTTCAGTCCTGTTAGTAATTTCTC
TTTATTGCACTCACTCAAATAAAACTAGACAACAAAATGTTGATTAAAAA
GATGAGTTTCTAGTTGTTTTTACGCAGAAAAACATAAAAATGACTTTTAC
AACGACAAATTTCGGGTTTGTGGCATACAGAGTGAACTTTCAAATTATAT
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ACATACTTTCAAATTCAAAAAGTATTTTAATTATTTCTGTACATTTTTCT
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TTCCTTAAAAGTCTCATAAATTCCTCAGGGGAAGATGATAAAAAAAGATT
CAGCCATGAAATATGTTAGAAACGACAGCTGTGCTATTATATTTGTAGGA
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AATTTATGAACAGATTTTCTTCTGATTCATAAATTAGGAAGGACCAATTT
TTTTTCTGGATCCCCCGTCATTCATTTTTTCAAAAAATCTCAAAAGTACA
TGATTTGTTCTAGAACAAATCCTGTATACATATGAGAGATGACAGGATCA
AAATTAATCCCAGTTATCTCTGTTTAAACTTTATATGACGCCATTGTACT
TGAAAAAACATATGATTTCATGTTAAGAACAACTTATCTGTAAAATCGGT
CTAGATCGATTTTTTGCCACCAAATTTTTTCTTTGGACCGATCTAGACCG
AACTCTCCTTTGGACCGATATAGAACAAAATTTTTATATCAGACCGGTCC
AAACGGAGGTTTTCCTTTGGTCTGAATTAGTTCCGTACAACAAAACATAT
AACGGTCTCAGAGCGATCTAGGATTTCCAGATCGAAGCCAAACACTAGTA
AAAACAATCAGGAACACACAATCATACAGTTGTAAGTTATCTAGTTTATT
GACAAAATTGAAAGTTTTTTTCCAAACAATTTAATTTAATTTTCAAATTT
TTTTTTCAAAAAAATTTCCTTTTCTTTGAATAGCTATTAATTTTTTTGAA
TTTTTTTGTGTATAGCTATGGATTTTTGAAATTTACTTCAAATATAAATT
TGCTACTGCACTTTAGAGAGAGTTCCATCTATGTATTATTTAATCTTTGA
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CTTCTTTGTTAATTCAGTGAGAAGGGTAAATCCAATGAGGTTGCATATTT
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AAAAAATTAGACAACTAATATGTTGGTTATCTATACAATAATAAATTATG
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CCTCCCTTCTGTATTTTTCTTGTTGCCAACTGTTAACGATTATTTAAAGA
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GTTTTTTTCCTACGATTTTTTTTCTTGCCTAACCTTGTTCTATTTAAATT
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CCATAGAAAACGAAGGTATTTAATAGAAATAAATGAATAATGAATAGACC
TGTTATTATTGAATGGGAATGCATTGGAGAGAACAATTAAATTCATTTTA
TGTGAAATTACGTAATTTGGAGACTGAATTCCTTATTTTTTTTCTTCATT
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GAGGCCTGGAGGGCTGTAGCCCAACTCCCCAACTAAGAAATTTTGGATTC
TTACAGAAAAAAAAATTGTCTAAAATGTATTTTACTTTTTCCAAAAAATT
TAATTGTCTCTGAATTGCTATGAATTTTGTTATTTTTCTCCAAAAAATTT
AATATTTGAGATTATTAGTAACAAATTTTATATTTGAAATTTTTTCTGGA
TTTTTTAATTGTTTTTTATACAAATTTTATATATTTAATTAAATTTTTAA
CCAAAAAATTTAATGTTTTGATAATAGCTATAAATTTTTAAATTTTTCTG
TTAATATGCTCTGGATTTTTGAATTTTTCTGTTAATATGCTCTGGATTTT
TGAATTTTTTTGTTAATATGCTCTGGATTTTTGAAAAAATTTCTAAAAAG
TTAATATTTTAATTTTTTTCTACAAAAATTAATTAAATTTTTTGTGTACA
