EMLSAT00000001772, EMLSAT00000001772-697619 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000001772
Unique NameEMLSAT00000001772-697619
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s1300supercontigLSalAtl2s1300:120944..130578 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000001772 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000001772EMLSAG00000001772-684538Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000007848EMLSAE00000007848-716776Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000007849EMLSAE00000007849-716777Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto772650auto772650Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000001772EMLSAP00000001772Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000001772

>EMLSAP00000001772 ID=EMLSAP00000001772|Name=EMLSAP00000001772|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=129bp
MDILFKEANAIFEKTAENQDEVNYIVLKEDNSLFVKTEENDNQYVDYEEM
NIFMKVASYFFELSAKKEKSATKRLIKDNKLPETEKASIIEMVEKNDIAK
DDEVGMPLKEAKSLFELTAEKEEVMNNEL
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mRNA from alignment at LSalAtl2s1300:120944..130578-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000001772-697619 ID=EMLSAT00000001772-697619|Name=EMLSAT00000001772|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=9635bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1300:120944..130578- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGATATCCTATTTAAAGAGGCAAATGCCATTTTTGAAAAAACAGCGGA GAATCAAGATGAGGTGAATTATATTGTATTGAAAGAAGATAATTCATTAT TTGTAAAAACCGAGGAAAATGACAATCAATATGTAGATTATGAGGAAATG AATATCTTTATGAAAGTTGCAAGTTACTTTTTCGAGTTATCAGCGAAAAA AGAAAAGTCTGCGACTAAGCGGTTGATAAAAGACAATAAACTACCTGAAA CAGAAAAGGCTTCGATTATAGAAATGGTCGAAAAAAATGATATAGCGAAA GATGATGAAGTGGGTATGCCTTTGAAAGAGGCGAAATCGTTATTTGAATT GACAGCAGAGAAAGAAGAAGTCATGAATAACGGTATCTTTAATATATACA TTATTTTTTTAGACTGTTTTATTTGACTGCTAATGTTTTCTTTTGTAATT TTTATTTAAAAGAAAATTATTCAGACTTCTAAAATTAATTAAAGCTTTAT TTAAGCATTACTTGAGATTTGTTTTTATTATAAAGAATATTTTTATTGTT TTAATAGTCTCCTCCGCCTTTAAAAAAAATCCTAAGTAACAGCCTTGATC TTAATTATAATTTGTATTTATGTATATAAAAGAGAAAGTGTGTCTGTCTT TATATGTCCTTTATATGTTCCCACACCGTTGAATTTAGGAGTCCTAAATT TTGCATTGGACTGGATAAGACGGGAATATTTATTTGGGGTGAGGTGGGGG TGTTTTTTAAGGGGGGTGGGGGAGCTTATGCCATATTATTTAAAACACAA