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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s128 | supercontig | LSalAtl2s128:770444..780255 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000001676 >EMLSAP00000001676 ID=EMLSAP00000001676|Name=EMLSAP00000001676|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=460bp
MGSSTLRRSLVVFGAFIIMFTLGSNFTFGNMMVYLVSYMRKRSEVPDVTY
GDFIRVAALFGVTQGFIMCLSGFIVQFTGHKPCILIGALIFMSHTFMSLY
SIDGSLWQVSFTYGFIPSLGQNLAYLSTITLAMKCFPDKRATISGIVTAG
LGIGGFFFXELQTLYLNPSNLLPNELAKKGGSYDSLSSTNILFKENYFDQ
SEVLDRVPGILKILGIVYGILLSLGVFLMWDSFPCFTPQDGSYYTDYDCE
EKELLDRTEDSSVNQFKRNLYFIINQVEFRSLWLTRFFIILINNTFISFY
KAFGQTFIKNDLLISTTGSIGGIANFLGRFVFGLLMDKTSYKNIMIVSTT
VLTFLLASFYYTKDSGSLAYGIGLCSILFSLPSVFSTQPPIAQERYGSNL
GQLMMGLVATGDIFNNILLGSFSGYILETLGWGGLYGFLTFVGFGSLISV
LIFPSDNYFS back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s128:770444..780255+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000001676-697523 ID=EMLSAT00000001676-697523|Name=EMLSAT00000001676|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=9812bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s128:770444..780255+ (Lepeophtheirus salmonis)
GTATTCAACTATATTTCAAGAGGTCCTAAGGTATTTACTCCACACACCCC
CTCCTCCTTACCAATCCTCTTGATCGATTTCTTAGAAGATTGGATTGTAT
TTTTTTTTTAAAATGAAGGAAATAGTATTGCAATAATATTACTCACACTT
GAAGGTACTCCCTTGAGAGATGGAACAAACAAATATGTTTTGATATTTTT
CATAAATAACATTAACGAATTTATAATGATTTATTATGACGTTTAAACTA
AATGGGTGCAATTTTCCTCCATTGTAATCTTATAAGTGCAATTTTCCTCC
ATTGTAATCTTATAAGTGCAATTTTCTCCAGAGCAGTTTTCCGATTAGTG
AAAAATCCGGAGATAGTTCACTTTTCATCTGAAAATAGCAGTTTTCTATA
TGCGGATTTAGCTCCATTACACAGACTTTTCAATTTGCTCTAATTTTTAA
TCATACGACTGATGTAATCAATTAAAATGTTGAAATTTTGAAGCTTATCA
TCTATCAATTCATTATGCTATCAATTAGAGGAATCACAGAGTAAAACATA
AGTATGTTAATGTAAATCTCAGGCTATTAGGTAGGTAGTGTGTAGTGAGT
GTACTGTACTCTGTAGAGGTAAATTACTTATCTTKCGCRCCTGCCATTAT
TACGTGTGCGTACAGGTATGTCTTGTTTTTTCTATTGCAGATTCATTCTA
AAATACGACAGTTACTACCATTGTAGAGAAATAAGCGGACTAGAGGGATT
TGACTCAAGGAACTGATTATTGATGTTCTCATCTGCATAGTTCTTCTTCA
TGAGGAAATTGTGGGAGTCTGTTTGTAGGAGGTAAGCTGTTTTTTAGAGC
TCTTCTTCTTTATTTATTTTTTGTTACTGGGGTTCTTTGTGTTTCATTAC
TAACGGAAATCGTATTTCTACATTGAAGTTCCGTTTATTTGCACTATTTT
GTGACGTAAGAATTCCACTAAAATCCCTTGCTTTAGATTACTATTGTATT
TTCCTTCATAAATTTGCAGTCGCGTAGATGATAGCCCTGCGTAACAATAT
