EMLSAT00000002407, EMLSAT00000002407-698254 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000002407
Unique NameEMLSAT00000002407-698254
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s145supercontigLSalAtl2s145:1656792..1665034 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000002407 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000002407EMLSAG00000002407-685173Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000010621EMLSAE00000010621-719549Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000010622EMLSAE00000010622-719550Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000010623EMLSAE00000010623-719551Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto780839auto780839Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000002407EMLSAP00000002407Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000002407

>EMLSAP00000002407 ID=EMLSAP00000002407|Name=EMLSAP00000002407|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=197bp
MPHEEEGDSSSXGGXDPLRVSLPKTFTVKYLGRRPALGLWGIKHTREPVD
EGQRSGAPLALLNMTISNQGVQLIPHNKNQNPTYDSGHFEIDTISYGVQD
LVYTRVFAMIVVKDTYEEVQHNHHPDSSLHIQSRGFQCYGFVCDSRNEAR
KLTYALATAFSKFSAKKNEAGGPPKTRFAIDLRRNDESSEGRRDQKE
back to top

mRNA from alignment at LSalAtl2s145:1656792..1665034-

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000002407-698254 ID=EMLSAT00000002407-698254|Name=EMLSAT00000002407|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=8243bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s145:1656792..1665034- (Lepeophtheirus salmonis)
CTAAGTGATAATCTCTCTCGTCTCCGGATACACAAGGAAGAAGGTAAAAA GGAGAACGCGTCACAAAGGATGCCTCACGAAGAGGAAGGAGATAGTAGTA GTGMCGGCGGRCRSGATCCACTCCGAGTGAGTTTACCAAAGACTTTTACT GTGAAATATCTTGGAAGACGTCCTGCCCTTGGACTTTGGGGTATAAAGCA TACAAGGGAACCAGTGGATGAGTTAGTGAGGGTTGTAAGGKAGTTTGAAT TTTACTTCATTTTATTTTGGCAAATGATGGAACTGTTTTTTATCTATTAA TTTATAAATAATTCCTTGTCATTGTAGAAAGTTTTTACAATGCCTTTTTT CACAATACTTATTTATACAAATATTATATACAAGACTGATAAACATTTGT GCAGGGGCAATACAAAAGTAATCTGGAACAAAATTCACAAATTGAGATAA TTCCAATTTATTATTTTAACTTTTTCAAAAATATAAACGGCCCAAAATTT CATAGGTATGTTATATTGATCCATTATGGAAGATATACTCAACTTTCAGG TATATGTTGGTATACCCAAGAATGTTAGCTATAATATAAAGCAGTGATTC TCAGTCATTGAAACACTCCAGAGACCATTTTTTATATTAAATATTCTTTA AATACTCAATCCAATATTTTTTCTTACTATTTATGTGGTCTCTCACAGAG CCCTTGACGATGTACCATGGAGCTCAAAAGCTCCTAGTGTCYTTTGTTGG GAACTAYTAGTATAGAACAKTAGCCATATTTATGATTTTTTATTTATTTA ATGCTTTTCAATAATCAATTTAGAAAATAAAAAATTTAGTCTCTTCAACT AATTACTTTAATGTTACTTAGCATCACTATTCTATCTACATATGTGCCCC GTCAACATAAAAGTATGCCTGAAAATTTTTACTTAAAATTGGATCTGCAT