EMLSAT00000001967, EMLSAT00000001967-697814 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000001967
Unique NameEMLSAT00000001967-697814
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s134supercontigLSalAtl2s134:768078..795597 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000001967 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000001967EMLSAG00000001967-684733Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000008681EMLSAE00000008681-717609Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000008682EMLSAE00000008682-717610Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000008683EMLSAE00000008683-717611Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000008684EMLSAE00000008684-717612Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000008685EMLSAE00000008685-717613Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000008686EMLSAE00000008686-717614Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000008687EMLSAE00000008687-717615Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000008688EMLSAE00000008688-717616Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto779628auto779628Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000001967EMLSAP00000001967Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000001967

>EMLSAP00000001967 ID=EMLSAP00000001967|Name=EMLSAP00000001967|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=209bp
TQIYHWKSEIRNLQIQQNCGKKSESIACSGKLLFISVITGYLDLREILDR
SHVHKVKKIYIHSDYKEWSLLQSIVAENDISILELFSPLKLSGMGKDFVT
ILGYGTTNNGARSCCLRYAKDLRSMGWRNCKKRLFRDFHFSSVIKYLTDK
TMNSNSVCSIGNEKHKATSCIGDSGGGMYFLEDDRYVLMGVTSYGKVSHA
MCDYQSPFK
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mRNA from alignment at LSalAtl2s134:768078..795597-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000001967-697814 ID=EMLSAT00000001967-697814|Name=EMLSAT00000001967|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=27520bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s134:768078..795597- (Lepeophtheirus salmonis)
ACTCAAATATATCACTGGAAATCGGAGATCCGCAATCTACAAATCCAACA AAATTGTGGTAAAGGAAAAAATGATATCCGAAGAGGGAAAATCTATGGTG GAACCATTGCTTCTCCAGGAGAATTCCCTTGGATGGTTTTAGTGATTAAA ATATCTATGATAAGTGATTTTCAACAATTTTTCATGTGTGTCAATTCAAT TTTTATTTGAATGTTTGACATATTTTTTCTAATACCAGGACTAAAATCCC TCACACAAAATCTCCCTCTGGGAATAATCCCTCATTCCCTCTAGACAAAA TGCTCCGAGTTAGATCTTTTTTTGATCATCGGTATTTTGTATTTTAAGGG ATTTTTTTCCTGAAAGAGTTTTGTCCACCGAGAAGTTTGGTCCTATTATT TTTACATAATTCGGATCTTGAAATTGAAACTTAATCCATTTATGTACTTC AAATAAGAATTGAAATTTTATAAAATTATTTAATCAGGTAAAAAATCAGA GTCCATAGCTTGCAGTGGTCAGATTTTAACGGAAAAGTTTGTCATTACGG CTGGRCATTGCGTGAACAAAGCAATACAAATGTTAGGTAAGTGGTTTTGA ACAAATCTCAAATATACAAATACATAAAATAATCTTTTAGAATTCATATC TAATTCTAGTAATACTTGAAGCACTAATCACGAATCTGTAATTCTCTTTT TAGCATCAAGTCTTATTTTAGAGCGTTTTTTAATAAATTTTGTTATAGTA CTTTTACTATTTTAATCTGTTAAATCCAACATCCGTGTTTATATTTCATT TGGGGTACACAGAGGTTTTTAAATTGTGTGAGGGGGGGATTTGAGGTCTT TTCGTCATAAACCTTGTAAATTTTTGGAGGCATTAAGCTAATCTGAGGGC ATCTATCCCCGTCCCAAATTGCCAACAGTTCCCATGTACAGAGTGCGACA GGAAAATTTTCTGCGATCAAGAAACAAAACCAAAACCTTAATAACTTTTT