AATCTTTTTTTGCAGCTCAAGGATACTAAATAGGGTTTTTGAGTTATTTT TCAGAAAGAGATTGGCGTTTCAAAAACAACTATACTAATAACTACTTTTT CTAAATTTATTCAAAATCCAAAAAGTTATCGGTAAAAAAAAAATCTGTGA AAATTGCAATTTCGTTTATTTCAGGTGCAAAAAAGTTAACTTCCATTAGA ATATGGGATTAGTAGATTGAATAAAATTCGTAGATATTTGTCTGGAGATT GGTTTGCATATAAATTTGCCTTTTAAAAATTGACGTTTAACTGAAATATC TGTCATTTTCTGAATAATTTTTCAATGTTTTTCCTCTTTTTTTTTCATTC TTTCATCAAACATCAAATTATAATTTTTTAAAACGAAATGCCACGAAATG ATCCGTTTTGGACATAAAATTTTAGAACTATTTGAAATAATAGTATTATT TTCAATTTCTGGAACTTTTTAGGACATAATTTTTGCAGTTATTGAGGGTT ATTTTTTCGACACTATTATTTTTGATAACTTTTTGTTTTTTCAAGTACGA AAAAAATATTGCTAGGTTTGTGTTTCTTTTACAATTCCAATAAATACTAT ATACTATTTTTTGCAAATTATTGAAAAAAAATGCAACTTTCCTTGCGAAT ATCAATTTGGGAATTTTTTGAATTAAATAAAAATTTGACTTCTCATCTAG TCAATTTTTTAGGTGCATATATTTTGATATATTATTTGAAGTTTATAGCA CATTACTGTTATTTTATATTCATAATAATACTTATTAAGTTACAAGAGGG AATGATAAGAGACTATGATGAGACTTTGTAGATTACTTAACTGAACTGGA TTGATATAGTGTAAAAAATTCCAAGATACTAAGAGAATTATAATTATCAG GAACTTTTTCGAAAACAACAAAACGTTCATATTATAATTTTTAGTATATA GAAGTATTTTCTGAATAGTTTTTTTTAATTTTCTCTATTAACTCGACCAT TAACAAAGTGATTTCTGTCTTCCTCTTTAGCCCTAGCAATCCCGGATAGT CTTTACCCTGTATATACATATATATAATAGGGTTTGTGTATGTGTGTCCT TTATGCGTGCGCACACAGTTGGACCTAGGAGGCTGAAATTTTGCTTCGGT GCATCTTTCAAACTAGTTCAGGATAAGACGGGGGTACTGATTTTTGGGGG GAAGGTCATATTGGGAGGGCTTATGTCAAATTTAAAGCACAAAAACCATT TTTTGGAGCTCAAAGAGACAAGATAGAGGGTTGAATTATATACCAAAAAG TGATTGGCGTCTCAAAAAAAACTATACGAATAAATATGTTTCCTAAGTTT TTTCAAAATCCAAAAAGTTAATTACTGAAAAATAAAGAAATCTATTGAAA TAGTAATTTTTTTGTATCTTTTCTTTCTTTTTGTTTTCATAATACGGCAA TTTTCCATTTTTAAGAAGAAATGCCTCCAAACGATGCATTTGGGACATAA AATTTAGACTGTAATATTGCAAAGAGAGTATTTTCAATTATTTTGGGAAA TACGAATAAAATGTGGATCGTTTTGTTTTTTCTTATACAATTTCAATAAA TACTGTTGACAATTTTTTTTCAAATTTTGTGCAAATAAGTTTTTTGCAAA TTACTTAACGAATTTCGATTTTGGTAATTATTTGACAAAAATAAAAAATA AATTTTTTACCATACAATTTTTTATGCATATATGTTGCTATGTTATTTGA ATTTTATAACACAATAGATTTTAAAAAATCATAATGACTCTACTAAGGTT ACAAGGGCCAATAGTATGAGTATTTGAGGGGGGGGGGGGKCGGGRGGGGG GCTATCATTAGACTTTKTGGATTGCCTTACTTAACTGGATTGATATAGTG AGAATAGTATATGTAGTATAAAGTATAGCCAATTTCATGATCCATGGTAA TTATCATAGCAAGAGTGTTATAATTATAATTATCTTGAAAAATTCTAATA GAAAGATCCTGATAAAGAAAAAAGACGAGTCACTGAATAAAGGTATCCAA AAAATACACAAATACTTTATTACCATTATACGTGACAGCTTATATCTTCT GCATAATTTTTATGAAAAACAGACAGGAAAAATTGATTAAAGCTTGAGTT AAGCATTGCTTGAGAATGGATTAGGAACAAATATCAGTAGTGTATGTTTT TGTCAATATTTATTAGATTACATTTTTTGTTTTTTTAATCATATTTAAAA