AGTGGAATAGTTAACTGTACATCATCTTAAAGTGTATAATATTAAATATC
AATATATCTACAAATTTGATTGTAAGAAGGATCTAAAGATATGATACGGC
CAATGTAATTAGATTCGACTTATTAAGTGAATAAATAATAAAAAATATAG
AGAGAAAAAATGTGAACCACTATTAAATTGAATCATTTGAAACAAGCCTT
CAGCCATGTTCCATTTGACCTTCATTTATTTCATCTGTAAACGATTTATT
TTTTTTAATTCCGTGATTTGGCATTTTCAAACAGATACACTTTTCAAATG
AAATCATGATATCCTTCTTTTTTTTTTAAATAAATAAAAAAGTATTGTAG
TTTTATAAATAAATACATTACTATGTTTTTTATCAATTTATACTAAATAT
ATACTTATATAAACAGATTGTACAAGTTACAATTTGTTCCGTCTCATTCT
GATTTATTGAATTACAACATCAGTCATTTTAGTTAGCTACTACTGATTGA
TGTTATCATTTTATTTTGATCTATTAAAATTACTTATTACCATATGTATA
TACAATTAATATGAAAACTGTTAAGCTTCATAATTTGCCACAAAACAGTG
CTTAACAAATAGTCTTTAATAATCATTCTCAAAATTTTCAACAATTACAC
CATTAATAATATATTAATAATCCAAGGAATATTCGCTTTTTGCATAATCC
TCATATCTCAAATGTCTGTGTGTTTAAAATGAATTATTCATCTCAGTATT
TGGTTGCAACTTTTACAATTTGCGCATACAAGTTACAACTTGTACATTAT
GAAGATATTATTCTATTTTCAATAAATCTAAATAATTTAAGCAAATACTA
GAGTTTCTGAGAGAAAAAATAAAAATGAAGGAACGGGGAAAAAGTTACTT
CTGAAGTGTTAATTCAGAACCTGAGACACAGTTTAGGATGTGGCGCAGGT
TATGGGAGGTGTCAGTTGAAATGGGACATCACCAGAGGTTATTATTTTAT
ATCTTATTTCTACATACCGCCAGAATATTAATCACTCGATATCATCAGTG
ACTGATATGACCATCCGGTTTGTGAAAAAAAAACAAAAAAACGGAAAATG
AACATGGTCACCCATACAATTTGAATAATGTTTGAGAGGAGGAAATCGCT
TATCTGTCATGATATGAAGGAAATAAACACAAATAACAAAGACATTTCAA
TTCATGGGGGTCGCGGGGTCATGGGGGTCTACTCAGAGTCTAACAAGAAC
CTACACATAACACAAATTCTACATCTTACTCTGTGTCTTTTCTCTCACTA
GTGATTACTTTTAACTTATATGTATCTCTTCAAGAATAATGATTAAAGCT
TTGGAAAATGCAGAACACTGTAGTATTTTGGGTTGAAAGGCAGGGGTTGT
CCTGGGAAATTTAGAATATTTAATAACCGGAATAAATATTATGTTTTATT
TTCGTCTCAAATTTTAAGAGTTTTTAACTCCCACAAATAAAATCCTGGGG
ACGACCCTGATTGGGTGTACTCACCAGCCTTAAAAAGTCGTAGATAATMT
AGCCATTATAAATAGTTGAAAAATAATGGAACACAATTGATAGAAACTTG
TTAGAAAATTTAAATGTGTCAACATACACCGCTTTTCCTCTATAAATAAG
AAACTTCTATTACCTATTAAAAACTATCATCATAATATCAATTAAAAGTA
TAGTGCTTCTAAAAAACGGATTTGTCGTCGTCATAAGAATCCCTAATCAT
TGCTAAAGACTCGAGTGTATCCCACTTAAATCGTATACATTTCAAGTTGC
TTTAATATCCAATTAATTAATTTGAATAATTTGCTTAGTTATAAGAAACT
TTGCATACGATATGCATTATACAGTTTATATTTCTTATTAGGAAACACTT
TTATTTGTGAGAAAATTAGTTTAAATATTTTAACTACATAATAAATACCT
ACTTGCAGAACGGTATTTTTATTTCCTTTTTGACGAATAAAGAAGGATAT
TCAATATCTCACAAAGCAATTTCTCCAAGGTATAAAATGTGTATTTTGGA
GTATTCTAATAGTGTGATTATATTAATATATATTTATTAATATTAGTAAA
AAGTGTATGAATGTTCGACATGGAATTTGGTATTAATCATCAACATTCCT
