EMLSAT00000001832, EMLSAT00000001832-697679 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000001832
Unique NameEMLSAT00000001832-697679
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s1315supercontigLSalAtl2s1315:101571..120466 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000001832 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000001832EMLSAG00000001832-684598Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000008075EMLSAE00000008075-717003Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000008076EMLSAE00000008076-717004Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto772168auto772168Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000001832EMLSAP00000001832Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000001832

>EMLSAP00000001832 ID=EMLSAP00000001832|Name=EMLSAP00000001832|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=169bp
MFSIWDTSGFPSYDAIRSLSYQEADVFLLCYKISDPASLYNVKNKWSAEV
RRHRPDVPIILCGXHSELRHDSVTMAQLSKTGRSPVTIEQALAICCEIXA
VNYIETSAKENSNDEHLRFVPLLQLNGFTLSNGRLPVGIPLPHHLRSPLP
LLSFNPPQSFAEVPVLTPI
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mRNA from alignment at LSalAtl2s1315:101571..120466-

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000001832-697679 ID=EMLSAT00000001832-697679|Name=EMLSAT00000001832|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=18896bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1315:101571..120466- (Lepeophtheirus salmonis)
AAATATTGTCCAACCAGTTTTGACAAATGTTTCTTCACGAAAGAAGTCGA CAAGCATGAAGTTATGTTTAGTATATGGGATACATCTGGTAAGTGATATA TGTACTTTACATTTAATATAAGTAGAGACGAAAAAATGGGCACATTATTA AGTTTGTGAGATTACAGTTGTGCAATCTACTTGCACAAGTTTTCATATTA TGGTGATTCATTATTGTATACTCCCAAATGCACGCATTCGACTCTTTTCT AAATGTAACTATATTGTGAAAATTGTCGAAATCCCAGTGAGCATATTTTA TTTAAAAAGTATTTGTTGGTAATCTGAAAGATATTAGTCATCTTAATAAT GAGTGATTTCTCCCCATTTTAAAAGTTCAAACGTATTAGCAAGTAAGAAC CACTATAGTTTTTATCAGTCATGGGACATTTCCAAAAAAAAAGCAAAAAA AAAAAACCTGATACCGTTTCCAATTTATTAATCTCTTAAATAATAGTTAA AAACTACCATTTTTCTATAAGTTTCTAAGAGTAACAATTGATAAAATAGA TCTTTCTCCTAATAATATAAATAATAGGCGAATTGGGTACCCTGACCAAG TTTGCCTGCACGTCATACTTTATCTTTCTATCTCAAAATTGGAGACAACG ACAGTGGAAAACATCTAATTCAATTTTAGCAACCTTTACATAAACCTTTT ACAGACCTTACATAATTAAAAATGATCTCCTCAGGCCTCATTCCTCAGTC AACGGATAAACTCTGAGAGAACCATATTTATTCACAGAAAATTTAACATC TTAGAACAAAATTTCAAAAATTAAATTAAATATTAAATTTTTCGAATAAA AAAAAAATCAAATATTAAATTTTGTAGTTAAAAGCACCAAATCCTCAATT TGTGGAGGGGCTACATCCCCTCCTTCCCACCCCTTTCGGACGCCCCTGCT ACCTTGTACAAATATTTGATATGTTGTTCTTCGTTTCCTACTTCGTTTCA AAGCTTTAGAGATCTCTATCAGCAGATATATCGTCTATCAAACTTGCAAA ATTATACTTTTCTGTCTGCTTAACACTCACAAGGATTTAAACGATTTTCA CATCCCTAAACATAACATTTTATTAGCTTTGTAATTGTTTTTTTATTTTT CGTTTTTACTTATTCATTTTGAAATTAGCATAGAAATAAATTCTCTNTGT TAGTTGAGTACTCACATGGGAATAATAAAAACTCGATTGTGTTATATTCA AGATATTTTATCGTCATGATTAAAAACTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTMTS RTTTTTTTAACAAAYAAATTACAACTCATTTACGTATGGATGTAGTATTA AAAAAGAATATATATATATAATATATACATATTCTTACGAWAGAAAAAAA AAGTTAGTACCTATTTGCCGAAATTATATATGTTAATTCTTATCGAAAGG AGTTGATTTACTTAGATAAGGAGGAAGGATTATGCGGAAAAGAAGAATGT AAAATATAATGGGATGAAATTCATTTATTCCTAAGTGCAAGTCTTTCTAT AATTGAGGGAGGGATAATAAGAAATATTTAGGTACTGATTGATATTTAAA GTATTACAGATAGTGACACTCTTTGCAAAGCATATGCTTCATTTACTTAG CTACAGAGTATAATATATAAATAGACTGCCTAAAGGCAGTCTATTTATAT TTTGTTTCTTGATTTATCTACTTCAATAATAATGGGTTTTTTTAGGGCTA ATGATGGGTAATAGTAAGTATAATAATGGCTAATTACTTTTTGCTTACTT ACTATTGGTTAATTGTAGGAGCAAGGAACTTACAGTCTTTTTTGCCTTAA TATATATAAATATATTTATTTTTTTTACCCAATAAGGGTTATTTTCATAG 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