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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s128 | supercontig | LSalAtl2s128:1881693..1892323 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000001658 >EMLSAP00000001658 ID=EMLSAP00000001658|Name=EMLSAP00000001658|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=395bp
MLIRKTPIRVQANFLIWSVISSSMSYLNEEARHIQFKYIQKLTGAKTMSE
RWKTCVGETKSRLGIHIGSMYVRQYFPEKAKTAAQSIVSYIKKEFEKLLR
QNKWSDEETKAKALKKVKAMHENIGYPNEILNNTVIDILYEGLDLGESTY
FENVHSLFKWTMDYVFLKIENEIKSYDWTDLVTPTVVNAFYNPLTNSINI
PAGILQGNFFSLHRPNYLNFGAIGMAIGHEITHGFDDTGRQFNFEGDLFD
WWNPSTKLKFINKTKCIIEEYGDFAYPKLNTTVNGVNTLGENIADNGGLK
VAYRAYASWLNQTSFPEPLLPGLNFTEKQLFWISNANLWCTKIRGKTLEQ
KIRRDVHTPAMFRVLGAFSNMVKFAEDFQCPIGSPMNPKIKCEVW back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s128:1881693..1892323+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000001658-697505 ID=EMLSAT00000001658-697505|Name=EMLSAT00000001658|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=10631bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s128:1881693..1892323+ (Lepeophtheirus salmonis)
CATTTTTGAGCGTAGGCATTGAAACACGCCATTAAAGGAGTATTATCGTC
TCAGGAAAAGCATGCAAGTGAACAAAATTGATTTTTTTTTAAAATAATAA
TTTCTGTGAGAAGAATGTTCTTCAAAATGAGAGCTGTAAAGCGGTCAAAT
ATTCAGAAAGGATTCGTAAGACAAATAATTGCTTTTGAATACACATTCCA
TAATATGTAAACATTTTATTCAAAATATGAAATCAATTTTGATTGGCGGA
TATTGGGGTCAAATTCAGTTATTACTCTTATGAAGCTCTTTGTTATAAAA
ATTCAAATTTATATTATGTAAATGTTCTTAGTAACATCTTTAGTTCTCTA
CTAAAAATTCCTATTTGTTAACAGCTAAAGTTTAGAAGAAGATATTTGTT
GTGTTCTCTTGATTTTTTTTTTTTTGGTGGCCTTTTTATTAAATTTATTG
CTAACAAATGTCGTTTTTTAAGGCCCTTTTTTAATTAATTATCTCTCTCT
ATTTTTTTATTGTACAATGTTTTATATTCTCTTAATGTAAAAAATATATT
TTACACATTAAATTGAGATAAGATCCTTTGTTAATCTCATTAATAAAAGA
GGAGAAGTTATTAAAAATATATATGTAAATTTTGGAAGTAATATTAGCCT
TCTTGGAAGAAGATATTATCCTTTCTTTTTTAAGAGAGGTTTCCCCTTCT
ACAGCTTCTTACCCACGCAGTTCTTCTTGCAGCGTCACTATTCTCCTGCC
GACAACCCTTTTTCTGTGCATTAAGGTCAATTTACTTTGGATGATAATTC
TTGATCAACAAGACGTTGGTAGTCAGTGCATAGCTTCATAACCACCAAGG