AAATCTCCTGTTGTCATTCCATGAAAATTAATTCTAGTAAGAGATTAATA TTAGTTCAGAAAAAGGCACTTCCGAAATGGATATTCTTAAATACATATAT TTTGCCTTACTACATCTATAAATGCATACATTGTAGGGGGAGACCGTTGA CAGTTGCAACACTATTTGTTTTTGGCTCAATTACTCAGAGCTGGTTTAAG ACTTTGTGTCGATCCTTATTTAGGACTGAAGACTGATGTCCTGTCAAGTT TAGTCTCGGTCCAGTTAAGTTCAGTCCTGCATATCAGTTGATAAAGTTTG GTCGTTGATGACTTCACTCAACTTTATTTAAGTCCTTATTATTAACAAAT TTTAACGCAGCATAAGTCAGCTTTTGTTTTAGTCAACTCAAACGTTACAC TAGTCAATATTTTTTCCAGAAATTGCTTGCTAATGGATCTCTCTAAAATT GAAACTGTAAAAAAATACCGAATTTAAATTAGAAATTTAAAGAATTAATT AAAGTAATATCTTTTGAGAAATAAATCATTTGACTTTTTATGATGTTGAA TGCGAAACAATGCGAGGAAAGTTGCATTAGCAAAACTACCCTTTGAGTGA GCTTTAAAATATCTCAACTTTCTCATCACTGAATCTTAATAAAGTTATAC TGATCGATAGCAAGGTAATGAATAATTTAAATTATCAGTCACAACAAAAG CAATGAAAAACTGGCGTCATTATTACAGAAATAATGATACCAAAAAAACT ATTTTTACTCTTCAATAACAGTTTGTATCCAAGATCTATCTTTCACAATA ACCTACAATATACCATATATTTGTGATGTAAACTTTATGACTGTACCTTT TTTTATGTCAGAGAAAAAGGGACTAATGTTATCCTTTACAAATCTCTATT GATTCAATGGCAAAATCTATTTAATGAATCGTAAATTGATATTATCGACA TATACATATATCCATATTATTTGGTTAAGAAAATGTGAATTGATAAAACA AGTGAGAGAAACAAAAATATTTCAATGCATAATTAAACTAAGAATATCTA AACAATGCATCATTTTGTCTTCATCCATATCGTATTTATATCACAGAGTT ATTTTCTATAAAAAAACAATGTATTTTTTATATTAATTTTTACTTTCTGC TCTTGCCATGTTGATACCTTTAATGTACCTTGTAAAATTCCTGCATAAAA AAACCAAAAATATGACCAAAGTCAAACGGGAGTTACCCAATTCTCCCAAT AGGGGATGAGGGTATCCTGTATAAGTTGGCCCACACCGTCATACTTTCTC TTTCTATCACCAAATTGGTCACAACGACAGAGGATATTGGAAAATCAATT CTCGCAACCTTTCAATAATAATTAAATAACTTTGGTACGTCAAGCGTAGG GACACGAAGTGAAGGGAAGAATAGAATTAGAAGAGGAAGAGAAGACGCGA AGTGAAGTGAAGAATATATTGCCATACGAAAGGGATCTCAACTTTTCCGA GTTATTCGGTTAATTAGCACTTCGAAGGGTCACAAAAGTAGATGGAAGGT CTCATAGTGTGTCCAAGAAGTTGTGAATTTGGCTCTTATGGAGTATTCGG AGGAGGGGGAAGGGTGAGTTATCTCGGAGTTCCTAATTTGACTGAGAGTG GAGGAATACTTTGTACGGGAGTCGTAGTGTACAAATTCGTACTGGCTTTT TTCTTCTTGGACATTGATGAACTCGGATAGGAGTTAATTCAAAGCATAAA TGAATTATTTATTTTTAAATAATCATGGTCCTTAATTAATTATCATTTGA TTTTGTGATGATTTTATCGATCCTAATTGTTGGAATAAGTTTACAGGTAG GATTATGTAATCATAATAGTTTGTACTGTAATATTACAATAAAATTAAAT AAGCAATAACTAAAAAATATACATATATACTATTAATAATGTAATTTAAA TTAAACTTTCCATTCACTTCGTGTCCCTACGCTTGATGTACCAAAGTTAT TTCCTTATTATTGAAAGGTTGCGAGAATTGATTTTCAACTATCCTCTGTC GCTGTCTCCAATTTGGGGACCGAAAGAGAAAGTATGACGTGTGGGCCAAC TTATACAGGATACCCGGGGGTGTTAATACATGAAAATGTGCCAAAATAAA TTTTAGCACAACTTTTCGGATGCAAAATGATATTTTAAGCACTCTGGAAA