EMLSAT00000002268, EMLSAT00000002268-698115 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000002268
Unique NameEMLSAT00000002268-698115
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s142supercontigLSalAtl2s142:172256..199901 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000002268 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000002268EMLSAG00000002268-685034Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000010030EMLSAE00000010030-718958Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000010031EMLSAE00000010031-718959Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000010032EMLSAE00000010032-718960Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000010033EMLSAE00000010033-718961Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000010034EMLSAE00000010034-718962Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000010035EMLSAE00000010035-718963Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000010036EMLSAE00000010036-718964Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000010037EMLSAE00000010037-718965Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto773827auto773827Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000002268EMLSAP00000002268Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000002268

>EMLSAP00000002268 ID=EMLSAP00000002268|Name=EMLSAP00000002268|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=460bp
MDEYSSSTTSSSSIRNIFVQRAGAFKRKSIKKIHGHAFIQRFFKQPVFCG
HCKDFIWGFGKQGYQCQVCSFVVHKRCHEFVTFICPGVDHGADSDDNRTR
HKFKNNTYSSPTFCDHCGSLLYGLIHQGLKCDACDMNVHKKCKESVPNLC
GCDHTERRGRINLKIHCSGNKLVVEVVEARNLIPMDPNGYSDPYVKIKLI
PDNGEVLKKKTKTIKANLNPVWKETLVVDLKQDDKDRRLLIETWXWDRTS
RNDFMGSMSFGISEIIKTPQEGWFKLLTEEEGEFYNVPVPAEGEDLTANL
KKLKRQNEGSNKPVIKQDPLVPHNMKGKDLIRATDFNFLMVLGKGSFGKV
MLAERKGTDELYAIKILKKDIIIQDDDVECTMVEKRVLAMAXKPPFXVQL
HSCFQTMTNPRLGENFDPHFKKYNVQDTPPTTDSAFILLHARGDEFLGFS
CVNSSFIYPS
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mRNA from alignment at LSalAtl2s142:172256..199901-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000002268-698115 ID=EMLSAT00000002268-698115|Name=EMLSAT00000002268|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=27646bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s142:172256..199901- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGATGAGTACTCATCCTCCACGACCTCCTCTTCCTCCATACGAAACAT TTTTGTTCAAAGGGCAGGAGCCTTTAAGAGAAAAAGTATTAAAAAGATTC ACGGCCATGCCTTTATTCAAAGATTCTTTAAGCAGCCCGTGTTTTGTGGA CATTGTAAGGACTTTATATGGTGAGTTTTTTTAATTTTTTTTTTTAACAA TTCAAGAAAATGAAGAAATGTTTTTCCATATCATAATACACTTACTCATA ATATATAGTGATTGTTGTTGACTCAGTTACTCATCTTTATAGTAGATACT AGTAATGTAACGGATCCTTAAATTTATCTTCCGTGTTCTATGTGAAAGTT TGTTCTCAACGGATCCTCATCTAAATATTAGCAGCTTTGATCTGATTCCA ACTCAATTTTCCTCCATTAGGCTGGAGCTACGGTTCTTTTACTGTACCTA TGTCCTTTAATAGGCGAAGGACAGTTTACTTTTTCTAAGGAGAGGGGGGA GGGATATTCAAATTTTGTGGGGATATTTGGGACCAGCATTTTTTAAAAAT ATTTTCTTGATGTGAAACATATTTCCTAATGCCGAATTTTTAACAATACC AGACCAATCGTTGTTATTTAACCATTTCAACACATNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTCACAACTTGAGCATT CTGCCTGTTGAAGACAGGGTCAACAGTATAGGTATTCTCATCATAAAATA CTTTTCTCTCCTGTTCTGTCAATGCGCCGCGGAGACTTTCCTCTTGTCTT