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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s136 | supercontig | LSalAtl2s136:21129..134054 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000002039 >EMLSAP00000002039 ID=EMLSAP00000002039|Name=EMLSAP00000002039|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=278bp
MKLCQNQLLTVVVFVFVTKVINPVRGQRRTDVFKTELFLNDGDLNSGLYE GMVRGRRLFGSSQIPHGIGTINYFTSDIFGRKNYTGNWKDGMRSGFGTTY FRDSSVYKGQYKDGVENGDGEFKDGKIHGHVVFNYPNGDQREGFFDNNIL NGQVIYTKANGDTKIEIWAEGVRQNEGVVTRPSASSRRVIPTTPKTVIIE SNNLEDFNPSFTSSNSIDNGQIFTKSIADERGEPFRLPRLXSTTDGSNRR INLLMESLRRIVKEEQRNFLLALFQDVS back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s136:21129..134054- Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000002039-697886 ID=EMLSAT00000002039-697886|Name=EMLSAT00000002039|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=112926bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s136:21129..134054- (Lepeophtheirus salmonis) ATTTACAAATAAACAATACGTACTTTGACCTAGTGTGCTATACACATTAT
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TCTCATCCTCAGCCAGCCAAGATTTCGGGTATATTTTAAGGTAGTCTGGC
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TGCGTGTGTCTTAGATAATTAATTAATAGCGATTCTGCAAAGGTCATAAA
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GTCCGTCTTTTATTAAACAAGGGTATTGTAGAATGTACTTTATTTGGATT
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TTAGCAGATTTAGGATTACGACTAATTATGTGTACTATCAAATATATTGC
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GATACTAACGCATTTCAAATATTATTATAGTAAACTGAAACTTCGAACTT
TTCCATAAGTGCATGTCAATTGTCCTTAAGGACCTTTTCAGCTGTTAAAT
TATGAAAAACTAGTAGAATACTTATATCCATGTAGGTACTAAAATATTCG
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TATTCCGGATTCAATCAGTCTGGGGTTTGCTATACATAGTATGATTTTTA
ATACAAAACCTTGTTCATAATATAATCACGTATTTACTAGGGTTTTATCA
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ATAAAGAATTTAATATTTAAAGCGTTTTTGACAATCCATTTTTTAAAGGA
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TGAAATATTTTTCATATTGAATAATAGTTTATTCTTATCTACAAAGTGGG
TACTCAAACTTGCAGTAACATGATTAATATACGAAAAACGTATATATTAT
GTAATCAAAAACATAAAAATAAAAACCAATTAGTAAACTATTTAAACAGT
ATTTTTGCCTTGACTTTATATTCAATATGTACTCATTTACAAGCAATTAT
AGCCTCTACAGTCTGCGAACAGATTAGCAGCTCGTGATGATGATGGACAC
GGKGTCCATGGKGTACAGTGCTTTTGTGATGGCAGRTGGAAGCGAATCCA
