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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s143 | supercontig | LSalAtl2s143:1023284..1055537 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000002311 >EMLSAP00000002311 ID=EMLSAP00000002311|Name=EMLSAP00000002311|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=238bp
MDSQNLLLLQIAFTVAVTEELSLYASCSASKTTTTAXASSGGVNNHHNLP
THPNQQIVAITATQQPQTLKRLWFASGDYSAAHSPPKVINHIHPGGVGLI
SGQLSTSPDTSDHKKLRLNSSHHQHIQQQHLHTSPSTIGGGGVILNNNSR
ASTXPSSSSSCKNNHKETTTNNSSNMESSGNLSQSIDSVSTVNGEEEGYE
GSLLKVTSKNGKTSSPVGFVTFNTRAGADAAKQDLQKL back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s143:1023284..1055537+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000002311-698158 ID=EMLSAT00000002311-698158|Name=EMLSAT00000002311|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=32254bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s143:1023284..1055537+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGATTCTCAAAACCTTCTTCTTCTTCAGGTAAAGGCTCTCCCTTTCAA
GCGCAAGGAGAAAGCTTCTTTTTCATGCGTGCGCGGGCCTCTTTTTACTT
TTCAGGAGGACCCGTTCTATTTTTTATTATTCCTTCCTCCTTCCTTCCTT
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TTGTGTTGAATCATATATTTAAAATTTACTCGGCCGTTCATTTGACATTT
TTAGCTAGCCTTGTCGTTTAATCGAGTAAATTCCACACCACAACACTCTT
TTACCTATATACACTCCCCCAATGCCCCTTTTCTCCAATTCCCTGGAAGA
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GGAAGAATTGAGCCTTTACGCCAGTTGTTCGGCCTCAAAAACAACGACAA
CGGCGMCGGCCTCTAGTGGAGGAGTCAACAATCATCACAACCTCCCAACC
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GGGCAATTGTCGACTTCACCCGATACCTCTGATCATAAAAAACTTCGACT
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GAAAAAAGGTTCAAAATCAGCTGGTAGTTCGTCTATTAGTCCCAACTATT
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ATTTTATTGGTTGATCTCCTGAGTTTATCTTATCAAATGACGTTTTGTGT
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TTTTTCCTTCATTGATTTGTTTTGATTGTTTAACTTTTTTGACATCATAA
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GGATCTTTTTTTATTTATTTATGCAAATCAAAAGTATTTTATTGAATCGA
AATTAATAAATGGACATGACTGGCCTAGAACCACTACAACCCATGGTGTA
GCAGAGGGCCCTGCAATCCATTTGACCCGTCATATAATTTATTTTCCCGT
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CCAGGTATGCGGTAAAATTATCCCTGACCTCAGGTATTATCCTTATTACC
CCTGGATTGGGATGTCGACCCCTGTAACCCTTTTTGGTTTACGGCCTCGT
AATAATTACACTGGAAAAAATTGCCAGTTATTTTGTTTCTCCTTCTTCCC
CTATGCTAATTCAATGACTTGATTCGGTTTGGTTCGACTCAAGTCGACTC
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ATTATGTATCTAAATATAAACATTATATAATTAATCCCATGATCTTTTTT
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TCGCGAACTCTATTTACTCTTCAGAGCCTATGAGGTAATATTATTCATAG
ATATACATAAGTTAGGGTGGTTTGTTTATCAACTTTTTTAGAATTTCAAT
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GTCATTGTACTACAATGTCATATTTAGGACGTAAGCCTCGAATAAAGTTA
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ACTATTTTATATTTAACAATCATATAATTTGTTCCCATTTATCAAACTTT
GCGCAACTTGAAGAAAAAACTACTATTTCGCTCTAACCCTATTCGAAATA
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TTTTATATAGGGCTATGAAGGATCTCTTCTAAAGGTTACGAGTAAAAATG
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GCATAATTTAAATACCTACGTCATACAACAAGTGTACTTAAATGTTTTCA
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GGTTATTGGTAGCTTTGTGGGACGGGGATATTCACATATTTAAACTGTAC
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GTCATTTATTAAAAGAAAATTTACTTAAATCTGAACTATGAACACAYCCC
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TAGTTACGTGAAAATATTAGTCTGTATTACATATTTTCTGTTCATGGACG
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CCACCTTTCTTGATAGTCAAATGAAGTTTTTAATTCAACCTTCTCAAAAT
AAATTGGGTGATGGTTCAAAGGAGATGAAGATATCTTCTCCTGGGCCGCA
