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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s134 | supercontig | LSalAtl2s134:877536..884511 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000001972 >EMLSAP00000001972 ID=EMLSAP00000001972|Name=EMLSAP00000001972|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=322bp
MIAIYSLLLLFCGQSLANTRMKQSTVDGILKNLTALVNSTEKDGVKFLVP
GIVRLVFHDCVDGCDACLNFDLISNRGLKKIVDALEPTYENYKSILSRAD
LWALASKAAIQIAIENNNNRCSDQSCKTPQINIRFRYGRKDCPTSPSHEE
NTFIPSPLQNSSVLMPWFKDTFNFKPNQVVAIMGMHTLGKAGAPFNSAWE
QGNTDGLSNNYYKQISDPNHCWVQEYIDPKLSGIPNKIFFWRTELFKAFA
LPVDMTLYKAIQVNETTGESSCSYHDCKRASTMGMFKRYAASVESWTKHI
RHLFPRMLEKTTSKLLFPRRNM back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s134:877536..884511+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000001972-697819 ID=EMLSAT00000001972-697819|Name=EMLSAT00000001972|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=6976bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s134:877536..884511+ (Lepeophtheirus salmonis)
CACAATTGCTCCATTTACTATGGGAATACAATTATAATTTGTGGGATTTA
CGACTTTTATTCAATAACACATTCATCTAAATACACCTATGTATAGTAAT
TGATGCGCAAGTAAAATTGATATTAGGAGTACTTTAATGAAGAAGAATCA
ATATCAGTTTAATAGTTTAGAAGGCAACATTCACTAAGAAAATCGTTCAA
AGCATAAACATGATAGCAATATATTCGTTGCTGCTCCTCTTTTGTGGCCA
ATCCTTGGCCAATACAAGGATGAAACAATCAACGGTTGATGGAATATTAA
AAAACTTGACGGCATTGGTAAACTCCACAGAAAAGGATGGTGTAAGAAAC
TCTGTTGTTTTATTTTAATTAATTCACACATTAAAATAACCAAAATAATT
GTTTCTTAGGTTAAATTCTTGGTGCCAGGGATTGTTAGATTGGTTTTCCA
TGATTGTGTGGATGGTTGTGACGCATGTTTAAACTTTGACTTAATTTCCA
ATCGTGGACTTAAGAAAATAGTTGATGCTCTTGAGCCAACATATGAAAAT
TATAAAAGTATATTGAGTCGAGCGGATCTGTGGGCTCTTGCTTCTAAAGC
TGCCATCCAGATTGCTATTGAGAATAACAATAATAGATGCTCTGATCAAA
GGTTGGTCAAAGTAGAATCCTAGTGTTGTTTACCTATTTGTATTTATTTT
TCCTTCATAGCTGTAAAACTCCACAAATCAACATTCGCTTTCGATATGGT
AGAAAAGACTGTCCTACGAGTCCAAGTCATGAGGAGAATACATTTATTCC
ATCTCCTCTGCAAAATTCCTCCGTTTTAATGCCATGGTTTAAGGATACAT
TCAAGTAATAGAATAGATATGTAGAGCATTTCTTTTCAAAAAAAAAAAAT
ATTTTCTTATAGTTTCAAACCAAACCAAGTTGTAGCAATTATGGGGATGC
ACACGTTGGGCAAAGCTGGAGCTCCCTTTAATAGTGCCTGGGAACAAGGA