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TTTTGGAGATAAAATTAATTTTTCATTTTTTTGTCAAATTATTCCACCTC
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ACATAACAATGATTACATATACTCTGTGAAATATATTTCATGGATGTATT
TATTTATAGAGTTTTCCTTGATTACAAGAAGTTAAGGGGATATTTATTCA
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GGTCCTGCTCTTAATGAAAGACCCCGTGCTAGATGAATTTGATTGAAAAA
TGTATTATGAAATACCGTAGTGTACGGTGAATTCGTATAAAATATATTCG
TATTGTGACATTTGCATAAAATTGTTTTGTATAAGGACATTTTGAATAAC
GACAATTTCGTATAAAACCATTTTGTATAAATTTATGAGGAAACGGGACA
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GGTATTGCCGGATCCCAAAAKAGGATGCAACWAMAAGCCAATACTTAAGA
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ACTGCAGGGTACCAAAACAGGATGCAAATAACCACCGATACATAAGTATG
GGGGGGGGGGGCGGAGGGATTGKGAGGGWTTTTAGTAGTTAATTAAGTAT
AGGCGGTGCCTGAAAATCCTGCCCAACATTCGGGGTACAAAATTGACAAT
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AAGATAAAAAACATTCTAAGATAGAAAAGATCCTTACACTCTGTTCATGC
TAAAATTGGCCCTGAATATAATGTTATTAATTTTTTAATGAGTGAAATAG
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TTTCTTATGAATCAATCAAAATAATATGATCATTCTTGAAACAACAGAAT
GAGGCCATTCAGTGTCTATACGGTGTACATATGTATATATATATATACAT
ATAAATCCAACTTTATGCGTAATAGAGTTTGAGTTTGATTACTCACTCTA
CTTATTTTAAAATAAGTATATAAGAAATGAAGATATATTTGATTTAAAAT
CAAACTTTTAATCCACAGAGATTGAAATATCGTAATGAGATTTCCTAATT
TATCATCTTATACTACATACTTTTGATACGTTGACGGATTTACAGGTCTA
TTTGTATCTTTATTAATAATACCTTATACACTGTTTTTAATATTGTTATT
AACTTTTTGCGGTTATTATGACAAACTTCTCTTGTTAATTTATTATGTGA
CGATATATATTATTTTTCCGTAATTTTCGAAACTTGGACTACATTCATCT
CTGCACCTTTTCCAACATTTTTGTACATATAATTGTGGTGAATTATCACA
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AGGACGATACATTTGACATACTTTCCCAGAAATTTGAAGTACATCCTAAG
AATTAATCCCAATAATTCTTTGGTAGAAATGATCGATACTTATAATTCGT
TGATGAATATAAATATATGTTGTAAATGCTCAGCATTAAGAAAACTTTTC
TAGCATGCTTTTTTCATTGACAGGCTACATATATTCAAAGGAGCAATTCC
ATGTGCAATCATCCTTTGGTGGCTCCCTCTAGTGGGAATTCTTCCACATA
TGATAGATAATTCAGCTACAAATTTTGATTTTCTTTTTTTATTACGAAAT
ATGTATTATATGGATACATGATCAAATCAGGTCATTTGATCGTGTTTGCT
CGTAAATGTTGCTTCTTAACMCCTCAGAGAGAATTGTTCATTCTCTCGTA
GTAGAATATATCTTTGTAAATCAAATCGAATTTCCCAGACATTTTCTTCT
CCGCTAATCATATGTTCAATGCTCATGTTTCCCCCCCCCCTTTTATTCTG
CTCTAATTCATTATACCTCTAATCAACAATTTCTATTACCTTTTCCAAAA
ACAATAACAACAAAAATAAAATACAAAGCAACGGCAATAAAAAAAAATAT
TCACTTAAATAAATAGGTTATTTAAATGTTAAAGTGATGGCCTAAGAAAA
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GGTATTCATTTATAGTCTACTCTCGATTATTCCAATACTTTTGCATCTAA
TAATTAGTGTTCTGATTGGTTGAATTGGTTTTATCTTTAGTTAAGCTGTG
