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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s145 | supercontig | LSalAtl2s145:1581187..1602244 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000002406 >EMLSAP00000002406 ID=EMLSAP00000002406|Name=EMLSAP00000002406|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=150bp
MPWFDTYVKKNVSEGLTVLAEDTQTKELVGIAIGTECKRKSKLYHKDSRG
SHRNCLCQCIPLQYVDRKGIMHGNCTSTNDGALWCYVKYQKSSPCGDLVK
SDIFQDRYWSYHACTTPVEDSSICKDTVIPLFFLGAYGGSRRDSQPKDVP back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s145:1581187..1602244- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000002406-698253 ID=EMLSAT00000002406-698253|Name=EMLSAT00000002406|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=21058bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s145:1581187..1602244- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGCCTTGGTTCGATACATACGTGAAAAAAAATGTGAGCGAAGGTTTAAC
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TATAGAGTGACCTAAACTTTATTATACTTTCAAAATTGTTGAAATGTTTT
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ATAAATTTATTCGCATTGGAAGCAATGGTGTGTTAATTTCAAGGTAGAAA
ACAGCAACGAATATTTGAATTTTATTTGGGTTGGTTCTGTTTAGTATGAA
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TTAATGTATTTTTAAACCATTTAAAAAATAAAATTTTCCCGGAATAAATA
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TCTGTTTTTTAACTTTCAAATAATTCATATCAGTATTTATCCCACAAATC
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GGTTCTTGAATTTGTTACCCATTCTCGCAAATGTGAAGTTTTTTTAACAT
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AAGAATCTCCAGAGCCTTCTGAGTCAAGTAGCTCATCTGAGCATGAAGGA
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GAAAAGCGTTACCCGGGCTTAGGAACGGAGATTGTACATAGATCTATGGA
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TCTTCAGTCAAAAAATTTTCACGAAGGAGGGATTTACTTTGTTAAAGGAA
ATGGCTTTTGAGGAGTATCGTCCTCATGGCAAGGTTGTGTTCAACAAGTT
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TTAATGTGAAGGAATATGTTTTAATGTTTACTAGAGTAGGTTATCCCGGC
GTTACTCGGGATATTAGGAAATTAAGATCAATTTTCAAATCTTTTGCTTC
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ATGAAAAAAACAGCCATTTATTAGATATATATAGTCGAATGGATACCTAT
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TGAGTCTTCACTGACAGATATTTAGTATTATATGTTTGAACTTTCGTTCG
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CTTTTTTTTATTTCTTTCCTAAACCTTATAATCTCCTTTAACCCTCAGTT
AACGAACATCTTTTTTGTCTTAGTTATTGAACCTGGGTTAAACGTTAACC
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TGACTGTTTATACTCAACTTAGCTTTTGTTAAACTTTAATGGAGTTCCAT
GGAAGAACAGTCTATCAGTTAGAATAATGGGCTGAGTATCATTTAATTTT
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ACATGTATTTTTACGTACTGAATTACTGTATCTTTCCAAAGAAATGCATA
TTATAAGTCAAAGGAATGTAATACTCTCTAAGGCATAATAAATCCTTGCT
AAGAAAGATTTAAATTAGCTTTCATACTATTGATTTGGGTAACATGGCTT
GCAAAAGGAACGGAATTTCATMTTTTAATGATACATATAAAAATCGCATT
GGTTCTATTGGATCAAGTTGATCAATGTACACATGTATATTTAAGATTTA
CTCTGTATTACTTGTATGTAGACACTTTTTTTCCTTCTTTGGGTGTGCGT
TCCTTCCCCCGCGTTTCTTTTTTATTGCATCATCTTATTAATTCATTCCT
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TGTACCAGGTAATTGACATTTTTTTTAAATATAATTATTCATAATACTCT
TCTTTTTTTAAAAGCACGTACAATGGAGCTCAGTGGTGCTATGTAAAACA
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TACTTGTAGGGACAGCATTGTTCCCTTGTTCTTTTTAAGTACTCGAGGTC
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AAGTTATTTACGATTACACTTGATTTACTCAATTTGATTTAAGTTTTTAA
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CATTATAAATCGTCATCCTCAAGGCCCCAGTCTGCTCCTCAATTGTCTAC
TGATACACTCCCGTGCAGAGCAGCACTGATATCTCAATTCTCTCCTCGTA
CTGTGTGTTCATGGTGGCGACTAGGACAATTTTTTTCTTAGCAATAGATA
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CTCTTCAGAGCATGGAGAATGTAAAACAAGAGAAAAAAAGTTTGAATATT
CTGTTTAATCAACGAGGTAGGATCACTGAAGATCCAAAAGAAATTTCTGC
