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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s145 | supercontig | LSalAtl2s145:1472587..1501620 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000002425 >EMLSAP00000002425 ID=EMLSAP00000002425|Name=EMLSAP00000002425|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=807bp
MLNNNSSSLVCFSNFSEDFWETNCDLPLRIDSPTMLKWNSRHMTGIDKET GHHLLRSAYSTNNFRWIWLVFEDPPGMSSPCDKFPAVFLLDGSHFTPPSG CRIVSEQSFNPFHDIRKNMYLPRKDLLQKGNLFVYRRIQLFSEMENITFV KKLVLTKLSTCSSIRKIQELNFQVMENTPSSEPIDVLPIFIKSQACPKFY CLIDSKNSHRLSLKTSNQSIHLFSIYSFDREIMGSLSFQIVCRTKGNSTS KIKFQSTLNIRDVDDNSPIPQSELFHNHSYEVQLYNENIKKGTYFKFDEI FYDADLPNTNSYTLNFPKIDYLSNDKKLGTFDFNCGTKYIYKKENVYCQK LPSNFSGTILYLKDQKIYFLKDLRNFRSTNIMGVIMNENQEKVSNFSFKL LASSISPSPMILHTNHSYSLYVLVNDPYLTRIGTLTNFERLTLHKSNCPW FSIADNIIYLDIKGGLKEQGVHPGDTCKLELKSNSSIRINVIINVRESLS LCSNPRSRTTLACSEFSLMEECVSICGPVTSICEWSPENKTLGRSYSTCT VGTKYCPDDKCDALEQLSPNICPQDCQEPEQFRGFNILIDKINNRPIARK SGVVVSCHGKCSAVMKSQAHSMKDELKRRSISEHTAQEYAKCGILCTFSI VLAFFGSFFCFFLFYRYNRSCKSNAHREFSTRTIKDQMADVELVKEQEKY EMHDDSYDEKWEFQRSNLVLEETIGEGEFGKVVSAKAFNLNKKNCQRVAV KMLKVYHTREQLHDLLSEYAILKEVNHPNVIKLLGACTKPDGPLLIIIEF AKYGSVR back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s145:1472587..1501620- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000002425-698272 ID=EMLSAT00000002425-698272|Name=EMLSAT00000002425|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=29034bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s145:1472587..1501620- (Lepeophtheirus salmonis) ATGTTGAACAATAATTCGTCTTCTCTTGTTTGTTTTTCGAATTTCTCCGA
AGACTTCTGGGAAACAAATTGTGATTTACCACTAAGAATTGACAGTCCTA
CGATGCTCAAGTGGAATAGTCGCCACATGACCGGAATTGATAAAGAAACT
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TTGGCTCGTCTTTGAAGATCCACCAGGTAGATTGTTGTTTTGTTTCGGGC
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TTTTGAAGCACCGTGAAGCGTATTTTTTCAACATTTATCTGCACCAGTTG
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATACATAAA
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TCATTTTGTTCCATCCAAGAGACTTTTTTATAAATAAACAAACACCATAT
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GTCCAAAATTTTATTGTCTGATTGATTCAAAAAGTAAGGGTCTTGAACTA
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TTTTCTATTTTCTCTGATACTGATAAGATGTAGATATTAGATATTTTGCC
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CCAACTATTTTGTCTTAGAACATTTTGGGTTAAAACCATTTTGTCATACC
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TTTTCTGGTACCATACTTTATTTAAAGGATCAGAAGATTTATTTCCTAAA
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TCACCCCGGAGACACATGCAAACTGGAACTCAAATCAAATTCTTCAATAA
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GTGTGTTTCTATTTGTGGTCCAGTTACATCCATTTGCGAATGGTCGCCTG
AAAATAAGTATACTTTTAATCTTAATTGTTATGCTAGATATCATTTTTTA