AAGTTGAGAATAATTAAAGATAAGCAGAGAAATGGGGTTGCTAATTCTGG
TCCACTTTTGTATTTCTTCTTTTAAGAGAAAGGTTAAAAGATAAAATAAA
GATAATGTTTGGATATTTATAGATATATAGTAATCTACTTATAAATTTAA
TATAGCCATTATAAATGAAACAAACTCCACATTAGCATTGCCCAACTTTT
ACTAAGACTCATCCATGTCTTTAGAGTGAGATATAGGTCAGTCACAGAAG
TCATGGGCGAAATATAGTAAGAAGTAAGTGGTCATGTTCAAAGTATGTAG
AGTATTTATGGTATAATGACTCCCATTCATAGACGGAGTTTGAAATTTAT
ACTAGTTGCAGTGATTCTAATTGGGAGCATTTTCGGTTTGTTTATAAAAA
GAAACCAAAATCTATATGGTAATCCTGATCTTTTGAAGAATTGCATCTAA
AGACGTTTCATTAGATCAGCTACAAAGACTTGTGACGAGAAGGAAATACA
TAAAGGTAGCAAGAATTACTATAATGTCGATCCTTAATTCTACTCTAAGT
ACAATAAGAACTTATAATTATAATTCCGCAAAAAATCCTCAGGGTTACTT
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TTATATGTAGCAAGATTAACAGAAATACAAGGTTAGACCATCATGTAATC
GGGCTTTCTAAAATTTTCAATCTGATCTATTGTACGGATTGCTTGGCAAG
ACGGACAGATTTTGACAAAACACGCAATTATTCATAGTCTATGACGTCAC
TATTGCTAAAATTTCCAATTTAATGTATCGTACCGACTTTTGTGCAAGAA
AAACAGGTTTTGGCAAAATATGCTATGAATTCAATATTAAAAGCGTGGTG
GAACTCAAACATCAGTCGTACACGCGTTATGGTATAACCTTGTATTTTTA
TTAACCTTGATATATAGTAGAAAAGGACGTTCACTTCTCAGGAATTAAAA
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TCCAAAAAAAACCGGGTGAGTTTTAAAAGATACCACTTAGCGTTAGGGGA
TATTGTGGGAACCCAAAATTGAGGCATAAATAACTTTTTTTTGCCTATTT
AAAATATGATTTTTTGTATTACCTAACATATTCCTTAAGTCAAATCTGTC
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TGGTGCATGTAGGTAAGGAACGGCACTTCGCCAACCTCCAGGTCCTGGCT
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TCCATAAGTTTGCCCACACGTCATACCTAATCTTTCTATCTCGAAGTGGA
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TTCGGATACGTGTCCCAGGCCCGTCGGATCTCTAATGTTGGTTGACATTT
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TAACCTAAATATTCTTTTTAGTTAGATGTTTTTTTATGTGTGGTATATAA
CCCTATTGAGTTCATACCCAAATCCCAACCCCATTGGACCTGTTGAGAAC
AGGAAAAACATTTTGGGGCAAAATATACTTAATGGTTTTCATTTTGTTAT
TTTCCATCAATTTATAATTGGTAGTACTCCCAATATAATGGCAGATTGAG
GATACTTTGACCTTCCCCTATTTCTAACCGTGCGAGGACAATTAGCCGAA
AACATTTTTCTGAACGGGCAATTTGCCAACGACAATTCGACGAAGAACAA
TTTGCCGACTGTACATTTGGCCGAATGACAATATGCCGAACGGACATTTC
GCCGAAGGTCTATGTGGGACATTTGACCGAAACGTAATATTTAATAAATA
CTATATTGATAAATAGAATTGCATATTTTAGTTCATTTAAAAAAGATTGT
ATGATAAATTCCCGGATTGTAATTGTTCATATGCTATATACGTCATACAA
GTAAATTAATTAGTGTTCTTTTCCAGATAATATTTTTTTTACTAATTAGG
TATATTCATTTTTGATCATTATATATATGAACACAAAACAGTAGAATGCT
GGTCGAATCTTTTACCGTTCTAGTTGTTTAAATAAATTAAATAATAATCA
AACACGACAGTGATTCAATCGAATGGACCAAGTGCTTTATAAGTAATATC
CGTAATATATCCGTTATTATTTATTTTTCGACATGATGGATTTATTTATA
