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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s12 | supercontig | LSalAtl2s12:1154101..1167433 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000001737 >EMLSAP00000001737 ID=EMLSAP00000001737|Name=EMLSAP00000001737|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=284bp
MNFLPRILLLLSSVFIQPQGAQGRQSFEDRPLYTEVNPGDDTILLCRIFE KSRNSDCIWQKDGKPIRMQPGKYEWDGIKESGDCSLRLIGADIEYDDGMW ECQVSPSTYDANDALSSNPARLIVRVPPSDPRIYYDDQYLTSEPSIHIPA GRPVRVRCESRNGNPPPALRWFIEEEEIPGSSQTNETGNSRLFNAISNVE LILSKDDNQKNLKCVAFHEAYSRKMREIRVQMDVLYAPIVTLEKNRNASE LEALVDDVSFRCLTDANPPASVYWRKAGGESRYP back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s12:1154101..1167433- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000001737-697584 ID=EMLSAT00000001737-697584|Name=EMLSAT00000001737|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=13333bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s12:1154101..1167433- (Lepeophtheirus salmonis) ATGAACTTTCTTCCTCGGATTCTTTTACTCCTCTCCAGTGTTTTTATACA
ACCTCAAGGTGCCCAGGGACGTCAATCATTTGAGGATCGACCACTTTATA
CAGAAGTGAATCCTGGGGACGACACAATTCTCCTCTGTCGGATATTTGAA
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CTTCCCATTTTCTTAATTATTAATGTGATTATTGAGATACCTTCCCTCCT
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ACTGGACCGGACTGACACAACACTACCCCTGCTATGTGTCCTCTGTTTTT
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ATAGTTAGAATTATCCGATTTAGATGGTTCCAAACAGTTTCCCTGCTAAT
CTTCATTTACTGGAATAAGTCCTCACATGCCGGTTCAACTCGAAGATTTC
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CTCGAAATTTTGAGTTAGGCATCAAGTTGAATTCATATTTGGACAATATA
CTCATTTTCAATTTGAATCGATTTTGATTATTGAGAGTTTCCACAAAATA
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ATTATTTAACTTTGTAACATTATAAAATGTTCGTATTATACAGAAAAATA
TAAGATATTTTATTAAGATATGTGCAATAATCTTAATATATATATCATAT
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GACCGATAATTAAGGACCAGTCCCAAGAATACACAGTTATAAGGAACGAC
GGTCTTAAGGACCAGCCCCAATGAACGAAAGTCTTTAGGACTGATCCTAA
GGGTGCTGGACGAATGCAACACTGGTTCACATCAGTCTCTAATAACATGG
TGTCAACGAGTCTTTTCTAGGAACTATAACATAAATTTAAAAAAAATCCC
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TACACCCCAATCAAAATTTGTTATTTCACCGTACATCTACAAAGGGGGAT
AAAGCGTGCATAGCAACTCAAAATAAAACTATTAGAAACAAACGACTACT
ATTGTAGTTTCTTACGTATTTTGAGTTATAATAAAAAATGGACTAATTGA
ATTTCCACCCTGTTCATAGTGATACTAAAGAATGTATCGAATTTCCTCTT
TTTTCAGAAAGTTAGCTGTAACTCACAACTGGGTTCACCAAAAACAAAAC
TCTAGATAAACTTTTTTTTTTAAATGTACACTTAAACTTTAGTATACTTT
AAGCTTTTTTTTTATGCAATGCATTGATCACTATAGACATCTAGCAAAAA
ACACTCAGAAGTTTTTACTTAACCTAATAATTCTGGCGAATTTGATTGAT
TTTCAGAAAATGATCCACTTTAATAAAGTCGAGTTTATTTTGAGTTCGAT
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TTTAACCCCTAAAAAATTACTCTTGATGAAATTGTATGGTAACAAAAAAG