AACACTGATGGATTGAGTAACAATTATTATAAGCAAATTTCCGATCCTAA
TCATTGTTGGGTTCAAGAAGTAAATTTGATTTACCTTTTTGGCAATTTTA
TGTTCTTAGAGTACATATTTACCTATAATAACTATTTCTAGTATATTGAT
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ATTCAAGGCATTTGCTCTACCTGTTGATATGACATTATATAAAGCTATTC
AGGTACTATTATTGTTTGTCTTAGTTTCCAATAAGTTTGATATGTATAGT
TTACTCATTAGGTAAACGAAACAACTGGAGAGTCAAGTTGTTCTTATCAC
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TGTTGAAAGGTAATACTGTTCTTAAATGCTGCTGTCATTTATTGATTTAA
ATTCTAATTCCATGTTATAGTTGGACTAAACATATTCGACATTTGTTCCC
GCGAATGTTGGAGAAAACGACTTCAAAACTTCTATTCCCTAGACGAAACA
TGTAATAAGCTACAAAGATATATAAAGATACTGGAAATAAGATTCAAAGA
TACTGGAAATAAGATTTAAAGTGCGTTTATTCTCTATTTAATTATTTATT
TACTAAAATGTTGCAATACATATAACGGAATGTCATACTTCAAGCAATTT
ACAACAGTGTTACGATTAGTTATAGTTATGTATTGTAAAATCACTTTTAG
ATCCTTAGTTCGATTTTTTAAAGATAAGTTTCTTTTTTCTTTGGCCATTC
ATGGATATTTGCAGTAATTTGACTACTTCTTTTATCTCAATTGCTAGCTA
CCTCATATATATTTTCACAAGTGCCAATTTTACGGAAAACAAAAGTATTT
TTTTATATAGTTGGAATCCCAGGATCATGTATCATCTACCTATAAACTTA
AAGGAAGTTTATTGCTTGAAGCCTTATCAGATGGTACCTATAGGTATCTA
AAAATTTATGTTAGGGGTATTTTGTTCAATGAAATTTTGCGATACTAAGA
TTGAACAATAACTGTTGTCGATTTTTACGAAGATATGGCGTAAAGAGGCT
CTAATTATAGAGCAGTAATTTGCAATCTTCGGAGTTTCGTAGACCAAAAA
AACTTAGATTACTTTTACTAAAAAGCATAGTTTTATTACTTATAAACAAT
AACCCTTCTATATCACAATAGGATCTTCACAAAGTCACAACTCATGTGCA
TTTTTTATTAAGAGTCGATTGGTCTACTCTAAAAAAATTTTAGTTTTCTG
AATGTTGATTTGTTTAAATCGAATTATTATTTGTTAAGCAACAATCATAT
CCTTATTATCAAATTAGCGGTAGAATTTGGCATTGCCTGGAGTAGTTAGG
CGTTGGCTACAACACAATTTTTGATTTAATATAGAAGATAACTCCTCAAG
AAGTCCTTAGTGTTAGTCTCCGTTTTTCAGGGCACACTCACATATAACTC
CTCAATACTTAAATCCCTATATATATCGTGTTCCCTCCTCAAGAGTAAAA
GAATAATAATAAGATTTCGAGAAACAAAAAAAAATAAAATAATAATAGAA
TGATGTGATGGGTAAAGAAGGAATATGTGCAAAGAAAAAACTAAGTATAG
CAATTAAAAACGGAAAAACAGTTTATGCGTGGGGTCTTTCTTCCTCTTTT
GTTCATTATTTAATAAGTCGCGTGTGTCTTAACATCTGCCTCTAAAAGAA
GAATTCTAATCTATCTTTGGTATACATGAATTTAAACATAATTATAATAT
TTTCCCTTGACTTATGAAGAAGCTGTAGCCGAGCCCGCCCCGCCCCCTTC
CCCAAATAATGTATTTTTTTAGAAAAAAATATTTTAGTGAAAAACAAAAA
ACGTGGTCCATTTAGGAATTATATTCTAAAAAAAAGGTCAATCGATTAAA
TTATGCAGCGGAGTAAAGACTCAAAAATTATAACCCTCTTCGAGGCCGTC