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GTTGGTTTGCAAATTCTCTATAATCAATAAAGGTTTTGATTTTTGATCAG
TCTTGGAAAATAAAAAATCTTTCTTACTTATAAATTTTGCCATCAATTTT
AAATTATTAGGTGATTATTTTCACTGAATTAAACATCAACGTCCATCCTA
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TTTTTTTATTAAAATAGGATAATTGATTTCAATAGTATCGATGCATTGAG
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TCATTTCTCTATGTGTAAAAATGTTGAAGCAACAAACAAAAAAAGAAAAG
CMACTCCTTCAAGCAGTGTCAGTACGGNNNNNNNNNNNCATCTCCATTCA
GACTAACAACAACATCAATAAGCCCATAATAGTCACAGAAAGCCTAAAAG
AACCAAAACTTCTTCAACGTCAATATGGCTGACTTTTGGGCTGCCTCCAT
GGGGCCTTCTCCAGCCCTATAGTCGACCGTTTGAACTTTGCAGTTTCAGA
CATTTAAGAGAAGAATGTCTGCCTCACTGATCATCTAAATTTGGAGTATG
AGAACGTAGTAAGCCATGGACACGGCCTTCATCATCAAAGGCTGCTGATC
TCTTCGCAAGCAAGTCTCTGTTTGTGCTTTGACTAATTCTTGACCAAATA
GGATCTTGTTTTTTACCCTGGCTTTAAATATGGGCATTGGACACCAATTC
ATTTTACTCTTCTTTTTTTTTCAATTCTAATTAATTGGTTCGACTCAAAT
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TTTAAGTATATAGTTATCTTCCAAAGGCTTCTCAACAATTTTCTCGTCTA
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TAAAACTTCGTTATGTGAAATAGTTTTAACTTTAAATATTATTTAATTGA
TATCCTTCCATCTTAATGTTATGTCTTATATTAAAAAGTTATGCTCTAAA
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CTTTGTCTGTAAGTCTAAATAAATATGCAGCAATACCAATGGTTTATTAT
TTTCTTAGTTTTCATATTCCATCCATTTAAGGATCAAATAGATTATTTTA
TATGTATTTTATTACAAAGTAGTTAACCATTGGTTCCATTGAAATCTAAA
TAGTTACTCATTCAATAATTAATGAAGGTTGAGTGATTGAAATTAATTAA
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TGAGCTCTTTAGCTTAGCGACAAGTCGAAAAAATTACACTTGAACTTGAT
CGAAGATTTTCCATTCGTGCACTCCAAACCGTTGTGTATCTCCAGGACCA
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CAACCCTCTCAAGTTCATGAGGGCCCATTTTAGGACACCTCTGGATTTCA
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TGTGGAGAGGCTACTTTTGACACCAGCAATGGAATAAAMACATCTCTTTC
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CCTCCTATATTCCTTCTACAAACTCCCTCAACAACATATTTTGTGTGCAT
GTCGAATGCCTGCAGATTCAGTCATACAAACACCAACGCCCTCMCAGCCA
CTGTCAGTCAGCACTGCGACGCCATGACAGAGGACTACATCTGCAGAAGG
TGACAGTCCTTCCACCGTTACTTGTAACCCGGCATTGCCTCTAAGAGTGG
TTACATTAATGATTAAGAGAGCTCACACACATTTATTTATAATATTCATT
TCGTTGAAATTCTATTGTTGATTAATAAATTATATCTTGTCTGAGCTTAG
AAAAAAATAGCATTTTTTGGGTGCACTTTTTTGTTCTTGTTAGTGTATCA
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGCCTATCT
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TTCATACATTACAATTGGATCTCCAAAGCATCCATATTCAATAGTTCCCA