TTGATGTCATCATCATATCCTTAGTAAAAAATCAATATGTTATAGAAAGG
GCTTGAAATGAGTAAGAATTACGGGGGAATTCTATTGCTTTTGATGAAAA
AATACCCACGGCCCTGGAAAATCTCATTTCAAAGTTGTATTTATTATCAG
AGATTCAAATAATATGAAACGCCAGTATGTTAAAATAAAAAATTAACGGG
GTCACCTTGACAATATGAAGGATCTTTGGGAAGATAGGAGCTTAGCTGTA
CTAACGTTTCAATAAATTAGATGCAAGCAGCAATGATATAAAGCAAATAC
ACACATATCCCACTCCGAATCTAGCACAGATATAAGCAGAAATTACCGTA
ATGTCGATCCTCAATTATACTCCGAGTCCAACGAGGAGTTAGACTTATAA
CTCCACGACAAATACTCGGGGAGTTAATTTTCGTCTTTCATGCACTAGTG
ATGATTTTATCCTTGTTTATCTCTCTTCAAAGATAAAAGAATAATGAGGA
CAGCTTTTGTAAATAAAAAAATAATTTAGCTAGGAGTTACAAAAAGAAGC
AGATCTTAAAATTTCATATTTTTTTAACACCTGTTTGTTAGACATATACA
GATACCCAAATGTCAGCCGATTCTTCTCACCCACCATCCTCGATTTTAGC
GTGAGCAAGGCCTGGAGCATAGATAAATATGTTGGGTCTTTTTTTTTTCT
GTTACAAAAAATTTAAGTTAATGTTAAATTTAATATTTCGACAGATAACA
TGTGGGGATTTCGAATATTATTTTTTTTAGAAAATCAAATTCGGCCCCTT
TCATATTTTTTTCTTAAATTAATAGCCAGTTATAATATTCATTAATTAAA
AAAATCTACACATTACAGAGCACCCCAATCATGCGCCCAGAGCAAATACC
TCCATAAAACAGGTACTCGCACACACTTTTCATATCTTTAAATAATAAAT
TAGTATTTAATGTCCCTCGGATGATATTACCCCTCTTCTCCTGGAGGTGA
CCTTCTTCCCTTTGTCACCTCACTTTTAACAGCAACGTTCTTCACTGTCT
GGCCGTAGAAACTGGAGGAGATCCTTCTAAAAATGTTTAATTTGATTTCG
TACATATTTTGACTGGAATAAATAGTTATTAATATATGTTAGTCAGGCCC
CTTCTAATACAATAGTACTTATTTCCCTATAATTTCAAACAAAAAAACCC
GATTCAAATCAGATTTAATCAAGCTTAATTGTACAAAATTTACGTATTTG
TGGAATCGATAGTTTTTAGTCGATTCTGATACATTTATACATCCTTAGTT
TTTTGCCTTAGATAACTTCCTCCAGATTGACAAATTATTTGGAGTGACTC
TCTCTAACTTGGCTGAGACTTGTATCATTATACAGATCCCTCAAAGATAT
AAATGATCATTGATCATACATGTATTACTTCCACTTAAGAATCTTAAAAT
TTATCCCTCCCCTTTGTCTGTTTTTATCCAGAAACTGAGAAAAAAATACA
TGATAGCATTAACTTTACATATATTTTTTGAAACAAGAAATTATAGATAT
TTAGAGGACCATTTTTTTAAGGTGATCAAATTTTGGGGTCCATAAAAGAG
GACACTTGTTGTCGGTGTCGGTTTTATAATTTTTCTCTAACGGAATTACA
TTTTGATTCTGGTATTTTTAGAAAATATTTTTTCTTTTTTTCTTTTTAAA
TTTGTCCCAAATTAAAACAGACATTTTATGAATTTATAATGTAAAAGGAT
GTTTTATAGAGTATGCAAAAAGAGAACATGGCCGTGCATAATAGGGGAGT
TGATCAACTTAATTTCTTAACTTATTTCTCACTCAGCCCACATTTTATCA
TGAACGTTTCAAATTCATTGAAAGTTTAAGATTATATACATTATTGATCA
GTATTCTGCTGCAACCAGTGTCATAACTATGGGAAAACKCTTGGGTACAT
CCCCCCCCCCCCCTCAAACGATGCTTACCAAACTGAAATATAAATTGTAT
TCATCTAAACTGCAGAATTGTTACAAAATTCTTGTTCTTAAAGGTCACTT
ATTTTTAAATCCCACCAGAACTGTAACTTCAAATGTAATCTCTACCTAAT
CAACCTAAAGCGGGGTAACCCAAAAAAAGAAAGAAATTTTTGCTTTTTAC
TAGAAAATTCCTTATTTGAAATTTATATTTGAAATTTAATTTATCAAATT