TAGCCTCAGTTTTAAAAGTTTGACAATTTTGTACTTTGCGCCATTTGAAA
AAACTGGCAAAAATCTACAATTTAATGTTTCTTTTGTTTTTGGGTTATCA
AAAATGTTAAAGCAACAATCAAAACGGCCGCGTTTGCACGATCACTTCCG
CATACAAGTCGATCTCCGACAAAAAGATCTTCGTAGTGGACGCTGTTCTA
AACTGGAGAAATTAGCTTCTGCTTCAACTTGTGCTTCAAAAGTTTGCCAA
AAAATGTCACAAAATAAAAATATATAAATGGAAATACGGCTTTTAAAATT
TTCTAATTTTGAGTCCCCACCTTGTATGTAAATATAATCCAACGGACGTT
CCTGGCCTCAGACCTCTCATTGAAAATTGAAGAATCTGAGAAATTAAAGG
GAAATAAATTATTTCATATAATGTGATTCCATGTTGCAGGAGCAMCCGCC
GAAAAGAATTGGTAATAAAATATAGGTTCAAAGGAAAGTGAAGCCCTTTG
TTAATATTGGGATGCATAATATCCCCGTTAACTAATAAAGGGTTAATCAT
TTATTCTTATATTCAAACGAATTACAACAATTATTTATATTAATTTTATT
ATTATTCAAATGTACTTTAATTGAATCAATATTCTTAAAGAATAATTATT
TTTTATGATAAAATAGTAGAAATTTAATTTGATGGATCTGTTAAGTTGAA
TGAAGATTAACAATGTTTCTTCTGTTGTACTGATAATGGGTCTTACTTGA
TCATTTGTAAAGAACACAAAATTATTCATCACAACGTTGAAACATTTGAT
ACTAATTGTAGGAATATAATTAGAAAAACTGCGATCAAATGTGTCAGTTA
TTGATGATATTTCACAGGATATTGGAAAAGATTTAACTATTTCTTCTACA
AAAGCACTAAATATTTTGCGTTGAAATGTAGACTGCTGAGTCCTGAAGTT
TTTGTTAGTATCTAGTCCCTTGTATGATATCGCTTAATACGGTTCTCCTC
CATTTGGCTACCTTCTAGGGGTCTTTCATTCGAAACCTGTGAAATATTAA
TTCAATATCCATTGAAATGCAGCATCCTGGGGAAGAAGTCTTGTATACCC
TGATGAAGGATGGTTTAAAGAACTTAAACTTCTTGTTACAATTAACCCTT
CAATGCATGATATCCAATATATAGGATATGCCAAATTTTGGCAAAACTAC
GTATCAGTATATCATAATCAAAGACCTTGTATATTTTCATTTCTTAGAAG
TAAATTTTCCTCATTAACATAACGGATCAAATATGAAGTTATTTGAATTT
AAAAATTAAAATAGTTTCACCTAGAAATTAAAATTCATGCAATGAAGGGT
AAAAAGAGTATTCTCCTGAACAACGCTTTACTTTTTTTTGTTACAAGAAT
ATTAATAATCTCTGTATGTAAAAAAAAGAACCTTATTTTAAGACGCAGTT
CTAGTTGTTTTAGAATACTATGCTCTGATTCCAGTCTTACGACCCTAAGT
ACATCCCGTCGTTATTTTAATAGGACATGTGCGTTGTTTATTTATATTTG
TTTGTAAACACATTACCATTGAGTAGCGCCACATTGGGGATAAATTATAA
ACCTCCATAAATAATAATTATGATTCTCTGGCCAAAGAATACTAGCTACC
AGCTAGAGAATGACTTCAGACGAAGTTGAGTCACTTGTTGATAAAAGTCC
TTTAATTTTATTTACATATGTATAAATTATAATAATAACAAACTTACAAT
TTACAAATATCGCAATATTGCAATTTGTAAAGATGAAATATTATTAATAA
TAAGTAATATAACTATTACTATAAATCTTATAAGTTATTAGTGATTATTT
ATTAATAGCTAAAGAATACATCGGCGTCACACAACAATTAACGTAATCTT
AAGCGATACCAGGTACCTTAAGCAATCCATACTTATATTAGTCAATGCGA
CAGTGATTCACACCCCTAGTGGATAAAATATATTTTTTAGTTTGATCGTG
CCCTATTGGATCTCTAAACCTTTTCTCCTAAGAAAATAAGGTACAAATTT