AGTACTTTAAACCTTGTATAACAAGGTTTCAATGTTGACAACGTACACTT
GTTCGTCCTTGGCCTCCAGAGATAGAAAGTCATTCTTCACTGAAAGCATC
CTCGCAGGATGAACATCCTCATCGTATTCAGCACTCTCTTGGGCATCCTC
ACCCTACTTGGACTTCTCCTTGCCATCCTCTTTCTAGTCTCTACCGATAC
ATTCCTTAGTGTCCTAATCCAGAGTCACGATCCAGATATATTCATCACTA
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TAATTAGTTTTATGAAGTTTTTGGAGAAAATAATATATTTTTTTGTATTT
AAATATTGTTTGTGTTTAAATTTCAAATCCATCTATCTAATTTTGTGAAG
TTCTCCAATTCCATTGACAGCAAAGTAAGCCCAAATATTGATGCTTCCAC
CATCGTGTTATACTGCGGGAGTGTTGTTTTTGAGGTTGAAAGCTTGGCCC
TTCTGTTCCTAAATGTCTTTGTGGTCATCGAAATACTTCATCCTAGCATT
TATGTGCCTGCTCTTGAGGAGTGGAGTGTTTCTTGGCATCTTAACATGGC
CAGTTCTTTTGAATTTGGTCATAATGCTTTGGACAGATGATTTTGGGATG
GAAATGTATTTGTTGCCTTGATTATGTCAATTAACTATAAGCTGGGGATG
TCCTCTTGGTTAATATTTACTTTAATGATACAGTGTTTAAAATCCTAAAC
CCCGTGATTTCTTCTTTTTTGTAGATTTAAGAGCCACAATAAAAATGGAT
GATATTTTGAGCTTTCAACAAATTAGCTAATACCTTCGCAAAAAAATAGC
ACTTACTGTAATTTTTTCGCAACAGTACATAAATAGATTTAAATATAAAT
TGTCTTGTCTTTAAAAAGTTTTAAATATAAAAACCTGTGCTGCTAACCAC
TTTTCCAATAATTGATGAAAAAGTACTATTTTTCGAAAAACAACAACAAT
TTTCCAAACTTTAAGCAAAAAGCGCAAGGTGTATTCAGAGCCCCAAAATA
ATGATTTTCTTTCTTCTCACATATCAAAGCATGGGGAAAAATACGGAAAC
CTAATAAAACTTAAAAATTGTGTTTTTTTGAATAGGTCTAAATTGTGCCA
TTCGTCTCGCTCTTACCTTTCTTCTTGCTCTCCTTTTTCATTACAAACTA
TTCAACTCTACCTATGTGTAAATAGTAGGGACGAACTTTGATATCCGAAT
ATCGATATTGAATGTAGTAATTTATTCAGCACACTACAAAAGGAAGTTCC
CCTTTCGGCCTCAGGGATTTCAGACTTAAAAAATTAACTTAATTATTATT
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TTGTTTTTTTCAGGAGAAGGGATATACGTCACAAAATTGATTTTCAATCT
ATTCAACCATTCTCTGAGTATTCTATATATGTTTTCTGAAATAAATAATA
ACAATTTCTATTTAATAATTATGACATTAATTTCGAATTAATTAGATATC
AGCCTACTAAATTCTCTTTCACTAAAATACTAATTTCATAACTCATAAAT
GTATTGTATCAAATAGTAGAAACAATTTGATAATTGGTATTCAATTTTTA
GTTTGAATAAAGTTTTACTATAAAGTATACTTGTCAGAAAAAATAATGAT
ACACTTTTTAACCGTTCATTCTAAAATTTATACATCTGTTGTATTTGAAA
AAAAATCAATTTTTTTTCTGATTTTTTGTACTTATTTATCAATTATAAAT
ATTCAACTTTGGATCAATGAAATATAAATCCTTTTATTTCTCTCCTAATT
TCCACCTTAAATAAAAGATAATTTCTTATTATCATGGATTATAAACATAT
GTTCTAATATAGTTGTACCGGGGTATCGTCGTTTTGTTTTTAAAACGCTA
