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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s151 | supercontig | LSalAtl2s151:1204746..1240219 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000002576 >EMLSAP00000002576 ID=EMLSAP00000002576|Name=EMLSAP00000002576|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=179bp
MGDHCPKMNGNTQSIADYLAQLLKDKKQLAAFPNVFNHLERLLDEEISKV RGNLFQINGAAKEPLVLPDGVGPPITQSEKVYVPIKDYPDFNFVGRIXGP RGMTTKQLEQETGCKIMVRGKGSMRDKKKEDSNRGKPNWEHLNDDLHVLI TVEDSENRAAAKLQRAVAEVRKLLTVSEG back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s151:1204746..1240219- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000002576-698423 ID=EMLSAT00000002576-698423|Name=EMLSAT00000002576|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=35474bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s151:1204746..1240219- (Lepeophtheirus salmonis) ATGGGTGATCACTGCCCCAAAATGAATGGAAATACTCAAAGTATAGCGGA
CTATTTAGCGCAATTACTCAAGGATAAAAAGCAGTTGGCTGCTTTCCCCA
ACGTCTTCAATCATCTTGAGCGACTTCTGGATGAAGGTAATTCATTACTT
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TTAATTGTAAAGAGCACACTAATATATGGAATTTTTTAAGGATCCATAAT
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TCTCCTCAAATATAAATCAGGACAGTGATGTAATTCCTACAACTCTATAC
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TCATTTTTGTGCTGGAAATTCTTGGCTTATTTTAAGTGATTTGCCTTGAG
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TTTTTTCTTCTTTATATAATGCATCCCACTGATAAGAAAAAACCTACCAT
TAAAATTATAGGCAGTTCATTTCTTTGTCAGTGGGGAAACTTACACAATC
GGCATGGGATCAAATCCTAATTTCCTTACCTCTGTACCTACCTTTTTGTA
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TCCTCGGAGTTTAGGTCCATTCTAGACATAGAGGATTGCATCCTTCAATG
CTATTTTTCTTGAAGGAAGGGTACTCTTTTAGACGACTTCTTTTGCACCA
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TAAATCCTCGTGGCTATAAATCAAAAATAAAGAAAAGTATATGTTGGCAA
CTTTGATAGACTACTGAATATCTACTAAAAAGATTTTTAAATAATGTAGA
GTGCACCTTACTCGCTAATACGTTTAAATTGTCAAAATATGGAGAAATAA
TTAATTAGAGGACTGATGATATCTTGCAAACATATACTCACAAGGATTTC
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CCCTGTGAAGTAATCACTTTTTCAGTTTATCTTGCCTGACTGCTTAACAC
AGGTTTGACTGTATCTGACAATTCCGTTCAAATTTAGCTCTGCAATTATT
TGTACGTAATATTGAATACTTTTTGATGATGTGTTACTTGAATAATATAA
TATGTGGCGTAGCTTTTCAGAAATATATTTCCCTATCTCTTAAATTATCT
TTCATTTAAAACACATGTATGTACACTATCTGTATAAAATAGTAATTATC