CTAATGAACCATGAGCTTAAATTGCACAGTAAATAATATAAATATGATAA
AATTCACTTACATTTGAATGTTTTTTAAAATATATGATCAAAAGAGGGAA
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CCTAGGATCCGTAGCAATTGATRCGCCCCCTTCCAAGGCTACAGTGTGTT
GCCATAAAAACACAATTGAGGTAACTTATAACAACAGCAGACTGCCTGTT
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AAGACTAATCACGTAGTATTCATATGACGTTTTAGGGTACTAACTGTGAA
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TTATACTCTATACCTATGTACATAAGACACAATAATTATACCATTAAATA
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CGATACTCTTATATTAGTAGTTGTATATTTCCAACTCTAAATTATAACTA
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TTAGTACTTGTGATGAATAAGGTATTCCAAATACCTTTTAGCTCTTCGTG
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TTTTTTAAATATTTTAATGCAAATGAGTACAAAAGAAGGGGAAATGAAGG
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TGGTTCCTGGAATTGCACGTAACAAACAGATGGCCAGAGGTGTCTCTGGT
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GCAGGATAATAGTTTGCTATTGTTCATAATTTAGGCCTAATTCCCCTGTT
TATTATTCCAATTTTACGTTTGACTCGGACTCGTTCTGAAGAATTCAAAA
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AACAGCTTTAAAAATAAGATACAGGGGCCTTTGGCACAGCTTAAATATAC
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TTTGTATTCTTTGAGGAATAATTATAGTTAATTTATATTAATAAATTATC
TGCTAAATCTTTTGGAAGTGTTTCTAACAAGGAGAATTTTACCACGAGTC
TTGCAGGGCTAAAATAAATTTTTGAAATTTAAATTCAATTTTGAATTATT
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GAGTCCTTTTTTAATAGTCAAGGTGGTATTTATGTTAAAAAATGATTTCA
ATGGCCTTAAATGATTTGAAAGAGTTACTTTTTAATTACTTTTTATTCCG
AAAAATATACACTGTGCGACACCCATAGTTTTTATAATTAGCAAAAAAAA
CAACTGGTTGTAAATTGGACTTAAAGTAACAAGCCTGTAAATATTACATA
TTTAAAAATTGATAGATTTTATTTAAAGATGCCGTAATATCCGGCCCTAA
TGTATCTTCTAATAAATCAAATAGAAGCTTTAAAGCTTATAGTTTACATT
CATGGGTATCTCAACTTATCCCCGAAATTTGAAGACACAGCCTTGAATCG
ATGGAAATATGTCCATGAAATATTCGGCTTTATCTATTTCATAAATATAT
GGAAATAACTATTTCCCGGTTCATCCTAATGTGATTTGTATTTCGGTCCA
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AGTTGAATTTTACACTAATGAAATTAATTCGGTCTTACAAAAACTATAAC
TGCCTAAGGCCAATATAATATTCCCAAACCACAACCTTACATTAATATTA
CTATGAATGACCAAAAACTATATTGGACATATTATCTCTTTGTCTTGAGT
TTTGTTTATTAAAATTCAAGATCGAGCAAGGACATTAATACAGACTAAAT
TATCGTTATGTTATCAATAAAGCAAATTTTATTTGTATTTATATTGTAAG
TCATATACAACTAAAACAGTATATTTAAAAAAATGGGGGATCATATACAG
GAAACACTGTATAAAGTTATTGTACATTGCAAGCGTTTAGTTCAACTCAT
ATTTAAAAAAGAAAAAGAAAAAGGGAAGTACTTTATATAGAATTTTAAAA
AACATGAATGTGACTTTAGATTATGTTTAGCAACAAGCTAAACATAATCC
CTGGCTCATCAACTCAATGAGAACGTCTTAGTATTGAGTAAGTAGCTGCA
AGTGAGCGTGTATATAAAAAACGTAGAATAAGACCAAGGATTTCTTGGGG
AGTTATCTTCCATATTATTAAAGCAAAATTTTTATGTTCGTTGACGCCTA
ATAACTAGTCTTACTATAAAATGTAGTCAAAGAGTAAAAAGCAATTTAAG
CTTTATAATCAATTATCATATTATAATAATTTATATCAACATCTTTGAAA
TTTGTTTTATCTACTTTATCCTAGATTTTATAAAGAAAATTCTTTCTTTT
ATTTAAAAATTCCACTCTAAGGGTATTTTGAGACAGTCTATTGCAGGATT
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GCCTTAATTTTGTACTCCTTTTCAGCCTTTCCCCCAAAAATGTACCTTAT
TTGTTCGTTATCAAAAAGTATATGCTTTAAGCTTGTACACTGTACACGAG
TATGGTTTCACGAGTGCACCCCTTCCTAGAAACAAAGTTGAATGATTCGC
TTTGTACCTCTGTAATATGCCTACTCTATTCTGCTCTACATAAGTACGTA
GTTAGTTTGTTGCAGTATTATCAGACAAAGTTCGAATAACAAGAACCGGA
AAGAAACTTTTACTTTGTTTAAGATTTTTGATAATTATCTAATAATATAA
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GTTTTATATATTATATTGTATAAGTACAAAGTACAGCTATGCGTTATATT
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ATATGTATTATTTGGTGTACGTTTATTTAAGCAAAGTTATTTTTAGTGAG
TATCAYCMCAGCCACATTCATTCTGAGCGATATTTTCATTTAATAAACAT
TACAATTAGAGATCTACCGATAGCAAAATGTGGACCGATTCTGATACTAT
CTTTATAAATAATTCCAATGTCGATACTTCAATAATATTATATATATATC
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TTTATTAATGAAGGCTTGACAAGAAAAGATTTAAATATATCAATCTTAAT
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