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ATCCGAGTTACGAGTATTAGCTTTCGATGCCAAGTAAATTTGTAAGTCTT
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CTGGTTGTTATAGATACGAAAAACTTAAACTATCTACATATGATGCTCTA
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TATATACTTGAGAGTTTTGTATAGATTATGTGATATACATTTGTTTTTCC
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TCTAACCGTTTCATAGAATTAGCTGCAAGCAGATAAGAAAAACAAAGTAT
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TGATGAGTAGCAGGTTCACGTCTGAAGAGAAGGGCTGCCACATTCCTATG
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AATGACACAGAGCTCCGTCTTGAGTGAAAACAAAGCTGTACCCGAACTTT
TCATGGCCAAAGGTAGTAATTTCTTATCCAGAAGTTCGATGTAAGCATCT
GTATTGAGCCAATCCTTCCCCTCCACAAAAATGCAAGAGCAGACATCGCW
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TCTTACTGAAGATGACCCAAACTCCTCTGATATGAGCATGGGGAACATGC
TGTGTGAGAGAAGCTTCAAAATTTCACTCTTTTGTTGCTCCATTTTCTGG
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATA
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AAAAAAAAGTGGAAATTGATGCCACTGGTTGTTTTATTTTATATAATTTC
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TTACGTAATATAATCTACTCCAAGTTCATTCCTTTAAGGTCTCTCTCATC
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GGTTTGCCCATTCGATAACCTGACTCTTTATAAACACAGTTACTCCCTTA
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CTTTGTAACTAACGGGTTTTCACGGTAAATTTAGACAAAAATTAATTTAA
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CGGTGGATACTATTCCTCGCCATTTCAAAGATTTGGCATACTGCAAGAAG
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AAATTTGTTCAAGAGGGAGATTGGAAGGGCAAATTGTATCAACTTAGATA
CTAAATACAGTTTGGGGCTATTCAATCTGGAACATGTTTAGACCTTAATA
TCTTGGCAAACCTGAAATGTATGTTTATAGAAGTGTATTTTATCAGATTT
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ATMCCTCTMCAGCCATTAATGTGTGCCTCAGGCCAGGTACAGCCCCAAGG
ACACAAATAATTCCATAGATAATTATGCATGAGAGCTTAAATTGATGTTA
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CGGTGTATTGGAACAGGATTTATTCTGAAAAAACCAACATTTTGTAAATC
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ACAACTATTTGTGGTGCATCTTGAGAGTCCAATAAACGTGCACATGGCAC
TAGTGACTCTTTAAGGACTTCCATTTTGAAGGCTGTGGTCCATATGGACA
ATGAGCTCCTCATGGAAGTCAGAACCAGGTTCAGGGATATTTTTGAGGTT
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TAAACTTTTTGGGTTTAAAATCGTCGCCCTGCATATATATATATGCTCAC
ATAATAAGTCTTGAGGCTTAGGGTGCATAGCCCCWTCATTTATTTGGTGA