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TTTTTCTTCTTAATCCAAATATTATAAGAGATGGAAATAACGAATATTTT
TACTTCATGTGTTAGTTACTATAATCGTTTACTCTTTCCAAAGTATGTCT
TAATTTATTATTTGTATTCATAGAAAAAGAGAAGTCGTATATTATAAATT
GAATTATTATTCTGACACCCATAAATGGGGTGAGTTAACAGATTTAAAAG
CTCTTGAACAAAAATAAAGGAGAAAAGGATAAATGTCTAATTTTTTTTTT
TTCATGAGTTATTAAACATACAACCTTATATTTCATAGCCATATTMTACT
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TTAACTATAGTTTAGAATTTTCATTCTATATATAATACTTATGTAGGGCC
TTTTATGGCCTTTTTTAAATATAATTTGTCAACTTATAATTATCTCATTG
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AATACAACCCAATATTTCATGGACATAATTCGTTCAATTATAGGCTGATT
ATTCAAATTACTGGCCGATGCGTTGAGATGCACAAGAATATTTGCTATAA
TTATGTGACTGTATTTGGACTGGATATTGCCTTTGAGTTTTTTCTTGTTC
CTTTAAGTGCAATTTTCAGGGCCTTCAAAGGCTTAATCAGAATAATCTTT
GTTGATCGAAAGGAAGCATAATTTTTGTTTTCGTCGAAGAGTACAAATAT
ATATCCAGAGTTAATTTTCGGAATAATTAATTTACTCTTGCTTTMTTTTG
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AAATTGAAAACTTAAATTTCAAATATACTATTTTTTTTTAATTTTCTAAA
AATCCACAACTTTTCTCAAAAATTTCAAAAATTATATTTCTATTATAAAA
TTTAAAAAAATCAAATCATATATTAATATAATTTAATTTCAAATATTAAA
TAAATAAAAAATAAAAAATTATATTTCTTTAAAAAAAATCAAATCGAATC
AAATATTAATTTAAAAACAAAAAAAAAAATTAAAACTATATTTCTATTAA
AAATTTAAAAAATCAAATCTAATCACATATTAATATTTTTGTCAAAAATT
TCAGAAATACATCGTTATTCACAGAAAATTAAATTTTTTGGAGAAATATT
CGAAAAATTAAATTTTTCAGGGAAAAAATTTCAAAGATTAAATTTCTAAT
ATAAAATTAAATATTAATTTTGGATTTTTTTCCTTCATAATTATATCTTC
ATTCACAGAAATTAATTTTTTGGGGGAAAAAGTTTCAAAAATGTTAAATT
TTCTAGCAAAAAGACAAAATTGCTTAATTGGGAGGAGGTAGTTTTTTTTT
CTTCATAACTTGGCAAAGTAATAAATAGTTAAATATTAGTAATAAATAAG
AATCTGATTTGCAAATAAAACATTACTTCCCCTTGGCCGATCCTGATTCC
AGAAAGAAACACCCGCTTCCAGATTCCGATTAATCATCCTATCCCTAGTT
TATATTATTTAAAATAAGACTAGTCTGTCATTTGTTAAGAATTCTGTTTT
CTTTGTCACTCAAACCCATCAATATTATAGGACAAAGCATTGTAATAATG
ATAATAAATAATTAATGGATAGATGCCATGAGTTTTAAGTATACAAAAAA
ATTGTATATTTTATATAAATCCCAACCTCAGAATGAGTATTATTACTCTC
TTGTTGTGTGGTCCTCTGACTGCCTATGACAAATTATGCATTTAATATTT
TTTTTAATACTTGAATTTGAGAAACTCTGGCACTATTTAGACATAAATAT
ATTAGTGTTGAGTCTCTGTCTCGAACTGAACTTTTATTCTTTTCTGTTCA
AACGGATTTTTTCTAATTGTGCAAAAAAACAAACTCATTTATATTTTTCT
ATGTCTCTCTCCCTTATTAGTAGGGGTTTGGGCTAACTTTGCTCCTGACA
AAACTTTACATGACACCTATTATATTGCCCATTTCCATTCAGTTTTTGCT
TTAATAGCGGGATTTACTCACTGATACCCTTTGCTTACGGGACTTGCAAT
AAATATAGCAATGAAAAAAGCTCATTTTATTTTAATATTTATTGGTTTAA