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AATTTATTTGAAAAATTATAAATAAATAAAATATGTCACCTGGAATTTCA
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AGCACCTCAATCCTCAATTACAGCCCCTATAGGAGCCCGAAAGCGCGAGC
AGATCTTCGTCACTTGATCCCTTGGCATATCCTGGAAATCCTATTTGATC
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TTCGATCACCCCACAAAAAAAAATCCATAAGGTTCAGATCTGGCAAGTTT
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CTGAGTCCCAAAGTTCGAGTAATTATTACGTTATTGCTCCTGGCGGGGTT
TTAAGGAGGGTGCCATGCCTTTTTCAAATATTTGAGAGAACAGATTCGTC
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GTTCCCAAATGGACTGAGGCTTAAATAATAATATATATTTATTTTTTTTG
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AACCCTTTTTTTAATTAGACTTTTATAGTATTCAGGAGTGACAAGGTAAA
TCCGGAATAACTTAAACGGCTAATTATTAATATTGGAGAGGTTTTGAGAT
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TAACAGATTTTTTGAGCATTTCGACGTTCAAGCATGGAAATAGTCAGGAG
AATTTATATCATCGAAGCAACCCGCGCGGGACACTGTGCACAGGAGATGA
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ACTGGGTCGTGTAGGATCATTTGAGTGGGTGTCTCCTATTGTGTCAATAC
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TCTTCCGTGATACATATACAMCTCTATCCACTACTGCACCTGGATGAGGG
GTTTGCAAATTTTGCAGGAGCAAAATTCTTCAAAAAAGTTGGATTTCACG
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CGTTGGGCCTCATCAGGTATCATGTACTGCAAATGTATTTGCATATGCTT
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TATTTCGTCGGGTTCAAGATGCTGAGGCGAGGCTGGAGGCAAGGAAATCC
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CTATACGAACTTACAAAGAAGAATATTAACTTCTCTTGGTAGGAGAAGCA
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TCACACATTATGACCCTTCACGTCCACTCAAACTTTCGACTGATACCTCA
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AACACATAAAAAACCGCACAATCTTAATGCTGATGCTTATTCAATACTTC
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GGACAGTGAACTACTCAAAGCAATTGAAGGCGCCNATAAATGGAGAAATC
GTTCAGAAATTGCCATCTTTTCGGGGTAATCAGCTCGTGGTTCCGCTCCC
TCTTCAAAATACCTTCCTAAACGAGCTATAACTGAACTACCGAGCTATAA
TTAAGATAAAGGCAGAAGCTCAGATGCTAGTTTGTTGGCCGAGAATTTGT
GTAGACATTGAAAATTTCATACACACTTGCTCTTCATGTCAGGAGTATCG
TCCAAACCAAAAAGAAGAATACACACCTTCCTCCCCTGCCTCCAAATTGG
AACGCATTCCAGAGTATTGATCCTTCAATGGAAAGAACATCCTATTCTTA
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GACCATAGCAACATTGAGATAGATATTCCCTTGGTTTTCTCGCTTTGGAT
TTCTGCGGGAAGTACACACTGATAATGTTTTACAATTTTCAAGTGAGAAA
TCCATTACAAGGTTGTCTGAATGGGGGGGAGGGGTAGTTTTGTCKCCTCC
ATATCACCCTCAGTCTAAATTTTTGACTGAGAGAGCCATAGGTATTGNTC
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TACTTTCTCTTCATTTAGGTACTCACTTGATTAGATTGCCAAATTCCAAG
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GTCTGATGTTACGTACAGGGGAAACCAAAGAGGGTTCCGGAAACTCTAGT
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GGAGAAGACAACTTAATCAACTTTGCCCTCGAAGGTCGTCTAGTTATTGG
GGGGAGAAAATGAATTACTCCTATAAAGAGGAAAACTTCTACATTTAAAA
TAGCATTAGTACAGGAAAATATTATAATAATGCCAATGAGGGAAAATATT
ATAATAATGCCAATGAGGGAAAGTTTCAATAAAATGAACATAAAAACCAT
ATGCTCCAATATAGCAGGGAATGTCATTTTGTCTAAGTCCTTGATCAATC
AAATTGCCTCTAAACGCTTATCTTCGATCTTCGGTTCTTGTGTGAATTTT
CAAAGAACAAGTGTGCCTTTTAGGTTGAGAATTTCATCAATTTTAACGGA
CTTCGTAAGGAACTATTACAAAATTCCTTCTCTTCTGCCCTTCCAAAATT
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TAAACTCCTAACTTCTCCTGAAAAATGATTTAAATATCGTTTACTAACAG
GCATACTTGAAGACGCTGACAAGTTTTTAAAGATGAAAGAAATTTATGAT
TTTTCTGCAAAGAAATGCCTAAAACGACATATCACATCATGTGGGAATGC
GTCCAACTACAGTTGACTTACATGAGTATTACAAAATTCATTGAAGAGCG
ACATGCTAAGAAACTTGGAAGTATCCACTTTCTGACAACAAGTAATAACG
CTGAAATTGACGCCATGATCACCAAGACACAGTATATTTTATATAAGCTA
AGGACTATAAACGACAATAATTTAAATGGAATAATTCCTATTTTAACTTT
GTACTCGAACACTTTAAATTGCATTTAATTTGAAATTTTAATTTAAAATC
GCTTATAACTTTCTACCTGATATGTTTTATTATGATATATTTGATGTGAT
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TCTTTCAGTAGGAGGTGTTAATACACCGACGACTTATTAAATAATGAACA
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