AAAATGATAAAAATTTCCGGCCAAACCCCCCTACCCCAAAATTAATTTCT GACCCATAACTGTATCATTTTTTTAATCTTTTTTCAAAGTAATAAGAAGA TTATAACATTTTAAATTCAAAAACTACATATTTAAGGTCATAAAAAGGTC AGAGATCATAATAAATTCTATATTTTTATTTTAATGTGTGTACTAGGGGG TTTAATTTTGAGGGTGACCTGTTTATTTTGATCTCCTGTTAATAAAAAAT TACGTTTCTAAAATTATAGTCTTCAAAAGGCGTTTCTTGACTTCTATAGC TACTTGAAAATGACTTTTTTAACGATTTTCTCTATTTGTAAAGGGATTCA GAAATTTTAATTTAAAAGTTATGTTCCTGAATTTCAAAAGTTTCATTAAA GTTCATTTTTTCAAGTGATACATAAGAATATATAATCCTTWTTTTTCATT TTGAAGAAAAAAAAATTGTAGCCAATGAAATACTTTGGATACTCAAACAA TCAAACCCACTTTACTGACCTCAAAATCGAATCAAATGAGTAATCAGAGC TCATTCCTAAGTTTTATTTGTATGTGGCTAAAGTAATAGAAATTAATGTT AAGTGGAGTGCCAAAAACAAATGTACACATAATTGGACAACAGACAATAG GGGAAGGAAACTGTTTATGAAGGTAGAGAAGAAAAAAAAATAATGTGATA GAAAAATAATTCAATATTGCTGAAGGGTTTCAAACTTCCATGCAAATACC ATACCGAGTATTTTAATATTCCTAATGTATATATCGGATATTTTTGGATT GATGTAGTTATATATAAATTTATTTTCCAAATTGCATCTAGATTAATTAT GAGTGAAGATGTACAATGTACATATAAAATACGATCAAAACCCACATTTC ATAGTACAATACAATTAATAAGGACTCATTTAGTCCAAACTTCTCTTTTA AAAGAAGTTATATTTACCATTGGAAGTAAATCGCTCAATATTAAAAATTT TATAAAATATAACACTTTGGGTATAATTTAGAATGATTGATTGGTTCCAG TTGATTTTTATTCATCTTTCAATTTCCAGGAGAAAGATAAAAATACCTAA GAAAAGTTGTCATTTCATTATAGTTTCAACTTCGTATGGCAATCACCCTC ATGTCCCTTTGAAATTGTATTTATTGACGTTCTCATTACTTTGCCTAAGA AATCATTTAATACATTTCTGAACTTTTCTTTCGTAAGATAAGATCAATCT TCTGATCATATCCAATTCTTCAAATCCAAAGACACATATTCTCTGTCGAT GGAATCATTCGGTTAGTTTGAGAAGAGCAATTACTTAAACAATAATGTTT GAATTAATTCAAAGACTGGCTGGSTGGCTTGGAAATATCTAGGRTATCTC AAATATTTATTGTTCTCAAATCAAGATAAAGTTACTTCCTTTTAAGATTA TATTCTTATGTATCACTTGAGAAAAGGAACTTAAATGAAGCTATTGAAAA ACAATAACATAACTTTAAAATTAAAACTTCTGAATCTCTTTACAAATAGA GAATGTCGTTCAAAAAAGTAATTTTCAAGATAGTTATAGAAGTAAAAAAA CACCCTTTGAAGATTAAAACTTTAGAAATTACGTTTTTGCTTAAATACAA CAGAAAATCGAATTAACCGGTCACCATAAAAATTGGACAGCCTGGTACAC ACACAAAATATAAATTTAGAAAAAAATGACCTTTTTAATGACCAGTGACC TTTTTTCAGACATGAAAACTGAACTTTTAAAACTTAAAATATTATATAAC TATTGCTTTAAGCATGAAAAGGCTTGATTTTTTTTTTTTTCAGTGTGCTT AAAAAATAATATTGCATCCGAAAAGTTGGGTTAAAATTGAATTTGATTTT AACTCTACCAAACTATGCAATTATATACAATAATTCTTAGAAATTGTTCA TAACTTAGTAAGAACTATTTTGAACTAAATCAATCAAAATTCAAAATATT AATTAGGGTAAAAGAAGTTGAAAAATCGACAGATGACAACAAAATGTACC GTAAATTTTTCGCAATAGTTAGATGATGCCGTGATAGGACTCTGTTTTAT AGAAAATACATCAAAGTTGTTGAAGATAGGGCCTATAACTGGGCTGATGT CAAAATATTTTCTCATCCGATACCGACCCAATATGATCAAAAAAAGTTAT