GTTTAACCTTTATGCCTGTACACTTCTTAGGTTCGGCCCGTAAACCTCGC
CGTTACAGGGACTATCTATGAAATCAGGTAGCGAGCTTTAGCTCCTACTG
AACTTTATTCTCTGTGGTGGTYTTTGTTGGGATAATTTGAGAGTCTATAG
TGAGATAGCGCCCTGTATTAGATATCTTTGATAGGGGTAGGTCTATTGAA
TTTAGATACACCTACCCTCCTTAGAATCATTCTTATAATTCGTGTCCCCA
GTTAGCTTTAGCTTAGTAATTAATTTAAAAAAAGGATCTAAATTACTTAT
TTTCCTTCCGTACTTATAAATAAATAAAGATCTGGAGGTAGAAAACAATC
TGACTCGTTCAACTCAAATGAGTTCCTGTTTAGCAGCATTGAATAGTATC
CAACAATGATCAAATAATAGTGTCATGGGTCCAAAAAATTGGCAAACTGG
TATGATGGGATTTAAGGAGAAAAGTTTGCGAGATACAATAAATGTAAAAA
AAACCATACTATTGTTGATCGGTATACTGATTCTGTAATACCGTAATATA
ATTAATTATACAGTCAAATTCGGATAAAGGAAACTGCCATTTTTCCAATG
AAAAATGGACTATATCCGGATTTTTCTTATACTATTGTATATAGCACGGT
TTTGTAGCAAATTTTAGAGTTATGTACATGATTAGTAAACTAAATTCGTT
CAGTAAAGTATAACGTATCTTTCACATAGATCCCCTTTAACGAGGTCGGT
CTAAAAATTTGCCCATCTAACAAAGATACAAGGCATTTTGTGTCAATTTT
ATCCTCGTATTTTTCAACAAAGTCTCCTTGTAACCCGTTACAATTGTACA
AAGTGTTTCTCCGCAAAATATTTGTTCACGAGACACTTATTTGAATTGAC
TTAGGCGCGTCAAATTTTAACACAACCAGCCTTTATATGTATCCCATTGT
TTGAATCTATATAAAGGTTAGACTTTCAAAAATAAATATTAAATACTGGA
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CCGGTCTCAAGCTGGTCTCAAGCCGGCATCCAACCCTAATAAACATGTAT
GTAGTTTGCAAAGACTTCTTGTATAAAAAAAAAATCTCTTTGACAAATGT
GTATATAAACATACTTTTTAAGGGAGCTGAAGGTCAGAAAACTGGTTTAT
CTCTCTTCCAGAACGGCTTAATACATACTACCATGATCATTTATTAATAA
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AAGTACAAAGTGTGAGCCCATGTTGGACTCGGAGTAGAATTGAGAAGCGA
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TCTTCAACTTTCATATATTTTTAACTTATTACTATTTTTTTTCGTCGCAA
GATGTCGTTTTTAATGATACCACAGAGGATTTAATTGTTTTCCTTCATAG
CGTATACACTCTTTTTTCTTTCCTTAGCGGAATTTAACTTGTCAATTGAA
TTAATGGGGTGAATTTATGGAGTAGTCTGTTTAGTTAGTTATGAAGACAA
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AAAATGTACTCATTAACTTTGATGAAATTGAGTGTGATATATAGAATAAC
AGCTCATATTACATTAGTATCAACGCGTATATCTTAAATTGAAAAATAGG
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TGAGTGCTTCTGCATGTCTGTTTATGTACTGATGACTCATTTGTATTATT
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GTTGTACGACCTCTACTTTCTCTTAAATCTATGTTTGTATAAAAGTTTTT
TTTTTTTTGTAGATTTTTTACATTAGGACAGCCATATTGTACAAGCTATA
ATTACTATTTTAATTAGTATTAGTTCTAGTACGTTCCTCTCAATTTGATC
TATTATAAAAAATACTTATACATATATCATGGTATACTGTTGCGTCTTGA
CGAGGGATAGACACAAACTTATTTATAAGGTGGAGAGATCCAGGATGACT