GCATACTTAGTCAGCATTGGAACTGGTAGTATTTATGACGTAATAACGTC
ATAAAAATATTGGACCGCAGCACCAGTGACTTAAGTTTCAAATTTCAAAG
CAAGTATCCCTCCCAAAATATATATTAAAATTATCCTTGATTGAAAGATA
GTAATCATTTTTTTTAATATTTTTAGTTGAAAAAGTATCGAAAAGTATTG
AAATATCGATATCAATAATGTTGGTAACCCAACACTATGCTAAACTTTTC
GATATCCTAACATCCCTAGTGTATAGTAAAATCACTTATGATTAATCATT
AGTAATGCTTGAGTGAGAAGTCATCCATTGAACTTAAAAGTACAATCTTT
TTGTATTTGACTGTCTTATCTACAGTGATAAGAGTTGAAAAAAAAAGTAA
TAAAAAAATATAAATAAACGAACTTGCAATAACATAACTGAATTACAAAA
AACGTGATTTTTATAGAATCCACGAAATATAACTTAAAACCAGTTGGTAA
TGTGTTTTAATAGTACATTTGGCTAAACTTTTTATTTAATATGTTTTCCT
TCGCAAGCAATAMCAGCCACGACACGCCGGCAAACAGATTGTCTGCTATT
CACGATGAAGGGTGTGCCCAAGAATTACCTCATTGTCATGGTGCAGGCTC
TGAGCGAATCCAAATTTGGATGAAGTCGTAGCACACTTTCTTCTCCAAGA
CACCCCAAACTGCAAAGTTCTGGCCCATCACAATAAGAAATTTATAGTAT
AATACTTACTATTTGCAGAATTTCCCAGCATTGCTTGGAGTTATATACAA
AAATGTGCAAATAATATAGAACATTCGTTCTCAAATGGGGGTACGCGTAC
TCCTTGGGGTACTTGGAGGCACTTCAAGGGGTACTTGAGATGTTGAAAGA
ATATGTTACAAGTGGTACATAACTTAGGGGCGTCCGTAGGGAAAGCGCTG
GAGGGGATGTAGCCCCACCCTCAAATTAAGGAATTTTTGATTTTTCACTA
AAAAATGTATTATGTCGTTTTTTTTTCTAAAATATTTAATATTTGAAAAT
TTTTCTCCAAAAAATTTTATAAATGAAATTTTTAATTGACAGTAGTGGAT
TTTGGATTTCTAAAAAAACTTAATTTTTGACAATAAATATGGATTTTTGA
AATTAAAAAAAAAAAAAATAATTTTTTGTGAATAACAAAGGATTTTGTAA
TTTTTTCTGAGTAGCTGTGGAGTTTTGGTTTCTTTTTCTCAAAATAATAT
AATATTTTGAATTTTTTTAACAATTTTAATTTTTGGATTTCTTTGTATAA
TTATTCCAAAAACTGAAACTTTTTTCCAATATACGGGCGCGCCTGTCATT
GAAGCTAAAAATGCTTTGTGCTTGACTTGGGTTAACTAAATATTTTGCAA
GTGGTACATCACTAGAAAAAGGTTGAGAATCCCTGATATAGAAGATAACA
CCCCAACAAATCCTTGGTGTTACCTTTTGTTTTTCATCCGCTCACTCACA
CGTTGCTACTCACTCAATACTTAAATATTCTTTAATTGTGAGTTGAACTA
CACACTTGCGAGATTTCATCTATTTTATAAAGTGTTCATTGTATATTATA
CTACCTTTTTTCTTTTCTTTATATAGTATTGATTATATGAATCAGGGACC
ACAATATACCGTGCACCCAGTGACGTGTGGTCATACATTCATAAATTATG
TTTTACTCGCAAGATGGGTCTTATTATGAATCAATGTTACTTATTATATA
CTTTTTGCAAGATGGTTAGCTTCATTTTTTTTTTTTTGTCAAAAAAAACA
ACCTAGATGTTTAACTCAATTCAGTCCAATTGCATCAAATTTCTGAATAC
TCAAATTGTATCTCATGGTCTTATAATGAAATGCCCTAATTTTTATAAAT
