EMLSAT00000002395, EMLSAT00000002395-698242 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000002395
Unique NameEMLSAT00000002395-698242
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s145supercontigLSalAtl2s145:1359835..1379567 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000002395 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000002395EMLSAG00000002395-685161Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000010585EMLSAE00000010585-719513Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000010586EMLSAE00000010586-719514Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000010587EMLSAE00000010587-719515Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000010588EMLSAE00000010588-719516Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000010589EMLSAE00000010589-719517Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000010590EMLSAE00000010590-719518Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000010591EMLSAE00000010591-719519Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto780680auto780680Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000002395EMLSAP00000002395Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000002395

>EMLSAP00000002395 ID=EMLSAP00000002395|Name=EMLSAP00000002395|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=215bp
MDPTVATHCGNEKSSLYRPWNDKEASEEENLRAKHAYEALLTVTAHTADT
NEYHDFAKDVKSLSKKLFNYSYEEPVTPLVANFHDAVLLYTTALKEVIEE
HGLEKKGDGRLIVQKMWNRTITDRNADYALLDMDPKTGEFIVVAVYQGLN
NAFKMVPNTKIYWPHRDGPPPDKPVCGYDGSLCKEGANKVIIVITSIFVF
IVLILFFLAALSFCN
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mRNA from alignment at LSalAtl2s145:1359835..1379567-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000002395-698242 ID=EMLSAT00000002395-698242|Name=EMLSAT00000002395|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=19733bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s145:1359835..1379567- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGATCCCACCGTTGCCACCCATTGTGGGTTAAAGAAAGGATGAATAAA TTATAGAATTTTGCCTTAACTCCATATAAAAATATCTTTTTTAATCTTAA TTTTTTATTTCAACATTTATTAGTTAATACTATATACTTGACTTTGTTTT GACGTTTTTTTAAAATTATTTAATTATTATTCCGGGCAAACGCCACAGAT ATTTATTTCCATTTTTAATATTATTGTCTTAGGTGATTTCCAATAATAGA AAAAGTAAAAGGATATACATAATTTCTGACGATATAATAAATAATCTCTA AAGTCCAAGAAATCAAATATATACGGTTTAAAGCAAAAAAGMCCTCCCAC TCAATTAGAACTTTGAGAGTAATGAACATATACATTGGTCTTAGGTACTT TCCCCTGAAACTATTTGGGATTGGGACATTTTGCTTCAAACCATTTGCCC TTGGACATTTTACCTTAAATATAAAAATAAATGAGAGTCATACGTCGTTA TTGTATATTTTTAGTTACAATTGATGTTCCATTTGAAAAATGTGGAATTT GTATTACTATAAGAAAAAACATTAAATGGCTGTTTTCCTGTGGAAAAAGT TTGAATTATGCCCCAAAATTTCAATGCATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNGGAAACAATTACGACAATGCCATCAGGCTATGATGGAACACT TCTTCACACAGAAACATGATAACTTAAGGTTCACTGAGAAAGTGGACAGA AATAAGGTAACTACCGATTTATCTAACCGTGAATATAATGTACAAATATG 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