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TACAAATGAGGTAACTGTGGACTTTCTTCAGGTAAAAAACCCTCTAAGAA
AATGGGGGATGAACAAACTAAAAAAAAGTATGTTATCCACACGGTAGTGT
GACAGTCGGTCAAAGTATTCATCACATATTTTTTTTTGCTTCCTACGATT
ACAACTGTCTAACAATCAGTTATGGGTCAGTTAACTTATCTTTTAAACTA
TTTAAGTTCAAGTTAATTAATTTTTTATAACTAGTTGAATTAAAGTTAAT
TTCGATTTCTATGAAAATTAACTCGTTAAGCTAAAGTGAATGTCGAGTTG
CTTTTTTTAAAAAATAGTTATGTTTAAGTTAATTAACTTTAGATTCAGTT
AAATTAACGCACCCAACCTTGCTTAAGTTAAAAATTCATTTTGATATTAA
AAAATAACTATTTAAGTTGGTCCATTGAGAGATTTATCAAGGCTTTACAA
TAAAAATTATTCTGTCAGTCTCTCTGCCTGAAATTTTCTCCACTTCCAAT
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AAAGTCAAAGACAGCTAAAATCTTAGATTTTTGAGTTTCTATCTAATTTT
AAACTAAATCTAAAATAATAAAAATATCTGTGATAATATAAAAACGACAT
TTTCTACGACACTGAAAAAATATCCTTTTGATCGCGATTTGATGTGGAAT
GACACAGTTGAAAAGTCTAATAGAACAAATATGATCGAAACAATGTTTAA
CTTAATCATTGGAGAACTAACGGCTACTTCAAGATGTGTTTTTTTTTTTA
GTATTTCAACTTTGAATAACAAAATAAATGTAACTTTAACTTAAGTTAAA
ATTAAGATAATGAAGTTTGAAAAATTAACAAGTTAAGTGAAAAGTTGATT
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ATAATACAAGTTACAACTTGTACAAAATTTTTACTTGTATACACAACTTA
CTTAACGCCAAAGGAACCTATAATGATTTTTCTCAAAATGGACTGTGGAC
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TTACCCTATTAGTTGGGTCGCAAATTACACTTAAATTCGACAAAATGGAT
CGTTATAATAATGGAAAAAGTCTCTTAAATAAAGGTTCTAAAGTGTACTC
AACAATCTTGAGTTTCTTAACTCATCCAACAAATTTGAATACGTAGTCTA
TAACTGACTCATATATATATATATATACAAAGTAAATACATAAATTGGCA
TTTACTCCTTTTCTTGAGTTGCGTTCCAGATTGTTTGATGTTAGCACACC
ACATTTAACACTCAAGATTCTATTTCAATTAGCTAACACTTGCCAAAAAA
GAATAATAATTGAATACAATTCTCTTAAACACAATGATACTTCATATGAA
CATATTTATTTTTTTGTAAAACTGTTAACTCAACTCACTATACATATTTT
ATATCTACGTAGAACATTATGGATCACAAATAATGTCCTTTGTCAAATGC
AATTTTTTTGAAAACATGAAATGGGGTCAAAAATGCAATTTTTGAACCCA
TTATAATCGGTGGACCATCAACGCTCTACAGTATTACATTAATTGTATTC
TTCAACTAATTATAATTATGATGAATCCGTTTAGGAGAGGCCCAAAATTA
CACTCACAAGGTCACAAAAATTCCTTGTCTTAATCTAAAGGTATAATAGG
ATATATTATTCGGCCCAAATAATGTCTCATAAATTAAATGGATATTTTAA
ACTATAGACAATACTATTCCCATCCCAAAAATTTAAACACAAAGCCCGAT
GTATGTTCATGAAATATTAGTGCGGTTTATTTTTCAACTTTTTCCGAATT
TTGATTACGGCGCATGCGGAAAAGTTGTGATATAGTATGATAATTACATA
TGCAAAATTGTATTCTTCTAAAGATAACTTAATGTTACTGTTATTTGAAC
ATAATGATTGTAATAATAACATTGGACACGTCGTTACTTTTATTATACCG
GGTTGTCCCTAGAAATCTGAACATTTACTAATTCAATAATTAATGAAGAT
TGAATGATTGAAATTAATTCATATTTATATATATTTACGCATAAACAATT
CGTTACAAAACTAACCTGAGCTCTCTGGCTTACGTACAACTCGAGAAAAT