ACTCCGCCATTGATACCAAAATTCCTTGCTGGCCTCAAACACTCATTTTA
TATCCCTCCATGATGGTTGCTCACCTATCTAACAATTCAAATAAATATTT
CTAAGAGGCAGTCATCAATGACCTTGGATTTAAGTCTGAAATGTTGATTT
TTACTGAGAGTATGAAGGATATCGAGAACAAGTTATTGAACAAACTGAAA
CATGAGGGTGCTGGCAAATTATTTTTTTCCCCTTCATTTACATATTTAAT
CCTCTGAGTGAAAAAACAAAAATATATTTAAAAAACATACAACAGGCATG
CAATTATGTTACAGACACAATAAAAAAGCTCCAGTATTAAACGTTTAAAG
GAGATCGCTAAAGAAAAGAAAAAAACACAAAAAAGCGGGTACAATCACAA
TGACGAAATATATAAAAATTAACACACAAAACAGGGATGGAGTAAAAACT
GGACTCGTAATGCTTAATAATTTAAACAAAAAATAACAATTATTCACAGC
TAAAGTTGTTTATAATTCTAAATTGTTTAAGCATATAATTATCAACAGTA
ATTCCTAAAAATTTATGTTCTGATAACTTTTACATATAATCCTTGTAAGG
AGCCATTAAATGTGATTGAGTCTTGGTAGGCATAGCAACAAGCTAGGCTT
CTTTATAAAGTTCCAGCCGGAATTCACCCTCTACTTTTTTCTCATCTATC
TTTTTCACAGGTTCCACGATTTGTCATTAGTAAAATAGATGGAAGGAGGA
CTCAGCGATCTTCTTACAAAATGTGCAAAGCCTATCTCTTTTATCTGGTG
AAGACTTATTTGTAAAAACTGTAGATGTGGGAGCATGATACCACATCCAC
TTTTCCCTTGAGTTTGTAAACGGATCATACCCGATTTCCATCCCATTTCC
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AAAATACCCGAAGGCTTGATTTTTTCTCTTTTTGTGTGTATTTTGAGGAA
TTATTTTTAGCTAAGGTGGTCGGTTGCACAATTCAATTCGTCAAAAAATT
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CAGAAGCCTGGTGACCTGGAACCAGCCAAAATTGTCAGAAGTCCTAATTC
GTTGAAGAAAATAAACAAAAAAATGGAGAAAAATATCGGTCAATCATTGC
ACGCTCTCCCAGACAGCATCGACGTAGTGTCTCSYTCAACTATTCATGGT
ATCATCATTTAAGACTTACGGTACCACAGCATTGCACGTCGAAAGGAGAA
GATTTTAACGCCGTCAAACAGGGAGAAAAAAGTCACTCGAACTAAGTAAT
TGATCAAACTAAAGCAGATACCTTCCATGAAAGATTGCGTATGATTCTTT
TCAGACGAGAAAAATGTATTTCCAACCCAGAAGGATAACTCGAGAAATAA
TAGATGTTTGGCATTAACGTCATTAGGATCATGAAGGTCAAATACCCACA
TCATGTGATATAGTTATCGTCGTTGTTCGTATCGAAGATCACGTTATGCA
GCCTTTTAGCTTCAACCAGGGACTGAAGGTTGAAGTTCAACATTCCTTTA
ATTTAATGCGTAAATTTATTGTAACAACCCTGTATATAGGATTGCCATTC
TTAAAGGTCACAAATTTGTGTCTATCTGTCTTTAATACATCATACTAAAC
CTTTGTACATAGGTGATAGATGAAGAAATTCAATTAGCATATTGTAAATG
TACTTAATTACTCTTTGTACAGCTCCTCCCACGCTCAATTCTACTCCTTA
GAATGTAATTTAAAAGTAATTACTGTTCGTCTATGATTATTAATTTTGTC
TCATGTGTACCTATGTGTAGATAATTTGTTATTCCATTACTTTAAGGTGT
AATAATAACTAAGAGGAATGCCTCAGATGGGATGAACATATTATAACGAT
TAAACAGGGTCAAAGCCCTCCCCACTTCAAAAAACACACAAGGATCTCAT
ATACTTAAAAATAAAGATGACATCATTTATGGATATATCTACCGGGTGGG
CCATTGAAATCTGAACACATACTAATTCAATAACTAATGAAGTGTATTTG
ATTAAAATTCATTCATATTAGTGTATTAACAAGAAAAAAAAAACAATTCT
GAGCTCACAAACTAATGTAGAAGTAGCAAAAATGGCACTTGAACGTGATG
GACAAATTTCCATTCACGCACTCCAAGTAATTGGACGTCTCCAGGACTAC