TTGTAGAGCCTGGTCATCACACTGATGGGGACTTGTTCCTTTTCCTGGAC ATGTCAGCATTGGAAGAATCCGGCTTTTTCTTGAAGGCCGTCTTCAGGGC GGTTGACGGACACTGAGAGCTTCCTTCCTGCTCCTGGAGAGTGTCTGAGG KCCTCCCCGACCTTCAACCACATGCAGAAGTTGTATCTCGTGCTCCTTGA GGCCCCAGTCTACTCCCAGATGGCCTTTTAGGACAATCCCGCTGGGAGGA GCCCTATGATCCCAATTCTCTTCTCGTACTGTGTGCTCATGGTGGCGACT AGGAATTTTTTTTTCTTAGCAATGGACACCAAAATGTGTGCCACAACATT GATCATAGGAAAATTGTAAAACAATCATTCTTAATCTCTTAAAATTTTCA TAATAAAGATAAGTAAATAATAACCGCTACGTGTTTTCGGCCTGCCTTTT TAATAACATTTCCCCCCCTGCTTCTTAATTTTGTCAGCCGTTGTATTTCC TGTCCTCTCTTTTCGATGTCATTGGCCAATACTTAATACAAATTCATTTT TCACGAAAAGTTATTTAACATATTTTGATAAAGGGTATGCGGGTTATCCA TTTTTTTCATTTTAGTGAAATTACTTGTAGGTACCAAGATGAAGTATCAA ATAAGGGAGTATCTCTTTCTCTAAGGAGCTTGTTTGAGGAAGTCTTGTGA ATACGAACATACTTTTAACATAAACATAGTAGTCTTATGAAGCTATTATA CAAAACCTTGATTATCGACCTCCTCTCTTATCAAGGGTTATTAATTAGTA TGACTATTTATATACATATTGTATATGTACATAAATATACCTTATCACTT TTTACTCAAACTTGCATTATGTCATACTATTAACCGGTAGATACTTCTTC ATATATTTCCATTTGGGTTATTTTGGAGTGGAGTCCATTTATAGAAAAAT ATTCCGATTCTAATGAATTAAGACTGATCATAGGCCTTTGCAATTGTCAA ATCAGTTATTAAAAATATCCTAATAAATTGTTATACAATCTTATTATTAA ACCTGGTCAGTAGGTATATCGTATAAAATCTAGGAAAAAGTTGTGCTTAA TTCACCCCATTACTTTAGGCTCTTGACTCATTTAAATGTATAAAAAAGCT AAATGATAAAAGTCATTGCAGGGACATTCAAGGCTTAAGACAATCACTCT CCAACAATCGCCGTAATCACCGTTATGTCAGCTTCGGTATAATCAATGCA GACTTTCGAACAGTAAACACCGTCAAACACCCAGCATCAGCCATGGTGCT ATATATTATTGCCTCCAGCGGATTGTGCCCCATGATCTGGTTCTCGGAGG CCTACATACTCACGGCAGTTATGTACATCGAGGTTTTCTTGCGAAACCTG ATCCCCTGGGTCCAACCAAATTTACCCGATGGGAACGTCGTCCTTCAGAA AGATGGGGCACCTGCTCACACTAAAAAACTTATTCCGACCTTCTTAGCTA ACAACATCGCTTTCTGGTACAAGAGAATGTGGCGGAATATAATTTGACAA TAGCTATGTAGGATAAAAATAGTTTTTTTAACGGTTGTATTTTGGTAGAT AATCATTCCCGCGTTAAGGCTTCATTTATGAACATATACAGGGTGGKCAA GCTATCTATGCCGCCACTTAACGCGCTCTCTGGGTCAAACATAGGCACTT AGGTGGCTTTTTAAAAAATTATTAGATAGATTGTTCAAACCTGTACCATT TGGGGAAAAAGGAATCACTGGAATAATTCGTTGTCCCAAATATTTCCAAA AGGTATGGAACCTTCCTTAACATAACAATTGCTCGAACTCTGGAACTAAG TGAAACGTTCGTTTGCAAGGCAAGGAGGAAGTTTGAGGCCTCTAATGGTA 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GCATGAAATGTGGAATGATTTGTTAGTCAAATATACTTACCTAAGATTTT ATTTAAAGATATCATAGTTAGAGATAGGACGGATCTTGGACCCGGATCCG AAGTACCTGGGTACGGTATATATACGGAACTTGCATTATGCAAAAATATC TGAGATCCCTACGGGTTTTACGGATCATAAAAAGGATTCGAGGGTTTTTT CGGATCTAAAAAAGCTTAGAGTATTGCGTAATATTTTATTCTTGTTTAAA AAAATATTATCATATCAAAAGTAGCATCTCTATTTTTCATAATTAATGAT TGGAACTATATCCACATAAACAATTTCATCTTGTAGTTATTTCAAACGAT GTTACCTGGTGCACAAACATAAAAAATTACACTTTATTTAGTTGCCAGCT GTCGAAGTTTATTCTTCATATTCTCTAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNGAACAATTATAAAGTATTATTGAATAATAGTTCCATAG CTCGAAAAATTGAAAAACTATGGAATAATTTTGGAATCTTTTTCTGTTTC TGTTCGGTTGCGAGATACTCTAACTGCGCCCCATGTTTTATTAAGAATAA TTCAGATAATAACATACAATTATGTTTGTATTAGTAATAACATTACGTTA TTTATTGTTCGGGCATCAGTAAGCAGTAAAAATATAACCTTAATATGGAT TCTTTTTTATTTAGTTAGGAACTTTAGGTAAAATGCTAATAAAATTATCC GTCTAATTTTGTGTTTGGAATTGGATAAAAAAAGTTCGGATACCCGAATA TTTACGTCTAATGATCCGAACCGACTCAGATATGATATAATGTGAMCCGT CCTATCTCTAATCATAGTTCTTTATAACTTCAACAGATGGCGTCGATTAT AWWTWGWWATATTTRTTTTTAAAGGAWAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN 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