TACATTTTTATATATATATATACGAATTATTGTCCATTTCTATTTCCAAA TTACTCTGATTTATCCTTTGAAAGCACATTAAGAACCAAAAATTAATCCT TACCATCAAAGAACGATAAACTAATAGATTTTATTTGAAAGATTATATCG AGACCAAATTAAGTCCTGTAAATGAAATGAAGATTATTAAGCATAAGATA ACATTTTTGGGTATCTCAACTCATCTCTGAAGTTTGAATACAAGTCTTAT ATTTGACTAAGGCGATAAAATATAGAATATATTCGACATTTCTTGATTTT GATTTAAGATAGTTTTTGTCTTAACTCACCAAATCAGGGCCGTCCACAAG TTGGCGGGCTTGAGGGGCTGTATTCCGCTCCCCCTTCAAAGGTAATTTTT GCTTTTTATTATGATTTTTTTTCGTCATTCGGGAAAATTATCCAGCAGAG CAAAAAAAATTAGTATTTTAATTTTTATGTGAATATCTATGGATTTTTGA AAAATACTTCCTCAAAATTTAATATATGATATTTATTTTTTTTAAATTTA ATTTTTTGTTAATAGCTGTGAATTTTTGAATTTTTTTTCAAAAAAATGTA ATTTTTCAATTTTTTTTTTCAATTGAAGTTTAATTTTTTTGTGCATAGCA ATGGATTTTTGAAATTCTTGGATTTGTTTTTAAAAAAAATCCAAAGTCCC CCCCCCCCGAAAAAAAAAATAATAATAATCACTGCACATATGTATATGTA AMTGTATCAAAAGTTTTAAATTATTTAAATAGTACTTATAATTCATTGTA GGGGACAAAGGTCCGGAGCTCCACTTGCTCTTCTGAATATGACCATATCA AATCAAGGCGTTCAACTTATACCTCATAATAAGAATCAAAATCCAACCTA TGACTCTGGTCATTTTGAGGTATGTCTTATTGGTTAATAAATTCAGGTTC AATATGTTACTTATATATAATATCAATATTTTCCATGCACATGAAAATGA CTAAATTCATCGTATTAGTTATACGTTTTTTAAGTGAACTAAAATCATAT TATGTGGAGTCATTTTTATCTACTCAGCTAATGAGCAAGAACTATCAAGG GGTTAGTTCTTGCATCAGTTATTGTTTAAACATGCTTTCAATTTATTAAA AAAATCCTTAAAGATAAAATGAATCAATGTCAAACTATTGCTTCATTCCA AAAAAAATATTCATTGTTCGTCTGTAGAAACATATGTACGCACTCATCAA TATAATCAGAAGGTTGCTTAACCACAAACTGATGTGTCATAATTACTTAA ATGTGTTTTTAATTATGGTATATCAAGGTGATCGTTAAAATTAGACTACT ATTGATAATGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAATAAAATTATCCTGATTT TAGTCAAAGTGATAATTATAGTAATGGTAAAAATATTGTTTACCTAGTTG TATCTCACAACCTTCCATCTAAAAAAAACCTCAAAAAAGTCCAAAATCAT TAGAAGTTAATCCCATAATTGTTCGTAACTAAACAAGAGCTATTTCAAAT CCGACCAATCAAGTTGTAGAGCATTAATAAGGTGGAAAAGTATTTTGCGT ATTCGGAAATTTTTTGTTATATGTCCTTTTGCCGAATTTTTCCAAATGGC AGAGAAATGTATAGCAAAAAATCCCAGAACACTCGAATACTTATAACTGG TAAGCCGCACACAAACAAACTAAACATTTTATATAGCTTTAAACAAAAAA ATATATTCCTTTTTTAATGTACTCGCATAAAAAAATAAAAAAGTCCAGCG CACCAAATATACGTTACCCGCGAAGTAATCTTACTTTTTGAACCCACCTC GTAACTCTAAAAAAGGATTTAAAAGAAAAAAATAATTAAGCTATTTTTAT TATTCATGGGTATATGTGCTGTGGCTCTTGACATCAGTCTTGATCTCTCA ATCAAGTTAGAAGATCTTGGTCTCGTATTAATCTCGAACCCAACCAAGAT CAAAGCAACTAAATGAAAATTCTCCGTTTCTAAAAAAATAAGAAAAAGAC TAAATTCTTGTGTAGTTCTCAAGTAAAGTGGTATTGACCACCACACTAAT ATTTGGTATTACACTATAATAATATCTTTGTAAGAATATTTTTAAGCTAC TAGGAATATTGCCCGGAATCCATTTATAGTTAAGGTTTTAAAAGTTTGTC CCTGTAAATATATAAAATTAAAAACTACAAATTGTGAATCTCAATGCATG GCTAAAGTACCATCTGTCCAGTAGTAAAAATGTTTTCCATATTTTTTATT TATTTTATCTGTGCCATAAGAAAAATATTTAATTGTTTCAAGGTAAAAAG CTTTATAGAGTTTCATAGGAATAATGGACAACGTGAATCGTTATATTATA