CCTCTACGCCGTCAGTAAGTCCAAAATATTGCAGAGGAAGAAGGGTTCTG
TCAAAACAGCCAAACTGGATCCCCCTGTTTCAGCCTTTTGTTCATGGGTC
CGACCTGTTTTTTGTACAATTCAACGGTCCAAAGGATCGATTACCCATGT
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GTTATGATAAATCTTCAATAGCTCAAATGGCATTTGTACTTACTACGGTC
CTAGGACTGGCAAATTGTACTGATTTTAGTGCTTAAAGACGGATCCAACC
CTTCTAAAAGCATTATGAAACAATGTGAAAAATCCAAGCTCAGAAAAAAG
TGTATATCATAAGAAAATGATGCCATGAAGTCACTCGATTTTTTTGACAA
AAGTTCATTTGATCAAAGTGTTGAAGATTTGTGATCATGTCATGTTTTGA
TTGTATAAAGGGCGCCTCCTCCGGATATTCTTGTACATCAAACAGTTCCT
TTATTAATAAAAGTACCATACAAACCTATTAACGAAGCATTTTTACGACT
TTCAGTCGTAAAAAATTGAATGCCTGTGCCCAAAATTTTCGGCCTTCACT
CGTAGATTTTTTTTTCTAGACTAATTTTTAGTTAGTACCAACCTTCAAAA
ATGTACTGTTAAAATTTCATAACAATATATTCTTTAGTTTGTCTTTTTTG
GGCCGCAATTTTTGTTATTTCAAAAACAAACGGTTAAAAAATGTCATGTT
TTCATTTTAACCTGCTTCTTGATGGGGAAAAATATCCTTCAAAATCAGCA
AGGCCTTTAAAAGTGTGCTCAATAAAGCGAATAAAAAATAACCATAATTT
TTTTAAAAAAGCCAATTTTGAACGAAAACGTGTTTTATTTGTCAATACCG
GAACTTTTTAGCCCATGTGTTAGAATATTCTAGTCAAGTCGAATTCAAAT
CCTGCCTAAAATATTGAAAAAGTACTTAATCAATTCGTGAAAAAATACGA
AGGAAAAGTTATTAATAGAAAGAGGATCAAACAAGGCGATTCTCTCACTT
TTTCGTTGTGTCTGATTGCCGCTATAGATCTCTATTGCAGAACCCATTCG
AACCAGCTCGTGAAAGGCCTAAAAATTAATGGTATATCATTTAATACTCT
TTTATATATAGATGATCTCACAATTTTTACAACAGGAACACAAAGGGATA
TACAAATCTCGTTAATAAATGTTATAGATGAAATTGCTGATTTTGAAGGA
ACATCCGGATTGAAATTAAACATAAATAAAACAGAATTAGTCTCCTCTCC
AAAAAAAAACAAGCTTGAAACGTCATTTCCCAACTTCCGCCACACATCTC
CTTTGTTTTGTTGTTTCGTCGATATCCCAAGAATTACGAAAAAATTCTGG
AGACAATAACAAAGGAAGTCAACAGATATATTTCCCTAAATATTACAAAA
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TTTCCTTCATCTCAAAGCTTGTAATAGCACAATTCAAATGATGCCACGTA
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GACTGCAATTCTTGTTTATGTTTTTGTTTTTTTTGCAAAAAAAAAATATT
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TTGCCTACCCGGTAAAAGTGCTAATTCTCTCGGTATATTGTCTAGTACCG
TTTCAAATGTCTTGGTACCACGGTAAGGGTTAAAGGGTTGCTTTTATCTT
CTGGTACAAAATGTTATTATTTTCAATTCGAAATGACATTGGGGCAAAGT
CCCGGAGGAGGACAGGGCATCTTATCTTTGAACAGAGCATGCTGAGACGG
TTGGAAAGAGCAAAGAATATTCTAAATTTTCTCAAGAACAAAAAAAAATT
CGGGGAAAGTTTTGCTGCTTTCTTATTTAAAAAAAGCTCACAGTTGATGC
CTCTGTGAATAAGCCTGAACTGTCGCTACATCACAACGAATCATCCAGAG
AGTGGCTCAGCTTCAGTGAAAAATGTCTTCCCAGCAAAAAATTATGGTTG
CGAGCCCAGGCGAAGTTTTCCCTCACATTTTTGTGGAGAAGAAGAAGCAG
CTCAATACAGATGCTTACATCAAAATTTCACATAAGGAAGTGCTACCTTG
GGACAGACAAAAGATCGGGGACAGCGTTGTTTTTACTCAAGAAGGAGCCC