TTTATCAAAAAAATGTAACTTTCTGTGAATAGCTATGAATTTTTGAAATT
TGTTTCCAAAAAATTTATATTTGCAATATAATTTTTGAAATTTTTTTCCA
AAAAATTTATATTTGCAANTATAATTTTTGAAATTTTTTTCCAAAAAATT
TAATTTTTGTGAATAAATGTAAATTTAAAAAAAAATCCAAAAAATTAACA
TTTGAACTAGAATTTTGGAATATTTTTGTGAGTATCTGTGGATTTATAAA
AAAAAAATTCTAAAAAAATTAATTTTTGGAAATAGCTATGGATTTTTGAA
AAAAAATCCAAAATATTTAATTTTTAGTGAATTGCTGTGTATTTTTGAAA
AAAAATATGCAAAAAATTTAATATTTGAAATTAATTTTTWAAATTTTTTT
CTAAAAAATTAAAAAACCCCTCCCACAAAAAAAAATAAAAAAAGGATGTC
TATAAACTTGTGTATAAATTCAATAATCTTCATGGATAATATCTATATTA
TGTACTTTTAGAACTAGATATCAAGTGTTATTTATGTGTATCACAACAAA
TAAAATGTTTTTATTAGAGAGGTATGACTATTTACTAACCTAGCTCCTAA
TTTTTGATGATATAAAAAACCTAATCAGATCTCAGTAATACTCGTATGTG
TAATCCTTTTAACATTTAAGGATGAGGAGTGCGTATACATAGAATAAATA
TAAGCACATAAAACCGTGCCCATGGGTGTGGTTCCTTAGTACAACACATC
AGGAGTACTGTTACTTTGGTAGGCACACATAGGTATACATTAACTGCTAA
AGTAAGTAAATTGGAAGAATATACATAATATGTATAAATTTGCTGTAGCA
TTTAATTTATACAGTTGAAGAGTGGTATGATATTTTCAAAATCCTAGCTC
NTATTTTTTTTTCTCAAATTACTTAATTAATGTTACGTGGAATATCATTA
GGATGATGATCTACTAATAAATGACATTTAAGATAGATAATCAAGACATA
AGGATGATATTAATATGATATAATATATATTTATATAAAAATACACTAAA
ATGAGACACTTTAAGGATTTCATTCCATTTTCACGCATCAATTTTCCATG
ATTGTGAAATGTTTTGGATTTCACAACGAAGGAAATATTATTTATTTTTA
ATGTGTAGTCAGAGCAGGAAACCAATTAAGATTCTTAATGGCATAATCAA
GGCGTGAGGATGGATGTATAAACATTTATTCATGACATTTTTGTCTTTGC
CTTCTCCTTCAAATAAATATACGATTTATATTTCCTAATCTTTGAGTAAG
ACCGTGAGTCATCTAAATTATGTAGTTCAACGTTTGAAAAGGATGTACGC
ATCAAGAAATATCCTATTTATTTTGATTTATTTATGGTTGTTTCTTGCAA
TTCATTGAGCAATTACTTAAATGGAGAAATACCATCTTAGCAATGATTTT
CATGTAGTTTACTACTACATGGAGACGTTGTAATCGTATTGCTCAAAATG
GGATTTTCTATAAATGCATTATTAGTAAAAAACGTCTTCGAGAATGAATT
TTTCTTTTTTACTCAGTCAAAGAATATTTCGATAAGCTTTTTCCTTATCA
AATTTTCGGTGTTTAACAATCCACGCTCCTAAAAAATATGTACTATTTCA
GGAGCAATCACTATTACAAAAGAGAAAAGAAAAAAAAGAGAGCTACTATA
TAGACAGCGAGTAGAATACCGGGGACCGTAAGAGCAAAAAAAGTCATTTT
AATCAAGAGGAATAATAAAATCATGAGACGAAGGACTTCAGAATGCCTTC
AGAGTTTCTCGGAGATAGAAATTTAAGTTTAATTTACTTCCTTGATGAAC
GCCAGGATTTGAAACAAGAGGAAACCAATAGATCCACTCAAATCCTTGTG
TCTCAATTTGAAGATTCCCTGTTAAAGGACTCAAAATACGTGAATGTTAC
AATATTTGGCATTATATTTATTTTCATATTCCTCATATCCGCGATCTACT
CCTCATTGGTTGGCTACATCTCTAAAAACCAGCGAGGTTCTAAGGGATTA
CCACATTCTGTGCAAGAAGGACGATCAAAGGCTCTCTCCATTGATAAAAA
CTATTCTTTTCACGCGTCCGAGGCTATTTTGTACTGATAATTGAGATACG