TTAACTTATAATTGCATTATCCATTTATTGAACTGTTTGTTAATTCAATA ACGACTGATTATATTCTTACCTCAATTAATGAATCAATACTTATGTAAAT AGGAGACTTTAGCGTATTTTATCTTTAGTTTATTGATGAATAATCTGTTT TTAAAACTTTTTATCAGATTACAGAATATCTTTAGAGATAAAACTAAAAA CTCATATTTGGCCAAGTATATATTTACAAGATTGGAAATTTTTTTCAAAA AACTATAGCTTTCCACAAAAAAATTCTTTTTTTGTGGAAAGAAATTCAAA TATTGAATTTTTTCCCTATTTTCGGCTAACATTTTTTAAATCCTGACCCA AAAAATTCTTCATTTGGAGCGTGGCTAAAGCCCTTCCAGCCCACGCTCTG CGGACACGCCTGGAAAGAATATAGAATCGAACTTGTATGTACAGGGTGCA TTGTATGTAGTGCTCTATGATGTAAATCATATAAACATATTTTTATCTAA GAAATAATAAAGTAGTCGTATTAATTATATATTGCATGCTTGTGTGTATA ACAAGAAAACACTGTGTCTATTTGTTTTTTTATTGGTTATAATTCATGTG CATATACCTATTTTAAGACTTTAGTAAAATATAAACTCAGGTATGTGTAA ACGAATTGTGTTTGTTTTTATGTGAGTGCTCCTTTTGACCAAAGGTCTCC CAACATGTTTTTTTTCCTCTCAAACACTTATTAATATTCTTTAATTCTTC AGGAGGGATCAAGTTTTTTTTGGAATTAAATTAAATCTTCTAGTAAAAAG CAAAAACTTATTAATTTGGCACACCCCCTTGTTTACTACATTGTTCTATA CCTGAAATTGTGCGAAATTGGGGGGTGTTAAAATCAATTTCAATTGAAAA TGACTTTTTTTGATAACATTTTATATTTGTAAAGGGATAAAGAAGTTTCA ATTATATTTTATTCATAAGAATATGTAATTTAAAGAACTGTAATGCTCTG AAGTTTTTTTATCTAATGTTATATTTTTATATGTATTTATTATTACTAAA AAAAAAAGATAAGGAGACAATTAAAAGTGTAGAAATAACTCATTTAATAT TAAAGTATAAACAGACTAGACATTAAATTTAATTGTATTGTTTTTCGTAT GTCGAAATTATATATTTTCTTTTTATTGAAGGGAAAGTTACATATATTTT AATTAAACCCGACAAATATTGCACAACTAGTAAAGAGTATAGAAGGTAAT ATTTTAATTTATCATGTCGTTACCTCTAAAAAGAATCAGAAAAAAGGTAC AAAATGTAGCCCACATTAAGGATTTTTTTTCTTTTTAGAAGAAAATTAAA TATTCGAATTTTTTTAATTTTATATTTGAAAAAATTTTTTTTGTAAGAAG CTGTGAGTTTTTGATTTTTTTTTTGAAAAAATTTCAATAATGAAAATTTA TTTTTCTAAAAAATTTAATTTCTCAATTTTTTTTTCCAAAAAGTTTAATT TCTCGAATTTGTGAACAAAAAATTTCATTTCACAAAATTTGTTCCCAAAA AATTTTAATTCTTTAAAATGTTTTCCAAAAATTTAATTTTAAGATTTTTT TCCAAGAAAAATCCAAAAAACAAGCCCCTACCCTCTCCTGCTCCAAATAT AATTCTGTGGACACCCCAGTAATTCCTGTCCACGTCTTTACTAGATACAG GTTTAATTTGTGTTTCTTCGCCCACTTATAACTGCTTGCAGCTAATATTA TAATAGACCATGACAGCTTAGCTGCTCTCCTTCAAATTATGATTCAAATT GTCATAGTTACTTAAGTTTATTTATTTTAACTTATAAGTTAATTTTTTTA GAACTCTATTATTAATGATTCACTAATTATTGGAAATTATTCACAACTTA ACAATAAGAGATAATTTGAATTCAATCAACCAACTTTCAGAACACTGATT AGAGAAAAAGAAGCAGAAACGTCGACAGGTGATAAAAAGTACAGGTTTAA TTTTTGAATAACTGAGGTAAACTTGTTTTATATATATAAACTTATGATGG AGTTTATTCATATAATACTCATAAATTAGAGGTTGTTATGGATGAAATCC TTTAAAAAAAAATTTTTTTTATATTTTAATCCGATAATATGAGCAAACTT TTTTGATAATTAACATATGAAATAATTGAATAAAACATTACCTTTTTACC ATTGCCCTTATTTTCTAAAGAGCCATATAATAATAATAGTAGAATTAATA CTAATGAAGAAGAAACCCTAATTATATATTAGAGACTCTCTTATAAAGAT ACAAATAATTATCTGATGTAGTAACAATCAACTCATAATTGATGTTAATG AATCAATATCAAATTCTTATTTGTCAAAATGTACATTTGTTAATTATTGA ACTCACATACCAAATAGGATCCCTTTCATCTCCTTTAACCTTTTACGTTG