TTACTTTAGATCCTAAGTGATAATAAAAGTTATAAATCATTGACAACGGC
AATACCCACGTTTGAAGATATTGAACATTTCAAAGAAGCTTTAAAATTAA
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TCGATAANNNTTAAAGGAGTTTGAAATCAATGTAATGGTAAATCTTGCCT
AAAAAAATAAAGTGTTTAACTAAAAAAAATATTCACTCTAAAGTACTTTT
TTTTCAACAGGGCTATTTTGGTACAGTGTTGAAACTTGTTCTAAGACCAA
ACTTTAAGAACGGTAATAAGGTATTTTTCCTAGACCGATTTGAATCCCGT
TCTCAAAACGTAAAACAATATTTACAGGCTCAATCTATAGACCAATTTTC
TTCTCCATCCTGATTCATCCGCTGTACAGATTTATGCAACAAATTTCATC
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TTATCAGCATTTCATATATAGAGAATTATCACTAACGTTATAATTGAATG
GGATGCTTCTTGAAGCCTCAAAATTGATATTTTGAATACATAAAATAAAT
AACTTTCTCATAAATATGAATGAAACTTCATTTAATGGCTTTAAGAATAA
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ATGCTTATGATAAACAAACACTAACATTTCAATTAAATTAAAGTAAGATG
TACCAAAAGTGGTTAAACTTCTTTATTTTTTTTTGATCGATTAAGTAGGA
GAAAAATAGGATAATTTGAGAAAAATATCTTGATCTTTCCAGAGTAATAG
TTAATTTTTACATATAATATGGAAATAGGATTGTATAACTATGTAATGAC
AGATATTTAATGGATATTAGGGTAAGATATTTGATAAACCTAGGTAATTG
AGGGAAAAATTAAAAGGTTTAAAACCTTTTATTACTTCTTTCAATGTTAT
AAAACTTGGTTGTTGAGCCTGATCTGTTCGACAATTGAAAGAAACGAAAA
AAGTCAGACTCGACTTATCTGTATATATAATTATATATACGAGTTTGCTT
GTGTGCGTCACTTTATGGGCCAACTCACTTTTGGGTTTAGGAGCCTGAAA
TTTTTCATGGGTACCTCTTTTGAACTTGGCCAGGCGAAGACGGGATGCCG
ATTTTCGGGGCGGGGGKCATATAAAAGGGATTAGTCTATACCCCCAAAAC
ACAAAAAATGTTTTTGAAGCTCAAGGAGACTTTATAAGGGGCTGAGTTAT
AATTAAAATGTGGGTTTTCCAAAAAAAAAAAAAATAATAATAATACACTA
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CAAAAAAAAAAAAATGGATTTTCTAATGAATATTGGATTTGTAAAAAAAT
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TAAAAATTAGTGTAAAATTAGAAATATCTCTCATTTTCTGAATTTTTTTC
ATCATACGTCAATCTTCAATTTTTAATAAGACATGCCACAAAACGATGCA
TTTTGGACATAAATTAAAACCCTAATACTAAACATTAGTATTTTCAATTT
CTGGAACATTTTATTATATAACTTTTGTAAAAATAAGTCAGATATATATT
ACTTTTTCAACAACATTATTCTCCAGACTTTTTTTATTTTTGCAATTTAC
GAGTTTTTTTATGGAAGATTTGTGCTCCTTTTTACAATGCCAATAAATGT
TATTGACTATAGTAGTTTTGTGCATTTTTCTTTTCAAATTTTGATTTTGC
AATTTCTTGACAAAAATAAAAGATGGACTTCTCATATAGACAAATTTTTC
CATGGATAGATGTGAATATGTTATTAGAAGTCTATAACACATTTAAAAAA
ATAAATCATAATAATACATATGTTATGCAGGCGCTATCTTATAATACCCA
CCCACACTGAAGGGATCTAAATATGAAGAAGAAATAACACTGACCATTAT
CAATGTGATTTCCTGCTCCCTTCTTGACCCGAGGAACACCGGGTAACCCT
TTGCTAGTAAATATATATAAGATKTTKKAAATGATCTCGAATCCAATTAT
TGCGAGCCCTCATTATTCGCTGTTGATACAAATCAGAACTTGCTACAAAC
GGTTRAAMCCTCCAATACATATAAATATTAATAANNNNNNNNNNNNNNNN
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CCAATACATATAATATTAATAAATAAGACTAAATGTAGTTTGAAGACAGT
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ATGCAAAATTGAATTGTCCTACGAGGTCATCTTTACGTCGTATATCTCGA
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AATAAAAAACAACTCTTTTAATTATTTTGCATAAAATAATTTTGATATAC
CTTTTTTAACTAAATGTTCAATTTTTTTTTAAACAAACTTTGTTTTATTA
ATATAAATAAGTACTCTTCAAAAAACAAAACAAAAAACGTATAACTTACT