GACACTTGAGCGTGATCGAAGAATTTCCATTCGCGCACTCCTTTACACTG
GAAAACCCCGACGGAAGTATCAAAGGTGTCTCTCATGAATCAATGAAGAC
ACTTAGTACCACAATGCKCTCTGCCATATCCTTGACCTTTGTGGCCTCTG
GTAGCAAGACAGAACTTCTGGTGTAGTTTCCGTTCGGGTACAGGCTTACG
GGATCCGACTATGTGACTGACTTGTAGGATAACCTTTTGCCGTGATTGCA
AGAAATCTATTTTGATGGAAATATAGTTTTCCAGTAGGATGATGCACCTG
CCCTCACCTCAGAAAAGGCACAGAATGGTTGGCCAACAACATTACTTTCT
AGCCCAAACACTTATGGGCCACATACACCCCCTGATGTCAACCCCCTTAA
CTACATCTTTTAGGCGCATATCGAGGAGAAGGCATTCAGTGACTGTCATC
CAAAGGCCAAGGCCTTCAAAGCCACTGCCATTTAGCACTGGGATGTCATG
ACAGAGGACTATATCTGCAATGGGTGCAAGGCCTTCTGACGCCGCCTGGA
AGCCAAATTGCCGCCCTTGGAGGCTAAATTAATGATTAAGAGAACTCAAA
CACACATCTATATATAGTATTAAAATGGTCTTTGTGCCATCCTTGCTTTT
GATCTGATGGATGTCCCAATATTTCTGACTTTACTAATTAAGTCTTTAGA
TATCATATTCTTCATTTAATGACTGTCAAGTTAATGGAACTTTATTTCTT
GGTTATTACCCTGAGTTTAAGATTATTTATTTATTAACTCTTTATATAAT
AGTGACGATTAGTGTACAATCAGTTCTGATTTATTTGGTCTGTCAGTACT
AGAACTGATATAAAAAAATAAGAATAAAGTTGAGTCGCGTCTAGAGGGAC
CGAAATTTATATGTTTCAGGACTGTACTGGACGATACTGATATTATAACA
CTAGGAACGATGCGTAGCAAAAATTAAAAGGAAATTATTTCAGTTTGAAG
GTCCAAATAAGACTACATAATTTATATCTTGGATCGTCATTTACGAAAAA
AAAAAAAAAATTTTTTTATTCGAGGTCATGTATGGTTAAGTTTCGTCATG
TAACATTATGTATTAGGGACTGACCAAGGATGATAATTATGTTTTGTCTA
TTTTTGCAAATAAATATTTTAATCATATTCATTAAAATACCAATTATGGA
TGGTATGATTTGAGGATGACCTTTTCTTGTGTCATGTGTGAGTTGTATTC
TCTGTCGGTGGAAGTGAAAGTATATAGATATGTTATCAAAATGAGGTTTC
TTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNAACCTTCGTAGAAAAACCACAAAGATTAATGTCAAACAACACA
CTATTTACTCTCTACAGGCGACAACATTAATGTCTTTTTTTTTGTGGTTA
ATTGCTTTACTTAACTCTCCGCCGTTACTTTTTCTTGAGATGGAATAGGT
TAAAGTAATGATTCCTGTTTAATATTTATCATAATTGATTGTTGAATTTT
TGGTATAATATAAAGGGAAATCAATATCCTCAAAAGATGTTTTTCTATTA
AGTTTTGCCTTCTATCAGTATTGGGTGTTTTAAACGTACTAAAAGACCCT
TCCACGTCCACATTAGTAGTCGGGGAGATCTTTAGTAGTCATGTTGAACG
GAGGCCTTACATCATTACCCCTAGTGTTGTGTTAGTCATTTTTTATTCTG
TCCAATTCAGTTCATTAAGACTCTCTGTCCTTTGGACTCTCAGTACTAGA
ACTGATTAATAGAAATTTGAGTGACATTATTAAGGACGAAATTCTAAATT
TTTAAGACGTAGGACTGAACTGGACCGGAGTGGATTTTCCCTCCCAAAAA
TATCTTCAAAGAATCATCAAAGCTGTTGTGTTATCTTACTAGTATACAAT
TTTTCTTAATTTTTTTATATCAATCAAAATAAATGTACAATAAATGTATT
CATAATGTGGCCAGTCAAAACAAAAACAAGCTAGAAGGATTTTTGATCAA
ATTAAGTGGATTTGTATATTTTTATTCTTTGACAAATAATAATAATAATT
TTGTCTCATTAATCCTTTGGAGTCGTCGGAAATTGCAGGCCTTTAAGTAG
CAAAAATTCAGTATCACGATGAAAAAAGTAGAAAATGATGGATTATATTT