TGATATTTTACTCTTAAATGGGTTAGAACCTTGGGTAGGTCCTATTCTAC
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ACACCCACGACTAACCAAATTTATATCCAAATTTAAATTCAGTTTATGGA
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TCAATGATTCATATGAAAATGAGAGATTCTCCCTAAGTCAAGTTAGGCAA
ATTTTGTCCAAGATTAAGAAAGGTGAACGCTTAATTGATCGGACGAGAGG
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GGTCACAAATTATTTTCACAGCTCGCTAAGGAGATAGATAAATATAAATA
TAATTTTACACATCTAAAACAACCAATACATCTTACCTTTACAAATTCTT
TCACAAGAGCACAAAAATATAATGTTGTAATTTTTCATTTAATTCCTTAC
ACATAATTGAATAAATAATAACCAATCACAAATTAGCCATCCCTTTCTTC
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ATCATTGAAGTAATTGAAATATTATTTAGGCATTTTTAAAGAAGATGAGA
TTGGATTAAGTAGAAAGAAAATGGAGTTCTCAAATTATCCTACACTGAGT
TTCAAATTTCCATTTGGTCATTATGCCGTGCTCTAAATTTAAAGAATTTT
AAGCCCAGCAAATGTCATGTTTTTCGTTGGGAGATTCACGAGTTTTGGTC
GGCTGTTCCATCTGAAACTTTAATGCCATACAAATATATTTTTTTATTNN
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ATAGAAGATAATTAAGACTTTAATTTGTAGTTTAACCCAATTGTTGAAAA
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GAATTTTTGCTTTTCACTAGTAAATTTAATATTATTGGATTTTTTATTAA
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AAAGACTCAATGTCCTGCTTTGATTGAGAAAAAATAGTTATTTTCTATTG
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TGAAATAATTTTAGAACCACTTGAACTTTAGTGTGATTGTTTTAACACAT
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TTATCAAAAATCAAAAAATAATAAATTTGAAGAGTGAAACAGCTCTTTAA
AATAATATATTAACTTATCTATTCATAGTACATTCAGGGTACTAAGTATG
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AATATTTTCACATTTTTGAATTTAAGAAAATACCTTGTAATTAAAAAAAA
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TGCATTGAATTAATATAATACAAACATGCCCTTATTAGGAGAGGGAGTTG
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TTTTTTTTCCAATTTAGGAGATATTAGTGTTTGAAATCAACGAGTTGCCG
ACAGGAAGTTGAAACAAGGAAAAAATACAATACAATGACAAAAAGACTAA
AAAAGAAGTTTAAAATTCCTGTAATCTTAAATATATATTTTAGGATTAAT
TAAACTTTACTGATAAATAGTATAATTGATCGATGTATAATTACTAGTAG
CTCAAAATTTAGGGATTGTGTACAGATTCGTGCTAGATGACTCCCTAAGA
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TCCGTATCACCAATTAAAGGAACATTAAAAAAAAATGATATATACTTTTG
TATCAAGTCACCAACTACATGCCATTTACTCTTATATAAATGAATTTGCA
GTCAAATTTTTATTTATTAATTTCTGCATGTCGAAAGTCGATCTAAATGT
TTGAAGAAAATATTTTTTTTTAGTCTATACAACATTCGATTTCTAAAATT
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AATTTCAGTGCATTTTCAATAAATCAATGCTTGATAATTATAGTGGCCCA
CCAGATCATTTTCGAAATTTTTCATGAGAAGCAAAATATTTTTTTACTCT
CTGAAATTTATGATATAAATAGTCAACATAATATTTCACAGATAGAACAT
TTTACATTAATAAAAACCACAGTAATAAGAACAATGAAAGAAATATTTTT
CATACAAAATAAGGTGGTACTGAACAAAGTAGTGATAACTCATTTTTTGA
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CAAAATACATATTCATTAAATATAATTGAATTCATATATTGTTATTGACA
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TTATTTTAATTCAAGCTCAACTTCATTTTCCGACAACAAAATTAGTCTCC