CATGTCATCGCAAAGCTATGACCCAGGTGTTTCCAGACTCTAAAAGCCTC
CATCTAGAAGAAGTGAACAAGGTAGAGTCTGACCACATATTCTAGGTCTG
TCAGGGATTTAGGACTCGTATTGAGACAATTATTAGAGCTGAGGGCTCAC
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TAGTCTGTATTCTGCCCATCAGCTGAGTAGTCATGTTCTTATTATGATGA
TTCTGACCACTAAATTGAACTAATATGTTTTTGAATGACAAGATAGATAA
AGATATGGATGTGAATATTGGCTAAATTGCAGTGAGCATAAATTTAAAAA
CATATGTTGGTATATCAGCTTGCAAAGAGGATTTTTATAATTTATAGTGA
TCTCTCTCAGCAGATATATTGTCTCTTGATGTGAACGTATTTTTATGACA
TCGTTTTGACGCTCTTCTCATGGTGGAAGTAGAAACAACTTTTCTTTCTG
TTGGCTCTAGACTGATCAAATAACAAAAGCATAAATAATTTTTGGATGAT
TTTGCATCTTAAAAATATTCACATCTACAAGGTTATATGGGTTAAATCCA
TATAAAATCGCACAGATTTTACCAATTTGGAAAGTTTCAGTCCTACAAAA
ATACAAGGCATTTTTCAATGAATTATTATTTTCGACATAGTCTCCTTGTA
GCCCTACACACTTCTCCCAGGGATACTTCCATATCTGTAGCCCAACTGAT
TTTTAAAATTTTAATCACTTTAAAATAAGCGTAAGAGCAAGTACTTGAAG
TTAACTTTTATTTAAAAAAAAAGTAATTATTCAAAAACTMCCATGAAACC
ATTATTGCAAATATTAAAAAATGACGCCCCCGACATAATTCAAGTTTTAT
TTTACTCATTTTTTTTATTAAAGTTTAACCTATTCGTACATTATGAGTTT
GCAAAAAATTAAAATGGAAACGTCTTCATTTAGGCCTAAAATTGAAAAAG
GTGATATTTGTCATAATAGTTAATTACAGGCTTKTYAGCGKTCCMCTATT
TTGTCGTTTCGTTCAATTTTTTCTTCTTTGTGGAGCATTCATCGTTCCCC
CGTTATTTCCAATCTGTCCTACGTTCCAATCATATGGTAGTACTATATAC
ACTATACGACAGCAAATCACCAATTCCATTTTGACAGTGTTAGGGAGGCC
TCAAATGGGAACTATTTTTCAATACAATCTGGTGAGTATTAGCGTTCGAA
ATGAGTTATAACTGATTAAATCGGTTTATTTATTTTTGAGTTGGAGGCCA
AAAGGCAAAATATAGGCAATTTGATTCACGCCCAGTACATCCTCAAGACA
AGAAAAACTGGMCTCTGGACCAGTCAATAAGCTCCAAGAACGACCACTAC
CTTGACTACAAGGTAAATGATGTTTCTCAGCCTCTGGGATCATGCTAGAT
ATCTTGCCATCAAACAGGACGAGGATACCCCTGTATTGGTTCCCGAAAGG
CCTGAAAACAGGAGTCAAGGATAACAAGGMCCTCCTCTTMCCCTGGATCA
AGTCCAACTACCCAGAGGGAAACTATGTGTCCCAGCAAGACTCTACTGAG
GTCCTTGCAATACAATAGTGCATAATTTATTATTTTTAGTAGGCCTTTCG
CATACATTTATAATTACTGAACTGGTTAAATTCATATGTTCGAGTTAAGG
TAGAGAGGGGAATAAACTTTCTTGCAACATAAAAGACTTAAAAAAGTGAA
CCCTCAGCTCCCCCCCCCCTCACCCTGGATACTGCCAAAAATAGGTTTAC
CACGCGTTTGACTTTGCTTTATCGGCCATTTAAATCATATTTAAAGAACT
TAAAAAATATATATTAAGTTTGAGTTGTTGAATTTATTGTAAGTACTCTA
ATGGAACGAAATGCTCAAATCTGATTTATGTCTTTCAACGTTCAGCGTTC
ATAAAAATATTCCGTTCCGTTCTTCGAACGCACGTTCCATTTTACATTCT
GTTCACAAGACTGGTATTTCCTTTCTTGAAATCCCTTGAGGATGAACAGA
GCTATGTTCCACGAAAGTTAGAGTATCCTTCGTAAAGGGCCAAACTTTGA
GGTACTCCAAAATGGGTCCTTGTGCTCGTATAAATCTACAATTTCAGATA
TAGTGTTATGTTTTAGGAATACACACCCTAAACAAAAATTATCAAATTTG
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