GGAAAATCCTTTTAAATTGAAGGAAGCAAGAGTTGAGTTCATTATACATT
AATACTAAGAAGTGTAAATTTTATTTAATAACAGGGATATAGAACGAATC
CCAGTAAAAAGATCTACTTATTTTTTTCCATGTGTGGTTCAGAATATTGA
ATAATAACATATTAACGAAAAATATCGCCAAAATTTAAATACATGTTGTT
TCTAAGCTTATAATCACTCCAAGTAGGTAGATGAAGCGTGTATGGATTGA
TAGCCCATAGTAATTTAGTGTTAATTGTAGAATTTTTCGAATATGAGGAG
TTATGAGTCGAAAACGGAAGTACACCCATTTTATGGTCCACCCTACCCTC
AAGGCTGTTTTAAGACAAGGGATCATCTGGGGCACAGTAATGAGCTAAAA
TTTGTATTTTTAATCTTACTGTCAAGGTCTACAAATATCATCAGTCCAGG
GGCCTATCATTAGGCTAAGGTGGCCTTGCCCACTGTACTTAACATAATAT
CTCAGGTTTACTTTATAGGTAAACCTGAAGGAGTACAGGGTATTATGACA
AACTTTACTCGAATGATTTAGATTTGCTTTATTAATATAGAAGATAACTC
CCGAATAAATCCTTAGTGTTTTTCATGAGTACACTCAACCATAGTTACTC
AATTCTTAGATGTTCTCTTCTCATGAATAATTATAACAACTTAATAAAAA
TACATTTTTCGGCTTGCCTACAAAAACAAACTCGCACGCTAAAAAAWGCT
TAGGATTTACTACCCTAAGCATAGGTATGTCCTTTTTTTTTTTTTAATWT
GTGCCTCTGAGCTTTAGCTACACCATCTCGTTGTTAAAAACAAGTCCTTC
CCATGATAAATAAACAAATATATGGACAAATCTTGATTGATTAATATAGA
TATACTGTGCTATTTTAATTATTTGATTTCTGATTTGAAGGTATATGGAA
CACAGCATTTTGATGCTGTTTTTTTTCCTCATACAAAGACAACTCATTGT
TCTTGGTACTGTGGAGGAAAGAATTTGTAGAACTGAAGAATGTTTAACAG
CAGCCAAACGTATTTTATTGAATATGAATGCATCTGTAAGCCCTTGCGAG
GATTTTTATGAATTTTCTTGCGGTGGATTTGTAAAAAGAGTTCAAATCCC
GGATAATAAAAATGAGATATCCTCATTCAGCCTGGTTCATGATAAGTTGT
TTGAACTTGTAAGTATTTAAACCTTTGAATTTTTAAACATTTGGACATTT
TAATGACATGTGTTTTCCTCTGATCGTATTGATTTTACCCAGATTAAAGA
CATATTGGAATTAGATTCGATAGAAAATGAACCAAAGTCATTCTATCTAG
CAAGAAATTATTATAAAGCTTGTATGAACAAATCAGCTATTGAGTCTTTG
GGTTTGAAGCCAATGGAAAAAGTAATTAAAGATTTGGGTGGATGGCCTCT
TCGACAGGGGAAATCATGGAATGAAAGTTCCTACCTTTGGTATGACAAAC
TTCGGATATTGAGAGGAAAAGGCCTTCCGATAAATCAATTCTTTTCACTC
AATGTGGGATCGGATTTAAAAAACCATACGAGATTAAGGATTAGTTTGGA
TCAGCCAGGATTTAATCTTCATAGTGCATATTTAAAGAAAGGAGACGCTG
ATGAAGGAGTTAAAGTTTGTTTGAGTGTTATGTAGTAATAAAGGATAATA
TATCATTGACACTGAGTATATAATTAGGCTTATTTTAACTATATGGTGGA
AATAGCTCTTTTGTTTGGAGGGAAGTTTAACGCGTCCATGGATGAAATGT
TCGAGGTGTTAAAGTTTGAAAATAAACTTGCAAATATTACTATTCCAAAT
GAGCAGAGACGGAACCTTTCGAAAATGTATCATGTGATGACAATTGAGGA
ATTATCTCAGATGGACCCCTCGACTCGTTGGCTGGATTGCATCAATAACA