GAAAGGTCTCAAAATTAGTTGGTAGATGGCCAACTACGCTACTTATATTC AATTTTGGGAATATTGTCTTCCTAGAGAGTGTTTTCACTGACCTCACAAA TTGCATTGTTCATAATCGTGGATGCCACCATATTGGATACTCATAGCTGA TATTTTTACAAATGAATACGTACAGTTTTCCAAAAAAAATGAACTATACT GAAAGACTTAAAAAATAAATAAGAAACGACATTGTACCTATATTAAATAC TAGTTAATACCATAGAAAAATAGTAATATTTCAATTAAACCTCATTCTCG CTTCAAGTAGTATTTTTAGAAAAATTATCGCTCTGGGAATTTTTTTAATG AGAAAACAGAAAAACAAGTTGATCAAATTATGCAATGGAGATTTTTTTAT TTTATTTTTTCAAAAAAAAAAAAAAATCACGCGGACNNTTTATTTTATTT TTRRAAAAAAAAAAAAAAAAATCACGCGGACACCCCTGAACAGGGTTGCC ATATTGGCCTTCTTTTAAGCAGTTTGGTTTGGAAAAATTAGATTTGGCCT TAATATGTATTTAAGAGTTGTGTTTTAATAAATTCATTTTTCATGACACT TAATTTAATAGATTTTGTGGCCCATTAAAATATTTCAATGGGAAATGGGT CTATTATATTAAAAGATTGGTCATCTCTGGCTTACATGTATGTATAACGC TGGAATATCATTTTTTTTAAATGTGTATGATACTGATTAATAAAGCTAGA TGTTATCATTCTATATTTTTGTTAAACTAGAAGTGTAGGTCCATATATTT GACAGTACGAATTTGAATTCAGTCTAAAAAAACTATAAAGATTGAAGTTA TNCTCAGTCTAGTTCTGATTAATTTTGTCAATCTTAAGACTGAGCAAAAT TGGTCTTTTAGTACTACATCATTTTGCGTCTCTCTTGCCATATAGTTTTC TAGTATTATATGATTTTGCTATCATTCATGCTTTTATTTAATCCTAGTTA GGACCATAGAATCAACTACCGGGTCCGAGGAGAAAAAGAGTTGACCACGG CTCGCTTTTTTAAATAAACAAAAATGTATTGTTTTTTCTTTACAACTTTT TTCATTATTTTCAAAAGTTGATTCCTCCATGACTTGAAACAGCTTACTCT CCGTATTATGTACTAAAAAGAGGTATTATATAGGGTTTGGATTTTTATAT TTATTTGTATGAATCAAGGACCTTTTATTTAGAATTCGAATCATTTAATA CTCTGTCTTTGATACCTATTTTAATAAAATTATCAATACAATATATATCA TAATTAATAACTATTTTCTAAATAATAATTAACAGTTGGCATTAAGAAAA ATACAGAAGGCTAGGTACCATATATTTATTTTCTTCAAATTTTTCCTTTT CGTTTGTCAATTGTCGTTGAGAGTGGAAAAAACTGAAAAAAAAACCCAAG AGAGAAACAAGATTGATTAATATACATAGTCCTTGGACTGATGCAACCAT AACAAATAAGTATTTCCTCACCATTTTCTTTAATTTGAATGAAACAGGGT TTTTTTTTTCTTATAAAGTTTGATCTTCCGAGATGGGCGACTTCGACAAT GCTGAGGTCACATGAAAATGCTCTTTTTAATAGTAGAGATATTTCCAGTT TAATGATATGAAATAATTTTAATTTAACGTAATATATTGCCTAGAAATCA ACATCTGACAAAGATGATAAAGCATTGAAGTCGTTGACATTGTGGGGATA CTATTGTGCAAATGGGTTATTATTATATTTATTACTAAAAATATGAAGAA AAAAATAAGTTTCACTTCATAAGAAATTGCCATAAGTATGATGATCACAA TTGGACTATTTAAACACATTCACACATGAAAAAAAGAAGAGAAACTTTAT GAAGAACAGGTGTTGAGTATTTTAATGTACAAATATACTTTTTAGAAAAT GTATTTTTTATCCACAAAAAAAAATATATATATTGTGTTTTCTACATTCG TATATGTATAAGTATGTACAAAACATAAAAACAAGCATAATGTCACTATT TTTTTCTTTTTCTTACAAACAGATTGATACAATTTCCTATGGAGTCCAAG ACCTTGTATACACAAGAGTTTTTGCCATGATTGTCGTCAAGGACACCTAT GAAGAAGTTCAACATAATCACCATCCAGATTCCTCATTACATATTCAGTC ACGAGGATTTCAATGTTATGGATTTGTCTGTGATTCAAGAAATGAGGCAC GTAAGCTCACCTATGCCCTAGCTACAGCATTCTCTAAATTTTCAGCTAAG AAAAATGAGGCTGGAGGACCTCCAAAAACTCGATTTGCAATTGATCTTCG AAGAAACGATGAGTCGTCAGAGGGAAGAAGAGATCAAAAAGAG
back to top
Add to Basket