ATGATTGATATATGTATGTATATTAAAATATGACCCACTGAGCTACACCT
CCTCGTTGCTACCTTTTTAATTTCTTAGATCAATTAGTAATGCTCAAAAA
TGAGGTATTGGAAAACATACAGACAAAATTTGGTTTAAAATCTAGATATA
TACTATAAATCAATTCCATTATGTAATTGATTGCTGAGTTGATGATTCAA
TAACCACGGAATATTAACAAACTAAAGTCATTTTGTAGTAAAATTTGATA
AACCCCTCTTTTTTGTTCGTTACATTAATGACTTTGGTAACTTTAGTTGC
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CCATAACAATTTGTGAGTTGTCTACTTTGTGTTCTCATAAAGTTTTTGTC
GAATTCTGATACATTTGTACTTGAAATCTAAACTTTTAAGATCCAATAAA
TCTTTTTCCATAATGTTCCAAAAAATTGGGGAATTAACGGCTTAAGTCAT
TTCTGTAGAAAAATATATTAGCAATAAATTTTTATCTATATTTACAAAAA
TATCCATTACAATTTGTTATCTATGTATGTGATGAAAAACTACAAAAAAA
ACAAAAAAAAAACACACACCTTGAATAATGAGTATTTATGGTCCAAAAAT
GAAACTGGGCATGATTGAATCCACGAATAAAGAAATGCAAAAGCGTGAGG
GCTCACTGTATTTATTAATTCATATTGCATTTTGTGTATTTGATCATTTA
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AATTTAGAAGCACAAATGTGTGAAGATACATTCAATTATTTCTTGGCTTA
AATAGACCGTACGTTTCAAATTGCACTGCACTATAATGACATGTAATATA
ATCATAGTTTTTCTTCAATGACTTATCCCCAAATAATTAAAAAAGTACAC
CAAAATAATCCCGTTCTGTCCTAGATATATACAAATCTTGGAATAAACAT
AACATATATATTATAGATTGAACGTATCTACAATATAGTTTAAACTTTAT
TGTGCTAAGCTAGAATGAATTTATATATATAAATCCGTTCACTTCCGAAA
ATAGAATAAAGTGAGCACAAAAATATTTATCTCTATGATGAAGTTATAAT
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GTGTTAGGTTTCGGTTTGGAAATCTTAGACTGGTTCGAACTCAGATTCCA
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AAAAAATTTCTTAAGACCAAAACGGGGGGGGGGGGGGATGTGAGAAAGCA
GTCTCGGACCGAATCTTAACTCTAGTATATACCTACATATTTGCATTTCC
TTTGCCATGTCACACTCACTTCAAATTCTTATTTTTTTGAGACAAAATAT
TACATGTACTAATATAATGCATATTTCCACAGATCATTATGAAAATATGG
TAATTTATTTTCATTTTATTGTCGACTATCTTATTGCTTTAAAATGCATT
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TATCGTGTAGACACTTTTTATTCAATAGAAAAAATGTCTAAAAACCTTGC
TGTTATAATAAACAAATGTGGGATTAAAATATTGGACAAAGTTATAAAGT
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ATTGTCAATCGAGTAAATTATGCAGAAGAGGAAACATTTTAATATTTGGA
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AAAACCAAAAAAATTAAAGTTTTGTAAATAGCTATGGATTTTTTTGATTT
TTCTTTCAAAAATATTACAAAAACTAAGCCCAAAAAGGTTAAAACAAAAG
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AAGAACAGCTGTCAGGACGTTTTATTAGATCAGCTGTAATCAGCCGTGAG
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GTTGGAATTACTTCAATGTCAATCCTCAATTCTACTCAAAGTCCAACAAG
GGCCTATTCTTATACCTGCCTCGTAAATCCTCATTCTTACTCTCGGATAT
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CTATTGTAAGATTTATACTTCTTATGTCAGAAAATCGGGCGTGCTTTTAA
ATCTTTTTTCATGAAAATATTGTCTCTAAAAATATTTGGCTCACGCTAAA
ACTGGCCATGGCCTCAATTATTAACTTTTATTATTATCCCTACCCAGATT
GTGATATGGGCCCTACAAAATCTGTTTCATATAGAAACACCAATACTTAA
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TGTGTTGTTGGCTTGTTCTTTTCCCCTTATCATTGTTCAGAAGTTATTGT
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TGGTACTGGAAAAGAATGTCTCAAGGGCGGTCCGAAACCTTTTTACTGGA
