EMLSAT00000002117, EMLSAT00000002117-697964 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000002117
Unique NameEMLSAT00000002117-697964
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s139supercontigLSalAtl2s139:1038313..1060164 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000002117 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000002117EMLSAG00000002117-684883Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000009368EMLSAE00000009368-718296Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000009369EMLSAE00000009369-718297Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000009370EMLSAE00000009370-718298Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000009371EMLSAE00000009371-718299Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000009372EMLSAE00000009372-718300Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000009373EMLSAE00000009373-718301Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000009374EMLSAE00000009374-718302Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000009375EMLSAE00000009375-718303Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000009376EMLSAE00000009376-718304Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000009377EMLSAE00000009377-718305Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto780297auto780297Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000002117EMLSAP00000002117Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000002117

>EMLSAP00000002117 ID=EMLSAP00000002117|Name=EMLSAP00000002117|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=512bp
MKSYTGLCDGYHIERDHVPSALKNLLDSSFESYPTHWIISKDKISGSNGH
GGEKATTPIRIIKRPKANPKEDLDLTGSPLECSFELDEDLNDDDNDEFIF
GGRNGSSSEDLYVPMTPQEARKILSKINLQTQNTTLNLPLICCITNGESI
YALGVYRKDNSTSSMFQITYEENKVRNDLVTFDKLMYNHRSISSSSTKVE
SNATSEYNVVGDHDDFSDITLIFKWNKPKSILENPSLTANVSLHMSVKPG
DDKLTTHDSWKELFLLRGFIAGVNNEGITWRERSDGENDLNNDLIVLLDR
VRNLTPRSNQEFTDVSAIVDSGGDVEERIGVITDSTRQDVDFTDLLWSTL
YKVESYQELSYTNDLAAKDDIKSLMLKNEDKTIECHNLLRLHYLLELVVL
AQTFLSLNHDDLRTIVSQALKFLNSNSTVSWKEEHFSMDLQSSHFRNQLL
QMNPYAWQCEFKSSDGKQTTSRFSIDPPMPFISTSGISNCKDLSDSEFSY
FTSILSVITRVS
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mRNA from alignment at LSalAtl2s139:1038313..1060164-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000002117-697964 ID=EMLSAT00000002117-697964|Name=EMLSAT00000002117|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=21852bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s139:1038313..1060164- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGAAATCATACACAGGGTATACATTTCATGATTATGCAGAAATGATATT CGGTTACTGGATTAATTATTGTCACTCCATAGGTATGGGAAAAACCCTGA TAACAAGTTTTAATACTTTTAGATAACAGAAATATACATCGGGACTTTCC TAAGGGGAAGGCTAGAGGGGATGCAGCCCCTCCCAAATTAAAGATTTTTT ACATTTTACTAGAAAATTTAATTGAAAAAAAAAAATCCAAAAAAATAAAT