TTTTTTTTTAAACAAAAAAAAAACAACTTTTTAGGGAGTCAAATAATGTT
TCATAGATCAAACAAAACTTTCAAACTTTAGGTAACATTCTTGTGTTTCT
CACCCCATCCCAGAAGTTTGAATAATACGCTTATAATTGACCAAAATATG
TGAAGGAAAATTGGGGTTATCTTCTTGATTTTTGCAGAAGATTGTTTTTC
TGTTTTGTCATCACAGATTCCAAGTTTTTTTTTAAAGTTACGCATATTTA
TATTAGCCCTAAACCTTGCTCACAGTAGTAAAAATAATTATGGGTGGAGG
GTTGCCAGATCATTTTACACATGATATTTATATAAATCTATCTTAAATTC
CCCCTTTGTTAGAAAATGGTGATCAAATCTACCATCCAAATGCAGGTGCA
CAGTTTGAGAAACACTGCTCGGGTGGATTGTTAATCAATCTTAGGTTAAC
CACCCAGGTGTAATGTCTGTAAAATTGTACTTCTAAGGAAGTGAGTAGAT
ATAGTAGTATCGAATATTTGAAGAATGTCACCTTATACACCTTGTAGAAG
TACACATTTAAAATAAAAACATGTGTACATAATTTGAAGAGGAGCACCCA
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TCCTTCATTCATCATAACATGATGTATTTGTATTGAATTATACAAAAGAT
ATTAAACTTTTCATCATACCTACTAGTATGGCATAATCTATCTACTTTTT
GTGATTCATGCATAGGTCGTATTATTAGTCATTAGTAGAGTTGAATCAGG
CCTAGGACTTATTTTGTGTCCGTCCCTATTTATTGGGTCTTAGAACAGAT
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GAAAAATCATTTTGACTAATAACACCATGGCTGAAAAGTACTTGAATTCA
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TTTACAGTTTAATCCACATGGTAACCCTGACAATTTGTTGAATTGAGATC
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CCGATCTCTACCTCCAATTCTACTCTGAGTTCAACAAGGGCTTACGATCA
TAACTCTGCAACAAATCCTCAGGGTTACTCTTCGTCTGTTATGAGCACAC
ACGAACGTCGTTCAAACAGGTTTTAGGAATATATTTAGGAAAGGATGTTC
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ATTCTTCGGACTGCAGTTTTTTTAGACGGATCCAACGCTATTTTCAGTAG
ATCCCCAGTAATTATTAGTTAATAGCTATTTGTGTCCTTCTTTCCACCTA
TGTATGTAGGCGGTTACTATATGGGTATGTAGGAATTAGGAGAGTCAATG
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GTGTATATTTTATTTCTCAAACTTGTATACATCCTTCATACTGCTCGGAA
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TTGAGACTCGGTCTCAAGTGATTGTTTGAGACCGATTGGGACTGTCGATA
GAAATTGAATTGTTTGGATGTCGGGAACAGATTTTTTTGATCTCAATTCT
TGGACTAATTTTTTCCCCTATCCTTATTTATGAGGAAATTATGTTTTTCA
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TGTCCAGGGGTGTCTGCAGGATGATATTTTGGGAACTTGGTTTTTGGAAT
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GAATATAATATTTTTAAATCCATAGTTATTCACAAAAATTTAAATTTCCT
GAAAAATAATTCAAAAATCCAGAGTTGTTTATAAAAAATTAAATTTTTTG
GAAAATTTTTTTGCTTATATCAATTTTTTTCCCAAAAAATTTCTAAAATC
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ATATTTTTTTTGTATATTGGAGGGGGGGGGGGGCGGTACAGCCCCYATAT
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