CAATGGGGTCAAGCACGCTTCGCCGTTCCCTGGTTGTTTTTGGAGCGTTC
ATCATTATGTTCACTCTAGGATCTAATTTTACTTTTGGCAACATGATGGT
CTATCTGGTTTCCTATATGAGAAAACGCTCAGAGGTTCCAGATGTAACAT
ATGGAGATTTTATTCGAGTTGCAGCTTTATTTGGTGTGACACAGGGTGAG
TCGATATATTCTACATTCATATTTTATAATAACTGTAGTAATTACTTCTT
TGACATTTACGTGTACCTATAATTGTAGGCACATTTGGCAAAATGCACTT
ATAAGAAATTATTTGATATTTGCATGTCCAAAATAGATCTTATCAATCAT
ACATATTTCCCTCCTCTTTATCAGGGTTCATAATGTGTCTATCTGGATTC
ATTGTACAGTTTACGGGTCATAAACCATGCATTCTTATTGGGGCACTGAT
ATTTATGTCTCACACATTTATGAGTCTCTATTCTATCGACGGATCCTTGT
GGCAGGTACATATAACAACGAAAGTTTGTAAGCGCAATTAAATGGTATTG
ATCCTCATTTTTCTCTTTTTTCATAAACATAGGTGTCCTTTACATATGGA
TTTATTCCTTCTTTGGGCCAAAATCTAGCATATTTGTCTACAATCACATT
AGCTATGAAATGCTTTCCTGATAAAAGAGCTACCATCAGGTAAAACACAT
TGAGTTAGACCCACCTGCTGGTACATTCATTGAATGCTTTTAGAAATGTC
AATTAATATATATCATACATGATGGCACTTAGCGTCATATCGTCTTTTCT
ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTACCATTAATGCTAGATCACTCCCCTAA
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TGGCATCGTCACTGCTGGACTTGGAATTGGCGGKTTYTTTTTTWACGAGC
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TCAAGATTCTTGGAATCGTCTACGGTATTTTACTAAGTCTCGGAGTTTTT
CTAATGTGGGATTCCTTTCCGTGCTTTACACCTCAAGATGGATCATACTA
TACGGATTATGATTGTGAAGAAAAAGAGTTATTGGATAGAACAGAAGATT
CCTCTGTGAATCAGTTTAAAAGGTTAAAATTGATATTTATTCGTCGACAA
TTTTATGAATTTTTCTTCTTAAACGAATTAGGAATTTGTATTTTATAATT
AATCAAGTTGAGTTTCGATCTCTATGGTTGACCCGTTTCTTTATAATACT
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TGTTTTTTGAGTAATTCTTTAGGCATTTAGTTTTAATATATCAAATTTAA
AAATAAAATTGTATGTACATACATTGTAATTGTTCATAATATCACCGTTA
GACTCAATTGCGGAAGAATACATCATATTCTAATGCTTATTGATTACAAT
GATAATACATATTCAATTTAAAAAAAAAAGTGAATCATTACGAAGCTTTT
CTTAAGCTTGATCTTAATTATGATGACACTAAATTATTTATTCATAACGT
CATTTAGAATGATCTCCTTATATCAACTACTGGATCCATTGGAGGAATTG
CCAACTTCCTGGGCCGCTTTGTCTTTGGATTACTTATGGATAAGACATCA
TATAAAAATATTATGATTGTATCAACCACAGTTCTCACTTTTCTACTTGC
TTCGTTTTATTATACAAAAGATTCTGGTAGTTTGGCCTATGGTATCGGAC
TTTGCTCAATCCTTTTCTCCCTTCCCTCAGTCTTTTCTACTCAACCACCC
ATCGCTCAAGAAAGGTACATTTTTTATTATAATATTTATTTATTATCTCA
TATATTTTTTTAGATATGGGTCGAATCTTGGTCAATTAATGATGGGCTTA
GTTGCCACAGGAGATATATTCAACAATATATTATTGGGTTCTTTCAGCGG
ATATATTTTAGAAACTCTAGGATGGGGAGGATTATATGGTTTTCTAACAT
TTGTTGGATTTGGATCCCTCATTAGTGTTTTAATTTTTCCCTCTGATAAT
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