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ATATAATACTTTATGTATGTGTATGGATTTCACAAAAAGATTCCTAGGTT
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AATATATTTTGTTAAATTCATTTTATTTTTCAGAACAATTTAGAGGTTTT
AATATTCTGATTGATAAAATCAATAATCGACCAATTGCACGAAAGAGTGG
AGTCGTAGTCTCGTGTCATGGTAAATGTTCAGCGGTTATGAAGAGTCAAG
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ATTTAGAATTTACTTTTATTTGATTTAAAAATACTTGAAAAACTCTACCA
CAGGTTTTGTTATGGCCTTTTTTATTTGGGACTGAAGACTGCAGTCTTTT
CCAGTTGAGTCTTGGTACGGTACAGTTTAGGTTTCCATACCGGTCCTAAA
AACTTATAAAGTTTGGTCCTTGAAGATGTCACTCAACTTTTTTCTTCTTT
GTTTAAAACGTTCTAGTACTGACAGTACTAATTCCCGATCCCAATGACCA
GTAGGACTGGATCCAAGACTGAACTGAAGTTAATAAATAAGGACCAACAC
TACACTAATCACAGGAGCTATAATAATACTCGAAAATAAAATGGGAAAAA
TGCCAAAATCCAAATTGATTCATATAAAAAGTCAGCAATTGCAAAACTAA
TTAATAATTAGTGCATTAATATATTCTAGAATAATATATGAATACATCCT
CACTATAGTAATACACTAAATTAAGTAATTCATGGCATACAATAATGGCC
TTTCACTTCAGTATTTTAATTGCTTTCGATTATATTTGAATCAATATAGT
CTGATCTAAAACAATAAATAAGTTCTACTCAGAACATGATAGCTTGAATT
TGATAAAGACATGGAAAATATGTTCTTAAATCTAATTTTACACTTCCAAT
CATTTTTAATGTAGCTTTAGATTAAATTAAAGTATAACCCAGCTGTGGGG
GTTGGTAAATTTGTATTTGAACCTATTTTTTTCGAGTCAAAAGTCTCATG
TACCGAATTAATTAAAAAATGACTCAAGTCTCACCTGGAACTACAGCTCT
ATACATAATTTAACAATCAAAAACTATAGACAATCACAAACGAGTCCTCC
ACCTAAATTATTTCTGTGCCTCCTTAGATCATAAATAAAAGATTTATGGA
AAAGGTCATGCAGCCATTTCGTTTCTCCCTTTATAGCTTTATCTGCTTAT
GTATGCATGGATATTGCTTTATATAAGACAAGGAGAACAATACGGGTATA
ATAAAGATCAATACGATTTGCAAGTTTAATTTCATCCATATATTAACATG
ATTAATTACCGTAACGTTTAGAAGTGTAAAATTAGCCTCTATTTCCACAT
TTCTTTCATACTCAATCCCAAGCACAACAAACTTGTTGGTTACAGAACAA
CTGGCAATGACACATCATCTACTGGAAACCATTCTCCAAAAAAGGGAGNA
ACACTAGTCTTTTTAACATTTAAGCTGAGCCTATATTTCATCTCAAACTT
CTTGAAATGAGGCAGTATTACTTCCAATCTTTGGACATGCTGTAATTCAG
AATTAGCTTCTATATACACTTTGACATCATTAGCATTKAGATCGATCAAA
TGTTTGGACTCGTAAAATTAATCCTAAATCCGCAATATTTACAGATCTAG
GTTAAAACTAATTCTTCAATGGCCATGACAAACAGTAAATGAGCTGAGGG
ACGTTCTTGCTGGCAGCCATGTTCTAAAAATATAAGACCATTCATTTTTC
CCTGCATCGTAATAGTAGGTGTTCCGTTTGGAAGGAGGGCTCTAATTATA
ACCCTGAGAATATATTTGTGAAGAATGGAATCAAACTTTTTCCTAAAATC
AACAGCAACTGTAGCCCTAAATTTTTTCTTCTTTTAAAAGGAATTAATTG
TAAAATTGTATATTTGTTGAAACATTTGATATTTTTCTATACTTAAGAAA
ACCCTTATGAGGGGCAGCTATTCAGCTATATTCAGTATTGGTTTCATTTG
TTTAGCAATAATGCCTGAATCAGTTCGATATAATTCATTCAGAATTGTTA
TTGGTAGCCAATGAATAATATCTGTTCCATCTCCTATTTTAGAAATTAAA
AAAAAAAATTCCATTTGTAACTGATCTCGTTAGCTTAGCACTTCTTTCCA
TTGCCCTTCTAATACAAAATAAATAAGTGTAAATACTACAGTTATAGCTG
GTAAAAATTGTCCCCTCCAATTCCTTCCAGACCGGTGATCTTGTAATCTT
TAAAATATTTCTTGATGGAATGCAGAAATAATATTATTAGGAAAAATAGA
AATGGAATGATACTTTACTTTCTTAGGAAAATGAGACCTCTGTCCTCCGG
CCGTAGATTGAAAATATGTAGGGAAATATCTTAAAATATCTTCAGATTTT
GTAAAATTTTTGCCACTGTGAAAAATTTTAGTAATTTTCTAAGTTCCACA
TCTCTCATTTTGCTTCAACTTTTTAAGTTTCAGACTGGAATTATTTTTAA
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