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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s128 | supercontig | LSalAtl2s128:1952833..1965919 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000001661 >EMLSAP00000001661 ID=EMLSAP00000001661|Name=EMLSAP00000001661|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=692bp
MRYICQSLREEKFYCSSGFTYHKSPDTCYRVSNGTYDYFNAIKDCQDHGG HLASFVFIGKHVDVTFLNEWVIYNDQNCTVHQNGQFELRDCNERHAYTCE QKPQHCPRNYSLNTALNICYFFSKDLRTYFEARNDCASNVPHASSALVNV ANGNVKSYIERSVDYPVFVGANDLVKRDEFVWESDGHTDQLQWENDLDCG IYGNNGHDVTKCDDNHAYVCEYEPKIICPANYYKFPNVSSCFYLSNDWLN YTDARNSCPYTAPSKFNSRLASITDTSVQALIEDQFPLPIYFGLNDLSHE GYPEWDLGDPYDKNQVSHWNDTYDCVYYNGKNYGLDQCKETKLYGCETEP SLIVEHQDFCLPDYLYFQESNXCYHISEQNRTYEEARKYCKSRNPIRGSS LASVNKEDLIKIVSNKLGSKEFFIGLSDLKTRGEYVWENGKDYEDLAYRI SDENNQDPDCVLASKNLNRVRGDCKESKLFLCETIPAYCPFGFFYFEATD TCLFYSKEKLDFYHAKNRCRSMSPKKGSHMVVVTDKRMNFLLFGDKSILQ WDNGDEYDPELSTPLLGPSGFHDNIKKCFGVNSWNDRLNYAYQPWKCEAR LHFFCQVAPNYPQLPPSPPELHYKDEYVKCRCILISLYVKSKILYCSEAI YYNDEFTILPTLHWVIRGLLLDGFSCDIFICMFNIQIEFCGX back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s128:1952833..1965919+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000001661-697508 ID=EMLSAT00000001661-697508|Name=EMLSAT00000001661|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=13087bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s128:1952833..1965919+ (Lepeophtheirus salmonis) CAAAATTATCTTTTCATCATTCTTGCACTCTATTTGTAATATTTTTTTCT
AATATTTATGAATTATTTGTGTATATCGAAATCTTTACACGGACTATTTT
TAGTTTCATGACCTTAAAGTGAATGGGACACTAATTCTCGACCACTCTGT
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GCTTAATGTTATTTATAACAAATATCTAAATATATTTGTTTGTTCCATTC
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AAGAGTCAATTTTGTTATTTTTTTAAGCTCAACCAGCATTTTCTCCCAAT
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AAGCATGTATCTATAAAATAAATTTATGGCTTRATTTAATCAAGTAAATG
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TTGTCCGGCTAATTATTACAAATTTCCAAATGTCAGCTCTTGCTTCTATC
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ATGACCCTGAATTGAGTACACCACTTCTGGGTCCGTCAGGTTTTCATGAT
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TTATTTGGAAAATTGCCTTTTATTAATGCCATTTTCGACATGGTGCTGCT
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TGTAAAAAGTATTTGTTAAAATGGTCAAATATGTCCAAAATACAACATTT
TGTAGCATTTCTTCTTAAAAAAAAACGTTCGATGAAAAATGATTCAGACA
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ATATGAAAAATTTCTACACGCTGAATGCACTTATATGTTATCTAGCGAGA
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CAGACAACTTTGAATTAATATTATGGATAGGATCTCTCCTTTTTTTTTAG
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TCCACAGACAAACTTTAACCTATCAAGTAGTTAATATAACATTAACACAA
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ATAGAATTTTGTGGAAGSTAAATTTGTTGTATTATAAATTTGATAAGATC
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TTATATAGTTTTAAAAATCATATCAGAGTGTTGTGTT back to top
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