TTTTCGATTTAATATTCCGATCCGATCAGATATTTTACAAATTAATAAAT GTACCCTGAATTAATATGTTTTGTTTATCGTATTTTTTTATTTTTTTCTC TCTCTTTTGTTTTGTTTTGTCACAGTTGGTTTGTTTGGCTTGCCAACAGA TTCCTATCCTCATGGTACAATATTCAAAAAATCAAAACTAAATATTTATT TGTAGCTTCTCAGTTACAAGACTTATATTAGGCTCTGAAATCGAACTGGT CATTATGTACATAGCTTTGATTATTAAAGAACATGTTGCTCATTCATCTT GTTTTATTCCTTGTTCATTCATGCTTTATTTGATGGAAATAGCTGATTCA TAAGATAAAAATTTATATTCATCCATTTGATCCCGGTGTAGTATGTAATG TTAGAAACATGATATGTGGAAAAAAAGAGAGAGAGAGATTTAAATGCAGG ACAAATTAGCAAATCATTAGTTATGAATAAATCTTATCTTATATATTTGA CACTACGAAGGGAAAGTATGTGCCACACTCTTTTGCATACATTCATCTAT GTTTGAGTACTCTGTGTATTAAGGTTTCAATTATTTCAAAAATTGAACAA TAATTTAATTCCAATCCTTCCTTCTTTTTCTTATTGCATCATATAAAATT TCTAATAATTTTCTCCGGTACCGATACAATGCTGATATTAGATATTTTGC CAAACATATCAGTTTTTCTATTTTGATACGATATCTCAGCTTATGCCTAA GAAGCGCTAAGTTATTTTGCATTAAACTATTTTACCTGAAATATTTTTCC TTAATATATAAATACATGAGGTTTATACGTCGTTATTGTTTATTTTCCAT TAAAATTAATGGTTCCTTTGAATTTTGTAATCAGAATATGTAATATGTTT TACTATAAAATTTATTAAATGGTTGCTTTCTGTTGAAAATGATGTAAGCA TGGCCCAAAATTTCATTTGCATACATCAACAAAATCTCACTGTGTAATGG ATTCGAATCAGAGAGAAATTAGGTGATAAAATTATTATAAAAACAAAAAT AAACAAACAAGGCAACGATTCAAATGGAACAAGTGTTAATCCCTTCTTTG TTAATAATTACCATTAGACATGATGTAATATCCATACTAGAAAAGACTCA AGGATTAATGAAGAAGCATAATATGAGAAAAGGGATTAATATCATTATTA TAAAATAGACAATAATGATGTATATATCTCATTTATTTATATACTAAGGC GAAATATACTTGATACAAAATTGCTTTAAGAGGAAATGTTCTGAGGCAAA ATTATCAGGAAACTGTCTAAAGACAATTATATACTTTTTGTGCTTCAAAT ATGTAGCTCGTCATTTTAAAACTTACAAAAAGTATGTATATTAAATTGTA AGAGATTTAGTCTTAATTAAGATATATCATTATTTATTCCAAAAATAATG CTAATACATTAACAATTAACGAATCTAATAAAGATATTGAGATGCAACCA AAATGAACATAATATTAAAATTACATGCATATATATAAACTCAACAGCGT CTGCAGGATTTATATATATTTTTTATTTTTTNGAGAGGTGGCTTAGTCAT TGGCTTTTTTTTTAATTTCTCAATCAAAAGTATTTAAAATTACATTTTTT GGAAAAAAAGTTACAAAAATCCATAATTATTTATACAAAATTTAATTTTT TGGGAAAAATTTCAAAAAAAAAATTTTAATCTAAGGCTGTTTATAAAAAT TTAATTTGGGGAAAAGAATTTAAAATATTCAGTTTTTTGTTCTGCTGCAT AATTGCCCGAATAACTTTTTTTAAGAAAATAAATCTCTCAAAACAAAAAT TTTCAAGTAGAATTTTTTGATCCTGAGCCAAAAAAATCTATTAAGTAGAA AAAGTTCATTTATTTTGTGGAGGGGCTACTGGCCTGCCAGCTCATCACCT GTGGACGCCRCTGCTTACCTACCTATATTTTCATTTTATCTTTATTTTAG TACCTCTAAAGCTACAATCCTTATACTCTGCGATCAATGCTGGATAACTT TTTTAACTCTGGACTACACTATTCTTCCGTTGCTCTTGGATATCCCTCCT ATCATTACTTTTTTGGATGAGCTTTCTTTAGAGATGAAAATTTCTTATGT TGAAAGAATCACTAACTTCAACTCCAGAGCTCTAA
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