ATCAAAAAGACTCATGGATGGACAAAAAAGCATTACATCAGATCAGAGAA
GAGTAGTGATTTAAGATTCTTACTTTGTTATGATCCAGGATGTTTGGAAA
GAAGAGGAGGTTGGCTGTGGTGAAAAGATTAAATATTATGTTTCAGCCAA
ATGCCCCAAATAATCATTAGGCAAAATGTACATTCAGCAAATTGCTCTTT
GGCAATTTGTCTGTTCGGCAAATTGCCCCTTCGGTAAAATGTCTTCGGCA
AAAATGTTATCCGCCAGTTGTCCTAGAACCATTTCTAATACATGGGGGCA
TACCCTTTGGACTCCTGGTGATGTACTTGGTGCTCCTGGAATTGGCTACA
TAGTCGACAGTAAATATTTAAAACAGTTATGGAATGACGTAGTTCATTGG
TATTCAGGAGAAATTATTCTCTTCAAGTCAATGTGCGTAGGGTCGTGCGC
CGGTTGTTCCTAGAGCAGGAAAGATAATTTATGTAAATCGAATTCAAAGA
CAATTCCTAGTTCCTAGGTCGAGTAGAGTAATCGTAATACTTACTTACAT
TATATCAGTGCAACTCCATCTGACTAATTAAATGAGCATTAGAAAAACAT
ATATTTTTTAGATAAAATAAATAGTAAATAACACTTTTTTCTGTCGTGGG
GACATTTAAATATAACTTTGACGTTTATTGACATAGAATAACATTTAAAT
CAAATTATTAAAGCTCTTGAGTCAGCCAAACGTCTTCAAATGTTGTAAAT
AAACGAAAGTATAAAGAAATTACTGTTGCTAAAAATATTTTCCGAGCGAT
GTTGAGACATAATGTTGGGTACTATTTGACAAAATTATAAGGTTATGTTT
TTTTAAAGCCATATTTTTTTCAACAGTCATAAATTAATCAATAATATAGA
ATGCAGCAACGAAATTYCTTTTTTATAATGTGTGGCAGTCGTAGCCGTCG
GGGNGTGGATTCATTCAAGAGTCAAAATACTAAAATTTTCTAGGAACTAC
AGTCTGTCGTTATATTCTTTAGAGTAGTGAAGAACGTGTGTTTGCTGTCG
TAAATACATATTGCAAAAACCAATTGTAATTCAGTTTTATTGGCGCAATT
TATGAAAATACATATTGTAAAAAAAAAAGATAAAAAATGATTGGACTGAA
TATTTTATATAATTAAACCAATTTTAATATAGTTCTTGAGCTTTATTGGT
GCAATTTATGAAAATCCATTAATTGCTTCAATTTTAATCTACAAAAAACG
ATATTTTCAATTCATTTTCACAATTCTATGAACGCAAACAACTCAATGGA
TAATGATTTCAGAGAGTTGAAACTAATGCCATCAGATTCGATGTCATGCA
AAAAAAATAAATGTGTGCAATTTGTTCAAATAAGGTCATTGAAACCAAAG
TTATCGTGGAAAACCCTTTATTTTTAAGACTTTGCAGAGTTGACAATATC
TTCATAATAATTTAATCAACTAATCATCCTGAATTATGAAATAAGACACC
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TGAAAAGTAATTTTTAAGGTCATCCATCGGAAACGATTTTATAAACTCTG
TAAAACAAAAATTATTACTATTATTATGAAAAAAACAGTCAATGGAAGGG
ATGTTTTTGGTTTGGAATAAATTAGAAAATAATAATGAATGACAGATAAA
TTATTATTATTAACTGATCGAAGTTAAACAAATTATTACCAAAATAAGCT
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TTTAAGGAACGGCTTTTGTGTCTGGMTAGGATAAGTACTGAAGATTTAGG
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CATGTGCTACAGAATAAATTGCCATGATTTTTAGCCCATTTACGCCATGC
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CCTTTTTTTTTGGTTTCTTTTTGGAGGAAAGGTTGCGTGATACAATAAAG
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TTTATGTATGCAGCCTTTTGTATCATTGGATCATTTTTTCAGTTGCGTGA
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ATTATTCCGATGTCGACCCTCAATTTTACTCTGAGTCCGACAAGGAGTTA
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