TTCTTAGAGTAACTAAGGTATAAACAAAGATCTTATTTGAACTTATTTGA
GCAATTGATTTGTATTAATATTTATTCAAGGTAAACGTGACTCAGGNAGA
TCATTGTGTACTCCCCATCTTATTTCAAGGACTTTGCAATGTTGATCCGC
AAAACACCAATCCGAGTCCAAGCCAATTTTTTGATTTGGAGTGTGATTTC
TTCATCTATGAGCTACCTGAATGAAGAAGCAAGACATATTCAATTTAAAT
ACATTCAAAAACTAACTGGAGCTAAGACAATGTCGGAAAGATGGAAGACA
TGTGTTGGAGAAACAAAGAGTCGCTTAGGAATCCATATTGGATCCATGTA
CGTTCGACAATATTTCCCGGAAAAGGCGAAAACTGCAGCTCAAAGCATTG
TATCCTATATTAAAAAAGAATTTGAGAAGCTACTTAGACAAAATAAATGG
TCAGATGAGGAAACAAAAGCTAAAGCCTTGAAAAAAGTAAAGGCAATGCA
TGAGAATATTGGATATCCGAATGAAATTCTTAATAATACAGTAATTGATA
TTCTCTATGAAGGGCTGGATCTTGGGGAATCCACTTATTTCGAAAATGTG
CATAGTTTATTCAAATGGACAATGGATTATGTATTTTTAAAAATCGAAAA
TGAGGTATTTTTCTTCCCTTTAAAACTATCTTGAAAGATAACTATTGCAC
GTAAACTTAGCAATAGACATTTTTATAATTGAATAAGTATCGTACAATTG
ATTACTTATTAAGTTCAATTGGGCTAAAATATTTTTATAACTATACAAAA
NNNNNNNTAATTAATACAAGCCTGGCTCAAGAGACTATAGAATGATTCCA
AATAAATATGGGACATCCATGCTACCCATGAACTCATATTGTAACCAAAT
TTTGATGAGATGTTCCTTTATACAATGTATGCAAATTTGTGAGATTTCAG
CCTGAAATTTTGCGTGCATCAAAAGTTATAAGGATTGGATAATTGTTCTA
GCTTAAAGTTTATACCTTTTGAAATAATGAGGCAACGAAGAACTTAAAAT
TTCACTCTGAAATGGTGCAAATTTCCATATCTTATACAAAAGAGGATTTC
ATCACAGTTTGCTCAAAATCTGAAGTAGTGATGAGAATCAGGTATATTTA
TAGCTGGTCCGTTTGTTTGAAATTGGTAATCTGAAGGAATCATTTTCTTT
TCTTCAGCTGTTGTCTAACTCCGGAGGAGTGAACTTCCTTTTCTAAAACA
TTCAAGTATATTCAAAAGCTGATTGAACATTTCTTTGTGCTCATAAAAGC
CAGATGATTTGTTGCGGAGTTATAATTGTAAATCCTTGTTGGACTCAGAT
TATAATTTAGGATCGACATTGGAGTAATTCTTGCCAAAGTCCTATTTGAT
TTCCTTTCACCTCTTTTCCTTTGTGACAGCTGACTGTAGCTGATCAAATA
AAACGGCATGACTCCTAATCTACTCTCCTTCAAAACATTATTTAAATTGT
TGGGTTCACCATGTTGATTTTCGGTTTTATAACACGCCCAATATACACAA
AATTTTCATCATTATTGTTTCGAATGGGAGTACCTAACTCCATTTTGTAG
GCCTCGAAATAGACCAGTAGACCATATAATATATACGACGTCATAATAAT
GAATACGTTACGTAGCTTAGATTTGGTCTTATTCACGTGCAATGGTAATC
GTATCAGAATGTATTAAATACTACCAAATTATGTTTTAATAATACGTCAT
CTTCATACCCTAGATAAAGTCATATGATTGGACAGATTTGGTAACACCAA
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GCAGGGATTTTGCAAGGCAATTTTTTTTCACTACATCGACCCAATTATTT
AAACTTTGGAGCCATTGGAATGGCAATTGGACATGAAATCACGCATGGCT