ATTACAAAAGTATAATGAATAAAAGTTATTGGAAAAACTTTTAACAATCA ATCTAGGCAAGAACTATTCAATATGGCCMCCTCCTGCCTATATTGCAGCT CCCTCACAAGGTCGGAACTTGGCGCATGTTGATGACACATTACATTTTGA TGGTAGCCTTGAGCTCCTACAATTTCTGTGTGATGTCTTCCCAACCTTGA TCTCTAAGACGATCCACACACTGAAGTCGAGGGAATTGAGATCAGGACTG GAAGAGGGCCAGAAGGTATTGTCCCAGAAGTCAGCAAAGTGCTCCTTCCA GAAGTTATGTGTCTTCAAGGCTTTAGAGCTTTCAAAACTTGGTTGACTCT GAAGATATTCTTGTCTTTGAAGATCTTCACAGTCGACAGATGACTTTTCA AGTAATTAAGGACTTTTTTGCATCTCCCAAACCTTAAGGCATTCATCCTA TCAGTGAGGAGATGTCTTGAAGTCCTGAAAAGCTCTTGCGGTTGACGTCA TCATGAAATGCCTCTTGTTGATCTTAAACAGTTTTTAAAATATTTTTTCA TTACACTTATTATTATGAGTGGAGATGTTAAAATTGTCAAAATTGCGGCG AGTGTTAAAATCATTTTTATGAAAATGCCATAAAAATATAAGTTTGAGGG ACAACATATCTGCTGAACTAAATCACTATAAACTATAGTACTCCTTGTTC GCTAATACATTTGAGCTTTCAAAATAACGAAGAATTATTAATCAATGCAT TAATATCTTGTAGGTTATCCACATATACTTTTTTTATTCATTTAGGCTTG TGAGGATTTTGACCATTTTCAGATCTTCTTTAATTATGGCTTTTATCAAT CTACAGGGTTGATCTTATTCAGTGGTACACATTTTATTATTTTCAATTTT 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TGTGGCGTGTTTGCCCATTCCGAATGAGAATGTCTCAAGTATAAACTTTA GTAAGCTTTATTTTATTAGATGATTCATCAACTATTGATCAAATTTTATT TGTTTAGGGATGGGAAAGGACTTTGTGACGATTCTAGGGTATGGAACGAC CAATAATGGAGCTAGATGTGAGTATCAAACCTAATCTATTGCCACTCATT CATTTATAAGCACATTATGTAGTCTAATGTAAACCTGTTGAAATATTATT GGAATATATTTTAGTAAAATATTTTTATTTGGTCATAGTTTTTGGGACTT ATAAGACTATACAATACAGTTGTGTCTCATATGGAGTAATTAGGCGTTGG CTAAAAAAATTTGCTTTAATATAATAAAAGACAAGTCATCCACGAATGTT CAGTGTTACTCCGTTTTTTATGACCAAACTCACACGTAGCTACTCCAGAG TTTTATCAATTCATATATGTTCTCTCCTCAAGAATGAAATAATAATTATA TAATAATATAATGAGCCAGGAAGTACTTTAGTCTCTTTAGCATTCACTGG CTATACTTTAACTGCACACACTCGTTGATAAACCTAATTACATTTCACAT TCAGTATTTTGTACTTTCAATACTATATAAATACAATGACATTGTTATTT CAAAGATCAAAAATACCTCAGGGAGCACTATAGGTATAGTTGACAGGATT GTAATTAAAAAAACTACTTTTGAAAATAAGAAAGGAAAAACAGTAGCCGC GKGTGTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTATATTATATAATAGGTC GTTTTTGGTGTTAACGTCTCTCTCTGGAGTAAGCATTATGCCCAATCTTT GGGATAAATTGTTTGAAAAATACATTATAAAATAAATATATACGAATTCA AATACAATTTCAAAAAATCCGAGTACTAAAATTATTAAAATGTACAATAT TCTCCTCTTAGTAGCAGTAATTCCTTTTCTCCCCCACCCCAATCATATAG TAGGCAGTTGGGTCTTAATTCAGTAGTACCATATGTCTCGCTCTCGTGTT CTCGTCGGGCTCATTTTTTTAATTACAAACATGTCACCCCTAACTGTAGG TATACAGTACCGGTAATTTCGCCACCTACATTTTTTCCGCTAGTAATTTT GCATCGACGAGATTTTGCTGTATGACATATTTTATAATAATAATGATAAA ATAAATTAAAAATAATAGTCAAAAAGGAATAGCCAATAAGTTCTAATACT ATTTGGAGTAGCATAAACTTCAATCATGCAACCTGTTGTAGTAAAATTAT CTTATCACTTCTTTAAATTCCTACTTGTCAACTCATATGAACTTAATAGC ATAATATTTCTGGTTGTTGCAATTTTATATCAACATCACATAGTATTCTG AGCAGCACTTTAATTTTCGGATAATATTTGAAATCCAAAGAATGTATACA AATCGAAATCAAAGAAGAACAGAACTGACTATAAAATACATTAATCCTAA GTCAATCATATTGTTATTTTTTTCCTTTTTTTTCTTTCTCTGGCTATATA ATTAATCTGATGGAGATTAAAGTTCGAACCAATAATATAAAAGCATAAAA AGGCAGCGAATATATCATGCGGAAAAATCTCCTTGGATTAAAAATGTAGG CGGCAAAATTACCAAGAGAAAAAAGTTTCACCGGAAAATTACCCAGACCA CTTGTGCACCATCTATAAACGTTGCAAGTTACATGCTTAAATTGTTATTT CTTTGGTAAAAAAATGCTTATTTTCATTCATCTTTCAAGATCTTTAATGT TTTTTTCGAATTTCTTATTTAAACGTTCATACAGAGAAACTTTACTTTAT AATATATATTTATAAATATTAGTGGAGAGATAATGATTACTTCTATGAGC 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