EMLSAT00000001988, EMLSAT00000001988-697835 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000001988
Unique NameEMLSAT00000001988-697835
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s1355supercontigLSalAtl2s1355:16064..43157 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000001988 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000001988EMLSAG00000001988-684754Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000008764EMLSAE00000008764-717692Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000008765EMLSAE00000008765-717693Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000008766EMLSAE00000008766-717694Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000008767EMLSAE00000008767-717695Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000008768EMLSAE00000008768-717696Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000008769EMLSAE00000008769-717697Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000008770EMLSAE00000008770-717698Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto769225auto769225Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000001988EMLSAP00000001988Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000001988

>EMLSAP00000001988 ID=EMLSAP00000001988|Name=EMLSAP00000001988|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=467bp
MWPRYLAQMSLLRLLASSPLCVKHINKVSNSNFLKTFGRNATTVSDSELK
SILASKIVPFQNEVKAFRKEHGSEKIGEITVDMVYGGMRGMKGLVTETSV
LDPEEGIRFRGYTIPQCRELLPKASVGGEEPLPEGLFWLLLTGEIPSEVQ
VRGLSKEWADRAALPGHVVSMLNNFPSNVHPMSQLIAAVAALNSESKFVK
AYSSGMNKSLFWEPCFEDSMDLIAKLPVVAXTIYNNXYREGKTPCPIDPN
KDWSHNFSEMIGYKDVTFTELMRLYLTIHSDHEGGNVSAHATHLVGSTLS
DPYLSFSAGMCGLAGPLHGLANQEVLIFLSKVAKDLGLNVTDNKLKDYVW
NLLKSGQVVPGYGHAVLRKTDPRYTCQREFALKHLPDDDLFHLVSQLYSI
VPPILTETGKVKNPWPNVDAHSGVLLQHFGMKEMNYYTVLFGVSRALGLL
AYHWRDQNLCQQKGLKN
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mRNA from alignment at LSalAtl2s1355:16064..43157-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000001988-697835 ID=EMLSAT00000001988-697835|Name=EMLSAT00000001988|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=27094bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1355:16064..43157- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGTGGCCTAGATATTTAGCTCGTTTCCTTTAGTTTTGATAAAAATACTA ACTACAATGCCACAATATCTTGATGTGGTAATTGAATCATCGTTACTTCG AAGAAGATGAGTTGGAAATGTGTTCTTCTGGATGACGGCACTCCTAAGAA CCCTGACATCAGTTTTCACAGATCCCCAGTCTTCAATGTGCCCCTAATCA AGAGCTCCAATCAAAGAAGGAAAGAGCCATTCCAAGATCCAAAGTTAACA AAAAAAAGCCAAGAGACAATTTAGACAATAACTAAGAATTCAAGAATCTG CASCCTCCATTTCACAGAGATGACTTCATCAACAAGGCAGCCGACAAGCA ACATAGCCATGGGAGCCAACTAAACATAGACCTATAACAAAGATAAGACT GAAAAGACTTGTATTACTTATTAACTAATTGAAAAATTAATTATTAATTT GTAGGGGTTGAAAGATGACACTGTTCCGTCAGGGTGGACAAATCTTCCGT CGTATCTTTTCTCACCTTCAGCACACATAGACTTACCAGAGCAGCATTAA GCAGTCAAAGGCACCAACCGACTAAAAACGTCAAAAGACCAGTGGGGTTG AGATGTCCAATAAAGAAGAAGTTGATACAGCTCAAGGTCTATATAAGAAG TTATCAATAGAGATACTTGCCTCAGGATTTACTCTTCTTAAATCGCCAGA ATTATCCCTAGTCAAGCTTGAAGCTACGAGGGCCACAGGCCTTGAAATAA AAGCCAGCCTTGAAATAGAAGATTTGCTACCCTTCAAAGTTTTTAAAGAC CATCACAGGATTAACACCAGTGCAATTTCCTACTGTCTAATAACAAAATG ACAGGGGAAGAGTAAATCTATTACGGAAGTAATCAATTTATTGGGACAAG