TTGATGATACAGGGCGCCAATTTAATTTTGAGGGTATGAAAAAATATAAA
TTGTAAGTCGACTAGTTTCATTTTTACTCAAAATTAAGGATGGGTCTCGT
GTACTTTAAAAAGGAACTGGTAATTGAGCTTTGGACTAGGTATTTATCAG
GATTTTTTTAAATCCTATGAGTCATTTGTAGTTATATGGCCTTAACAACA
AATAACTTTAAAAAGTAAAAAAGAATAATGCACTCTTGCAACTATGATCG
ATGCCTCATAGGCGCTAGAGGGGCTGGANGTAATTGAGCTTTGGACTAGG
TATTTATCAGGATTTTTTTAAATTCCTATGAGTCATTTGTAGTTATATGG
CCTTAACAACAAATAACTTTAAAAAGTAAAAAAGAATAATGCACTCTTGC
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ATAAAAAGACAAAACACTTTTAATTTGGTTCCAGTGCCCCAGGTGATGAG
TACTGAGTATTTGGAGAAAAATCGCAGTTTAGCTACTAGAAAAGGAAAAA
AACGGTTGGTGCGTGCACTCATTTTTCTTTTTTTGTTATTCTTTAATAGG
TCGTCATTGTCTTCATATCTCCCTCTAAAAGAAGGATTATCGCCAATCTT
TGCTGTAAATTGATTTAAAAATACGTAAATATTTATGAATTGATCTACAA
TTAAACATATTTTCCCTGCACTAAAGAGAGGCGACAATTCTTCTTTTAGA
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GATAATTATAGAGTCAAAGACGGTAATTAATTAATGAACAATGAATCAAT
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GAGAGAGATATAGTTACGGTGTTGCGGTATTTATCTTTTATTTTTTTTGG
CAAAGTGTCCGTTCGGCTAAGGGGTCATTTGACAAAATGGTATTCAGCAA
CGTGTTCTAGAGCCCCCTTAAGTGATGAGTGAGAGAGCAGGAAACTAACC
TATTATAATTATATGTGACATAACCTTCTTGAGTTTTCAAGACAGATGAT
GACGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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TCAAGGCATTTTCCTAAGTTGACTGCGACCTACAATCTACCACTCTATGA
CTTTTCCCCTTGATATTCTGATACAACATTCCCGTTTTGCAGGGGATTTA
TTTGACTGGTGGAATCCTTCAACAAAGTTAAAGTTTATCAATAAAACTAA
ATGTATTATAGAGGAGTATGGAGATTTTGCATACCCAAAGCTCAATACGA
CAGTGAACGGTGTGAACACCCTAGGAGAAAATATTGCGGATAACGGGGGC
TTAAAAGTAGCATATAGGGCCTACGGTACGATTATAGATAAATACATATA
CATTTCTACATCTTATAATAAATATGAAATAGCTTCCTGGCTCAATCAAA
CATCTTTTCCGGAGCCCCTTCTTCCAGGTTTAAATTTTACAGAGAAACAA
CTCTTTTGGATCAGTAATGCCAATCTTTGGTGCACAAAAATTAGAGGCAA
GACATTGGAACAGAAAATAAGAAGGGATGTACATACACCAGCTATGTTTC
GTGTTTTGGGGGCATTCTCAAATATGGTTAAGTTTGCGGAGGATTTCCAA
TGTCCAATAGGATCACCCATGAATCCCAAGATTAAATGTGAGGTCTGGTA
GTAAATTATACAGAGGATACTTCAATATCTC back to top
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