ATTTGATAGACAAACAATCTCAGCTTTGGAATATTTCTTCATTTATTTGT
AGATAAGGTAAAATGCTTATTCAAATTCAACCAATCAACGTTCAGAACAG
TGATAAAAAGTAGAAAAATCGACAGTTGTTTTAGATTTTTGGGTTTGTGT
TAAAGGTATCAACATTCAGATTGTTGACGGTCAAACTCTCAAACGGACTG
ATTACCAATGGTCAATTATTATTTAAANTTTAAATATTTGTTATTAACTA
TTAGATATATTAAATTGRTAATCTTATCAATGACTGTGTATAAAATTATG
CAAATTCTAAACAAAAGTCCCTGATATAGAAATTCATATAAAAATCCAAA
TCGTATGGAATAGCCTTTTTTGTTCGTAATACGTGGAGTCAGCTACTTTT
AATCATACAAGAGTCAATTTATGAAAATTAATGAATTCAACTGAAAGGAA
ATTACATTGTATCTTTGTTCATGTCAAAAAGCAGATCCTACTGGTTATCA
ATACACCGTTTTTCAAATAGATGAAAAAACCGGGTTCGGCAAAATGAAAC
ACTTTGTGAACTGTGAATCATTAATATAAAAATTTTCTGCTAGTGTAATG
TGTAGAACATTGACAGAATTTGCAATTTTTTCCAGGAGAGGTCCTGTTTT
TTTTTTTATAAATACACATACAATACATAGATACATAAAATATAAAGATC
CAGAGGGCTTAGCTCAAACTATATTGTAGGAGTGACTTAATGGTAAAACA
GATTTATCTTTAGCTAAGGTTGTTATCTAGTGTTACTCATGACTTTTGGC
TGGKAGTTGTACTGTTGCGCTTTTTCTCGMCTTCCCGTTTAACTATCCGT
TGAAAGTTTTTGATGATCGCTGACACTTTTAGTAGGTGGAAGACAAATGA
TATGTATAAAGAACAAGAAGAGCAATTCGGGCAGTTCTGAAAAATTAGCA
AGCTTCTTTTGCCAAGCGCTAAATAGCTGAAATTTAGGTCAACAATTGAT
TATTTGTATTAAAAATATCTACCCCAGTCTCGTGTTTATCATAATTATTA
ATTGAAGATCCAGTGAGGAACCGAGAGAGCTCTCATCCTCCATCCACTGA
TTTTTTATTGAAGTTCTTGAGTCTTTTTCTCCTTAAGTCAACTCTGCATC
TTCTCCTACTCTAAGAAAACTATTTCCTTGATCAGTGTTCTTGATATATA
TAATTCATAAATAGCTCGTCTCAATCACATTGATTTCAATTTATAAGGTG
GAGTTTGAGATGTATGCTCTATATGGATAATTATATCACCTGGACACTTT
ATTACTGATTAGTGCTTTCTTTAACACTTGTGAGTCTCTTTTGCGATTGG
AAAACAAGTGGACGATGATTCTAGACTCTTAAAGATAATGTACGTTGTAC
ATTTCTTTTCTCAATAGTTTTGTCTGCAATACATATTCTATTCTGCTATT
GCATATTAATAGTTATTGTTTCAAATCATTCTATACCTTTATTATAGAAC
GGAAGACAAATGAAAATACAGTGAGGAACAAATAAATTTCTCATTCTTCA
CCCAAAAATCCTTCATTGAAACTCTGAAGTTCAATCCTCGTAATGTAATC
TCCTACTTTAAGTAAATTCTTTCCTGGATATACATATATATAATACTTCA
AATATAATGTAAATACTTAAACAGATATTCCTTTACTAATTGATTGGACA
ATTGCAAATTGATTTACACTATTTTATTTGAATACTCTTAGAAATATATA
GATGAAGCCTGGATTTAGCTCTATTACCGTAAATCGTTACATTTATTAAT
ATTGAATTTAACTTCCAAGAACCTATGTGACAAAATTATTTCTTTTATAC
TCAATAAACGTGTTTGTTGCGCCCATTATCATAGATATTGCGAGGGTGTG
GAGAGAGGGATATATCTTATCTTCTG back to top
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