ATTTCTTTTTCAATTTTTTTTCCAGAAAATTACATTTTCTGCAATAACTT TGGATTTTTTAAATTATTTTCCGAAAAATATAATATTTCAAATTGGATTC CAAAAAATTTATTTATTTATTTTGAAAACCTGTAGATTTTTGAAATTTTT GCGAATAGTTATAGATTTTTGAAATTTTTTGAGAATAACTATGGGTTTTT CGAATTTTTCTCCAAAAAAAAAATGAATATTTGAATTTTTTTTCAAAAAA TTAAATATTTGAAATTTGTTTACAAAAGGTTTAATATTTGTGAACAGCTG TGGATTTTGGAATGTTTTGAGAATCACTATGGATTTTTTAAATGTCTTGA GAATCACTATGAATTTAGGAGTTTTTTTTCCACAAAATTTATTATTTGAT ATTTTTTTCCAAAAAATTTAATTTCTTGTGATATTTAAAACTTTTTTCAA AAGATGAAATTTTATGTGAATAGCTGTGGCTTTTTGAAAAATACCAAAAG TGGATCCTTTTGGCCTCTACAACTAGGTCTTTGAAGAGACGCATACCCTT TTGGAGATTTAGTTTGAGATACATGATCTTTCTTATAGGAATTGCGACAT AGTCCGCTTGAAAGACTATTAATTGATAATTCAGATAAGTTATAAATCAA CAAAATATTCAATCGTAATTTTTCGAGTAATTATTGTTTGAGTATTTATA TGACATTTTTGTTACCTTAAGTTAATTATTTAAAAAAACGTGAATTCAAT TTTTTTTTAATATTCCTTTTATTGATGAGATGGAGTTGCACTGATATGCG GTATTTTTGGAAAAAAAAAATCCACGTTTTATTAAATCTGCATTGTATAG GGACTTATTTAATACTAAAACCCGTGAAATACGAGTAATTATTTATAAAG TGCACTTTTTACTATTTTTCTTTTTTTTATAGTATGGTTAGGATAATTAA AACATTTCCCGAGTAGTCTGTACGATAAATTAAATTGAAAATTCTAGCAA TAGTGATGTCATAGACTATGAGTGGTTGCGTTTGTTGTCAAAATCTGCCT GTGTTGCCCAACAGTCTGTGCAATACATCAGATTGAAAATTCTACCATGC CCGATTACATGATGGTCTAACCTTGTATTTCTATTAACATTGATTTTATC GATAATAAATTATTTAAAATTATGTATRCTGAACAAGATACTTCTAAATA GTTTTAACATTAACCTCAATATTTAGTTTTTTTTWCTATTTATTATCATA ATACTAAAAAAMGTAATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNCTAACCTTGTATTTCTATTAACATTGATTTTATCGATAATAAATTA TTTAAAATTATGTATACTGAACAAGATACTTCTAAATAGTTTTAACATTA ACCTCAATTATTTAGTTTTTTTTTACTATTTATTATCATAATACTAAAAA AACGTAATATGAGGGGAATATACGGCACTATACGTTAAGTTAAAATAATT TCCAATATTGTATTATGGGAAATCCTCGCTGTTTGAAACGGCGTTATGCG GGGACCTCCTCTATCACCATTATTCCATGAGACCTAGGAATTGTCTTTGA AAGCCATATACATTAATTACCGAGGTGCAAACTTACGTTTATTGAGTTTA 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TGTATCTATGAAAAGACGTCAGCAGGTGAACTGTATAGTGTATATAGTGC CCCCTGATTTATATACAAATACTGTATAAAGGAGAAAAAAGGATTATAAT TTACAGATAGCACTGTATAACATGAATGAAATCTGGGAGGGGTTTATTTC AACTGATATTAAAAAAGAAAAAAGTGAAAACATGAAAAATGAATGTGTCT TTAGATGAGATTTAGCAACGAGCTAAAGTACTCCCTCGCTAATCAAATCA TATTAATTATTAATATGATTGAGGAAAAAAGTATTGAGGGAGTAGCTATG TGTAAGTGACGGCTAACAACTCCAGGTTAATCTGGGTAATACCGCTAGTA AATTTATAAGTAATTTTCTTAAATAAAGTTTAAAAAGTTTTAATTTCCTT AAAAAAATTTCATAATTTATTTTCTAAGAAAACAAAATTCGAAATTAAAT TATTTAAATTTTTTAAAGGGCACCGTAATCCTATGTTTGTCCTGGGGGTG GTAAAACCAGCTCTGTTTATATGGCTAAAGTAGAAAAAACAACTATTTTT AGAGTTTTGATGGGTATCCTGTATTACCACGAGAGATGATGATCCAAAAC AACAGTTATAATATCCCTAATTGTTTAAAATAAAAATATTTTAACAATGT CAATTTTTTTAAAATAATAAACAAGTGCTTCTAAAATTTTCTCGTATAAA TAAGTTTTGTAGAAATATTTTAGAGATGTATAAAAATGATCTTTCCTAAT GATCCGACGACTAACCGGAATCGTGTACTTTTTGCTGGAATCGGAATTGA CATCATGAAAATTGGTCTAATTTCCGGTTTGCATGTATTACCTATATTCA ACTATTTATTACTTTTCTAAGTTACAAAGCAAAAATTATTAAATCTTTCC CTTAAGATACAGACAAATACCATATGAATTTATAAAAATTTCATCATATA 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