GAGGAATTGAAGAACAATGAGGCGTATGAAGTCATCTTGACCCTCTTGCA TAAACTATTAGAGTCTTCAGACTTGGAGCCAGCTCAATTATCAAAGCTCT CTTTTATCACAGAGCAGATAACGCTACTCTTCAAGAGCCCCAAAGCTAGG AGATACTTACCAGGTCTTCTCTCTGTTCGTCTCCTATGGCAAAAGGTAAG CATGTCCCTCTATAAGAAAATCTATATCTCAAATGCTCTTACAATTCCTA GTCCTAAGTATATCAGAGCTCCGTCAAGCTTAGTTACTCTAGAGACTGGA TTTCCTGTTTAAACTGTTAAATATCTCAGAACAAGGGAAAATACCTAAAT AGCAGGGAACCCAATGTTACTCTCATGTTCCTTGGTTGTGAGGACAATCA AACGACCAAAACAATTCTCATATTCATGATCAAGTCTGCTGGAGGAAAGT ATATGGATGTGGTTGCACTCGTCCCAGTGGCAAAAGTGAATGCAGAATTT ATAAATAATCAATTATCAAGACTCTTTATCAAATCAGGTTCATTGACGTT GCCATATCGGTTGACAACCAAGCAGCTAATACAAATTTCCACACTAAGCC TTTGTTATGGTGAGCTCCAGACCTTAATACCTCACCCACATAACAGCAGT AGGAACGGTTATCTCCTCTTCAACATCAAGTGAAATGTATTTACTATGCA GTTTCACATGATTTTCATTTTTGAAATCTTAGTTATTGTCTTGTTGAAGT ATCCCTTATTTTAATAGTTCGTATTACATAAATTTATCNTTTGTTAATGA AATAAGGTTTATTATAACTTAGTTGAGTCCCAGTTTAAATCAGGTACATG AAGAACTAGAGTTTATATTATTGAATGCACGGTAGTCCACACTCTGAGTT GCTCGTTTTGAAGTCCGCCATTCATATAGAAGAGACACCCTTGTACAGAA CAATATCTTATTTTGGCGTGCGCTTTTTTTTACTAGTGTGCAAAAGGAAT 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ATTGTTCAATTCAAATCAAAGATTTTGACAGATTCATTTTTGTAAATCGG AGCCGTCGTCATGTGGTAGGTGGACTATGGATAGAAGAAAAGCCCACTTA ATTCGCTCAGTAACTTCACCAATCGCTAGATCGAGATCAACTCGTCAAGA AGATGGATGGATGAATAAGCCTGTTTACTGCCTACCTATACGAGTAGCTT ACATTGCCAACAGATGAGTTGTGAACACATTAGTAAGTTTCTGATCGAAT AGAAAAGTTCAAAAGCAAGTTTTATTCAAGTAAATTCATACCCTGTGTCT CATACTCCATTCGGATTCGTCTCTATCTGAAAATTCCTTGCTACGGATTA CTGTCAAGCAGAGGTTCTTTTAATGAAAACCAACTAGTGTGGATATAATA TGATGTAAATGATTTTGTTCATACCTTTTATAGGCTCTGATGTCAAACTG TATAGTGAACATAACAAGCATTGCAATAAGGACTGTGGAACTGTGTCATA AGGACCTTCACACTGCCTCAGGTGTCCCCGAATTTCCCTGTCAGATTAAA TTCCTAAAGTTCCCCCGTCGAGGTGACTTCTGATATTACTAATTATTTGA TTTTTTTTTTTTTAATTTATTTTCCTTACCCGGATTTTTAAATTGTATCT TTTTATTATAACGAATTCTGTATATGTTACAGTATAGATTGAAATTCAGT AGAATTGTTGATTCTCGTAGTATAGATCATGATCGTAATTTGTCCTGGGA CAGATTACGATCATGATTTCTACTAGGAGAATCAATAATTATACTAGTAG AGATTGCAATCCTATTCTCTCCTAGGACATATTAAAATTTTACTGAGGGA GATAGTAGCGTTGAATATTTGAAGAGGTTGTGTGTTTCCGAAAATATGAC ACAAAGTCGTACCCTCTAATTTGCCTATTATAGAATATAGTTAATAGTAA 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GGAGGTCAGTACAGGGTTTGTGATTGTTTATGTATCCGAAANCTTATTTT ATTCGATTTGGAGGTCAGTACAGGGTTTGTGATTGTTTATGTATCCGAAA TAGTTCGTAGTACAATAATTTGTTTTTCCTCAAAATGGAAATTGAGGATT ATATTATTTTTTTACAACTTGTGGAAGGAGCTTTAATGAAACTTTTAAAA TTCAGCATAATAAATTTAACATTAAAACATCTCAATCCCTTAACTATTTG TATATTCAATTTGACAAATTTTATTTTCAAATAGCTAGATAGGTCACAGA AACGGTTTTTCAAGACTGAAACTTTTTAAACATCTTTTTTTTCATCCATA CACAATAGATCATCCAAAATTTGAGATACCATAGTACACACGTTAAGATT TACATAAAATCTTGACTTTAAGTACATTTTTATCATTTATATTTACAAAA CAAGAATTAATATAATCTATTTCGATTCGCTCTTTCAGAGGGAAGTTCCT TATAATTTCATAATTAAAGATGTCCAATGTCCATCCTAGGTATGGACTTT CTGAGTTTGAATTTGACTGTGAAATAAAAGTTATAGTTATTATTATATAT AAGTAAATGATATTTCAAACATAAACCTCAAAATGTGAAGATCTCCTTAT CCTATTCAATCTTCAACTCAACAGATCAATGGGCTTCTTTTATTTATTAA CCACTAAAACTGGATGGKCTTGAAACCATGTTTTTACTTCCATTCGTTAG GATCCAATATCCTCCCAGTAATATGAAGATGGTTAATTGCTACAAAGATC AGAGTTGTTTCCCCCAGGGACAGTTAGGGAAGCTATTGTTTTATATACCC GGATACATAGCCTCTTTCATCATTAAGTTTTTCAAAATTAAAGATTGTTA ACCTTTTTGATTTCTCACAAATCAATAACTCATGGTGTCGGAATTTTCTG 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