TACAAGGAGKTATTACTATTCGCTCCTCAATATTMCCACCACTGGAGAAC
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AAGAGGACTACTTCACTGGTCCTCAAGTACAAAGGAACTAGGCGTTTTAG
ACCAACAAATCCTTTTTCCATAGCTCTGGAGTCAATAAAAAATAAATGAA
TAAGAACGGAACTACTAGGTCGTGGAGAAACCTCAGCGCCAAAAAGCTGG
TAACCAAACGGTTGGAGATACTAGGTCCCCTTAGAGTTGACTTCGATACA
AAAACACTATTTTTATAAACCTTTTTACTTCATCAAAGCAAAAATGGGTC
CGCTACAGATTCACTACCTCATCAATTTATACGAATAAGTCGAATAACGA
GGATGAGAGTATGAACTGCACATTCTGTAGCGAGAAAATATAAGTGTCAG
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GGTAGTGGCCACCGATCCGAATCTTCCCAGAGCTTTTAAGGTGAAGGCCA
TCATCAGTAAAGTGCAGTTTATAATATATCCTTGCAGATGTAACAAGAAA
CCCATGCCAACAAATTTGGAAGGTGTAAGCGAAAAAGAACTCGAGGTTTT
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TGCCGAATGGGTTTAAAAAAAATAATAGTTGGGAAAAATAATGGCCATTG
ATTTTTGCCTTTTTTATGTTTCTTTTTATAAAAAGGGTGCTAGATATAAA
AATGTAGCCATATTATATTTTACTACAAAGTTATACCTAATAAGATTACT
TTTTTAACAGTCTCACAAAAAATACTATAAACTAAATTATTTGAGYAATG
TTTTGTCTGTCTCTTATAATATGTCAGAAAGACAGGCGATAGTTAGTTTG
ACTCAAAATTTAACACAACTTAATAATATATGTTTACAGTGTTTGAATCT
ATTTAGAAATCGTCTACCTTACAGTATTGTAATATGAATAATGCATAAAA
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GTATCCTTTCGGCAAAATGACATTCGGTAATGGGTCATAGAACCTTTAGA
AATATTAAAAGACGAGTTGCTTTTCCGTAAATTGTAATTGAATGCAACAC
GTCAAATGTTTCAACTGTTACCAAAGCCCGGTATGGTTGCAACTAAGTAT
GTGTGGATCCTTATTTAGGACCGAGGACCGGGGTCCAGTCCATATTGGTC
CTATTCAGTCCCAATTTTGGTCCTTAAAGAAGGTAAAATCAATCCCTCGT
GACGTCAAATAGGATGTTTTTCTTTTTTTAATTATTCTGTTACATAATAG
AATAAACTATATAATCAAGTAACAATATTATATGTTCGTATTATAATGAA
AAAAGTCATACTTTTTTGCAAGATCTTAATATATATTTCATATATCTTAT
TTGCCTTAATAATCCTTCGATATTTTTATGAAAAAATCCAAGGAGTGAAT
AAAAAGGAAAGCCACACCACTAGTTGCAACTGTTAAAAAATATCAAGTTT
GAGTTAGAAATTAAGACAATTAGACTAAATAACATTTCTTGAGGAATTAA
CCAAAATAGATCTTACAAGGTCCTGAATTATTGACTTTCAATTTCAATTA
TTATAGTAAATTAAGATAAGATACAATGGGATTTATATTCTAATCAGTAT
TACAGATTGGAGAAATTTACTCTTACAAACTATTGACAAAAATTTAGACT
TATTTATAAAATAATTTGTATTTGTAATGGTTGATTTTGTGTTTGGAGCT
TTCTTGATGTTAAAGGATATGCTGGGGATTTAATAATTTATTTGATAGCC
ATGTATGTATATGTAGGAGGTGATAGCTATCTATGTTTTAATTAAATTTA
TAGGCATGTGGGAATGTCAGGTGTCTCCCTCAACCTATGATGCTAATGAC
GCCTTATCATCAAATCCAGCTCGACTCATAGTTCGTGTACCTCCGTCAGA
TCCACGCATTTACTATGACGATCAATATTTAACCTCTGAGGTTTGCATGA
TATATATAAATTCTTATAAGCAATCCATGACTAAGAGTCTTTGTTTGTAT
ATTTCAGCCAAGTATTCACATTCCAGCAGGACGTCCCGTACGCGTTCGTT
GTGAAAGTCGTAACGGTAATCCACCTCCGGCTCTACGATGGTTCATAGAA
GAAGAAGAAATACCTGGTAGTTCACAGACCAATGAGACAGGGAACTCTCG
TCTTTTTAATGCCATATCTAATGTAGAACTGATCCTTTCCAAAGATGACA
ATCAAAAGAATCTCAAGTGCGTTGCATTTCACGAAGCTTACTCTCGAAAA
ATGCGTGAAATCCGCGTTCAAATGGACGTTTTATATGCTCCCATTGTCAC
TCTGGAAAAAAATAGGAATGCTTCGGAATTAGAGGCTTTGGTTGATGATG
TTTCCTTCCGCTGTCTGACCGATGCAAATCCTCCAGCTTCAGTTTATTGG
AGAAAAGCGGGTGGGGAATCACGYTATCCGTAA back to top
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